Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GCP9

Protein Details
Accession C1GCP9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
93-112KEPQQARDKARKKTEQSRESHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
96-105QQARDKARKK
125-129KPGSR
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 7, cyto 4, plas 1, extr 1, pero 1, golg 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024461  CCDC90-like  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005739  C:mitochondrion  
KEGG pbn:PADG_04771  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07798  CCDC90-like  
Amino Acid Sequences MAAPRLPFLYPNLFRSVRACEPKTYHPIRFPPSQPQQQLQKNGGSYATFHTSRRCDVEPFHQRYGQAAESRLPPPQRPKDGGRVGSQKGVVGKEPQQARDKARKKTEQSRESGSQDLKDSGKGTKPGSRKKQSSSSTNILVELSVQGDSGGVNVQNGTGSSGGSAPATDDPNINPSKGNQSSVFQMPGPNPSSSQQDESLTQITLSNGHHQLPHPSSLTYAHLFDTYSLVKDLGRSGFTEEQSVSIMKAIRGLLADNFEMAREGLVSKSDVENETYLFQAACSELRNSLQASRNAEIQAQRSQRVQLQHEVDILTQLVTQELAGLKDDLKEMFNDQKISTRELQRSFDTAIQELNYQITVSLNSDGKSEVEGLRWILTRRAALAIATSAGMIILALRYFLYKLHEKDQVVKGSQAESKTIPQPFPDLELKSNFRPESSVTEPIG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.41
3 0.43
4 0.42
5 0.48
6 0.47
7 0.47
8 0.52
9 0.59
10 0.66
11 0.66
12 0.63
13 0.62
14 0.67
15 0.66
16 0.69
17 0.65
18 0.65
19 0.68
20 0.71
21 0.68
22 0.67
23 0.71
24 0.71
25 0.75
26 0.68
27 0.64
28 0.55
29 0.51
30 0.45
31 0.36
32 0.3
33 0.27
34 0.29
35 0.25
36 0.25
37 0.31
38 0.33
39 0.36
40 0.4
41 0.38
42 0.35
43 0.38
44 0.47
45 0.51
46 0.54
47 0.55
48 0.52
49 0.5
50 0.49
51 0.49
52 0.44
53 0.37
54 0.31
55 0.3
56 0.32
57 0.33
58 0.36
59 0.34
60 0.35
61 0.42
62 0.5
63 0.54
64 0.55
65 0.6
66 0.64
67 0.69
68 0.67
69 0.64
70 0.62
71 0.57
72 0.55
73 0.5
74 0.42
75 0.36
76 0.34
77 0.28
78 0.26
79 0.29
80 0.31
81 0.34
82 0.38
83 0.41
84 0.45
85 0.5
86 0.57
87 0.59
88 0.62
89 0.68
90 0.72
91 0.73
92 0.79
93 0.82
94 0.79
95 0.76
96 0.75
97 0.71
98 0.65
99 0.62
100 0.53
101 0.45
102 0.38
103 0.37
104 0.29
105 0.26
106 0.24
107 0.21
108 0.24
109 0.26
110 0.26
111 0.31
112 0.38
113 0.47
114 0.56
115 0.62
116 0.63
117 0.66
118 0.73
119 0.72
120 0.7
121 0.67
122 0.62
123 0.57
124 0.52
125 0.46
126 0.36
127 0.3
128 0.23
129 0.16
130 0.11
131 0.07
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.04
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.06
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.08
154 0.09
155 0.09
156 0.1
157 0.1
158 0.16
159 0.17
160 0.16
161 0.14
162 0.14
163 0.22
164 0.23
165 0.25
166 0.21
167 0.21
168 0.24
169 0.26
170 0.25
171 0.17
172 0.18
173 0.16
174 0.2
175 0.21
176 0.18
177 0.17
178 0.18
179 0.22
180 0.21
181 0.23
182 0.2
183 0.19
184 0.19
185 0.2
186 0.19
187 0.15
188 0.13
189 0.11
190 0.1
191 0.11
192 0.11
193 0.14
194 0.14
195 0.14
196 0.16
197 0.16
198 0.21
199 0.2
200 0.22
201 0.18
202 0.17
203 0.17
204 0.17
205 0.19
206 0.15
207 0.14
208 0.12
209 0.11
210 0.11
211 0.1
212 0.11
213 0.09
214 0.09
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.1
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.13
224 0.16
225 0.16
226 0.17
227 0.15
228 0.14
229 0.15
230 0.15
231 0.1
232 0.09
233 0.1
234 0.08
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.09
241 0.1
242 0.1
243 0.08
244 0.08
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.06
249 0.04
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.06
254 0.07
255 0.08
256 0.09
257 0.1
258 0.11
259 0.11
260 0.11
261 0.11
262 0.1
263 0.1
264 0.08
265 0.08
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.08
271 0.09
272 0.1
273 0.11
274 0.12
275 0.17
276 0.22
277 0.24
278 0.28
279 0.28
280 0.3
281 0.29
282 0.31
283 0.28
284 0.26
285 0.29
286 0.27
287 0.28
288 0.27
289 0.28
290 0.3
291 0.33
292 0.33
293 0.33
294 0.34
295 0.33
296 0.33
297 0.31
298 0.28
299 0.22
300 0.19
301 0.12
302 0.09
303 0.08
304 0.06
305 0.05
306 0.05
307 0.06
308 0.07
309 0.07
310 0.08
311 0.08
312 0.09
313 0.1
314 0.11
315 0.1
316 0.1
317 0.11
318 0.13
319 0.19
320 0.21
321 0.22
322 0.22
323 0.28
324 0.29
325 0.33
326 0.37
327 0.38
328 0.42
329 0.44
330 0.47
331 0.43
332 0.44
333 0.41
334 0.38
335 0.33
336 0.27
337 0.24
338 0.21
339 0.2
340 0.17
341 0.15
342 0.12
343 0.09
344 0.09
345 0.08
346 0.08
347 0.09
348 0.12
349 0.13
350 0.13
351 0.14
352 0.14
353 0.14
354 0.14
355 0.15
356 0.13
357 0.13
358 0.14
359 0.14
360 0.17
361 0.19
362 0.19
363 0.2
364 0.21
365 0.21
366 0.21
367 0.22
368 0.19
369 0.17
370 0.17
371 0.14
372 0.12
373 0.11
374 0.1
375 0.07
376 0.07
377 0.06
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.05
384 0.06
385 0.06
386 0.08
387 0.14
388 0.21
389 0.25
390 0.3
391 0.37
392 0.38
393 0.46
394 0.52
395 0.54
396 0.49
397 0.48
398 0.44
399 0.41
400 0.44
401 0.37
402 0.32
403 0.28
404 0.31
405 0.35
406 0.38
407 0.35
408 0.33
409 0.36
410 0.34
411 0.37
412 0.38
413 0.35
414 0.35
415 0.41
416 0.45
417 0.45
418 0.52
419 0.46
420 0.41
421 0.4
422 0.38
423 0.39
424 0.39