Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3HK90

Protein Details
Accession A0A1E3HK90    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-39SESCKRPSLTPPPPPKRAKKLPSLPATFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-30PKRAK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027521  Usb1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016829  F:lyase activity  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0034477  P:U6 snRNA 3'-end processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09749  HVSL  
Amino Acid Sequences MALVDYSSESDSESCKRPSLTPPPPPKRAKKLPSLPATFDTAPKDDPSLHQGRTRSRPFVDGEYNTHVYLSLAIPPLLLSTLKELLSSFPSTTNPLHSLLPDLHISLTRPLPLRRHQTKSFTDDLKAKLAKEVPAFRLSLAGRVKEYFSEVHVENGQGRGFLALRVGAGAAELKEVVDKTLDPLLKISHLPTYHNNPEFHTSFAWTLRGQEETMVLGDALDEEVERPTEKCLFSQELLDKINDRFEERLLAAQPTGGWLIDSIELKISKDITAIPLRMP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.26
3 0.29
4 0.31
5 0.4
6 0.47
7 0.52
8 0.57
9 0.66
10 0.72
11 0.8
12 0.85
13 0.86
14 0.85
15 0.86
16 0.83
17 0.83
18 0.84
19 0.84
20 0.84
21 0.8
22 0.73
23 0.65
24 0.64
25 0.54
26 0.47
27 0.41
28 0.34
29 0.3
30 0.27
31 0.26
32 0.21
33 0.22
34 0.27
35 0.28
36 0.29
37 0.32
38 0.35
39 0.42
40 0.5
41 0.53
42 0.51
43 0.47
44 0.49
45 0.47
46 0.49
47 0.48
48 0.41
49 0.4
50 0.41
51 0.41
52 0.37
53 0.33
54 0.27
55 0.2
56 0.19
57 0.15
58 0.12
59 0.11
60 0.11
61 0.11
62 0.11
63 0.11
64 0.1
65 0.09
66 0.06
67 0.08
68 0.11
69 0.11
70 0.11
71 0.11
72 0.12
73 0.15
74 0.16
75 0.14
76 0.13
77 0.14
78 0.17
79 0.17
80 0.19
81 0.18
82 0.18
83 0.18
84 0.17
85 0.18
86 0.15
87 0.17
88 0.14
89 0.12
90 0.11
91 0.11
92 0.12
93 0.12
94 0.12
95 0.13
96 0.15
97 0.18
98 0.23
99 0.29
100 0.38
101 0.43
102 0.5
103 0.52
104 0.56
105 0.58
106 0.58
107 0.57
108 0.48
109 0.43
110 0.4
111 0.37
112 0.36
113 0.32
114 0.27
115 0.24
116 0.24
117 0.25
118 0.24
119 0.25
120 0.22
121 0.23
122 0.23
123 0.2
124 0.22
125 0.19
126 0.22
127 0.2
128 0.18
129 0.17
130 0.17
131 0.18
132 0.14
133 0.15
134 0.1
135 0.09
136 0.12
137 0.11
138 0.13
139 0.13
140 0.13
141 0.12
142 0.13
143 0.12
144 0.08
145 0.08
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.07
167 0.12
168 0.12
169 0.12
170 0.13
171 0.13
172 0.14
173 0.15
174 0.14
175 0.14
176 0.15
177 0.18
178 0.22
179 0.29
180 0.35
181 0.4
182 0.4
183 0.37
184 0.42
185 0.4
186 0.37
187 0.3
188 0.24
189 0.21
190 0.22
191 0.21
192 0.16
193 0.17
194 0.16
195 0.17
196 0.15
197 0.14
198 0.13
199 0.12
200 0.12
201 0.1
202 0.08
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.05
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.06
212 0.07
213 0.07
214 0.11
215 0.15
216 0.16
217 0.17
218 0.21
219 0.25
220 0.25
221 0.31
222 0.32
223 0.32
224 0.33
225 0.33
226 0.3
227 0.27
228 0.31
229 0.26
230 0.25
231 0.22
232 0.21
233 0.25
234 0.23
235 0.26
236 0.23
237 0.23
238 0.2
239 0.19
240 0.18
241 0.16
242 0.15
243 0.11
244 0.09
245 0.08
246 0.1
247 0.12
248 0.13
249 0.12
250 0.16
251 0.17
252 0.18
253 0.2
254 0.19
255 0.16
256 0.16
257 0.17
258 0.19
259 0.25