Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3HLC2

Protein Details
Accession A0A1E3HLC2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
277-300MAKINKDVGKKKRGKKDEEDSEVDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
285-292GKKKRGKK
Subcellular Location(s) mito 13.5, nucl 13, cyto_mito 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MPPRKSKARDVKSTAPSPSPSVAATATRGSSRLSKSMSSNVGQSTDVETVTEEVQEESVEEKASTDAGVEESVEGEESAAPEDEGEAVKTGKVSMAERMAKMKELRMKMSQTSQENRRDLVADHQKNKTTAKDLARLEKQRKLAQTLRLKADAEEAGEDVERKKNWEYSIEDDERWAKKEAEKEAKQDQHFHNAEDDAWKRYERNIRGTKADLMAYERQKEAALGLAPGTLVPVAGGSSSAAGGSSALTKSEDLYRGADTLAYGDNKPSEEAVDRVMAKINKDVGKKKRGKKDEEDSEVDYINDRNRVFNKKISRYFDKYTKDIRANLERGTAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.68
3 0.61
4 0.54
5 0.48
6 0.4
7 0.31
8 0.27
9 0.24
10 0.21
11 0.21
12 0.2
13 0.19
14 0.18
15 0.19
16 0.19
17 0.24
18 0.26
19 0.29
20 0.3
21 0.32
22 0.34
23 0.41
24 0.43
25 0.38
26 0.37
27 0.33
28 0.32
29 0.29
30 0.26
31 0.23
32 0.19
33 0.18
34 0.15
35 0.13
36 0.13
37 0.13
38 0.12
39 0.09
40 0.08
41 0.08
42 0.08
43 0.08
44 0.08
45 0.08
46 0.08
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.08
51 0.08
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.07
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.07
60 0.06
61 0.06
62 0.05
63 0.05
64 0.06
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.06
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.08
79 0.09
80 0.1
81 0.13
82 0.19
83 0.22
84 0.23
85 0.27
86 0.26
87 0.28
88 0.28
89 0.3
90 0.3
91 0.3
92 0.34
93 0.35
94 0.37
95 0.36
96 0.41
97 0.42
98 0.4
99 0.44
100 0.48
101 0.51
102 0.49
103 0.47
104 0.42
105 0.37
106 0.32
107 0.34
108 0.38
109 0.36
110 0.4
111 0.43
112 0.44
113 0.45
114 0.46
115 0.39
116 0.33
117 0.33
118 0.33
119 0.37
120 0.36
121 0.42
122 0.47
123 0.52
124 0.52
125 0.5
126 0.51
127 0.48
128 0.48
129 0.47
130 0.45
131 0.47
132 0.51
133 0.51
134 0.49
135 0.46
136 0.45
137 0.38
138 0.36
139 0.27
140 0.18
141 0.14
142 0.1
143 0.09
144 0.08
145 0.08
146 0.07
147 0.1
148 0.09
149 0.11
150 0.13
151 0.15
152 0.16
153 0.2
154 0.22
155 0.24
156 0.31
157 0.31
158 0.29
159 0.27
160 0.31
161 0.28
162 0.27
163 0.24
164 0.18
165 0.19
166 0.25
167 0.31
168 0.37
169 0.38
170 0.4
171 0.46
172 0.52
173 0.5
174 0.52
175 0.45
176 0.45
177 0.43
178 0.39
179 0.33
180 0.27
181 0.26
182 0.24
183 0.24
184 0.17
185 0.17
186 0.17
187 0.16
188 0.22
189 0.3
190 0.29
191 0.37
192 0.43
193 0.44
194 0.47
195 0.49
196 0.46
197 0.39
198 0.36
199 0.26
200 0.23
201 0.27
202 0.26
203 0.26
204 0.23
205 0.22
206 0.21
207 0.2
208 0.16
209 0.13
210 0.1
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.07
216 0.07
217 0.04
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.06
233 0.06
234 0.07
235 0.08
236 0.08
237 0.09
238 0.13
239 0.15
240 0.15
241 0.16
242 0.17
243 0.16
244 0.16
245 0.15
246 0.11
247 0.11
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.13
252 0.14
253 0.15
254 0.15
255 0.14
256 0.13
257 0.13
258 0.14
259 0.15
260 0.18
261 0.18
262 0.18
263 0.23
264 0.23
265 0.22
266 0.25
267 0.3
268 0.31
269 0.37
270 0.46
271 0.49
272 0.58
273 0.66
274 0.72
275 0.76
276 0.8
277 0.82
278 0.83
279 0.84
280 0.84
281 0.82
282 0.77
283 0.7
284 0.63
285 0.54
286 0.45
287 0.35
288 0.28
289 0.24
290 0.24
291 0.21
292 0.26
293 0.31
294 0.39
295 0.42
296 0.48
297 0.54
298 0.59
299 0.68
300 0.7
301 0.73
302 0.72
303 0.76
304 0.77
305 0.73
306 0.69
307 0.69
308 0.69
309 0.66
310 0.64
311 0.64
312 0.65
313 0.62
314 0.57