Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GAT0

Protein Details
Accession C1GAT0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-31SWDYRPSSFRHRERPNLDHGDHydrophilic
644-670GGVHGVRHSPSRKRRSRREIGRSVDLGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
653-661PSRKRRSRR
Subcellular Location(s) plas 24, mito 1, cyto 1, E.R. 1, cyto_mito 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011701  MFS  
IPR036259  MFS_trans_sf  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0022857  F:transmembrane transporter activity  
KEGG pbn:PADG_04366  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07690  MFS_1  
Amino Acid Sequences MSLNRVISLESWDYRPSSFRHRERPNLDHGDNAFAEEREGNDSFSNARTRLAQVRPADSQSSVRRKLSFNPAAGPSWTHATVDDDGDDDDDGDDRDEECQRSLLSISDDSSALMPNDTVSDGPDTVAAFEVPRWKRIAQVSVAVLYCLLSAGVIFGYAALKPILVEEGVYRNRCSKEELDRGESLCYNQDLRLNFMFTLSAVATNISALPVGSILDTFGPRFSGSIGSILIASGSLCLALASLLPFDTYVAGYFLLALGGPFVFISSFQLSNTFPTHSGLILAILTGAFDSSSAIFLLFRILHGGFFTLRNLFLMYLIVPAVILASQILLMPSTLYKTAGELIQQKEDVIAENATDGPPEGSLITREQEQQLQNRISHRIYVVSQIEELLGNEQHDSQQTKSTPSQSTTPQTPNKVPHEARRSNSVWGVLHMASALQQIRSPYFILMTSFAILQMLRINYFIASIGVQYESLLSSPQLVKHLNHVFDLFLPLAGIVAIPFTGLILDRASTVTAVATLLCCSTLVGILGCIPHSLLAAYAHITLFTLYRPFCYASISDYAAKIFGFQTFGKVYGLMICLAGLGNFLQIPLDILTMKLFRRDPIPVNILLTIMVFVVGGILVLFVWWRGRERMGIVDVVVENGELGGVHGVRHSPSRKRRSRREIGRSVDLGEDDGDGGPSERDRLLTASHREDANGSACVYLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.3
3 0.28
4 0.34
5 0.42
6 0.49
7 0.57
8 0.65
9 0.74
10 0.79
11 0.81
12 0.81
13 0.79
14 0.71
15 0.67
16 0.59
17 0.55
18 0.46
19 0.42
20 0.34
21 0.25
22 0.26
23 0.2
24 0.2
25 0.19
26 0.2
27 0.19
28 0.17
29 0.18
30 0.18
31 0.21
32 0.25
33 0.2
34 0.21
35 0.22
36 0.27
37 0.34
38 0.37
39 0.41
40 0.4
41 0.45
42 0.47
43 0.48
44 0.46
45 0.39
46 0.42
47 0.44
48 0.5
49 0.5
50 0.51
51 0.51
52 0.51
53 0.57
54 0.61
55 0.58
56 0.51
57 0.51
58 0.5
59 0.48
60 0.47
61 0.4
62 0.31
63 0.29
64 0.26
65 0.21
66 0.19
67 0.2
68 0.21
69 0.2
70 0.18
71 0.14
72 0.14
73 0.14
74 0.14
75 0.1
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.11
83 0.15
84 0.16
85 0.16
86 0.17
87 0.16
88 0.17
89 0.17
90 0.17
91 0.16
92 0.16
93 0.17
94 0.16
95 0.16
96 0.16
97 0.15
98 0.15
99 0.12
100 0.1
101 0.09
102 0.08
103 0.09
104 0.09
105 0.08
106 0.08
107 0.1
108 0.1
109 0.1
110 0.11
111 0.1
112 0.1
113 0.11
114 0.09
115 0.07
116 0.09
117 0.18
118 0.19
119 0.21
120 0.24
121 0.24
122 0.3
123 0.35
124 0.39
125 0.32
126 0.36
127 0.35
128 0.35
129 0.35
130 0.29
131 0.23
132 0.17
133 0.14
134 0.09
135 0.07
136 0.03
137 0.03
138 0.04
139 0.04
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.04
144 0.04
145 0.06
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.06
150 0.07
151 0.06
152 0.06
153 0.07
154 0.14
155 0.19
156 0.21
157 0.22
158 0.27
159 0.29
160 0.3
161 0.33
162 0.32
163 0.36
164 0.44
165 0.48
166 0.47
167 0.48
168 0.48
169 0.45
170 0.4
171 0.31
172 0.25
173 0.21
174 0.17
175 0.16
176 0.19
177 0.17
178 0.21
179 0.22
180 0.21
181 0.19
182 0.18
183 0.17
184 0.13
185 0.14
186 0.1
187 0.09
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.05
194 0.05
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.08
210 0.09
211 0.09
212 0.1
213 0.1
214 0.09
215 0.09
216 0.08
217 0.07
218 0.05
219 0.05
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.04
243 0.04
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.06
253 0.08
254 0.09
255 0.09
256 0.11
257 0.11
258 0.13
259 0.15
260 0.13
261 0.12
262 0.13
263 0.13
264 0.12
265 0.12
266 0.09
267 0.08
268 0.07
269 0.06
270 0.05
271 0.04
272 0.04
273 0.03
274 0.03
275 0.02
276 0.02
277 0.03
278 0.03
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.07
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.09
292 0.07
293 0.08
294 0.09
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.06
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.03
310 0.03
311 0.02
312 0.02
313 0.02
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.03
318 0.03
319 0.03
320 0.04
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.06
325 0.07
326 0.07
327 0.09
328 0.14
329 0.15
330 0.16
331 0.16
332 0.15
333 0.14
334 0.14
335 0.12
336 0.08
337 0.07
338 0.05
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.05
343 0.05
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.05
350 0.06
351 0.07
352 0.08
353 0.09
354 0.1
355 0.15
356 0.17
357 0.2
358 0.26
359 0.27
360 0.28
361 0.29
362 0.32
363 0.27
364 0.26
365 0.22
366 0.18
367 0.16
368 0.2
369 0.19
370 0.15
371 0.15
372 0.14
373 0.14
374 0.12
375 0.11
376 0.07
377 0.06
378 0.06
379 0.07
380 0.07
381 0.07
382 0.09
383 0.11
384 0.11
385 0.16
386 0.16
387 0.2
388 0.22
389 0.27
390 0.27
391 0.27
392 0.29
393 0.28
394 0.32
395 0.32
396 0.37
397 0.37
398 0.39
399 0.41
400 0.44
401 0.45
402 0.49
403 0.46
404 0.47
405 0.53
406 0.54
407 0.52
408 0.52
409 0.49
410 0.43
411 0.43
412 0.37
413 0.27
414 0.22
415 0.24
416 0.16
417 0.15
418 0.12
419 0.1
420 0.08
421 0.1
422 0.1
423 0.07
424 0.08
425 0.1
426 0.1
427 0.12
428 0.12
429 0.1
430 0.1
431 0.1
432 0.1
433 0.1
434 0.1
435 0.09
436 0.09
437 0.08
438 0.08
439 0.07
440 0.07
441 0.08
442 0.08
443 0.08
444 0.08
445 0.09
446 0.08
447 0.09
448 0.08
449 0.06
450 0.05
451 0.05
452 0.06
453 0.06
454 0.06
455 0.05
456 0.05
457 0.05
458 0.05
459 0.06
460 0.05
461 0.07
462 0.09
463 0.1
464 0.13
465 0.15
466 0.16
467 0.24
468 0.29
469 0.27
470 0.27
471 0.26
472 0.23
473 0.22
474 0.23
475 0.15
476 0.1
477 0.08
478 0.07
479 0.07
480 0.06
481 0.05
482 0.03
483 0.03
484 0.03
485 0.03
486 0.02
487 0.02
488 0.03
489 0.03
490 0.04
491 0.04
492 0.05
493 0.06
494 0.06
495 0.07
496 0.06
497 0.06
498 0.05
499 0.05
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.05
512 0.05
513 0.06
514 0.06
515 0.07
516 0.06
517 0.06
518 0.06
519 0.06
520 0.06
521 0.06
522 0.06
523 0.07
524 0.08
525 0.08
526 0.08
527 0.08
528 0.08
529 0.08
530 0.07
531 0.08
532 0.11
533 0.1
534 0.12
535 0.14
536 0.16
537 0.15
538 0.18
539 0.17
540 0.17
541 0.2
542 0.21
543 0.21
544 0.19
545 0.19
546 0.17
547 0.17
548 0.14
549 0.11
550 0.1
551 0.12
552 0.11
553 0.15
554 0.16
555 0.17
556 0.16
557 0.16
558 0.15
559 0.14
560 0.15
561 0.11
562 0.1
563 0.09
564 0.08
565 0.08
566 0.08
567 0.06
568 0.05
569 0.05
570 0.05
571 0.05
572 0.05
573 0.05
574 0.07
575 0.07
576 0.07
577 0.07
578 0.07
579 0.1
580 0.13
581 0.13
582 0.17
583 0.18
584 0.19
585 0.22
586 0.28
587 0.31
588 0.35
589 0.39
590 0.35
591 0.36
592 0.34
593 0.31
594 0.25
595 0.2
596 0.13
597 0.09
598 0.07
599 0.05
600 0.04
601 0.04
602 0.03
603 0.03
604 0.03
605 0.03
606 0.03
607 0.03
608 0.03
609 0.04
610 0.06
611 0.08
612 0.11
613 0.14
614 0.16
615 0.19
616 0.21
617 0.26
618 0.26
619 0.26
620 0.23
621 0.23
622 0.22
623 0.2
624 0.17
625 0.11
626 0.09
627 0.07
628 0.07
629 0.04
630 0.04
631 0.06
632 0.06
633 0.06
634 0.08
635 0.09
636 0.11
637 0.19
638 0.25
639 0.33
640 0.44
641 0.55
642 0.65
643 0.74
644 0.84
645 0.87
646 0.91
647 0.92
648 0.93
649 0.92
650 0.89
651 0.86
652 0.77
653 0.68
654 0.59
655 0.48
656 0.38
657 0.29
658 0.22
659 0.14
660 0.13
661 0.11
662 0.09
663 0.09
664 0.09
665 0.09
666 0.11
667 0.11
668 0.12
669 0.13
670 0.15
671 0.19
672 0.26
673 0.33
674 0.36
675 0.4
676 0.39
677 0.38
678 0.38
679 0.36
680 0.31
681 0.26
682 0.21