Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3HDI0

Protein Details
Accession A0A1E3HDI0    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
183-215LWCQSATRRWRMKLRERRRRGRWPSQKGYNNRRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
190-215RRWRMKLRERRRRGRWPSQKGYNNRR
Subcellular Location(s) mito 14.5, cyto_mito 12.5, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039771  Csl4  
IPR019495  EXOSC1_C  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0000178  C:exosome (RNase complex)  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF10447  EXOSC1  
CDD cd05791  S1_CSL4  
Amino Acid Sequences MSQAAILLPGQPLPPNLTAPPLPKAGRGCYEHNGQILASVVGRPRRDGAVVSVVGREEAVGIVDVDAIVIGTVHRLTPQQAHLTLTTLADRALPESSEEFTGVIRLTDIRLTERDKIKVGECFRLGDIVKAKVLSLGDARSYYLTTAANELGVVYAKSEAGTSSHNAASSSPELLLTLVKATLWCQSATRRWRMKLRERRRRGRWPSQKGYNNRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.2
3 0.2
4 0.23
5 0.26
6 0.27
7 0.29
8 0.31
9 0.3
10 0.32
11 0.35
12 0.35
13 0.39
14 0.4
15 0.41
16 0.4
17 0.45
18 0.43
19 0.4
20 0.36
21 0.29
22 0.25
23 0.21
24 0.17
25 0.12
26 0.1
27 0.13
28 0.17
29 0.18
30 0.19
31 0.2
32 0.21
33 0.22
34 0.21
35 0.21
36 0.22
37 0.22
38 0.21
39 0.2
40 0.18
41 0.17
42 0.16
43 0.12
44 0.06
45 0.05
46 0.05
47 0.04
48 0.04
49 0.04
50 0.04
51 0.04
52 0.04
53 0.03
54 0.03
55 0.02
56 0.02
57 0.02
58 0.03
59 0.03
60 0.03
61 0.04
62 0.05
63 0.07
64 0.1
65 0.13
66 0.16
67 0.17
68 0.18
69 0.18
70 0.19
71 0.19
72 0.16
73 0.13
74 0.1
75 0.09
76 0.08
77 0.08
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.08
83 0.09
84 0.08
85 0.09
86 0.08
87 0.07
88 0.08
89 0.07
90 0.05
91 0.05
92 0.04
93 0.05
94 0.06
95 0.06
96 0.07
97 0.09
98 0.12
99 0.17
100 0.21
101 0.22
102 0.22
103 0.24
104 0.24
105 0.28
106 0.27
107 0.26
108 0.24
109 0.23
110 0.22
111 0.24
112 0.22
113 0.2
114 0.2
115 0.17
116 0.17
117 0.15
118 0.15
119 0.13
120 0.13
121 0.11
122 0.1
123 0.1
124 0.1
125 0.1
126 0.11
127 0.1
128 0.1
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.09
133 0.1
134 0.1
135 0.09
136 0.08
137 0.08
138 0.07
139 0.07
140 0.06
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.09
149 0.1
150 0.13
151 0.14
152 0.14
153 0.14
154 0.14
155 0.17
156 0.17
157 0.16
158 0.13
159 0.12
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.08
164 0.07
165 0.06
166 0.06
167 0.07
168 0.07
169 0.12
170 0.13
171 0.13
172 0.15
173 0.21
174 0.3
175 0.38
176 0.47
177 0.51
178 0.56
179 0.65
180 0.72
181 0.77
182 0.8
183 0.83
184 0.84
185 0.87
186 0.91
187 0.92
188 0.93
189 0.92
190 0.93
191 0.92
192 0.92
193 0.91
194 0.91
195 0.9