Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3HYH5

Protein Details
Accession A0A1E3HYH5    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
403-432KIEKEIAKLKQWRKEEKRPWGNMKLEKKGQBasic
446-472QVNENHVGRRRKGKMKKDHEQRMIPGABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
394-430PRSIPVDKSKIEKEIAKLKQWRKEEKRPWGNMKLEKK
454-462RRRKGKMKK
Subcellular Location(s) nucl 14.5, mito_nucl 11.666, cyto_nucl 10.333, mito 7.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002483  PWI_dom  
IPR039128  TRIP4-like  
IPR009349  Znf_C2HC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF01480  PWI  
PF06221  zf-C2HC5  
Amino Acid Sequences MVPSQRPPWVVKDITKILMLDEETVREMIVPEIEKQNVETRLRAHLQDFLGSSQQAKDFINRYLAYRFPSLTNTVSSIPNVTLVSDTRISEAKIKGKSFASVSASTSSTLETSGAAMRGSSTNVENAFGPAGKVYKKNQEADDVSDQIGRSSSRQGSSATRPGSGSSTPVPRQRQAGSVSINVIEAKSRVTTEGKGKGKKAERVWDVPKSRQVQKIEGVIESLKTVQNEGPKPEQGNNCFCQARIHGLNQYTPLCNHCALVLCQLHAPHLPCPSCGKPLYSPTQLTRLIQQVERDLEEQLDKERLEELEKGREREERLIAESGGGAFPMLGDSVNAIGTGSNAVPVGNTRKVLTIGSNPKGKSKATLTTTTYRTASTVSSRSKTPPPEHIIPRPRSIPVDKSKIEKEIAKLKQWRKEEKRPWGNMKLEKKGQALKYVEADYIVMGQVNENHVGRRRKGKMKKDHEQRMIPGAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.48
3 0.42
4 0.34
5 0.33
6 0.28
7 0.23
8 0.19
9 0.19
10 0.18
11 0.18
12 0.17
13 0.13
14 0.13
15 0.11
16 0.14
17 0.14
18 0.16
19 0.2
20 0.22
21 0.22
22 0.23
23 0.29
24 0.33
25 0.34
26 0.33
27 0.31
28 0.38
29 0.41
30 0.41
31 0.35
32 0.34
33 0.33
34 0.34
35 0.33
36 0.27
37 0.26
38 0.24
39 0.24
40 0.2
41 0.2
42 0.19
43 0.19
44 0.23
45 0.23
46 0.25
47 0.31
48 0.29
49 0.31
50 0.32
51 0.34
52 0.32
53 0.32
54 0.3
55 0.25
56 0.28
57 0.29
58 0.27
59 0.26
60 0.25
61 0.24
62 0.24
63 0.23
64 0.21
65 0.17
66 0.18
67 0.16
68 0.14
69 0.13
70 0.12
71 0.16
72 0.16
73 0.16
74 0.16
75 0.17
76 0.18
77 0.23
78 0.27
79 0.3
80 0.34
81 0.34
82 0.37
83 0.36
84 0.38
85 0.33
86 0.33
87 0.32
88 0.27
89 0.28
90 0.27
91 0.26
92 0.24
93 0.23
94 0.18
95 0.13
96 0.12
97 0.1
98 0.08
99 0.08
100 0.09
101 0.09
102 0.08
103 0.08
104 0.09
105 0.09
106 0.1
107 0.1
108 0.1
109 0.12
110 0.13
111 0.14
112 0.13
113 0.13
114 0.13
115 0.11
116 0.1
117 0.08
118 0.11
119 0.12
120 0.16
121 0.19
122 0.28
123 0.33
124 0.38
125 0.38
126 0.43
127 0.43
128 0.45
129 0.45
130 0.37
131 0.32
132 0.29
133 0.28
134 0.21
135 0.2
136 0.14
137 0.11
138 0.16
139 0.18
140 0.17
141 0.19
142 0.21
143 0.25
144 0.3
145 0.35
146 0.31
147 0.29
148 0.28
149 0.28
150 0.28
151 0.24
152 0.21
153 0.17
154 0.22
155 0.25
156 0.32
157 0.35
158 0.34
159 0.38
160 0.36
161 0.37
162 0.34
163 0.35
164 0.31
165 0.28
166 0.27
167 0.23
168 0.22
169 0.17
170 0.14
171 0.1
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.09
177 0.1
178 0.13
179 0.19
180 0.28
181 0.33
182 0.36
183 0.38
184 0.44
185 0.48
186 0.52
187 0.5
188 0.5
189 0.48
190 0.51
191 0.54
192 0.55
193 0.53
194 0.5
195 0.52
196 0.48
197 0.49
198 0.49
199 0.46
200 0.42
201 0.41
202 0.42
203 0.36
204 0.31
205 0.26
206 0.2
207 0.17
208 0.14
209 0.12
210 0.09
211 0.08
212 0.09
213 0.1
214 0.16
215 0.17
216 0.21
217 0.22
218 0.22
219 0.24
220 0.28
221 0.31
222 0.29
223 0.33
224 0.31
225 0.32
226 0.3
227 0.29
228 0.25
229 0.22
230 0.23
231 0.2
232 0.21
233 0.2
234 0.21
235 0.22
236 0.23
237 0.23
238 0.18
239 0.17
240 0.16
241 0.15
242 0.14
243 0.13
244 0.11
245 0.12
246 0.12
247 0.17
248 0.16
249 0.15
250 0.15
251 0.15
252 0.16
253 0.16
254 0.17
255 0.13
256 0.18
257 0.18
258 0.18
259 0.23
260 0.24
261 0.27
262 0.26
263 0.27
264 0.24
265 0.29
266 0.34
267 0.33
268 0.34
269 0.31
270 0.36
271 0.34
272 0.32
273 0.3
274 0.28
275 0.27
276 0.25
277 0.25
278 0.22
279 0.23
280 0.24
281 0.21
282 0.17
283 0.15
284 0.15
285 0.14
286 0.12
287 0.14
288 0.12
289 0.12
290 0.13
291 0.12
292 0.14
293 0.18
294 0.18
295 0.25
296 0.28
297 0.29
298 0.3
299 0.33
300 0.34
301 0.34
302 0.36
303 0.28
304 0.28
305 0.28
306 0.26
307 0.22
308 0.19
309 0.15
310 0.11
311 0.09
312 0.06
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.03
318 0.03
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.06
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.08
333 0.14
334 0.15
335 0.16
336 0.16
337 0.18
338 0.19
339 0.2
340 0.2
341 0.24
342 0.3
343 0.34
344 0.4
345 0.39
346 0.43
347 0.45
348 0.42
349 0.38
350 0.35
351 0.37
352 0.37
353 0.43
354 0.43
355 0.47
356 0.49
357 0.47
358 0.43
359 0.35
360 0.31
361 0.26
362 0.23
363 0.21
364 0.26
365 0.29
366 0.3
367 0.32
368 0.36
369 0.42
370 0.48
371 0.47
372 0.5
373 0.52
374 0.58
375 0.63
376 0.69
377 0.72
378 0.68
379 0.69
380 0.62
381 0.57
382 0.54
383 0.52
384 0.51
385 0.5
386 0.55
387 0.52
388 0.55
389 0.55
390 0.54
391 0.53
392 0.48
393 0.45
394 0.46
395 0.48
396 0.51
397 0.57
398 0.6
399 0.65
400 0.69
401 0.75
402 0.74
403 0.8
404 0.82
405 0.84
406 0.87
407 0.88
408 0.88
409 0.86
410 0.86
411 0.84
412 0.83
413 0.81
414 0.77
415 0.73
416 0.7
417 0.69
418 0.63
419 0.62
420 0.56
421 0.51
422 0.49
423 0.45
424 0.39
425 0.32
426 0.29
427 0.2
428 0.18
429 0.14
430 0.1
431 0.08
432 0.09
433 0.11
434 0.14
435 0.17
436 0.17
437 0.21
438 0.28
439 0.36
440 0.41
441 0.49
442 0.55
443 0.62
444 0.72
445 0.78
446 0.82
447 0.84
448 0.89
449 0.9
450 0.92
451 0.91
452 0.88
453 0.82