Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1FZ17

Protein Details
Accession C1FZ17    Localization Confidence High Confidence Score 18.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
176-196PHTPRPSTSKRPTTNRRRTYTHydrophilic
285-304VEGIRRKRVEKGREKGKQGVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
260-263RRRI
267-269RAR
285-301VEGIRRKRVEKGREKGK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 14.5, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039119  ABT1/Esf2  
IPR034353  ABT1/ESF2_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
KEGG pbn:PADG_01043  -  
CDD cd12263  RRM_ABT1_like  
Amino Acid Sequences MAARKRNEYLDIESSEGEGSEGGYDSEAVQEAKGKGRNTTLGTVMGRERKRRKVFEDADSGEGEDGVGDGDNEAAAMGDAETFVKRSDEVEGGADEDENEEKTRRKDISTTTTTAAAAAAATTATATTKPKSLKPRKDKTGVIYFSSLPPYLKPSALKSLLTQRGFSPITKIFLSPHTPRPSTSKRPTTNRRRTYTDGWVEFASKRTAKICAQTLNATIVGGKKGGWYHDDVWTMKYLRGFKWGDLMEQVQRERSEREARRRIEDARARREERVFVDGVERGRVVEGIRRKRVEKGREKGKQGVDGDGDGDGSGMAGIDVRRVFRQNEVRAGGKDGEKALDADVKRVLGKIF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.28
3 0.24
4 0.17
5 0.1
6 0.08
7 0.07
8 0.07
9 0.06
10 0.06
11 0.07
12 0.07
13 0.08
14 0.09
15 0.08
16 0.08
17 0.14
18 0.15
19 0.22
20 0.27
21 0.27
22 0.29
23 0.33
24 0.38
25 0.36
26 0.38
27 0.34
28 0.33
29 0.33
30 0.32
31 0.34
32 0.37
33 0.39
34 0.45
35 0.52
36 0.57
37 0.66
38 0.71
39 0.72
40 0.74
41 0.75
42 0.73
43 0.74
44 0.66
45 0.59
46 0.52
47 0.46
48 0.35
49 0.28
50 0.2
51 0.1
52 0.07
53 0.05
54 0.04
55 0.03
56 0.03
57 0.04
58 0.03
59 0.03
60 0.03
61 0.03
62 0.03
63 0.03
64 0.03
65 0.03
66 0.03
67 0.04
68 0.05
69 0.06
70 0.06
71 0.07
72 0.07
73 0.08
74 0.11
75 0.11
76 0.12
77 0.13
78 0.12
79 0.13
80 0.13
81 0.12
82 0.09
83 0.09
84 0.08
85 0.08
86 0.09
87 0.1
88 0.14
89 0.16
90 0.22
91 0.23
92 0.24
93 0.28
94 0.33
95 0.4
96 0.42
97 0.43
98 0.38
99 0.37
100 0.35
101 0.31
102 0.24
103 0.14
104 0.09
105 0.06
106 0.04
107 0.03
108 0.03
109 0.03
110 0.03
111 0.03
112 0.05
113 0.07
114 0.08
115 0.13
116 0.15
117 0.22
118 0.33
119 0.43
120 0.53
121 0.62
122 0.71
123 0.74
124 0.78
125 0.75
126 0.71
127 0.7
128 0.62
129 0.53
130 0.45
131 0.38
132 0.33
133 0.31
134 0.25
135 0.16
136 0.14
137 0.16
138 0.15
139 0.16
140 0.16
141 0.17
142 0.23
143 0.24
144 0.24
145 0.22
146 0.29
147 0.35
148 0.34
149 0.32
150 0.26
151 0.3
152 0.3
153 0.28
154 0.24
155 0.18
156 0.2
157 0.19
158 0.19
159 0.15
160 0.17
161 0.23
162 0.22
163 0.28
164 0.31
165 0.31
166 0.32
167 0.39
168 0.43
169 0.48
170 0.53
171 0.55
172 0.56
173 0.66
174 0.75
175 0.79
176 0.82
177 0.81
178 0.78
179 0.75
180 0.73
181 0.69
182 0.68
183 0.64
184 0.54
185 0.46
186 0.42
187 0.37
188 0.31
189 0.28
190 0.23
191 0.16
192 0.16
193 0.16
194 0.19
195 0.19
196 0.23
197 0.25
198 0.25
199 0.27
200 0.27
201 0.27
202 0.25
203 0.23
204 0.18
205 0.15
206 0.12
207 0.11
208 0.09
209 0.08
210 0.08
211 0.09
212 0.1
213 0.11
214 0.14
215 0.16
216 0.21
217 0.24
218 0.23
219 0.23
220 0.26
221 0.25
222 0.23
223 0.25
224 0.23
225 0.2
226 0.27
227 0.27
228 0.24
229 0.3
230 0.29
231 0.26
232 0.25
233 0.27
234 0.22
235 0.25
236 0.25
237 0.21
238 0.22
239 0.23
240 0.23
241 0.27
242 0.33
243 0.38
244 0.48
245 0.54
246 0.56
247 0.6
248 0.62
249 0.59
250 0.59
251 0.6
252 0.59
253 0.6
254 0.65
255 0.62
256 0.63
257 0.62
258 0.56
259 0.5
260 0.46
261 0.36
262 0.28
263 0.28
264 0.26
265 0.25
266 0.22
267 0.19
268 0.14
269 0.14
270 0.14
271 0.12
272 0.16
273 0.25
274 0.32
275 0.41
276 0.44
277 0.46
278 0.54
279 0.63
280 0.67
281 0.68
282 0.69
283 0.72
284 0.76
285 0.8
286 0.79
287 0.75
288 0.72
289 0.63
290 0.58
291 0.48
292 0.4
293 0.35
294 0.27
295 0.22
296 0.14
297 0.12
298 0.07
299 0.05
300 0.04
301 0.03
302 0.03
303 0.05
304 0.05
305 0.09
306 0.1
307 0.12
308 0.16
309 0.2
310 0.21
311 0.29
312 0.39
313 0.41
314 0.48
315 0.51
316 0.52
317 0.5
318 0.53
319 0.48
320 0.41
321 0.38
322 0.31
323 0.28
324 0.25
325 0.24
326 0.22
327 0.24
328 0.22
329 0.22
330 0.23
331 0.23
332 0.23