Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3HDZ9

Protein Details
Accession A0A1E3HDZ9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
156-181GSAHGESRERRRDRRDRDRDDEREIEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
165-167RRR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12, cyto 4, extr 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MATPPESLPSPSLSSSSHSHLGSLYQSTRASSSASGSQPAAQRHPNYTNGDGQIPYDSSQYSSMSFLPSTVSPPPNPPPYIPPPQHAMPPDPIHSATGTGYTQPQPWPNGPPGPAGWRAAAPPAGYGGYRSSVPNGRHLPTNPDFPGQRGFGTRPGSAHGESRERRRDRRDRDRDDEREIEEEVISTIFVVGFPDDMSEREFQNIFTFAPGFEAATLKFPSGSARREPAAAALLAELTQLAAHQNAQAAAGSTEYNEYPTAQLEEAISSLTLATASTSQSTTPSAPMSLTPSVPSNPTLGPNPLPTRRQTIGFARFKSRPDALAAKDHLQGKKIDALTGAVLKAEMAKKNLHTKKTTSGEELVGMLLRGKLGGLIGSGAGQGQGIAAPTAKEAWDSWSSLSDKEPRNRPDDIPPPSHAPQPSFSSQTTFVPSSLPSANPTSPTLDAKSPTQGQFPGHGGDSKALLALAEKADELVGWNIHGAAGLSLDPYSSIPPPQPAQAQGQQSQSQTQGRSLGSTGSQGPQGYGLGVMGPNFGGGREFEEGVGRDGLGGQGLSGRGVNGANPADQNPPINTLYVGNLPAVSPPTHPPGFLEESLRALFSRCAGFKRMSYRQKINGPMCFVEFEEVGYASQAIKDLYGHNLGGLVKGGIRLSYSKNSLGQRGNNHPPQLNTSLYSGIPHNVPIPGLGMTSPSSASVALPNGSASAGPMPYGLQHQQASLSLRDRERERGGEPGTAPLADLRRESAPASHGHSNAHFSPLSGTSLSPTAQPFNIALPPTSPRNHYITSPIPHRISPTESASSSYNSNPTPSGSNSNSNSASHSASASGVPIPSTRSSGSAFQPFGGAGSSGSTSGFSPVSSPIRTPGSFQWLSTSANATSSNVSAGLGSGLGSGLGAVGSLGVGSLGNLGNLGVGSLGGGGGLGSGSLGGGGYGGFDFGGNAPVGSLNGAASAWGASERRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.26
3 0.3
4 0.31
5 0.28
6 0.28
7 0.26
8 0.27
9 0.26
10 0.28
11 0.24
12 0.23
13 0.24
14 0.25
15 0.25
16 0.24
17 0.23
18 0.18
19 0.21
20 0.23
21 0.24
22 0.26
23 0.25
24 0.29
25 0.32
26 0.36
27 0.38
28 0.39
29 0.41
30 0.45
31 0.49
32 0.51
33 0.52
34 0.51
35 0.52
36 0.47
37 0.47
38 0.4
39 0.36
40 0.32
41 0.28
42 0.25
43 0.2
44 0.18
45 0.16
46 0.18
47 0.18
48 0.16
49 0.16
50 0.16
51 0.18
52 0.17
53 0.15
54 0.16
55 0.16
56 0.18
57 0.23
58 0.27
59 0.26
60 0.32
61 0.4
62 0.44
63 0.46
64 0.45
65 0.46
66 0.5
67 0.58
68 0.55
69 0.51
70 0.5
71 0.5
72 0.53
73 0.48
74 0.45
75 0.42
76 0.43
77 0.43
78 0.4
79 0.38
80 0.34
81 0.31
82 0.28
83 0.2
84 0.19
85 0.17
86 0.15
87 0.18
88 0.19
89 0.22
90 0.24
91 0.29
92 0.31
93 0.33
94 0.37
95 0.39
96 0.42
97 0.4
98 0.39
99 0.37
100 0.37
101 0.38
102 0.34
103 0.3
104 0.25
105 0.25
106 0.25
107 0.24
108 0.19
109 0.16
110 0.16
111 0.15
112 0.14
113 0.14
114 0.13
115 0.13
116 0.14
117 0.14
118 0.18
119 0.23
120 0.25
121 0.33
122 0.36
123 0.36
124 0.41
125 0.42
126 0.46
127 0.43
128 0.49
129 0.43
130 0.43
131 0.41
132 0.38
133 0.41
134 0.33
135 0.32
136 0.28
137 0.28
138 0.29
139 0.33
140 0.32
141 0.27
142 0.3
143 0.32
144 0.29
145 0.31
146 0.29
147 0.35
148 0.39
149 0.47
150 0.54
151 0.57
152 0.64
153 0.7
154 0.76
155 0.77
156 0.84
157 0.85
158 0.84
159 0.86
160 0.89
161 0.83
162 0.8
163 0.74
164 0.65
165 0.56
166 0.47
167 0.39
168 0.29
169 0.23
170 0.16
171 0.12
172 0.09
173 0.07
174 0.06
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.06
182 0.07
183 0.07
184 0.1
185 0.11
186 0.11
187 0.14
188 0.15
189 0.14
190 0.16
191 0.17
192 0.14
193 0.14
194 0.14
195 0.11
196 0.13
197 0.13
198 0.1
199 0.09
200 0.11
201 0.1
202 0.13
203 0.13
204 0.11
205 0.11
206 0.11
207 0.17
208 0.21
209 0.25
210 0.25
211 0.29
212 0.29
213 0.3
214 0.3
215 0.26
216 0.23
217 0.19
218 0.14
219 0.11
220 0.1
221 0.09
222 0.08
223 0.06
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.07
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.07
239 0.07
240 0.08
241 0.08
242 0.09
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.1
247 0.11
248 0.1
249 0.11
250 0.1
251 0.1
252 0.09
253 0.09
254 0.07
255 0.05
256 0.05
257 0.04
258 0.04
259 0.04
260 0.04
261 0.05
262 0.06
263 0.07
264 0.07
265 0.08
266 0.09
267 0.11
268 0.11
269 0.12
270 0.12
271 0.11
272 0.11
273 0.12
274 0.16
275 0.15
276 0.15
277 0.14
278 0.16
279 0.16
280 0.17
281 0.17
282 0.15
283 0.14
284 0.16
285 0.17
286 0.18
287 0.19
288 0.23
289 0.28
290 0.3
291 0.32
292 0.32
293 0.37
294 0.36
295 0.37
296 0.35
297 0.38
298 0.43
299 0.47
300 0.47
301 0.46
302 0.48
303 0.47
304 0.48
305 0.4
306 0.32
307 0.3
308 0.33
309 0.29
310 0.33
311 0.34
312 0.31
313 0.34
314 0.37
315 0.34
316 0.3
317 0.29
318 0.24
319 0.28
320 0.25
321 0.22
322 0.17
323 0.17
324 0.16
325 0.17
326 0.15
327 0.08
328 0.08
329 0.07
330 0.1
331 0.12
332 0.13
333 0.14
334 0.16
335 0.19
336 0.3
337 0.36
338 0.38
339 0.38
340 0.4
341 0.47
342 0.5
343 0.5
344 0.42
345 0.39
346 0.34
347 0.31
348 0.29
349 0.2
350 0.14
351 0.11
352 0.08
353 0.06
354 0.05
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.03
361 0.03
362 0.03
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.03
367 0.03
368 0.03
369 0.03
370 0.03
371 0.03
372 0.03
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.05
380 0.09
381 0.11
382 0.11
383 0.12
384 0.16
385 0.17
386 0.17
387 0.19
388 0.22
389 0.27
390 0.33
391 0.4
392 0.4
393 0.43
394 0.45
395 0.45
396 0.46
397 0.49
398 0.47
399 0.43
400 0.42
401 0.44
402 0.42
403 0.44
404 0.36
405 0.3
406 0.27
407 0.28
408 0.28
409 0.26
410 0.24
411 0.23
412 0.23
413 0.23
414 0.23
415 0.19
416 0.17
417 0.15
418 0.15
419 0.15
420 0.15
421 0.13
422 0.12
423 0.14
424 0.15
425 0.16
426 0.16
427 0.16
428 0.16
429 0.17
430 0.17
431 0.16
432 0.17
433 0.16
434 0.18
435 0.19
436 0.19
437 0.19
438 0.19
439 0.18
440 0.19
441 0.19
442 0.17
443 0.14
444 0.14
445 0.13
446 0.12
447 0.11
448 0.09
449 0.07
450 0.06
451 0.05
452 0.05
453 0.06
454 0.05
455 0.05
456 0.05
457 0.05
458 0.05
459 0.04
460 0.05
461 0.04
462 0.04
463 0.04
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.04
468 0.03
469 0.03
470 0.03
471 0.03
472 0.03
473 0.03
474 0.03
475 0.04
476 0.04
477 0.05
478 0.05
479 0.06
480 0.07
481 0.09
482 0.1
483 0.12
484 0.13
485 0.14
486 0.18
487 0.22
488 0.25
489 0.26
490 0.29
491 0.29
492 0.29
493 0.28
494 0.26
495 0.24
496 0.21
497 0.19
498 0.19
499 0.17
500 0.17
501 0.16
502 0.14
503 0.11
504 0.12
505 0.12
506 0.09
507 0.11
508 0.1
509 0.09
510 0.09
511 0.09
512 0.07
513 0.06
514 0.05
515 0.04
516 0.04
517 0.04
518 0.04
519 0.04
520 0.04
521 0.04
522 0.04
523 0.04
524 0.04
525 0.06
526 0.07
527 0.08
528 0.08
529 0.09
530 0.1
531 0.11
532 0.11
533 0.08
534 0.07
535 0.07
536 0.06
537 0.05
538 0.04
539 0.03
540 0.04
541 0.04
542 0.04
543 0.04
544 0.04
545 0.05
546 0.05
547 0.06
548 0.07
549 0.08
550 0.08
551 0.09
552 0.11
553 0.12
554 0.12
555 0.14
556 0.12
557 0.15
558 0.14
559 0.14
560 0.13
561 0.12
562 0.13
563 0.12
564 0.12
565 0.09
566 0.08
567 0.08
568 0.08
569 0.09
570 0.09
571 0.09
572 0.11
573 0.17
574 0.17
575 0.17
576 0.17
577 0.21
578 0.24
579 0.23
580 0.23
581 0.18
582 0.2
583 0.2
584 0.19
585 0.14
586 0.11
587 0.11
588 0.1
589 0.13
590 0.12
591 0.14
592 0.17
593 0.18
594 0.21
595 0.29
596 0.36
597 0.41
598 0.47
599 0.51
600 0.55
601 0.6
602 0.65
603 0.62
604 0.56
605 0.51
606 0.45
607 0.4
608 0.34
609 0.27
610 0.2
611 0.15
612 0.12
613 0.09
614 0.09
615 0.08
616 0.07
617 0.07
618 0.05
619 0.06
620 0.06
621 0.05
622 0.05
623 0.06
624 0.07
625 0.09
626 0.11
627 0.1
628 0.1
629 0.12
630 0.12
631 0.11
632 0.1
633 0.08
634 0.06
635 0.08
636 0.08
637 0.06
638 0.07
639 0.09
640 0.12
641 0.16
642 0.19
643 0.2
644 0.25
645 0.27
646 0.32
647 0.35
648 0.36
649 0.38
650 0.44
651 0.51
652 0.5
653 0.51
654 0.47
655 0.43
656 0.44
657 0.41
658 0.34
659 0.27
660 0.24
661 0.23
662 0.21
663 0.21
664 0.16
665 0.14
666 0.13
667 0.12
668 0.12
669 0.11
670 0.11
671 0.09
672 0.1
673 0.08
674 0.08
675 0.07
676 0.08
677 0.08
678 0.09
679 0.09
680 0.08
681 0.08
682 0.08
683 0.08
684 0.09
685 0.09
686 0.09
687 0.09
688 0.09
689 0.09
690 0.08
691 0.08
692 0.07
693 0.07
694 0.07
695 0.07
696 0.07
697 0.07
698 0.07
699 0.11
700 0.12
701 0.14
702 0.15
703 0.15
704 0.16
705 0.19
706 0.2
707 0.2
708 0.22
709 0.23
710 0.24
711 0.29
712 0.31
713 0.35
714 0.36
715 0.37
716 0.34
717 0.36
718 0.37
719 0.36
720 0.33
721 0.3
722 0.26
723 0.23
724 0.22
725 0.17
726 0.18
727 0.15
728 0.15
729 0.15
730 0.15
731 0.16
732 0.17
733 0.16
734 0.16
735 0.18
736 0.23
737 0.25
738 0.25
739 0.26
740 0.26
741 0.29
742 0.28
743 0.28
744 0.23
745 0.18
746 0.2
747 0.2
748 0.2
749 0.16
750 0.15
751 0.13
752 0.15
753 0.15
754 0.14
755 0.14
756 0.15
757 0.14
758 0.16
759 0.15
760 0.16
761 0.19
762 0.17
763 0.16
764 0.16
765 0.19
766 0.23
767 0.25
768 0.25
769 0.26
770 0.3
771 0.32
772 0.31
773 0.35
774 0.37
775 0.41
776 0.43
777 0.47
778 0.43
779 0.42
780 0.44
781 0.41
782 0.38
783 0.36
784 0.36
785 0.33
786 0.32
787 0.33
788 0.31
789 0.3
790 0.27
791 0.25
792 0.24
793 0.2
794 0.22
795 0.2
796 0.21
797 0.23
798 0.24
799 0.29
800 0.28
801 0.35
802 0.36
803 0.41
804 0.4
805 0.37
806 0.37
807 0.32
808 0.3
809 0.23
810 0.21
811 0.16
812 0.16
813 0.15
814 0.13
815 0.12
816 0.11
817 0.1
818 0.11
819 0.13
820 0.14
821 0.17
822 0.16
823 0.18
824 0.2
825 0.24
826 0.28
827 0.31
828 0.31
829 0.28
830 0.28
831 0.25
832 0.23
833 0.19
834 0.14
835 0.08
836 0.09
837 0.09
838 0.08
839 0.09
840 0.09
841 0.08
842 0.1
843 0.1
844 0.09
845 0.1
846 0.15
847 0.19
848 0.2
849 0.21
850 0.23
851 0.29
852 0.29
853 0.32
854 0.31
855 0.36
856 0.35
857 0.35
858 0.36
859 0.32
860 0.34
861 0.31
862 0.3
863 0.21
864 0.23
865 0.24
866 0.2
867 0.19
868 0.17
869 0.16
870 0.13
871 0.13
872 0.1
873 0.1
874 0.08
875 0.06
876 0.06
877 0.05
878 0.05
879 0.05
880 0.04
881 0.04
882 0.03
883 0.03
884 0.03
885 0.02
886 0.02
887 0.02
888 0.02
889 0.02
890 0.03
891 0.03
892 0.03
893 0.05
894 0.06
895 0.06
896 0.06
897 0.06
898 0.06
899 0.06
900 0.06
901 0.04
902 0.03
903 0.04
904 0.04
905 0.03
906 0.03
907 0.03
908 0.03
909 0.03
910 0.03
911 0.02
912 0.02
913 0.02
914 0.02
915 0.03
916 0.03
917 0.02
918 0.03
919 0.03
920 0.04
921 0.04
922 0.04
923 0.04
924 0.04
925 0.06
926 0.06
927 0.09
928 0.08
929 0.08
930 0.08
931 0.09
932 0.09
933 0.09
934 0.09
935 0.06
936 0.07
937 0.07
938 0.06
939 0.06
940 0.06
941 0.06
942 0.09