Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3H994

Protein Details
Accession A0A1E3H994    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-59EKEPTKAFVKAKKKDKPFHFPSHPTRHISBasic
180-201VEGKESKKAKQKPEPKAPNEFPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-44AKKK
180-195VEGKESKKAKQKPEPK
Subcellular Location(s) cyto 13.5cyto_mito 13.5, mito 12.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR001406  PsdUridine_synth_TruA  
IPR020097  PsdUridine_synth_TruA_a/b_dom  
IPR020095  PsdUridine_synth_TruA_C  
IPR020094  TruA/RsuA/RluB/E/F_N  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01416  PseudoU_synth_1  
Amino Acid Sequences MSKYASWSKDQLLQKLVALEDASNPPPPAVEKEPTKAFVKAKKKDKPFHFPSHPTRHISLLISYTGWPYSGLALQAPPTPHPNYPPKSALPDEITTVEGELLKALEKTRLIEEGKGWEGCEFARCGRTDRGVSGDGQVVDLWVRSNRAEGDGGGELGDGWRPAREPAPPKPPVAEEEKEVEGKESKKAKQKPEPKAPNEFPYPKLLNSLLPPGIRVLGWSPLPAAFSSRFSCTQRHYRYAFHRLPTPTSPPLDLELMRQGAALLKGEHDFRNFCKLDGSKQIENHSRRVLDAWFAEEEQGMGKEWVVFNLVGTAFLWHQVRHIIAILFIIGSKLEPPSLVSSLLDTEKFPGKPSYAMGHPLPLTLFECGYAEGDVDWRFGTYDGPWRGLSEEEKKGLYESAMGGREGLERQLAVAHQEAELKAWHIAAPLRKLHSLYGPVLAEKAVKAEEKNGKGKEQKVWPVGGGEYGQTGKWVPVLERTQGATPEEVNEKYRETKGKARAERKAVEGEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.4
3 0.36
4 0.29
5 0.24
6 0.19
7 0.19
8 0.22
9 0.22
10 0.22
11 0.22
12 0.2
13 0.21
14 0.23
15 0.25
16 0.26
17 0.32
18 0.34
19 0.4
20 0.45
21 0.48
22 0.48
23 0.48
24 0.49
25 0.51
26 0.56
27 0.59
28 0.65
29 0.71
30 0.78
31 0.82
32 0.85
33 0.86
34 0.84
35 0.85
36 0.84
37 0.84
38 0.84
39 0.85
40 0.82
41 0.77
42 0.7
43 0.63
44 0.57
45 0.49
46 0.41
47 0.33
48 0.28
49 0.23
50 0.22
51 0.2
52 0.17
53 0.15
54 0.12
55 0.1
56 0.11
57 0.11
58 0.11
59 0.11
60 0.12
61 0.13
62 0.16
63 0.17
64 0.18
65 0.21
66 0.24
67 0.25
68 0.32
69 0.4
70 0.41
71 0.46
72 0.49
73 0.47
74 0.5
75 0.5
76 0.48
77 0.43
78 0.39
79 0.35
80 0.32
81 0.29
82 0.22
83 0.2
84 0.16
85 0.12
86 0.1
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.08
91 0.09
92 0.11
93 0.12
94 0.14
95 0.16
96 0.21
97 0.22
98 0.22
99 0.24
100 0.25
101 0.28
102 0.26
103 0.25
104 0.19
105 0.18
106 0.17
107 0.17
108 0.14
109 0.12
110 0.17
111 0.17
112 0.22
113 0.25
114 0.29
115 0.29
116 0.28
117 0.31
118 0.28
119 0.28
120 0.25
121 0.24
122 0.19
123 0.18
124 0.16
125 0.12
126 0.11
127 0.1
128 0.09
129 0.07
130 0.09
131 0.08
132 0.11
133 0.11
134 0.13
135 0.14
136 0.12
137 0.14
138 0.13
139 0.13
140 0.11
141 0.1
142 0.08
143 0.08
144 0.08
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.06
149 0.08
150 0.1
151 0.16
152 0.22
153 0.29
154 0.38
155 0.41
156 0.41
157 0.42
158 0.41
159 0.38
160 0.39
161 0.32
162 0.25
163 0.26
164 0.27
165 0.26
166 0.24
167 0.23
168 0.19
169 0.19
170 0.24
171 0.27
172 0.31
173 0.39
174 0.47
175 0.54
176 0.61
177 0.7
178 0.73
179 0.78
180 0.82
181 0.78
182 0.8
183 0.74
184 0.7
185 0.67
186 0.6
187 0.5
188 0.48
189 0.44
190 0.35
191 0.34
192 0.3
193 0.24
194 0.22
195 0.24
196 0.19
197 0.17
198 0.18
199 0.15
200 0.15
201 0.13
202 0.12
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.1
210 0.09
211 0.11
212 0.09
213 0.12
214 0.13
215 0.16
216 0.19
217 0.2
218 0.23
219 0.25
220 0.34
221 0.37
222 0.41
223 0.41
224 0.44
225 0.49
226 0.55
227 0.55
228 0.46
229 0.48
230 0.43
231 0.44
232 0.41
233 0.39
234 0.33
235 0.3
236 0.29
237 0.23
238 0.23
239 0.21
240 0.18
241 0.14
242 0.14
243 0.13
244 0.12
245 0.11
246 0.09
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.06
251 0.07
252 0.08
253 0.1
254 0.11
255 0.11
256 0.12
257 0.13
258 0.21
259 0.21
260 0.2
261 0.23
262 0.23
263 0.25
264 0.33
265 0.38
266 0.32
267 0.34
268 0.4
269 0.43
270 0.45
271 0.45
272 0.39
273 0.33
274 0.31
275 0.3
276 0.25
277 0.19
278 0.17
279 0.15
280 0.13
281 0.12
282 0.12
283 0.1
284 0.1
285 0.08
286 0.08
287 0.06
288 0.05
289 0.05
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.08
294 0.07
295 0.07
296 0.09
297 0.09
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.07
302 0.1
303 0.11
304 0.08
305 0.09
306 0.11
307 0.11
308 0.1
309 0.12
310 0.09
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.06
315 0.06
316 0.05
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.07
324 0.1
325 0.11
326 0.11
327 0.1
328 0.11
329 0.13
330 0.14
331 0.13
332 0.1
333 0.12
334 0.16
335 0.16
336 0.18
337 0.18
338 0.18
339 0.19
340 0.21
341 0.22
342 0.19
343 0.23
344 0.21
345 0.22
346 0.21
347 0.2
348 0.18
349 0.16
350 0.15
351 0.12
352 0.11
353 0.08
354 0.09
355 0.09
356 0.09
357 0.08
358 0.07
359 0.06
360 0.09
361 0.09
362 0.09
363 0.08
364 0.08
365 0.08
366 0.08
367 0.09
368 0.09
369 0.17
370 0.19
371 0.21
372 0.21
373 0.22
374 0.23
375 0.24
376 0.27
377 0.25
378 0.28
379 0.27
380 0.28
381 0.27
382 0.27
383 0.26
384 0.21
385 0.15
386 0.13
387 0.16
388 0.17
389 0.16
390 0.15
391 0.15
392 0.17
393 0.16
394 0.15
395 0.1
396 0.09
397 0.09
398 0.11
399 0.1
400 0.11
401 0.12
402 0.12
403 0.12
404 0.14
405 0.14
406 0.14
407 0.14
408 0.14
409 0.12
410 0.12
411 0.12
412 0.11
413 0.15
414 0.19
415 0.24
416 0.28
417 0.31
418 0.32
419 0.33
420 0.33
421 0.35
422 0.34
423 0.3
424 0.31
425 0.28
426 0.26
427 0.25
428 0.24
429 0.19
430 0.15
431 0.15
432 0.12
433 0.14
434 0.14
435 0.23
436 0.31
437 0.37
438 0.45
439 0.46
440 0.51
441 0.56
442 0.6
443 0.6
444 0.6
445 0.63
446 0.59
447 0.58
448 0.52
449 0.47
450 0.42
451 0.36
452 0.27
453 0.18
454 0.16
455 0.15
456 0.14
457 0.12
458 0.13
459 0.11
460 0.13
461 0.14
462 0.13
463 0.21
464 0.24
465 0.27
466 0.29
467 0.31
468 0.32
469 0.33
470 0.34
471 0.27
472 0.24
473 0.25
474 0.27
475 0.27
476 0.27
477 0.26
478 0.28
479 0.31
480 0.37
481 0.41
482 0.42
483 0.49
484 0.56
485 0.64
486 0.71
487 0.75
488 0.78
489 0.79
490 0.77
491 0.73