Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3ITH3

Protein Details
Accession A0A1E3ITH3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-33EIIASKPKPNRSKQGGARRGGHydrophilic
203-229APPPSQPQRRRAQQAAKPRNPRPVKKTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
18-34KPKPNRSKQGGARRGGA
211-227RRRAQQAAKPRNPRPVK
Subcellular Location(s) cyto 12, cyto_nucl 11, nucl 8, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MASKMDIDRSLDEIIASKPKPNRSKQGGARRGGAASGARARYTSTVPKGTSVIQTPLGAEVYKIIISNLPGDVTEPAVRDLMQSTVGPVKTVRMSFTSTGKSTGVATVVFKNRGDARKAHASYHLTLGMMECWLIGHVCGRRMALVFETSGSHQTDKIICNAIAINAIIPVQHYIWRQSLFTERPMKVELIVDPNQSLAGRVAPPPSQPQRRRAQQAAKPRNPRPVKKTAEQLDAEMAEYKQTSTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.23
3 0.22
4 0.25
5 0.3
6 0.4
7 0.49
8 0.55
9 0.63
10 0.64
11 0.74
12 0.78
13 0.83
14 0.82
15 0.77
16 0.73
17 0.64
18 0.56
19 0.46
20 0.38
21 0.28
22 0.23
23 0.25
24 0.22
25 0.2
26 0.2
27 0.22
28 0.21
29 0.25
30 0.28
31 0.28
32 0.32
33 0.33
34 0.34
35 0.34
36 0.34
37 0.34
38 0.29
39 0.26
40 0.22
41 0.22
42 0.2
43 0.2
44 0.18
45 0.14
46 0.11
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.08
51 0.08
52 0.08
53 0.09
54 0.1
55 0.09
56 0.08
57 0.08
58 0.09
59 0.09
60 0.1
61 0.11
62 0.1
63 0.11
64 0.11
65 0.11
66 0.1
67 0.11
68 0.09
69 0.09
70 0.08
71 0.09
72 0.13
73 0.13
74 0.13
75 0.12
76 0.13
77 0.15
78 0.15
79 0.15
80 0.13
81 0.16
82 0.18
83 0.21
84 0.22
85 0.2
86 0.22
87 0.2
88 0.19
89 0.16
90 0.15
91 0.12
92 0.09
93 0.1
94 0.12
95 0.15
96 0.16
97 0.15
98 0.17
99 0.21
100 0.23
101 0.24
102 0.22
103 0.24
104 0.32
105 0.34
106 0.32
107 0.33
108 0.32
109 0.31
110 0.31
111 0.26
112 0.17
113 0.16
114 0.15
115 0.1
116 0.07
117 0.06
118 0.04
119 0.03
120 0.03
121 0.03
122 0.03
123 0.06
124 0.07
125 0.09
126 0.1
127 0.1
128 0.11
129 0.11
130 0.12
131 0.1
132 0.1
133 0.09
134 0.08
135 0.09
136 0.09
137 0.11
138 0.12
139 0.11
140 0.11
141 0.13
142 0.15
143 0.15
144 0.17
145 0.17
146 0.16
147 0.16
148 0.16
149 0.14
150 0.12
151 0.11
152 0.09
153 0.06
154 0.06
155 0.05
156 0.05
157 0.06
158 0.06
159 0.1
160 0.11
161 0.14
162 0.18
163 0.19
164 0.19
165 0.2
166 0.26
167 0.24
168 0.31
169 0.36
170 0.33
171 0.35
172 0.37
173 0.35
174 0.29
175 0.28
176 0.23
177 0.21
178 0.23
179 0.22
180 0.2
181 0.19
182 0.19
183 0.17
184 0.16
185 0.1
186 0.1
187 0.11
188 0.13
189 0.16
190 0.16
191 0.19
192 0.27
193 0.36
194 0.44
195 0.48
196 0.55
197 0.63
198 0.7
199 0.77
200 0.77
201 0.78
202 0.75
203 0.81
204 0.84
205 0.83
206 0.83
207 0.81
208 0.82
209 0.82
210 0.83
211 0.8
212 0.79
213 0.77
214 0.74
215 0.79
216 0.75
217 0.73
218 0.65
219 0.59
220 0.53
221 0.46
222 0.4
223 0.33
224 0.25
225 0.19
226 0.18