FuNGI

A0A1E3H9C9

Protein Details

Accession

A0A1E3H9C9

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
277-304	KETEVKEKKGRNRNRSKKDKKEKGDGAA	Basic
468-488	SGNGSRRGNRPPPKQAAQVKI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
169-172	SKGK
252-300	GGGARKGGKGKAKEKEKGDKGGGGAKETEVKEKKGRNRNRSKKDKKEKG

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, mito 11, cyto_nucl 8, cyto 2.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MAPPSPAPRNKLVIRRLPPTLPEDIFWNAVSTWITDKSCLWKSYVAGKAPNGNLDSHPVHSRAYVLMSDPEALVNFHRGFDGHVFRSKTGAEFQAVVEYAPYQKTVHKARVKPDNRQGTIDEDPDFLSFLKSLDTPAPESAQHTFVPAAPPPSTTPLLDHLRSQKSAKSKGKGKATPAPSQAPSQSATPVPTVPGPLKGKAAALASIKDASQRRQLLAQGTSSQVMVAGKGREVSIAPSTSASPAPGSSAAGGGARKGGKGKAKEKEKGDKGGGGAKETEVKEKKGRNRNRSKKDKKEKGDGAATPTGRQTPNLQPKSFPPLPQSTSKAPTPAPAPPPAAVSAAPAQTVPPPSNQRAPAPRVAQPPRPPFAPQEPAFTARPPPQSPIRPPPMRGGHVRPMGQPARPHIPAMNQGMPLNQPVRPLPSRGAPPHNGLHANSPSMFNGGARPAPGPSGQGMEPNSMAPGGSGNGSRRGNRPPPKQAAQVKILARDATAGAGSDTGASSARIDM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.68
2	0.68
3	0.68
4	0.63
5	0.6
6	0.55
7	0.53
8	0.44
9	0.38
10	0.36
11	0.34
12	0.32
13	0.28
14	0.25
15	0.17
16	0.18
17	0.18
18	0.15
19	0.16
20	0.19
21	0.19
22	0.19
23	0.22
24	0.28
25	0.34
26	0.33
27	0.33
28	0.31
29	0.33
30	0.41
31	0.46
32	0.43
33	0.41
34	0.42
35	0.47
36	0.45
37	0.48
38	0.39
39	0.35
40	0.31
41	0.33
42	0.32
43	0.28
44	0.3
45	0.26
46	0.26
47	0.24
48	0.24
49	0.19
50	0.19
51	0.17
52	0.15
53	0.16
54	0.16
55	0.17
56	0.15
57	0.15
58	0.13
59	0.12
60	0.12
61	0.16
62	0.15
63	0.15
64	0.15
65	0.15
66	0.17
67	0.23
68	0.28
69	0.25
70	0.31
71	0.33
72	0.33
73	0.35
74	0.33
75	0.29
76	0.26
77	0.25
78	0.2
79	0.19
80	0.19
81	0.21
82	0.2
83	0.18
84	0.14
85	0.12
86	0.13
87	0.12
88	0.13
89	0.11
90	0.13
91	0.21
92	0.27
93	0.36
94	0.43
95	0.48
96	0.54
97	0.64
98	0.67
99	0.7
100	0.73
101	0.74
102	0.67
103	0.65
104	0.58
105	0.54
106	0.51
107	0.44
108	0.35
109	0.26
110	0.24
111	0.21
112	0.2
113	0.14
114	0.11
115	0.09
116	0.08
117	0.09
118	0.08
119	0.1
120	0.12
121	0.14
122	0.15
123	0.16
124	0.18
125	0.17
126	0.19
127	0.19
128	0.19
129	0.17
130	0.16
131	0.15
132	0.15
133	0.17
134	0.16
135	0.18
136	0.15
137	0.17
138	0.17
139	0.21
140	0.22
141	0.19
142	0.2
143	0.23
144	0.28
145	0.27
146	0.29
147	0.32
148	0.34
149	0.36
150	0.36
151	0.34
152	0.37
153	0.46
154	0.49
155	0.5
156	0.54
157	0.59
158	0.68
159	0.67
160	0.66
161	0.64
162	0.62
163	0.61
164	0.57
165	0.54
166	0.46
167	0.44
168	0.39
169	0.32
170	0.28
171	0.22
172	0.2
173	0.16
174	0.16
175	0.15
176	0.14
177	0.13
178	0.12
179	0.14
180	0.12
181	0.18
182	0.19
183	0.19
184	0.2
185	0.2
186	0.19
187	0.19
188	0.19
189	0.15
190	0.14
191	0.13
192	0.13
193	0.13
194	0.13
195	0.16
196	0.17
197	0.17
198	0.23
199	0.24
200	0.24
201	0.25
202	0.28
203	0.26
204	0.26
205	0.25
206	0.19
207	0.18
208	0.18
209	0.15
210	0.13
211	0.1
212	0.08
213	0.08
214	0.08
215	0.08
216	0.08
217	0.08
218	0.08
219	0.08
220	0.08
221	0.09
222	0.09
223	0.09
224	0.09
225	0.1
226	0.1
227	0.11
228	0.11
229	0.09
230	0.07
231	0.07
232	0.08
233	0.07
234	0.07
235	0.06
236	0.06
237	0.06
238	0.07
239	0.07
240	0.06
241	0.08
242	0.08
243	0.08
244	0.09
245	0.12
246	0.16
247	0.23
248	0.3
249	0.36
250	0.43
251	0.49
252	0.54
253	0.6
254	0.58
255	0.57
256	0.51
257	0.45
258	0.38
259	0.38
260	0.32
261	0.24
262	0.2
263	0.15
264	0.19
265	0.18
266	0.25
267	0.21
268	0.24
269	0.29
270	0.35
271	0.44
272	0.49
273	0.58
274	0.62
275	0.71
276	0.79
277	0.84
278	0.89
279	0.91
280	0.92
281	0.93
282	0.93
283	0.88
284	0.87
285	0.82
286	0.76
287	0.72
288	0.62
289	0.56
290	0.5
291	0.44
292	0.34
293	0.3
294	0.28
295	0.22
296	0.21
297	0.21
298	0.26
299	0.37
300	0.42
301	0.41
302	0.39
303	0.41
304	0.5
305	0.47
306	0.39
307	0.34
308	0.34
309	0.37
310	0.41
311	0.43
312	0.38
313	0.39
314	0.38
315	0.35
316	0.3
317	0.29
318	0.27
319	0.28
320	0.27
321	0.26
322	0.28
323	0.25
324	0.27
325	0.25
326	0.24
327	0.18
328	0.17
329	0.15
330	0.14
331	0.13
332	0.12
333	0.11
334	0.12
335	0.15
336	0.14
337	0.17
338	0.22
339	0.25
340	0.32
341	0.34
342	0.38
343	0.42
344	0.46
345	0.47
346	0.45
347	0.47
348	0.51
349	0.54
350	0.56
351	0.58
352	0.6
353	0.56
354	0.54
355	0.51
356	0.47
357	0.49
358	0.5
359	0.42
360	0.42
361	0.42
362	0.44
363	0.43
364	0.38
365	0.36
366	0.33
367	0.38
368	0.33
369	0.35
370	0.39
371	0.46
372	0.52
373	0.57
374	0.61
375	0.59
376	0.59
377	0.64
378	0.63
379	0.59
380	0.58
381	0.55
382	0.54
383	0.56
384	0.55
385	0.48
386	0.49
387	0.48
388	0.45
389	0.42
390	0.39
391	0.4
392	0.39
393	0.39
394	0.32
395	0.33
396	0.36
397	0.4
398	0.38
399	0.32
400	0.31
401	0.31
402	0.3
403	0.3
404	0.25
405	0.2
406	0.19
407	0.19
408	0.26
409	0.26
410	0.29
411	0.28
412	0.32
413	0.39
414	0.43
415	0.49
416	0.46
417	0.48
418	0.49
419	0.51
420	0.47
421	0.4
422	0.41
423	0.36
424	0.35
425	0.31
426	0.29
427	0.25
428	0.23
429	0.22
430	0.15
431	0.16
432	0.16
433	0.16
434	0.16
435	0.16
436	0.15
437	0.17
438	0.18
439	0.17
440	0.15
441	0.17
442	0.16
443	0.2
444	0.21
445	0.22
446	0.21
447	0.2
448	0.19
449	0.15
450	0.15
451	0.1
452	0.1
453	0.08
454	0.09
455	0.12
456	0.14
457	0.22
458	0.26
459	0.29
460	0.33
461	0.41
462	0.5
463	0.57
464	0.64
465	0.67
466	0.73
467	0.76
468	0.81
469	0.81
470	0.78
471	0.73
472	0.71
473	0.64
474	0.6
475	0.56
476	0.47
477	0.38
478	0.32
479	0.27
480	0.21
481	0.17
482	0.13
483	0.1
484	0.1
485	0.09
486	0.08
487	0.08
488	0.07
489	0.08
490	0.08

A0A1E3H9C9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer