Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3HAM4

Protein Details
Accession A0A1E3HAM4    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
96-124QSLPRHLRRRAASHNPRRVPKRLRSRAAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
100-166RHLRRRAASHNPRRVPKRLRSRAAAEIDAADNIAKKHRKIAKLRAKGNLRSHLSRTALFRIRQRSKR
Subcellular Location(s) mito 15, cyto 7, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039182  Pop1  
IPR009723  Pop1_N  
IPR012590  POPLD_dom  
IPR027266  TrmE/GcvT_dom1  
Gene Ontology GO:0005655  C:nucleolar ribonuclease P complex  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
Pfam View protein in Pfam  
PF06978  POP1  
PF08170  POPLD  
Amino Acid Sequences MSKPASKAAPQKPYGRPQKVVNKTVDLLKKNERASAAGKGKERQVLGDVMGLVDEVKRLPNLIQVEKFAQTRAMEIHAFQTAIKSAATQGNTRAFQSLPRHLRRRAASHNPRRVPKRLRSRAAAEIDAADNIAKKHRKIAKLRAKGNLRSHLSRTALFRIRQRSKRWLPTHIWHAKRHHMVNHWGWRLPMSPTLKSFRPAYRAGRRKAVAWDVSYYGVIEMEGRREDIVRLLGGVTDGKFAGDMFESGARVAGISFYQYDAFPQGLIGPGEVIWQPITHAKNDRKVWIRLHPSIFNHVWTLFKTTSLHILSEAGSSSNASQGLQIRDLRDQLEALEIMGPKSGEVLRRVLRLCKSEESLKQRVSLLVFNGLQDPSNIPDGTVIGLQAYDPRLHFPPPKLSEAEQSGTNDGVLRDDIIGPTGKLAFSLLWDAESRENASEVTHTKFQLDARRHKLGLPGTRLHPRQSDDRLPIMLFKRSTHPPPSTTPQSFHGFTLLLPTAWAQYLLTSIAYTGTLIGGLNERKVQHREAGVHSFPEYFSGVCEAGDRWHEGKAAFEKETWDRKPPGKRVEFAKVGTSSPWTPDWDKLLGADTSAEEASLNTSSPCKPYLLPHPFSTYISPSLDPLQLLEQLNTFRRQRSLAALPPTKTEALFNEAVLHVDIDVLGRGSPGDMAMICGLVGEKREKWIQAYEREDDGFNFAGEVTELQKLGQAPSSHQRLIGYTDSGNISLTRGQGHALGTITLRGYVELLQASYPSAAGQIGHVEGWDGKALVCVKNRDGTVGRFGEVRVCG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.77
3 0.73
4 0.73
5 0.78
6 0.79
7 0.78
8 0.73
9 0.67
10 0.62
11 0.66
12 0.64
13 0.58
14 0.54
15 0.56
16 0.58
17 0.54
18 0.55
19 0.48
20 0.44
21 0.44
22 0.48
23 0.46
24 0.45
25 0.48
26 0.48
27 0.51
28 0.53
29 0.49
30 0.41
31 0.37
32 0.33
33 0.29
34 0.28
35 0.23
36 0.17
37 0.16
38 0.14
39 0.11
40 0.09
41 0.08
42 0.06
43 0.08
44 0.08
45 0.1
46 0.11
47 0.17
48 0.23
49 0.29
50 0.3
51 0.32
52 0.35
53 0.38
54 0.38
55 0.33
56 0.31
57 0.25
58 0.24
59 0.23
60 0.23
61 0.2
62 0.2
63 0.22
64 0.19
65 0.19
66 0.17
67 0.17
68 0.14
69 0.14
70 0.13
71 0.11
72 0.13
73 0.18
74 0.2
75 0.2
76 0.24
77 0.31
78 0.32
79 0.33
80 0.31
81 0.26
82 0.31
83 0.37
84 0.42
85 0.44
86 0.53
87 0.59
88 0.62
89 0.7
90 0.69
91 0.71
92 0.7
93 0.72
94 0.73
95 0.77
96 0.83
97 0.83
98 0.86
99 0.84
100 0.84
101 0.82
102 0.81
103 0.82
104 0.82
105 0.81
106 0.78
107 0.78
108 0.76
109 0.72
110 0.63
111 0.52
112 0.43
113 0.37
114 0.3
115 0.24
116 0.15
117 0.12
118 0.11
119 0.18
120 0.21
121 0.21
122 0.3
123 0.38
124 0.47
125 0.55
126 0.65
127 0.68
128 0.73
129 0.79
130 0.79
131 0.8
132 0.79
133 0.78
134 0.77
135 0.72
136 0.66
137 0.64
138 0.61
139 0.56
140 0.5
141 0.46
142 0.45
143 0.46
144 0.45
145 0.48
146 0.52
147 0.59
148 0.63
149 0.66
150 0.69
151 0.72
152 0.79
153 0.78
154 0.75
155 0.72
156 0.72
157 0.76
158 0.74
159 0.7
160 0.67
161 0.67
162 0.68
163 0.68
164 0.65
165 0.6
166 0.57
167 0.6
168 0.61
169 0.65
170 0.59
171 0.53
172 0.48
173 0.44
174 0.4
175 0.34
176 0.31
177 0.26
178 0.26
179 0.3
180 0.34
181 0.34
182 0.36
183 0.38
184 0.36
185 0.36
186 0.39
187 0.44
188 0.5
189 0.58
190 0.59
191 0.62
192 0.59
193 0.57
194 0.57
195 0.54
196 0.47
197 0.4
198 0.38
199 0.31
200 0.31
201 0.28
202 0.22
203 0.15
204 0.11
205 0.09
206 0.08
207 0.07
208 0.09
209 0.09
210 0.1
211 0.1
212 0.11
213 0.11
214 0.12
215 0.12
216 0.1
217 0.1
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.1
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.07
227 0.06
228 0.07
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.07
237 0.06
238 0.06
239 0.05
240 0.04
241 0.05
242 0.06
243 0.06
244 0.07
245 0.07
246 0.08
247 0.09
248 0.09
249 0.08
250 0.07
251 0.07
252 0.08
253 0.08
254 0.07
255 0.06
256 0.06
257 0.07
258 0.07
259 0.08
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.12
264 0.13
265 0.15
266 0.23
267 0.28
268 0.36
269 0.38
270 0.44
271 0.45
272 0.48
273 0.49
274 0.5
275 0.53
276 0.5
277 0.51
278 0.49
279 0.45
280 0.48
281 0.44
282 0.36
283 0.3
284 0.25
285 0.22
286 0.18
287 0.21
288 0.15
289 0.16
290 0.16
291 0.15
292 0.2
293 0.2
294 0.19
295 0.15
296 0.15
297 0.14
298 0.14
299 0.13
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.08
308 0.12
309 0.13
310 0.16
311 0.18
312 0.18
313 0.19
314 0.2
315 0.19
316 0.15
317 0.14
318 0.11
319 0.11
320 0.09
321 0.08
322 0.09
323 0.08
324 0.08
325 0.09
326 0.08
327 0.06
328 0.08
329 0.09
330 0.09
331 0.11
332 0.15
333 0.17
334 0.21
335 0.22
336 0.25
337 0.27
338 0.28
339 0.29
340 0.27
341 0.28
342 0.3
343 0.35
344 0.38
345 0.41
346 0.39
347 0.37
348 0.35
349 0.34
350 0.3
351 0.25
352 0.18
353 0.16
354 0.15
355 0.14
356 0.15
357 0.13
358 0.12
359 0.11
360 0.11
361 0.08
362 0.1
363 0.1
364 0.08
365 0.08
366 0.08
367 0.09
368 0.08
369 0.06
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.05
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.09
378 0.1
379 0.13
380 0.16
381 0.17
382 0.25
383 0.28
384 0.3
385 0.3
386 0.3
387 0.31
388 0.3
389 0.29
390 0.22
391 0.19
392 0.17
393 0.15
394 0.14
395 0.12
396 0.09
397 0.08
398 0.06
399 0.06
400 0.05
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.05
406 0.06
407 0.06
408 0.05
409 0.05
410 0.06
411 0.05
412 0.05
413 0.06
414 0.06
415 0.06
416 0.07
417 0.08
418 0.08
419 0.09
420 0.09
421 0.08
422 0.09
423 0.08
424 0.08
425 0.09
426 0.1
427 0.13
428 0.14
429 0.14
430 0.14
431 0.16
432 0.19
433 0.24
434 0.3
435 0.35
436 0.39
437 0.43
438 0.43
439 0.43
440 0.45
441 0.43
442 0.43
443 0.39
444 0.36
445 0.35
446 0.42
447 0.42
448 0.4
449 0.37
450 0.33
451 0.35
452 0.38
453 0.4
454 0.36
455 0.37
456 0.35
457 0.32
458 0.34
459 0.29
460 0.27
461 0.22
462 0.2
463 0.23
464 0.27
465 0.31
466 0.33
467 0.34
468 0.33
469 0.38
470 0.44
471 0.47
472 0.44
473 0.41
474 0.4
475 0.41
476 0.39
477 0.34
478 0.28
479 0.2
480 0.18
481 0.2
482 0.16
483 0.11
484 0.1
485 0.1
486 0.1
487 0.09
488 0.1
489 0.05
490 0.05
491 0.06
492 0.06
493 0.06
494 0.05
495 0.05
496 0.05
497 0.05
498 0.05
499 0.04
500 0.04
501 0.04
502 0.04
503 0.04
504 0.07
505 0.08
506 0.09
507 0.11
508 0.13
509 0.16
510 0.2
511 0.21
512 0.22
513 0.25
514 0.28
515 0.3
516 0.35
517 0.32
518 0.3
519 0.29
520 0.25
521 0.22
522 0.2
523 0.16
524 0.09
525 0.09
526 0.1
527 0.1
528 0.09
529 0.1
530 0.08
531 0.1
532 0.11
533 0.14
534 0.12
535 0.14
536 0.15
537 0.14
538 0.18
539 0.22
540 0.24
541 0.22
542 0.22
543 0.24
544 0.29
545 0.38
546 0.36
547 0.37
548 0.38
549 0.44
550 0.53
551 0.58
552 0.62
553 0.59
554 0.61
555 0.61
556 0.64
557 0.61
558 0.53
559 0.5
560 0.42
561 0.37
562 0.33
563 0.31
564 0.23
565 0.21
566 0.22
567 0.2
568 0.21
569 0.23
570 0.26
571 0.23
572 0.23
573 0.2
574 0.21
575 0.17
576 0.15
577 0.13
578 0.1
579 0.1
580 0.1
581 0.09
582 0.07
583 0.07
584 0.08
585 0.08
586 0.08
587 0.07
588 0.1
589 0.11
590 0.13
591 0.14
592 0.14
593 0.15
594 0.2
595 0.3
596 0.37
597 0.39
598 0.4
599 0.45
600 0.44
601 0.45
602 0.43
603 0.35
604 0.29
605 0.28
606 0.26
607 0.21
608 0.23
609 0.22
610 0.19
611 0.17
612 0.15
613 0.18
614 0.19
615 0.18
616 0.17
617 0.19
618 0.22
619 0.27
620 0.27
621 0.25
622 0.27
623 0.28
624 0.29
625 0.33
626 0.36
627 0.38
628 0.45
629 0.48
630 0.46
631 0.47
632 0.48
633 0.41
634 0.35
635 0.3
636 0.23
637 0.23
638 0.23
639 0.2
640 0.19
641 0.19
642 0.19
643 0.17
644 0.15
645 0.09
646 0.08
647 0.08
648 0.06
649 0.06
650 0.05
651 0.05
652 0.05
653 0.05
654 0.05
655 0.05
656 0.05
657 0.06
658 0.05
659 0.07
660 0.07
661 0.07
662 0.07
663 0.06
664 0.07
665 0.07
666 0.09
667 0.12
668 0.13
669 0.17
670 0.21
671 0.22
672 0.25
673 0.33
674 0.38
675 0.43
676 0.47
677 0.46
678 0.46
679 0.46
680 0.44
681 0.36
682 0.32
683 0.24
684 0.18
685 0.15
686 0.12
687 0.1
688 0.1
689 0.1
690 0.09
691 0.1
692 0.1
693 0.1
694 0.13
695 0.13
696 0.15
697 0.19
698 0.18
699 0.21
700 0.3
701 0.36
702 0.34
703 0.35
704 0.34
705 0.3
706 0.35
707 0.33
708 0.27
709 0.21
710 0.23
711 0.23
712 0.22
713 0.21
714 0.17
715 0.15
716 0.15
717 0.16
718 0.15
719 0.14
720 0.14
721 0.16
722 0.16
723 0.17
724 0.15
725 0.15
726 0.14
727 0.15
728 0.15
729 0.14
730 0.13
731 0.11
732 0.11
733 0.11
734 0.13
735 0.12
736 0.13
737 0.12
738 0.12
739 0.13
740 0.12
741 0.11
742 0.08
743 0.08
744 0.08
745 0.07
746 0.08
747 0.1
748 0.1
749 0.1
750 0.1
751 0.1
752 0.11
753 0.12
754 0.12
755 0.1
756 0.09
757 0.14
758 0.17
759 0.21
760 0.27
761 0.3
762 0.32
763 0.38
764 0.39
765 0.4
766 0.41
767 0.4
768 0.42
769 0.4
770 0.37
771 0.32
772 0.32