Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1E3HNM2

Protein Details
Accession A0A1E3HNM2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
266-285KAKTTETKTKAKKEKVHIAIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
25-58KPAAKKADAPAPAAARAVPGAAPRGGARGGRPSG
294-344RPPRGDDRENRGERRERSDRPARGRGAPRGAFAGQRGQTRGAPRGGRGGRA
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 9.5, mito 8, nucl 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04774  HABP4_PAI-RBP1  
Amino Acid Sequences MAFASKNIFDLLGDNDAPAAAQAPKPAAKKADAPAPAAARAVPGAAPRGGARGGRPSGNRPAHTTTRDNRTADNEGAETTSGFDGERVPANKKANHVRDAHTKGPRGGRQNKTSGGHTSSGAGHYKGGKVVAQAGERRQFDRKNASGTTDSVKKTEHGWGATTGAAELKDEVAGEKDAQAEETAPQTPAEETSAESGWGKDEPAAEPQAEEEPEEVTKSYEEYLAEKAEENARNAALGKKQGREVSGEIEGTAFVREGLNDFFSGKAKTTETKTKAKKEKVHIAIDGQFAQPSRPPRGDDRENRGERRERSDRPARGRGAPRGAFAGQRGQTRGAPRGGRGGRAAAPAINANDTSAFPALGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.14
3 0.14
4 0.14
5 0.11
6 0.11
7 0.08
8 0.09
9 0.12
10 0.16
11 0.22
12 0.24
13 0.29
14 0.3
15 0.31
16 0.37
17 0.39
18 0.43
19 0.41
20 0.41
21 0.42
22 0.41
23 0.38
24 0.32
25 0.28
26 0.2
27 0.18
28 0.15
29 0.11
30 0.1
31 0.13
32 0.12
33 0.13
34 0.13
35 0.15
36 0.16
37 0.16
38 0.17
39 0.22
40 0.25
41 0.29
42 0.32
43 0.35
44 0.44
45 0.49
46 0.49
47 0.47
48 0.51
49 0.53
50 0.56
51 0.58
52 0.55
53 0.57
54 0.61
55 0.57
56 0.52
57 0.51
58 0.5
59 0.44
60 0.39
61 0.3
62 0.24
63 0.23
64 0.21
65 0.15
66 0.11
67 0.1
68 0.08
69 0.07
70 0.07
71 0.08
72 0.09
73 0.15
74 0.15
75 0.19
76 0.25
77 0.31
78 0.33
79 0.39
80 0.47
81 0.48
82 0.52
83 0.53
84 0.51
85 0.56
86 0.6
87 0.61
88 0.57
89 0.54
90 0.52
91 0.56
92 0.56
93 0.56
94 0.59
95 0.6
96 0.6
97 0.62
98 0.63
99 0.58
100 0.55
101 0.5
102 0.44
103 0.37
104 0.31
105 0.27
106 0.22
107 0.22
108 0.21
109 0.17
110 0.15
111 0.15
112 0.15
113 0.14
114 0.14
115 0.12
116 0.11
117 0.15
118 0.16
119 0.18
120 0.19
121 0.23
122 0.28
123 0.29
124 0.31
125 0.32
126 0.32
127 0.34
128 0.4
129 0.38
130 0.37
131 0.37
132 0.38
133 0.34
134 0.33
135 0.32
136 0.29
137 0.27
138 0.23
139 0.23
140 0.2
141 0.2
142 0.24
143 0.22
144 0.17
145 0.18
146 0.18
147 0.18
148 0.18
149 0.16
150 0.11
151 0.09
152 0.08
153 0.06
154 0.06
155 0.05
156 0.04
157 0.04
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.07
166 0.07
167 0.06
168 0.06
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.08
177 0.07
178 0.07
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.07
186 0.07
187 0.06
188 0.07
189 0.08
190 0.1
191 0.11
192 0.11
193 0.1
194 0.11
195 0.12
196 0.11
197 0.1
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.09
202 0.08
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.08
208 0.08
209 0.09
210 0.11
211 0.11
212 0.11
213 0.11
214 0.12
215 0.17
216 0.19
217 0.18
218 0.18
219 0.17
220 0.17
221 0.18
222 0.19
223 0.15
224 0.2
225 0.23
226 0.24
227 0.27
228 0.29
229 0.29
230 0.3
231 0.29
232 0.25
233 0.23
234 0.21
235 0.17
236 0.16
237 0.15
238 0.11
239 0.1
240 0.06
241 0.05
242 0.05
243 0.05
244 0.07
245 0.08
246 0.09
247 0.09
248 0.09
249 0.1
250 0.12
251 0.13
252 0.12
253 0.13
254 0.14
255 0.18
256 0.24
257 0.33
258 0.36
259 0.45
260 0.53
261 0.61
262 0.68
263 0.74
264 0.76
265 0.76
266 0.81
267 0.78
268 0.75
269 0.67
270 0.62
271 0.57
272 0.51
273 0.43
274 0.33
275 0.26
276 0.22
277 0.21
278 0.2
279 0.21
280 0.25
281 0.27
282 0.3
283 0.36
284 0.45
285 0.54
286 0.59
287 0.63
288 0.68
289 0.72
290 0.72
291 0.72
292 0.72
293 0.66
294 0.67
295 0.67
296 0.62
297 0.64
298 0.7
299 0.71
300 0.72
301 0.76
302 0.71
303 0.71
304 0.73
305 0.72
306 0.71
307 0.64
308 0.57
309 0.53
310 0.49
311 0.42
312 0.36
313 0.37
314 0.32
315 0.34
316 0.35
317 0.34
318 0.37
319 0.4
320 0.43
321 0.42
322 0.4
323 0.38
324 0.46
325 0.45
326 0.44
327 0.41
328 0.4
329 0.36
330 0.36
331 0.36
332 0.26
333 0.26
334 0.26
335 0.25
336 0.23
337 0.19
338 0.17
339 0.18
340 0.17
341 0.18
342 0.15