FuNGI

A0A1E3HDQ9

Protein Details

Accession

A0A1E3HDQ9

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
130-149	GVAPRAKMNQQRSRRFRAAQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 13.5, cyto_mito 11.5, mito 8.5, nucl 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MAFQRQSDHLLLHPQTCKSPNMGVPALFRWLSKKYPKIVAKVNEQTPTKVRGPDGELIEEPIRYENPNPNGFEVDNLYLDMNGIVHPCTHPEGKPAPETEEEMMVEIFNYTERVVNMCRPRKVLMMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAQEAADKEEERKEAIELFKAMGHTVSDETANKKGWDTNAITPGTPFMDLLSISLKYWVSHKLSTDPGWKDLKIILSDSSVPGEGEHKIMDWIRRQRSYPTWDANTSHVIYGLDADLIMLSLATHEPNFRVLREDVFAQSSRGPPVCKNCGKAGHIIANCKADKVMKDPNEKKVVEVAKTEELKPFIFLDVSTLREYLAIELNLPGLPFPFDLEVAIDDWIFMIFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDMLLKIWRAELPRMGGYLTNHGKVNLDRAQVILEGLAKAEDEIFQKRKSDEDRQENQQKRRRVDEHRRQDDEKAREEAAKNGTVSLNGTDYVPVQAAATARGGALHPSLPTRPAFDLVPKEEVDAKSASAPASKAAQALGGSNSDIVKNRRAIRMANMSAAQALKAELEGNDGEANAVTDEMAKKAEGKEDADAVVTVQRTEDEEKEQLSKQGAKATLEEQGGDEGVDEDVVPAAIKADEEDGEPPLGDATMAEPEDTEESTEAPRKRKRGSDGEDDGDASEDDDVEAPPNPEADQPVPKKKLNVNPDGTVDYVDDVRLWEPGYRERYYEQKFGVSSTDRSLIDTVTKCYMEGLCWVLEYYYQGVPAWDWYYPYHYAPFAQDFQNIDQFDIKFEVSQPFKPFAQLLGVFPAASRIHLPDPLQTLMISEDSPILDFYPPDFEIDMNGKKMAWQGVALLPFIDQKRLLDALSSKEPELTDDEKRRNSWGDQVMFISSKNDLYDGFCDKLYGLRAKDVVKPMPIDTTASHGITGTVLADPNCVPNATFDSPLPTIEACPDVNPNDSLSVRYFFPRQSHPHRSVLLKNFKPAPPRLTESDKDFVRRGGQGGGRGGRGGHRGGGGYNQPTGGPGMGRGRYESGPHQRGQGYGQAPAPRQDYGAPQTHGYAPPPRPVAAYGAPAGGYGYQNPYAAAPPAPYGGGGYGAPPSAAYGAPYGGARPPFPPTQTPYGGPPAGGYGGGYGAPPRGGGAYNPYGGQSGAYQPRNGGAPPSRRY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.41
3	0.42
4	0.42
5	0.37
6	0.41
7	0.39
8	0.42
9	0.43
10	0.39
11	0.39
12	0.39
13	0.4
14	0.33
15	0.3
16	0.27
17	0.29
18	0.35
19	0.41
20	0.46
21	0.48
22	0.58
23	0.64
24	0.67
25	0.72
26	0.7
27	0.71
28	0.73
29	0.72
30	0.69
31	0.65
32	0.62
33	0.57
34	0.57
35	0.51
36	0.46
37	0.42
38	0.4
39	0.44
40	0.45
41	0.44
42	0.41
43	0.37
44	0.38
45	0.37
46	0.31
47	0.27
48	0.23
49	0.21
50	0.19
51	0.23
52	0.27
53	0.33
54	0.39
55	0.4
56	0.4
57	0.42
58	0.39
59	0.37
60	0.33
61	0.28
62	0.22
63	0.21
64	0.19
65	0.15
66	0.15
67	0.13
68	0.09
69	0.08
70	0.08
71	0.08
72	0.09
73	0.09
74	0.12
75	0.16
76	0.2
77	0.2
78	0.26
79	0.32
80	0.35
81	0.4
82	0.39
83	0.39
84	0.38
85	0.41
86	0.35
87	0.32
88	0.27
89	0.23
90	0.21
91	0.16
92	0.14
93	0.1
94	0.09
95	0.07
96	0.07
97	0.07
98	0.09
99	0.1
100	0.13
101	0.16
102	0.24
103	0.34
104	0.41
105	0.45
106	0.46
107	0.48
108	0.49
109	0.49
110	0.47
111	0.42
112	0.39
113	0.36
114	0.33
115	0.32
116	0.27
117	0.25
118	0.2
119	0.15
120	0.1
121	0.13
122	0.19
123	0.26
124	0.36
125	0.45
126	0.55
127	0.65
128	0.73
129	0.79
130	0.81
131	0.77
132	0.74
133	0.74
134	0.71
135	0.67
136	0.68
137	0.61
138	0.57
139	0.56
140	0.5
141	0.42
142	0.39
143	0.33
144	0.26
145	0.23
146	0.21
147	0.22
148	0.24
149	0.24
150	0.21
151	0.21
152	0.21
153	0.21
154	0.2
155	0.15
156	0.14
157	0.12
158	0.12
159	0.12
160	0.12
161	0.14
162	0.17
163	0.2
164	0.23
165	0.22
166	0.22
167	0.25
168	0.24
169	0.29
170	0.3
171	0.33
172	0.37
173	0.38
174	0.36
175	0.33
176	0.32
177	0.27
178	0.22
179	0.15
180	0.09
181	0.1
182	0.09
183	0.1
184	0.11
185	0.1
186	0.1
187	0.13
188	0.13
189	0.12
190	0.14
191	0.2
192	0.22
193	0.24
194	0.26
195	0.28
196	0.32
197	0.36
198	0.43
199	0.39
200	0.4
201	0.41
202	0.39
203	0.36
204	0.34
205	0.33
206	0.27
207	0.25
208	0.21
209	0.19
210	0.21
211	0.2
212	0.18
213	0.15
214	0.13
215	0.12
216	0.13
217	0.11
218	0.11
219	0.11
220	0.09
221	0.12
222	0.15
223	0.19
224	0.25
225	0.34
226	0.4
227	0.44
228	0.45
229	0.49
230	0.54
231	0.57
232	0.57
233	0.56
234	0.53
235	0.53
236	0.53
237	0.49
238	0.46
239	0.39
240	0.31
241	0.25
242	0.2
243	0.16
244	0.16
245	0.13
246	0.08
247	0.07
248	0.06
249	0.05
250	0.05
251	0.04
252	0.03
253	0.02
254	0.03
255	0.04
256	0.05
257	0.06
258	0.07
259	0.08
260	0.14
261	0.15
262	0.15
263	0.19
264	0.19
265	0.21
266	0.22
267	0.23
268	0.19
269	0.21
270	0.21
271	0.18
272	0.2
273	0.2
274	0.21
275	0.22
276	0.22
277	0.23
278	0.31
279	0.39
280	0.41
281	0.42
282	0.44
283	0.48
284	0.48
285	0.49
286	0.45
287	0.44
288	0.42
289	0.42
290	0.4
291	0.4
292	0.37
293	0.33
294	0.29
295	0.24
296	0.23
297	0.25
298	0.31
299	0.32
300	0.43
301	0.48
302	0.55
303	0.6
304	0.59
305	0.54
306	0.52
307	0.49
308	0.41
309	0.38
310	0.34
311	0.33
312	0.35
313	0.35
314	0.3
315	0.28
316	0.26
317	0.25
318	0.22
319	0.15
320	0.14
321	0.12
322	0.14
323	0.14
324	0.16
325	0.15
326	0.14
327	0.14
328	0.14
329	0.14
330	0.11
331	0.13
332	0.1
333	0.1
334	0.1
335	0.11
336	0.11
337	0.1
338	0.09
339	0.06
340	0.07
341	0.06
342	0.07
343	0.07
344	0.07
345	0.07
346	0.08
347	0.08
348	0.08
349	0.08
350	0.07
351	0.06
352	0.06
353	0.05
354	0.05
355	0.04
356	0.04
357	0.03
358	0.03
359	0.04
360	0.05
361	0.05
362	0.05
363	0.07
364	0.07
365	0.07
366	0.08
367	0.08
368	0.07
369	0.08
370	0.12
371	0.12
372	0.12
373	0.11
374	0.12
375	0.11
376	0.11
377	0.1
378	0.07
379	0.05
380	0.06
381	0.06
382	0.06
383	0.06
384	0.07
385	0.09
386	0.11
387	0.12
388	0.13
389	0.16
390	0.17
391	0.17
392	0.17
393	0.17
394	0.16
395	0.22
396	0.22
397	0.21
398	0.21
399	0.21
400	0.22
401	0.2
402	0.26
403	0.22
404	0.21
405	0.19
406	0.19
407	0.19
408	0.17
409	0.17
410	0.11
411	0.07
412	0.06
413	0.06
414	0.06
415	0.05
416	0.05
417	0.05
418	0.06
419	0.08
420	0.13
421	0.16
422	0.18
423	0.2
424	0.21
425	0.25
426	0.3
427	0.38
428	0.42
429	0.48
430	0.53
431	0.59
432	0.69
433	0.72
434	0.75
435	0.73
436	0.71
437	0.64
438	0.67
439	0.65
440	0.66
441	0.7
442	0.71
443	0.75
444	0.77
445	0.79
446	0.72
447	0.72
448	0.7
449	0.63
450	0.57
451	0.48
452	0.41
453	0.39
454	0.38
455	0.35
456	0.3
457	0.27
458	0.23
459	0.21
460	0.2
461	0.16
462	0.16
463	0.12
464	0.1
465	0.08
466	0.08
467	0.07
468	0.07
469	0.07
470	0.07
471	0.06
472	0.05
473	0.06
474	0.06
475	0.07
476	0.07
477	0.06
478	0.06
479	0.06
480	0.07
481	0.06
482	0.06
483	0.06
484	0.07
485	0.08
486	0.09
487	0.1
488	0.11
489	0.12
490	0.12
491	0.13
492	0.13
493	0.16
494	0.19
495	0.2
496	0.22
497	0.19
498	0.2
499	0.22
500	0.22
501	0.2
502	0.16
503	0.14
504	0.13
505	0.13
506	0.13
507	0.1
508	0.1
509	0.08
510	0.1
511	0.1
512	0.09
513	0.08
514	0.09
515	0.08
516	0.09
517	0.09
518	0.07
519	0.07
520	0.07
521	0.07
522	0.07
523	0.1
524	0.12
525	0.15
526	0.19
527	0.23
528	0.25
529	0.26
530	0.26
531	0.29
532	0.35
533	0.32
534	0.29
535	0.26
536	0.23
537	0.23
538	0.21
539	0.16
540	0.08
541	0.07
542	0.05
543	0.05
544	0.05
545	0.04
546	0.06
547	0.06
548	0.06
549	0.06
550	0.06
551	0.06
552	0.05
553	0.05
554	0.04
555	0.04
556	0.03
557	0.04
558	0.04
559	0.05
560	0.05
561	0.05
562	0.06
563	0.07
564	0.1
565	0.1
566	0.11
567	0.11
568	0.12
569	0.12
570	0.11
571	0.1
572	0.08
573	0.08
574	0.07
575	0.06
576	0.06
577	0.06
578	0.07
579	0.09
580	0.1
581	0.11
582	0.12
583	0.13
584	0.15
585	0.16
586	0.16
587	0.16
588	0.17
589	0.15
590	0.19
591	0.2
592	0.18
593	0.19
594	0.18
595	0.21
596	0.18
597	0.17
598	0.13
599	0.12
600	0.11
601	0.09
602	0.08
603	0.04
604	0.04
605	0.04
606	0.03
607	0.03
608	0.03
609	0.03
610	0.03
611	0.02
612	0.03
613	0.03
614	0.03
615	0.03
616	0.04
617	0.05
618	0.05
619	0.06
620	0.06
621	0.07
622	0.06
623	0.06
624	0.05
625	0.05
626	0.04
627	0.03
628	0.03
629	0.05
630	0.05
631	0.05
632	0.05
633	0.06
634	0.07
635	0.07
636	0.07
637	0.05
638	0.06
639	0.08
640	0.14
641	0.16
642	0.23
643	0.28
644	0.33
645	0.37
646	0.42
647	0.48
648	0.52
649	0.55
650	0.57
651	0.57
652	0.54
653	0.5
654	0.44
655	0.37
656	0.27
657	0.21
658	0.11
659	0.07
660	0.05
661	0.04
662	0.05
663	0.04
664	0.05
665	0.06
666	0.06
667	0.06
668	0.07
669	0.07
670	0.07
671	0.1
672	0.11
673	0.18
674	0.23
675	0.32
676	0.36
677	0.37
678	0.41
679	0.45
680	0.51
681	0.5
682	0.54
683	0.49
684	0.47
685	0.48
686	0.44
687	0.38
688	0.31
689	0.23
690	0.15
691	0.11
692	0.09
693	0.07
694	0.06
695	0.06
696	0.06
697	0.07
698	0.08
699	0.09
700	0.15
701	0.21
702	0.21
703	0.22
704	0.23
705	0.32
706	0.34
707	0.37
708	0.32
709	0.3
710	0.29
711	0.28
712	0.3
713	0.24
714	0.21
715	0.18
716	0.22
717	0.19
718	0.2
719	0.19
720	0.16
721	0.19
722	0.19
723	0.19
724	0.17
725	0.17
726	0.16
727	0.16
728	0.16
729	0.12
730	0.12
731	0.12
732	0.09
733	0.09
734	0.09
735	0.08
736	0.08
737	0.09
738	0.09
739	0.08
740	0.08
741	0.08
742	0.08
743	0.09
744	0.1
745	0.1
746	0.08
747	0.09
748	0.1
749	0.14
750	0.16
751	0.17
752	0.16
753	0.15
754	0.16
755	0.17
756	0.2
757	0.18
758	0.18
759	0.19
760	0.19
761	0.21
762	0.26
763	0.23
764	0.21
765	0.22
766	0.2
767	0.19
768	0.19
769	0.17
770	0.12
771	0.13
772	0.18
773	0.18
774	0.22
775	0.24
776	0.25
777	0.25
778	0.26
779	0.25
780	0.2
781	0.22
782	0.19
783	0.17
784	0.17
785	0.17
786	0.15
787	0.15
788	0.18
789	0.13
790	0.12
791	0.12
792	0.12
793	0.13
794	0.16
795	0.17
796	0.16
797	0.2
798	0.2
799	0.2
800	0.17
801	0.16
802	0.14
803	0.14
804	0.11
805	0.08
806	0.08
807	0.08
808	0.08
809	0.08
810	0.07
811	0.07
812	0.07
813	0.08
814	0.11
815	0.11
816	0.12
817	0.12
818	0.11
819	0.13
820	0.18
821	0.2
822	0.17
823	0.17
824	0.15
825	0.16
826	0.19
827	0.18
828	0.14
829	0.12
830	0.13
831	0.15
832	0.17
833	0.16
834	0.13
835	0.11
836	0.15
837	0.15
838	0.15
839	0.13
840	0.12
841	0.15
842	0.16
843	0.16
844	0.14
845	0.16
846	0.19
847	0.24
848	0.25
849	0.22
850	0.23
851	0.23
852	0.22
853	0.25
854	0.24
855	0.27
856	0.33
857	0.39
858	0.41
859	0.43
860	0.44
861	0.43
862	0.41
863	0.41
864	0.41
865	0.37
866	0.35
867	0.35
868	0.33
869	0.3
870	0.28
871	0.21
872	0.14
873	0.13
874	0.11
875	0.11
876	0.09
877	0.11
878	0.15
879	0.17
880	0.18
881	0.17
882	0.17
883	0.16
884	0.19
885	0.21
886	0.23
887	0.2
888	0.22
889	0.25
890	0.27
891	0.33
892	0.35
893	0.34
894	0.32
895	0.32
896	0.3
897	0.3
898	0.28
899	0.25
900	0.2
901	0.22
902	0.22
903	0.21
904	0.2
905	0.16
906	0.16
907	0.14
908	0.14
909	0.08
910	0.06
911	0.07
912	0.07
913	0.09
914	0.09
915	0.11
916	0.11
917	0.11
918	0.1
919	0.11
920	0.18
921	0.19
922	0.2
923	0.18
924	0.23
925	0.23
926	0.23
927	0.23
928	0.16
929	0.15
930	0.15
931	0.17
932	0.12
933	0.13
934	0.16
935	0.16
936	0.18
937	0.18
938	0.18
939	0.19
940	0.19
941	0.2
942	0.19
943	0.19
944	0.18
945	0.21
946	0.22
947	0.22
948	0.27
949	0.32
950	0.39
951	0.47
952	0.55
953	0.57
954	0.61
955	0.62
956	0.63
957	0.63
958	0.65
959	0.66
960	0.59
961	0.6
962	0.6
963	0.59
964	0.61
965	0.57
966	0.53
967	0.48
968	0.51
969	0.51
970	0.52
971	0.52
972	0.51
973	0.53
974	0.5
975	0.48
976	0.44
977	0.4
978	0.37
979	0.35
980	0.3
981	0.3
982	0.3
983	0.3
984	0.35
985	0.35
986	0.31
987	0.3
988	0.29
989	0.26
990	0.26
991	0.23
992	0.19
993	0.17
994	0.17
995	0.18
996	0.22
997	0.23
998	0.22
999	0.22
1000	0.2
1001	0.19
1002	0.19
1003	0.19
1004	0.16
1005	0.11
1006	0.12
1007	0.18
1008	0.2
1009	0.21
1010	0.23
1011	0.25
1012	0.26
1013	0.29
1014	0.34
1015	0.39
1016	0.41
1017	0.41
1018	0.45
1019	0.42
1020	0.42
1021	0.41
1022	0.4
1023	0.31
1024	0.3
1025	0.33
1026	0.33
1027	0.33
1028	0.36
1029	0.36
1030	0.29
1031	0.29
1032	0.27
1033	0.29
1034	0.3
1035	0.35
1036	0.33
1037	0.31
1038	0.33
1039	0.36
1040	0.36
1041	0.33
1042	0.36
1043	0.32
1044	0.37
1045	0.39
1046	0.37
1047	0.35
1048	0.34
1049	0.36
1050	0.31
1051	0.31
1052	0.25
1053	0.23
1054	0.22
1055	0.2
1056	0.19
1057	0.15
1058	0.13
1059	0.11
1060	0.14
1061	0.15
1062	0.16
1063	0.16
1064	0.17
1065	0.17
1066	0.18
1067	0.17
1068	0.14
1069	0.14
1070	0.15
1071	0.15
1072	0.13
1073	0.12
1074	0.11
1075	0.11
1076	0.1
1077	0.1
1078	0.1
1079	0.1
1080	0.09
1081	0.08
1082	0.09
1083	0.09
1084	0.09
1085	0.09
1086	0.09
1087	0.09
1088	0.11
1089	0.11
1090	0.11
1091	0.14
1092	0.16
1093	0.17
1094	0.18
1095	0.23
1096	0.26
1097	0.3
1098	0.35
1099	0.37
1100	0.42
1101	0.45
1102	0.45
1103	0.45
1104	0.48
1105	0.44
1106	0.38
1107	0.32
1108	0.27
1109	0.23
1110	0.21
1111	0.16
1112	0.09
1113	0.1
1114	0.1
1115	0.09
1116	0.08
1117	0.09
1118	0.09
1119	0.09
1120	0.09
1121	0.1
1122	0.11
1123	0.12
1124	0.18
1125	0.21
1126	0.23
1127	0.23
1128	0.23
1129	0.22
1130	0.21
1131	0.21
1132	0.16
1133	0.2
1134	0.27
1135	0.3
1136	0.3
1137	0.3
1138	0.32
1139	0.34
1140	0.32
1141	0.32
1142	0.31

A0A1E3HDQ9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer