Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GGJ6

Protein Details
Accession C1GGJ6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-54LNSNSNRDPSPKRQRKRYHHYHSLQHRFTHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 4, cyto 4, cysk 4, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR037818  TAF8  
IPR019473  TFIID_su8_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
KEGG pbn:PADG_06433  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10406  TAF8_C  
CDD cd08049  TAF8  
Amino Acid Sequences MKPDPEAVGVVQPEPAPSPSLAHALNSNSNRDPSPKRQRKRYHHYHSLQHRFTHNLPDDALTADSAVDTLLNLSIGLLLLQSGFTHAEPVALDGLRRGVEEYMLHFLAYTRQSMASCRRTQPIPIDFQHALLYANIPVDSLRAHLKLSMPTHPAAAAEGIITIPTTLPSPPPSSPPPHTNLPFLGPELISPTSIDHDRQDQGATRRHIPKHFPTFPSKHTYQETPMYITRETDPRRIREKATEEGRLGEEALRRLARVAKDWSGSGSGADGGGEYRENMLWGRKGESMEGMFEKTVKAVSRGVVRREEQQRQQRNGGDEIGLALGSGSGVGGEPMSSSSETARGGNMKPSITPPVVRLDLSPVVNCDRAYWWKVTRPDVRGKMDGAGIGGVVGNKKGRGGKAGVVG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.18
3 0.15
4 0.15
5 0.17
6 0.17
7 0.21
8 0.2
9 0.2
10 0.22
11 0.24
12 0.32
13 0.32
14 0.35
15 0.34
16 0.36
17 0.36
18 0.4
19 0.44
20 0.46
21 0.55
22 0.61
23 0.68
24 0.76
25 0.85
26 0.89
27 0.92
28 0.93
29 0.92
30 0.92
31 0.9
32 0.89
33 0.89
34 0.89
35 0.82
36 0.76
37 0.69
38 0.64
39 0.59
40 0.59
41 0.52
42 0.43
43 0.39
44 0.36
45 0.33
46 0.29
47 0.27
48 0.16
49 0.12
50 0.1
51 0.09
52 0.07
53 0.06
54 0.04
55 0.04
56 0.04
57 0.04
58 0.04
59 0.04
60 0.04
61 0.05
62 0.05
63 0.04
64 0.04
65 0.03
66 0.04
67 0.04
68 0.04
69 0.05
70 0.06
71 0.06
72 0.08
73 0.08
74 0.09
75 0.09
76 0.1
77 0.11
78 0.1
79 0.1
80 0.09
81 0.11
82 0.11
83 0.11
84 0.11
85 0.08
86 0.1
87 0.11
88 0.12
89 0.15
90 0.15
91 0.14
92 0.13
93 0.13
94 0.17
95 0.17
96 0.16
97 0.13
98 0.14
99 0.15
100 0.19
101 0.28
102 0.31
103 0.35
104 0.37
105 0.4
106 0.4
107 0.43
108 0.47
109 0.44
110 0.42
111 0.39
112 0.42
113 0.38
114 0.38
115 0.35
116 0.27
117 0.22
118 0.15
119 0.14
120 0.09
121 0.09
122 0.08
123 0.07
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.07
128 0.09
129 0.09
130 0.1
131 0.11
132 0.14
133 0.18
134 0.21
135 0.24
136 0.23
137 0.23
138 0.23
139 0.22
140 0.2
141 0.15
142 0.13
143 0.08
144 0.05
145 0.05
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.04
153 0.05
154 0.06
155 0.09
156 0.12
157 0.13
158 0.18
159 0.21
160 0.26
161 0.3
162 0.32
163 0.34
164 0.37
165 0.38
166 0.36
167 0.33
168 0.3
169 0.27
170 0.23
171 0.19
172 0.13
173 0.11
174 0.12
175 0.12
176 0.09
177 0.09
178 0.09
179 0.1
180 0.11
181 0.11
182 0.09
183 0.12
184 0.13
185 0.13
186 0.14
187 0.16
188 0.2
189 0.26
190 0.27
191 0.3
192 0.36
193 0.39
194 0.42
195 0.44
196 0.47
197 0.51
198 0.54
199 0.51
200 0.52
201 0.52
202 0.52
203 0.54
204 0.47
205 0.41
206 0.38
207 0.37
208 0.33
209 0.34
210 0.32
211 0.28
212 0.29
213 0.27
214 0.24
215 0.24
216 0.22
217 0.24
218 0.26
219 0.31
220 0.34
221 0.37
222 0.43
223 0.44
224 0.45
225 0.45
226 0.47
227 0.47
228 0.47
229 0.46
230 0.4
231 0.39
232 0.37
233 0.29
234 0.25
235 0.19
236 0.17
237 0.13
238 0.16
239 0.14
240 0.13
241 0.14
242 0.18
243 0.17
244 0.19
245 0.22
246 0.22
247 0.23
248 0.24
249 0.24
250 0.21
251 0.2
252 0.16
253 0.11
254 0.09
255 0.07
256 0.07
257 0.06
258 0.04
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.06
265 0.07
266 0.1
267 0.13
268 0.14
269 0.17
270 0.18
271 0.19
272 0.19
273 0.21
274 0.19
275 0.18
276 0.18
277 0.17
278 0.14
279 0.14
280 0.13
281 0.11
282 0.12
283 0.1
284 0.12
285 0.12
286 0.15
287 0.24
288 0.29
289 0.32
290 0.36
291 0.37
292 0.44
293 0.5
294 0.55
295 0.56
296 0.61
297 0.67
298 0.67
299 0.72
300 0.68
301 0.63
302 0.57
303 0.5
304 0.4
305 0.3
306 0.25
307 0.18
308 0.13
309 0.09
310 0.06
311 0.05
312 0.04
313 0.04
314 0.02
315 0.02
316 0.02
317 0.03
318 0.03
319 0.03
320 0.03
321 0.04
322 0.07
323 0.07
324 0.08
325 0.09
326 0.11
327 0.13
328 0.13
329 0.15
330 0.17
331 0.18
332 0.24
333 0.26
334 0.24
335 0.24
336 0.27
337 0.31
338 0.29
339 0.29
340 0.25
341 0.29
342 0.31
343 0.3
344 0.27
345 0.27
346 0.3
347 0.3
348 0.29
349 0.25
350 0.26
351 0.28
352 0.27
353 0.23
354 0.23
355 0.28
356 0.3
357 0.34
358 0.35
359 0.41
360 0.47
361 0.54
362 0.58
363 0.58
364 0.65
365 0.68
366 0.69
367 0.64
368 0.6
369 0.54
370 0.47
371 0.4
372 0.3
373 0.22
374 0.15
375 0.12
376 0.11
377 0.1
378 0.09
379 0.11
380 0.13
381 0.13
382 0.17
383 0.22
384 0.24
385 0.28
386 0.31