FuNGI

A0A1E3H9B6

Protein Details

Accession

A0A1E3H9B6

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
493-520	NTENHPGTIRNPKRKPREPQPAPPVREE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
296-305	GGKKRRGKRG
505-508	KRKP
551-572	KKARKAAVKAERAARRAEKKSH

Subcellular Location(s)

nucl 19, mito 5, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPKGSTFRGPNAQHFQLVHRSQQDPLINDPDAGQRVLKAVSRGNDKKTELSLAELEASLDKSKIRSNEGEAALYGITYDDSAYDYMQHLKPVGGLAAGGDSWLIAAPKGGSGVAPGMKGGKQKAKGGAVDDDMFKLPETVLPSKAMMSVQEARARSEAIPTELQGLQPDMDPHLRQVLEALDDDEFVDEEGDDEDWFGSLVKGGERSAHEEVPWEFAEWGVDEQGKPMDKKPVQEGEEREETWEDRFKAFKAQQHKLPEVVSEAGDDMWGEEERSEMADTIGSLASNMSDMMVRGGKKRRGKRGPSDASGMSMSSSSMFRTQGLRDLDDRFDKVEMDYLYDDEEEEEEDWDDSDDGTASIAASNFSTASRFSLASHASRASNATAVPPELSRDDFESIMDDFLDNYEIVGRRLRPALGGTTMTGPEKLKVMRAAIEGQDEEKEENRKRIMEIEREEMSRGGKGPKRPAQTERVRQEDGPKWDVESILSTRTNTENHPGTIRNPKRKPREPQPAPPVREEESESDSGSETEREGGPRVTVARQKGETADDKKARKAAVKAERAARRAEKKSHTETFATERKKQLKSAGKLVADGKAADVPSGREGVVRLR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.51
3	0.5
4	0.5
5	0.49
6	0.47
7	0.44
8	0.43
9	0.41
10	0.47
11	0.47
12	0.4
13	0.42
14	0.42
15	0.36
16	0.35
17	0.35
18	0.33
19	0.3
20	0.28
21	0.23
22	0.18
23	0.19
24	0.21
25	0.22
26	0.2
27	0.23
28	0.28
29	0.39
30	0.44
31	0.48
32	0.53
33	0.53
34	0.53
35	0.51
36	0.5
37	0.4
38	0.38
39	0.34
40	0.27
41	0.26
42	0.21
43	0.19
44	0.15
45	0.16
46	0.13
47	0.13
48	0.13
49	0.13
50	0.19
51	0.22
52	0.26
53	0.29
54	0.34
55	0.42
56	0.42
57	0.41
58	0.36
59	0.34
60	0.27
61	0.23
62	0.17
63	0.08
64	0.07
65	0.05
66	0.05
67	0.04
68	0.06
69	0.07
70	0.07
71	0.08
72	0.1
73	0.16
74	0.17
75	0.18
76	0.18
77	0.17
78	0.18
79	0.17
80	0.16
81	0.1
82	0.09
83	0.07
84	0.07
85	0.07
86	0.06
87	0.05
88	0.04
89	0.04
90	0.05
91	0.05
92	0.04
93	0.05
94	0.05
95	0.06
96	0.07
97	0.07
98	0.06
99	0.07
100	0.1
101	0.11
102	0.1
103	0.1
104	0.12
105	0.14
106	0.18
107	0.23
108	0.27
109	0.3
110	0.35
111	0.41
112	0.43
113	0.43
114	0.42
115	0.4
116	0.36
117	0.34
118	0.3
119	0.25
120	0.21
121	0.2
122	0.16
123	0.13
124	0.1
125	0.11
126	0.16
127	0.16
128	0.17
129	0.19
130	0.19
131	0.19
132	0.2
133	0.18
134	0.13
135	0.16
136	0.19
137	0.21
138	0.26
139	0.26
140	0.26
141	0.27
142	0.28
143	0.23
144	0.22
145	0.2
146	0.19
147	0.19
148	0.18
149	0.21
150	0.2
151	0.2
152	0.16
153	0.16
154	0.12
155	0.12
156	0.13
157	0.11
158	0.14
159	0.14
160	0.14
161	0.18
162	0.17
163	0.16
164	0.16
165	0.15
166	0.13
167	0.13
168	0.14
169	0.09
170	0.09
171	0.09
172	0.08
173	0.07
174	0.06
175	0.05
176	0.04
177	0.04
178	0.05
179	0.05
180	0.05
181	0.05
182	0.05
183	0.05
184	0.05
185	0.05
186	0.04
187	0.05
188	0.06
189	0.06
190	0.07
191	0.08
192	0.11
193	0.12
194	0.18
195	0.2
196	0.19
197	0.19
198	0.21
199	0.21
200	0.22
201	0.21
202	0.16
203	0.13
204	0.12
205	0.13
206	0.1
207	0.1
208	0.08
209	0.08
210	0.07
211	0.08
212	0.11
213	0.12
214	0.13
215	0.15
216	0.23
217	0.24
218	0.27
219	0.32
220	0.37
221	0.37
222	0.42
223	0.43
224	0.39
225	0.41
226	0.38
227	0.33
228	0.27
229	0.25
230	0.22
231	0.24
232	0.19
233	0.17
234	0.18
235	0.17
236	0.25
237	0.28
238	0.3
239	0.34
240	0.37
241	0.42
242	0.47
243	0.47
244	0.41
245	0.37
246	0.33
247	0.27
248	0.23
249	0.17
250	0.11
251	0.1
252	0.08
253	0.08
254	0.07
255	0.05
256	0.05
257	0.05
258	0.05
259	0.04
260	0.04
261	0.05
262	0.06
263	0.06
264	0.05
265	0.05
266	0.05
267	0.05
268	0.06
269	0.06
270	0.05
271	0.04
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.04
276	0.03
277	0.03
278	0.03
279	0.05
280	0.07
281	0.08
282	0.13
283	0.19
284	0.26
285	0.34
286	0.41
287	0.51
288	0.59
289	0.66
290	0.7
291	0.75
292	0.74
293	0.69
294	0.65
295	0.54
296	0.46
297	0.39
298	0.29
299	0.18
300	0.12
301	0.09
302	0.07
303	0.07
304	0.06
305	0.07
306	0.08
307	0.08
308	0.11
309	0.11
310	0.16
311	0.18
312	0.19
313	0.19
314	0.21
315	0.22
316	0.22
317	0.22
318	0.17
319	0.16
320	0.14
321	0.12
322	0.14
323	0.12
324	0.12
325	0.12
326	0.11
327	0.11
328	0.11
329	0.11
330	0.07
331	0.07
332	0.06
333	0.06
334	0.06
335	0.06
336	0.06
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.05
341	0.05
342	0.04
343	0.04
344	0.04
345	0.04
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.05
350	0.04
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.06
355	0.05
356	0.07
357	0.08
358	0.09
359	0.09
360	0.13
361	0.15
362	0.15
363	0.17
364	0.17
365	0.16
366	0.16
367	0.17
368	0.13
369	0.12
370	0.11
371	0.11
372	0.1
373	0.1
374	0.11
375	0.09
376	0.1
377	0.11
378	0.12
379	0.11
380	0.13
381	0.14
382	0.14
383	0.13
384	0.13
385	0.12
386	0.11
387	0.11
388	0.08
389	0.06
390	0.06
391	0.08
392	0.06
393	0.05
394	0.08
395	0.09
396	0.1
397	0.13
398	0.13
399	0.15
400	0.16
401	0.17
402	0.15
403	0.16
404	0.17
405	0.16
406	0.16
407	0.15
408	0.15
409	0.16
410	0.15
411	0.15
412	0.14
413	0.12
414	0.14
415	0.14
416	0.15
417	0.17
418	0.17
419	0.18
420	0.2
421	0.22
422	0.2
423	0.21
424	0.19
425	0.17
426	0.17
427	0.15
428	0.15
429	0.15
430	0.22
431	0.23
432	0.28
433	0.3
434	0.3
435	0.3
436	0.37
437	0.4
438	0.41
439	0.42
440	0.42
441	0.42
442	0.41
443	0.41
444	0.34
445	0.29
446	0.22
447	0.2
448	0.23
449	0.25
450	0.31
451	0.4
452	0.46
453	0.52
454	0.56
455	0.59
456	0.61
457	0.67
458	0.71
459	0.68
460	0.68
461	0.63
462	0.59
463	0.62
464	0.6
465	0.56
466	0.49
467	0.42
468	0.36
469	0.35
470	0.33
471	0.26
472	0.22
473	0.17
474	0.19
475	0.19
476	0.18
477	0.2
478	0.22
479	0.23
480	0.21
481	0.27
482	0.27
483	0.27
484	0.3
485	0.3
486	0.32
487	0.42
488	0.49
489	0.52
490	0.57
491	0.66
492	0.73
493	0.81
494	0.86
495	0.86
496	0.88
497	0.86
498	0.87
499	0.89
500	0.88
501	0.82
502	0.77
503	0.7
504	0.61
505	0.55
506	0.48
507	0.41
508	0.37
509	0.34
510	0.3
511	0.26
512	0.24
513	0.21
514	0.19
515	0.16
516	0.11
517	0.12
518	0.13
519	0.14
520	0.16
521	0.17
522	0.16
523	0.18
524	0.2
525	0.23
526	0.28
527	0.3
528	0.35
529	0.35
530	0.37
531	0.37
532	0.4
533	0.42
534	0.42
535	0.47
536	0.48
537	0.5
538	0.53
539	0.55
540	0.53
541	0.51
542	0.52
543	0.52
544	0.55
545	0.6
546	0.61
547	0.66
548	0.69
549	0.65
550	0.66
551	0.65
552	0.64
553	0.64
554	0.67
555	0.66
556	0.68
557	0.74
558	0.74
559	0.69
560	0.62
561	0.59
562	0.58
563	0.58
564	0.56
565	0.54
566	0.56
567	0.6
568	0.62
569	0.62
570	0.63
571	0.65
572	0.65
573	0.68
574	0.68
575	0.6
576	0.6
577	0.58
578	0.52
579	0.43
580	0.36
581	0.28
582	0.24
583	0.22
584	0.2
585	0.19
586	0.17
587	0.17
588	0.19
589	0.17
590	0.15

A0A1E3H9B6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer