Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3IS20

Protein Details
Accession A0A1E3IS20    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
49-69DGVAPRAKMNQQRSRRFRAAQHydrophilic
361-380RQEHSQKRRRIDEHKRQDDEBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MNGIVHPCTHPEGKPAPETEEEMMVEIFKYTERVVNMCRPRKVLMLAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAQEAADKEEEHREAIKLFEAMGHPVSEETANKKGWDTNAITPGTPFMTLLSISLKYWVSHKLTTDPGWKNLKIILSDSSVPGEGEHKIMDWIRRQRSYPTWDANTSHIIYGLDADLIMLSLATHEPHFRVLREDVFAQSSKGPQPCRNCGKPGHLSANCKSEKKVKDPNVVEVSKPEDPKPFIFLDVACLREYLAIELNVSHVPFPFDLELAIDDWIFMIFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDVLLKIWRAELPRMGGYVTNHGKVNLERAQVILEGLAKSEDEIFQKRKQDEERQEHSQKRRRIDEHKRQDDEEAREKGVMNVNGTEYVAVSNPAATARGGALHPSLPTRPSFDLVPKNEVEKTQSNNEDDKVKRAMAGSNSDIVKNRRAIRMANMSAAQALKAELDGDLNDTEVNLDQDEEAKEQKGTDQDKSSISLKQTQSDGEERAIKQETQEKRSNPEDVVNSMPVFINENKSQKEVPEDESVVADVDTNTENAAIDGEEDSTIIPHKRKRSEDAEENDDEDNDAEVPLNSEDQPDSKKKLKVNADGTVDYTDDVRLWEPGYRERYYEKKFGVDLGNREFLDSITKAYMEGLCWVLEYYYQGVPAWDWYYPYHYAPFAQDFQNVGSMEISFEISMPFKPFAQLLGVFPAASRIHLPEPLQTLMINEDSPILDFYPPDFEIDMNGKKMAWQGVALLPFIDQNRLLDALKSKEDELSDDEKRRNTWGDNLMFVANDNTLFDVFCDKLYGLRAKDLNRQQPVPIDPSTSMGMSGAVLPDPNCVPSSSFDTPLPTIPECPDLNPNDSISVRYYFPRQASPHRSILLRGYESEPPRLTESDKDWVRRGGQGGRRGPRHSGADGTSSKQPSGGPGVARGRYESGPGRSSHGYTPPSGRQVYSNTSSSSYGYSTPHSMPLPPRPPVPVYGGGSYSYGNANPYAAAPPNASSYAGYSGSTSYTSNGVYGHGNNGQKAPYPPANPYAAAQPSAYGVQRAGGGYGYGAPPRGSEGAYNPYGNGTYQPRNGPPPRRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.43
3 0.43
4 0.41
5 0.44
6 0.39
7 0.35
8 0.3
9 0.26
10 0.23
11 0.19
12 0.16
13 0.12
14 0.11
15 0.08
16 0.1
17 0.1
18 0.14
19 0.16
20 0.2
21 0.25
22 0.35
23 0.45
24 0.51
25 0.54
26 0.54
27 0.55
28 0.56
29 0.54
30 0.5
31 0.45
32 0.43
33 0.39
34 0.36
35 0.35
36 0.3
37 0.27
38 0.22
39 0.17
40 0.11
41 0.15
42 0.21
43 0.28
44 0.38
45 0.47
46 0.57
47 0.68
48 0.75
49 0.81
50 0.82
51 0.79
52 0.76
53 0.77
54 0.74
55 0.7
56 0.71
57 0.65
58 0.6
59 0.57
60 0.5
61 0.42
62 0.41
63 0.34
64 0.28
65 0.26
66 0.24
67 0.22
68 0.23
69 0.23
70 0.17
71 0.16
72 0.17
73 0.16
74 0.17
75 0.18
76 0.17
77 0.14
78 0.14
79 0.15
80 0.14
81 0.16
82 0.18
83 0.22
84 0.23
85 0.24
86 0.25
87 0.28
88 0.28
89 0.33
90 0.33
91 0.35
92 0.4
93 0.41
94 0.39
95 0.35
96 0.34
97 0.28
98 0.23
99 0.16
100 0.1
101 0.11
102 0.1
103 0.11
104 0.13
105 0.12
106 0.12
107 0.16
108 0.16
109 0.15
110 0.17
111 0.23
112 0.25
113 0.27
114 0.29
115 0.31
116 0.35
117 0.4
118 0.47
119 0.44
120 0.47
121 0.51
122 0.49
123 0.46
124 0.44
125 0.43
126 0.34
127 0.33
128 0.28
129 0.25
130 0.26
131 0.25
132 0.23
133 0.2
134 0.18
135 0.17
136 0.15
137 0.12
138 0.12
139 0.12
140 0.1
141 0.13
142 0.16
143 0.21
144 0.28
145 0.36
146 0.43
147 0.47
148 0.48
149 0.52
150 0.58
151 0.6
152 0.6
153 0.59
154 0.56
155 0.56
156 0.56
157 0.52
158 0.49
159 0.42
160 0.34
161 0.27
162 0.22
163 0.18
164 0.17
165 0.14
166 0.09
167 0.07
168 0.07
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.03
173 0.03
174 0.04
175 0.05
176 0.06
177 0.07
178 0.08
179 0.09
180 0.15
181 0.18
182 0.17
183 0.22
184 0.24
185 0.26
186 0.28
187 0.28
188 0.24
189 0.26
190 0.26
191 0.22
192 0.21
193 0.22
194 0.25
195 0.28
196 0.32
197 0.35
198 0.43
199 0.51
200 0.58
201 0.6
202 0.59
203 0.59
204 0.63
205 0.63
206 0.62
207 0.63
208 0.59
209 0.6
210 0.59
211 0.63
212 0.58
213 0.52
214 0.49
215 0.48
216 0.49
217 0.51
218 0.57
219 0.57
220 0.63
221 0.64
222 0.69
223 0.69
224 0.64
225 0.56
226 0.48
227 0.45
228 0.4
229 0.39
230 0.33
231 0.3
232 0.32
233 0.33
234 0.35
235 0.3
236 0.26
237 0.25
238 0.23
239 0.24
240 0.23
241 0.23
242 0.19
243 0.18
244 0.17
245 0.17
246 0.17
247 0.12
248 0.12
249 0.11
250 0.11
251 0.11
252 0.13
253 0.12
254 0.12
255 0.11
256 0.08
257 0.1
258 0.1
259 0.12
260 0.11
261 0.1
262 0.1
263 0.1
264 0.1
265 0.09
266 0.09
267 0.07
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.05
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.05
277 0.06
278 0.05
279 0.06
280 0.08
281 0.07
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.09
287 0.13
288 0.13
289 0.14
290 0.12
291 0.13
292 0.12
293 0.12
294 0.11
295 0.08
296 0.05
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.09
303 0.12
304 0.14
305 0.15
306 0.18
307 0.19
308 0.19
309 0.19
310 0.19
311 0.18
312 0.24
313 0.24
314 0.23
315 0.22
316 0.22
317 0.24
318 0.22
319 0.27
320 0.23
321 0.22
322 0.2
323 0.2
324 0.2
325 0.19
326 0.18
327 0.12
328 0.09
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.07
333 0.07
334 0.08
335 0.09
336 0.1
337 0.16
338 0.2
339 0.24
340 0.31
341 0.32
342 0.37
343 0.42
344 0.49
345 0.54
346 0.59
347 0.61
348 0.64
349 0.71
350 0.72
351 0.76
352 0.74
353 0.69
354 0.67
355 0.69
356 0.67
357 0.7
358 0.74
359 0.75
360 0.78
361 0.82
362 0.77
363 0.7
364 0.69
365 0.65
366 0.6
367 0.57
368 0.49
369 0.4
370 0.37
371 0.36
372 0.33
373 0.32
374 0.27
375 0.19
376 0.18
377 0.18
378 0.17
379 0.17
380 0.14
381 0.08
382 0.07
383 0.06
384 0.06
385 0.05
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.06
390 0.05
391 0.06
392 0.05
393 0.07
394 0.07
395 0.07
396 0.08
397 0.08
398 0.09
399 0.1
400 0.11
401 0.11
402 0.12
403 0.15
404 0.15
405 0.16
406 0.17
407 0.22
408 0.29
409 0.3
410 0.34
411 0.3
412 0.31
413 0.3
414 0.3
415 0.28
416 0.24
417 0.25
418 0.28
419 0.31
420 0.31
421 0.32
422 0.33
423 0.35
424 0.32
425 0.32
426 0.28
427 0.24
428 0.22
429 0.22
430 0.24
431 0.19
432 0.22
433 0.2
434 0.22
435 0.22
436 0.22
437 0.24
438 0.23
439 0.25
440 0.26
441 0.28
442 0.27
443 0.28
444 0.29
445 0.31
446 0.38
447 0.35
448 0.31
449 0.28
450 0.25
451 0.24
452 0.23
453 0.17
454 0.08
455 0.07
456 0.05
457 0.05
458 0.05
459 0.04
460 0.04
461 0.04
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.05
467 0.05
468 0.05
469 0.06
470 0.04
471 0.04
472 0.04
473 0.06
474 0.07
475 0.08
476 0.09
477 0.09
478 0.09
479 0.09
480 0.11
481 0.15
482 0.17
483 0.19
484 0.21
485 0.22
486 0.23
487 0.26
488 0.25
489 0.22
490 0.21
491 0.25
492 0.24
493 0.24
494 0.24
495 0.22
496 0.23
497 0.23
498 0.23
499 0.17
500 0.2
501 0.18
502 0.2
503 0.21
504 0.18
505 0.17
506 0.24
507 0.26
508 0.29
509 0.34
510 0.33
511 0.36
512 0.39
513 0.39
514 0.32
515 0.31
516 0.27
517 0.23
518 0.24
519 0.2
520 0.17
521 0.15
522 0.14
523 0.1
524 0.12
525 0.1
526 0.13
527 0.15
528 0.19
529 0.19
530 0.21
531 0.21
532 0.19
533 0.23
534 0.21
535 0.21
536 0.21
537 0.2
538 0.19
539 0.19
540 0.18
541 0.14
542 0.11
543 0.08
544 0.05
545 0.05
546 0.05
547 0.05
548 0.05
549 0.05
550 0.05
551 0.04
552 0.05
553 0.03
554 0.04
555 0.04
556 0.04
557 0.04
558 0.04
559 0.04
560 0.04
561 0.06
562 0.07
563 0.1
564 0.15
565 0.21
566 0.28
567 0.31
568 0.37
569 0.43
570 0.48
571 0.54
572 0.54
573 0.53
574 0.47
575 0.46
576 0.4
577 0.32
578 0.25
579 0.17
580 0.12
581 0.07
582 0.06
583 0.04
584 0.04
585 0.05
586 0.05
587 0.06
588 0.06
589 0.07
590 0.07
591 0.08
592 0.12
593 0.14
594 0.19
595 0.24
596 0.29
597 0.31
598 0.39
599 0.44
600 0.49
601 0.51
602 0.52
603 0.5
604 0.46
605 0.44
606 0.37
607 0.3
608 0.21
609 0.16
610 0.1
611 0.07
612 0.07
613 0.06
614 0.06
615 0.06
616 0.09
617 0.1
618 0.16
619 0.21
620 0.21
621 0.22
622 0.25
623 0.33
624 0.35
625 0.4
626 0.35
627 0.32
628 0.32
629 0.33
630 0.36
631 0.31
632 0.3
633 0.28
634 0.31
635 0.29
636 0.29
637 0.25
638 0.19
639 0.19
640 0.16
641 0.13
642 0.1
643 0.1
644 0.09
645 0.1
646 0.1
647 0.07
648 0.08
649 0.08
650 0.07
651 0.07
652 0.07
653 0.06
654 0.06
655 0.07
656 0.08
657 0.07
658 0.08
659 0.08
660 0.08
661 0.08
662 0.1
663 0.1
664 0.08
665 0.09
666 0.09
667 0.13
668 0.15
669 0.16
670 0.15
671 0.15
672 0.15
673 0.16
674 0.19
675 0.17
676 0.16
677 0.17
678 0.16
679 0.16
680 0.2
681 0.17
682 0.15
683 0.13
684 0.11
685 0.1
686 0.1
687 0.1
688 0.05
689 0.05
690 0.06
691 0.06
692 0.07
693 0.09
694 0.09
695 0.09
696 0.1
697 0.1
698 0.1
699 0.12
700 0.12
701 0.11
702 0.13
703 0.13
704 0.12
705 0.12
706 0.15
707 0.12
708 0.12
709 0.12
710 0.11
711 0.13
712 0.15
713 0.16
714 0.16
715 0.19
716 0.19
717 0.19
718 0.16
719 0.15
720 0.15
721 0.15
722 0.11
723 0.08
724 0.08
725 0.08
726 0.08
727 0.08
728 0.07
729 0.07
730 0.07
731 0.08
732 0.11
733 0.11
734 0.12
735 0.12
736 0.11
737 0.13
738 0.18
739 0.19
740 0.16
741 0.16
742 0.15
743 0.15
744 0.18
745 0.17
746 0.13
747 0.11
748 0.12
749 0.15
750 0.16
751 0.15
752 0.12
753 0.11
754 0.12
755 0.12
756 0.12
757 0.09
758 0.09
759 0.1
760 0.12
761 0.12
762 0.12
763 0.15
764 0.17
765 0.19
766 0.2
767 0.19
768 0.19
769 0.19
770 0.19
771 0.21
772 0.24
773 0.27
774 0.31
775 0.33
776 0.33
777 0.34
778 0.35
779 0.33
780 0.3
781 0.32
782 0.35
783 0.34
784 0.33
785 0.33
786 0.3
787 0.27
788 0.25
789 0.18
790 0.1
791 0.08
792 0.07
793 0.07
794 0.07
795 0.07
796 0.07
797 0.09
798 0.09
799 0.09
800 0.1
801 0.09
802 0.11
803 0.15
804 0.2
805 0.18
806 0.23
807 0.27
808 0.29
809 0.38
810 0.45
811 0.49
812 0.49
813 0.49
814 0.46
815 0.47
816 0.47
817 0.43
818 0.35
819 0.29
820 0.25
821 0.26
822 0.25
823 0.2
824 0.17
825 0.12
826 0.11
827 0.09
828 0.09
829 0.07
830 0.06
831 0.06
832 0.06
833 0.08
834 0.09
835 0.1
836 0.1
837 0.1
838 0.11
839 0.13
840 0.21
841 0.22
842 0.24
843 0.24
844 0.26
845 0.27
846 0.28
847 0.29
848 0.22
849 0.22
850 0.21
851 0.25
852 0.22
853 0.23
854 0.27
855 0.26
856 0.29
857 0.29
858 0.28
859 0.26
860 0.26
861 0.25
862 0.21
863 0.21
864 0.19
865 0.19
866 0.23
867 0.24
868 0.27
869 0.32
870 0.34
871 0.42
872 0.49
873 0.52
874 0.54
875 0.51
876 0.5
877 0.45
878 0.46
879 0.42
880 0.36
881 0.33
882 0.31
883 0.35
884 0.36
885 0.4
886 0.35
887 0.31
888 0.33
889 0.32
890 0.31
891 0.29
892 0.31
893 0.35
894 0.39
895 0.4
896 0.4
897 0.42
898 0.42
899 0.41
900 0.41
901 0.4
902 0.42
903 0.48
904 0.53
905 0.58
906 0.61
907 0.6
908 0.6
909 0.57
910 0.55
911 0.47
912 0.43
913 0.37
914 0.39
915 0.38
916 0.37
917 0.38
918 0.34
919 0.32
920 0.29
921 0.27
922 0.23
923 0.27
924 0.27
925 0.22
926 0.27
927 0.34
928 0.35
929 0.35
930 0.34
931 0.31
932 0.28
933 0.32
934 0.31
935 0.3
936 0.31
937 0.31
938 0.35
939 0.33
940 0.35
941 0.35
942 0.36
943 0.33
944 0.33
945 0.39
946 0.39
947 0.42
948 0.41
949 0.38
950 0.35
951 0.37
952 0.41
953 0.39
954 0.36
955 0.32
956 0.33
957 0.33
958 0.31
959 0.27
960 0.22
961 0.2
962 0.19
963 0.2
964 0.22
965 0.23
966 0.26
967 0.25
968 0.28
969 0.32
970 0.41
971 0.44
972 0.43
973 0.44
974 0.44
975 0.45
976 0.44
977 0.44
978 0.41
979 0.37
980 0.37
981 0.35
982 0.32
983 0.31
984 0.28
985 0.23
986 0.17
987 0.14
988 0.13
989 0.12
990 0.12
991 0.11
992 0.12
993 0.14
994 0.15
995 0.16
996 0.16
997 0.17
998 0.2
999 0.2
1000 0.2
1001 0.17
1002 0.17
1003 0.19
1004 0.19
1005 0.18
1006 0.15
1007 0.15
1008 0.15
1009 0.16
1010 0.14
1011 0.12
1012 0.13
1013 0.13
1014 0.13
1015 0.12
1016 0.13
1017 0.15
1018 0.15
1019 0.19
1020 0.23
1021 0.25
1022 0.26
1023 0.28
1024 0.28
1025 0.29
1026 0.31
1027 0.33
1028 0.34
1029 0.35
1030 0.37
1031 0.41
1032 0.42
1033 0.39
1034 0.38
1035 0.38
1036 0.33
1037 0.32
1038 0.28
1039 0.23
1040 0.22
1041 0.24
1042 0.23
1043 0.17
1044 0.14
1045 0.14
1046 0.16
1047 0.16
1048 0.14
1049 0.11
1050 0.11
1051 0.1
1052 0.13
1053 0.13
1054 0.13
1055 0.14
1056 0.13
1057 0.13
1058 0.17
1059 0.18
1060 0.17
1061 0.17
1062 0.21
1063 0.26
1064 0.3
1065 0.3
1066 0.26
1067 0.26
1068 0.26
1069 0.24
1070 0.25
1071 0.25
1072 0.29
1073 0.34
1074 0.4
1075 0.43
1076 0.52
1077 0.61