Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GBX4

Protein Details
Accession C1GBX4    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
128-155FYDGEKRQRGGRKKRKKNREEETNLQNWBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
133-146KRQRGGRKKRKKNR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040052  RBM17  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
KEGG pbn:PADG_04496  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
Amino Acid Sequences MASHPPPEGGLMSLYANLLDPSSDSSFTPGTISRAPAVFKQAGETEAQQDDATSKKQQISSASLRFQPTKRPQLASHKAKAKSGVPKAPVIGSATGTSPAVGTLAKPVAKTTLADWATTADDDDVNGFYDGEKRQRGGRKKRKKNREEETNLQNWDDIYDPSRPNTYEAYRHSEEKIREVREWKDRLYAHRMARTSSDTDSDEDYSRSPRNQRRFVPPGLNFAPPPNLNEPRPAQQDSEGSSEPAPAPSAPIPDDATGEDAYARRLRLSQNMYPPPDTNPTNMPSPSAPLPSSYQPTPPPVTPSDQVFSSATISRAPVRYTLPPAPEEIPATEAELEATFAEEEDSKQEVDGEAPRSLRPGQKGFAERLLTKYGWTKGSGLGASGEGIVKPLQVKLEKQKKKPDSEGGGFATPAGRAKIIGGKQKASDDGKFGRMSEVVVLHGMVDGMDLDAELEGGEGGGLMQEIGDECAEKYGRVERVFIDRNATGTIPVFVKFTSQLSALRAVNALEGRIFNGNTITARFFDVERYHHSTSSDLAIPNHSQSLLNRPPPRKSHLPLSPPLPPPRSYLHLSFSTSTLLSTPLNVSPLKSLQRAHIPYIGMRTSSTFAHAVPERIAASQGKSLF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.11
3 0.1
4 0.09
5 0.08
6 0.07
7 0.07
8 0.12
9 0.14
10 0.15
11 0.15
12 0.18
13 0.19
14 0.19
15 0.21
16 0.17
17 0.19
18 0.21
19 0.23
20 0.23
21 0.25
22 0.27
23 0.27
24 0.32
25 0.3
26 0.27
27 0.29
28 0.27
29 0.26
30 0.27
31 0.26
32 0.23
33 0.21
34 0.22
35 0.18
36 0.17
37 0.17
38 0.18
39 0.2
40 0.19
41 0.23
42 0.27
43 0.3
44 0.33
45 0.37
46 0.42
47 0.47
48 0.5
49 0.49
50 0.49
51 0.51
52 0.54
53 0.51
54 0.53
55 0.54
56 0.58
57 0.6
58 0.6
59 0.63
60 0.68
61 0.76
62 0.75
63 0.74
64 0.72
65 0.69
66 0.67
67 0.64
68 0.6
69 0.6
70 0.59
71 0.58
72 0.52
73 0.53
74 0.51
75 0.47
76 0.42
77 0.35
78 0.27
79 0.21
80 0.19
81 0.17
82 0.16
83 0.15
84 0.13
85 0.1
86 0.09
87 0.08
88 0.07
89 0.06
90 0.1
91 0.14
92 0.15
93 0.15
94 0.16
95 0.18
96 0.19
97 0.19
98 0.16
99 0.22
100 0.21
101 0.21
102 0.2
103 0.19
104 0.2
105 0.19
106 0.18
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.1
111 0.08
112 0.09
113 0.09
114 0.08
115 0.08
116 0.12
117 0.15
118 0.2
119 0.22
120 0.22
121 0.29
122 0.38
123 0.49
124 0.56
125 0.64
126 0.69
127 0.79
128 0.88
129 0.92
130 0.94
131 0.94
132 0.93
133 0.93
134 0.9
135 0.87
136 0.85
137 0.8
138 0.71
139 0.6
140 0.5
141 0.38
142 0.31
143 0.24
144 0.16
145 0.12
146 0.17
147 0.17
148 0.19
149 0.22
150 0.21
151 0.22
152 0.26
153 0.27
154 0.29
155 0.32
156 0.39
157 0.38
158 0.4
159 0.4
160 0.42
161 0.39
162 0.41
163 0.44
164 0.39
165 0.41
166 0.43
167 0.46
168 0.49
169 0.51
170 0.44
171 0.44
172 0.43
173 0.45
174 0.48
175 0.5
176 0.45
177 0.48
178 0.47
179 0.41
180 0.41
181 0.39
182 0.34
183 0.28
184 0.26
185 0.21
186 0.22
187 0.23
188 0.22
189 0.19
190 0.17
191 0.17
192 0.18
193 0.19
194 0.22
195 0.29
196 0.35
197 0.44
198 0.52
199 0.56
200 0.62
201 0.66
202 0.66
203 0.67
204 0.6
205 0.58
206 0.52
207 0.48
208 0.39
209 0.34
210 0.34
211 0.25
212 0.27
213 0.26
214 0.28
215 0.27
216 0.31
217 0.33
218 0.34
219 0.39
220 0.37
221 0.31
222 0.3
223 0.31
224 0.29
225 0.31
226 0.25
227 0.21
228 0.19
229 0.19
230 0.17
231 0.15
232 0.13
233 0.08
234 0.1
235 0.1
236 0.11
237 0.11
238 0.12
239 0.13
240 0.13
241 0.13
242 0.11
243 0.12
244 0.11
245 0.1
246 0.09
247 0.08
248 0.1
249 0.12
250 0.11
251 0.1
252 0.12
253 0.13
254 0.2
255 0.25
256 0.28
257 0.35
258 0.41
259 0.43
260 0.42
261 0.41
262 0.37
263 0.36
264 0.32
265 0.25
266 0.23
267 0.23
268 0.24
269 0.23
270 0.21
271 0.17
272 0.18
273 0.18
274 0.17
275 0.15
276 0.14
277 0.16
278 0.17
279 0.2
280 0.18
281 0.2
282 0.19
283 0.23
284 0.23
285 0.21
286 0.23
287 0.21
288 0.24
289 0.23
290 0.23
291 0.21
292 0.18
293 0.2
294 0.16
295 0.15
296 0.13
297 0.13
298 0.11
299 0.1
300 0.11
301 0.11
302 0.12
303 0.12
304 0.12
305 0.14
306 0.15
307 0.2
308 0.22
309 0.22
310 0.21
311 0.23
312 0.22
313 0.21
314 0.2
315 0.15
316 0.13
317 0.11
318 0.12
319 0.09
320 0.08
321 0.07
322 0.06
323 0.06
324 0.05
325 0.05
326 0.04
327 0.04
328 0.05
329 0.04
330 0.05
331 0.06
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.08
338 0.11
339 0.12
340 0.13
341 0.14
342 0.14
343 0.16
344 0.18
345 0.2
346 0.21
347 0.21
348 0.22
349 0.26
350 0.29
351 0.29
352 0.31
353 0.31
354 0.27
355 0.27
356 0.28
357 0.23
358 0.21
359 0.24
360 0.22
361 0.21
362 0.21
363 0.2
364 0.18
365 0.2
366 0.19
367 0.15
368 0.12
369 0.11
370 0.1
371 0.09
372 0.08
373 0.05
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.07
379 0.1
380 0.12
381 0.16
382 0.25
383 0.36
384 0.44
385 0.5
386 0.6
387 0.64
388 0.69
389 0.72
390 0.7
391 0.67
392 0.62
393 0.6
394 0.52
395 0.45
396 0.37
397 0.31
398 0.23
399 0.16
400 0.14
401 0.1
402 0.07
403 0.07
404 0.08
405 0.14
406 0.18
407 0.25
408 0.26
409 0.28
410 0.29
411 0.31
412 0.35
413 0.32
414 0.29
415 0.26
416 0.27
417 0.29
418 0.28
419 0.27
420 0.24
421 0.2
422 0.2
423 0.17
424 0.14
425 0.11
426 0.1
427 0.1
428 0.08
429 0.08
430 0.07
431 0.05
432 0.04
433 0.03
434 0.03
435 0.03
436 0.03
437 0.03
438 0.03
439 0.03
440 0.03
441 0.03
442 0.02
443 0.02
444 0.02
445 0.02
446 0.02
447 0.02
448 0.02
449 0.02
450 0.02
451 0.02
452 0.03
453 0.04
454 0.04
455 0.05
456 0.05
457 0.08
458 0.09
459 0.09
460 0.1
461 0.16
462 0.21
463 0.22
464 0.23
465 0.22
466 0.31
467 0.35
468 0.34
469 0.33
470 0.28
471 0.28
472 0.29
473 0.27
474 0.19
475 0.15
476 0.17
477 0.13
478 0.13
479 0.12
480 0.1
481 0.12
482 0.12
483 0.13
484 0.13
485 0.13
486 0.15
487 0.16
488 0.22
489 0.2
490 0.2
491 0.19
492 0.18
493 0.19
494 0.17
495 0.15
496 0.11
497 0.11
498 0.12
499 0.14
500 0.14
501 0.11
502 0.12
503 0.13
504 0.13
505 0.15
506 0.14
507 0.13
508 0.14
509 0.15
510 0.14
511 0.19
512 0.21
513 0.23
514 0.29
515 0.36
516 0.36
517 0.36
518 0.37
519 0.32
520 0.31
521 0.31
522 0.28
523 0.22
524 0.21
525 0.24
526 0.24
527 0.25
528 0.24
529 0.21
530 0.18
531 0.18
532 0.27
533 0.32
534 0.39
535 0.46
536 0.5
537 0.57
538 0.62
539 0.68
540 0.67
541 0.65
542 0.66
543 0.66
544 0.69
545 0.66
546 0.66
547 0.66
548 0.64
549 0.67
550 0.61
551 0.53
552 0.5
553 0.5
554 0.5
555 0.46
556 0.43
557 0.41
558 0.41
559 0.43
560 0.4
561 0.36
562 0.33
563 0.28
564 0.24
565 0.19
566 0.17
567 0.13
568 0.14
569 0.15
570 0.14
571 0.18
572 0.18
573 0.18
574 0.2
575 0.26
576 0.3
577 0.31
578 0.31
579 0.35
580 0.44
581 0.47
582 0.47
583 0.45
584 0.42
585 0.41
586 0.45
587 0.41
588 0.32
589 0.28
590 0.27
591 0.25
592 0.23
593 0.24
594 0.19
595 0.17
596 0.24
597 0.26
598 0.25
599 0.24
600 0.27
601 0.24
602 0.24
603 0.27
604 0.22
605 0.22