Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3HMK0

Protein Details
Accession A0A1E3HMK0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
349-379PARGQEAGQKKKPKSKGKPKERTGEQNQQVPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
356-370GQKKKPKSKGKPKER
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035979  RBD_domain_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
CDD cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MSYNYSNPFQGYQDRPALPQRPYEARPGLGKSQIKVFFTGLPEGLSDRDLLAVLKEDLNLPSTTRVFNAYQPDGFDLGAAIVCVDTVEDAERIRSWYNGKVINHRYTLSVHHVLTHDKKYPSALIEKLHQSSDSKPIITRTPVTPVTPTSNHPIPPKAVAYHQAGQSNGFPTPRVNGHANGNTYGYSPSLQPRAQAQRSRPVPPRPHSANSLTSRIAKAGPSRNRVQPQNGGGKGIAQQQETDPAPGLSLLKRISGGPGSKKSHQQLLLEQQEQNFARSQSQPQPQSQSQNRPSQPRRAHQTRAQRTMTSLRTPQQSSRAKVQRAKERLVNDGMEVDQEVATGNGSGVPARGQEAGQKKKPKSKGKPKERTGEQNQQVPVESKTQEVLDQEMEIWRRGWRFSTGDGNRGNGN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.44
3 0.51
4 0.54
5 0.48
6 0.49
7 0.49
8 0.49
9 0.5
10 0.55
11 0.51
12 0.48
13 0.51
14 0.5
15 0.48
16 0.49
17 0.5
18 0.43
19 0.47
20 0.49
21 0.45
22 0.42
23 0.39
24 0.34
25 0.33
26 0.35
27 0.26
28 0.21
29 0.21
30 0.19
31 0.18
32 0.15
33 0.12
34 0.09
35 0.1
36 0.09
37 0.09
38 0.08
39 0.1
40 0.11
41 0.11
42 0.12
43 0.13
44 0.13
45 0.16
46 0.15
47 0.14
48 0.17
49 0.18
50 0.18
51 0.18
52 0.21
53 0.2
54 0.24
55 0.31
56 0.29
57 0.29
58 0.29
59 0.31
60 0.27
61 0.25
62 0.21
63 0.13
64 0.1
65 0.09
66 0.07
67 0.05
68 0.04
69 0.04
70 0.04
71 0.03
72 0.03
73 0.03
74 0.05
75 0.06
76 0.06
77 0.08
78 0.09
79 0.11
80 0.12
81 0.14
82 0.16
83 0.2
84 0.25
85 0.3
86 0.32
87 0.4
88 0.46
89 0.49
90 0.48
91 0.44
92 0.4
93 0.35
94 0.37
95 0.35
96 0.32
97 0.27
98 0.27
99 0.28
100 0.32
101 0.36
102 0.37
103 0.36
104 0.32
105 0.33
106 0.32
107 0.33
108 0.3
109 0.3
110 0.28
111 0.24
112 0.28
113 0.32
114 0.31
115 0.29
116 0.27
117 0.24
118 0.24
119 0.3
120 0.27
121 0.23
122 0.23
123 0.24
124 0.27
125 0.28
126 0.28
127 0.21
128 0.25
129 0.26
130 0.26
131 0.26
132 0.25
133 0.27
134 0.26
135 0.27
136 0.27
137 0.29
138 0.31
139 0.32
140 0.32
141 0.28
142 0.29
143 0.28
144 0.23
145 0.22
146 0.23
147 0.26
148 0.27
149 0.28
150 0.28
151 0.26
152 0.26
153 0.26
154 0.23
155 0.19
156 0.15
157 0.12
158 0.11
159 0.13
160 0.13
161 0.16
162 0.16
163 0.17
164 0.22
165 0.26
166 0.26
167 0.25
168 0.24
169 0.2
170 0.19
171 0.17
172 0.12
173 0.09
174 0.09
175 0.11
176 0.15
177 0.15
178 0.15
179 0.21
180 0.29
181 0.34
182 0.37
183 0.37
184 0.42
185 0.46
186 0.51
187 0.52
188 0.52
189 0.55
190 0.54
191 0.6
192 0.56
193 0.55
194 0.53
195 0.5
196 0.49
197 0.44
198 0.43
199 0.35
200 0.31
201 0.29
202 0.26
203 0.23
204 0.17
205 0.19
206 0.25
207 0.3
208 0.34
209 0.37
210 0.43
211 0.48
212 0.49
213 0.48
214 0.44
215 0.43
216 0.46
217 0.43
218 0.37
219 0.32
220 0.3
221 0.28
222 0.28
223 0.25
224 0.17
225 0.17
226 0.16
227 0.21
228 0.2
229 0.18
230 0.13
231 0.11
232 0.11
233 0.1
234 0.11
235 0.07
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.11
240 0.11
241 0.12
242 0.15
243 0.18
244 0.21
245 0.29
246 0.33
247 0.36
248 0.42
249 0.43
250 0.46
251 0.46
252 0.42
253 0.4
254 0.44
255 0.47
256 0.43
257 0.42
258 0.36
259 0.38
260 0.36
261 0.32
262 0.25
263 0.19
264 0.2
265 0.22
266 0.27
267 0.29
268 0.37
269 0.39
270 0.41
271 0.47
272 0.47
273 0.54
274 0.56
275 0.58
276 0.57
277 0.63
278 0.64
279 0.67
280 0.68
281 0.69
282 0.7
283 0.68
284 0.71
285 0.69
286 0.71
287 0.69
288 0.75
289 0.75
290 0.75
291 0.7
292 0.61
293 0.57
294 0.58
295 0.55
296 0.49
297 0.44
298 0.4
299 0.43
300 0.45
301 0.45
302 0.47
303 0.5
304 0.49
305 0.55
306 0.58
307 0.6
308 0.63
309 0.68
310 0.69
311 0.67
312 0.68
313 0.63
314 0.58
315 0.56
316 0.53
317 0.45
318 0.35
319 0.31
320 0.25
321 0.2
322 0.18
323 0.13
324 0.09
325 0.08
326 0.08
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.05
331 0.05
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.07
336 0.07
337 0.09
338 0.1
339 0.1
340 0.17
341 0.27
342 0.36
343 0.43
344 0.52
345 0.57
346 0.65
347 0.75
348 0.79
349 0.81
350 0.83
351 0.86
352 0.88
353 0.93
354 0.92
355 0.92
356 0.9
357 0.89
358 0.87
359 0.87
360 0.82
361 0.78
362 0.71
363 0.62
364 0.56
365 0.47
366 0.4
367 0.35
368 0.3
369 0.24
370 0.24
371 0.23
372 0.23
373 0.22
374 0.23
375 0.18
376 0.18
377 0.17
378 0.21
379 0.22
380 0.21
381 0.2
382 0.22
383 0.23
384 0.24
385 0.27
386 0.28
387 0.29
388 0.33
389 0.43
390 0.42
391 0.48
392 0.48