Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GDI7

Protein Details
Accession C1GDI7    Localization Confidence High Confidence Score 22.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-39VSLPKANTVNPQKRKKTIFDHydrophilic
72-93DEPSSKRPANSKRKSPAPQTLNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
370-372KAK
377-377K
379-379R
390-405ARERYLARKREREKEK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018612  NSRP1_N  
Gene Ontology GO:0000381  P:regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG pbn:PADG_05323  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09745  NSRP1_N  
Amino Acid Sequences MSHPTLSHGLNLPGKKPQPVSLPKANTVNPQKRKKTIFDSDSEDGDGPKETNGSVEITTIGDLNDDSNFPSDEPSSKRPANSKRKSPAPQTLNYTNLSSLHSSKKHAQTAESLDSTIYDYDAVYDSLHVKKLSTTSSSSAQAVSTPKYMTALFRSAEIRKRDQLRARDKQLQREREAEGEEYAGKEKFVTAAYKAQQEEARRIEAEEAEREREEQERRREGVGMVGFYKNMLERDEKRHEEMVRWAAEAAATAASGEKEMEKEVDEDEKTDSQIAAELNARGANIILNDEGQIVDKRELLTAGLNVVHKPNKARMATVSEKSGWGGADRRRGGLEIGGSGRAAQRARQTGMLAAQLEERMRKEAEEEEKKAKELAEKTRSSKTERDVQSARERYLARKREREKEK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.44
3 0.44
4 0.43
5 0.47
6 0.53
7 0.59
8 0.6
9 0.63
10 0.62
11 0.66
12 0.63
13 0.62
14 0.64
15 0.67
16 0.67
17 0.72
18 0.75
19 0.77
20 0.81
21 0.79
22 0.78
23 0.78
24 0.74
25 0.69
26 0.69
27 0.63
28 0.58
29 0.52
30 0.42
31 0.32
32 0.27
33 0.23
34 0.15
35 0.13
36 0.12
37 0.1
38 0.1
39 0.11
40 0.12
41 0.11
42 0.11
43 0.11
44 0.11
45 0.11
46 0.1
47 0.09
48 0.07
49 0.07
50 0.07
51 0.08
52 0.08
53 0.08
54 0.1
55 0.11
56 0.1
57 0.12
58 0.13
59 0.17
60 0.23
61 0.26
62 0.32
63 0.34
64 0.38
65 0.45
66 0.55
67 0.61
68 0.65
69 0.7
70 0.71
71 0.78
72 0.82
73 0.81
74 0.81
75 0.76
76 0.72
77 0.7
78 0.66
79 0.6
80 0.54
81 0.47
82 0.38
83 0.32
84 0.28
85 0.23
86 0.21
87 0.26
88 0.26
89 0.3
90 0.37
91 0.43
92 0.47
93 0.45
94 0.44
95 0.42
96 0.46
97 0.47
98 0.39
99 0.32
100 0.26
101 0.25
102 0.24
103 0.18
104 0.11
105 0.07
106 0.06
107 0.07
108 0.08
109 0.07
110 0.06
111 0.07
112 0.1
113 0.12
114 0.14
115 0.13
116 0.13
117 0.14
118 0.16
119 0.18
120 0.18
121 0.19
122 0.2
123 0.23
124 0.24
125 0.23
126 0.21
127 0.19
128 0.19
129 0.18
130 0.17
131 0.15
132 0.14
133 0.13
134 0.14
135 0.15
136 0.14
137 0.15
138 0.17
139 0.15
140 0.17
141 0.2
142 0.22
143 0.28
144 0.31
145 0.32
146 0.35
147 0.4
148 0.46
149 0.49
150 0.55
151 0.59
152 0.63
153 0.66
154 0.69
155 0.67
156 0.7
157 0.72
158 0.69
159 0.62
160 0.57
161 0.52
162 0.44
163 0.43
164 0.33
165 0.24
166 0.18
167 0.15
168 0.13
169 0.12
170 0.1
171 0.08
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.09
177 0.09
178 0.14
179 0.16
180 0.2
181 0.2
182 0.21
183 0.23
184 0.23
185 0.26
186 0.23
187 0.23
188 0.19
189 0.19
190 0.18
191 0.17
192 0.17
193 0.16
194 0.15
195 0.15
196 0.15
197 0.15
198 0.15
199 0.18
200 0.22
201 0.26
202 0.32
203 0.36
204 0.38
205 0.38
206 0.38
207 0.34
208 0.34
209 0.28
210 0.21
211 0.17
212 0.15
213 0.14
214 0.13
215 0.13
216 0.09
217 0.09
218 0.1
219 0.13
220 0.16
221 0.24
222 0.32
223 0.34
224 0.36
225 0.4
226 0.39
227 0.36
228 0.38
229 0.36
230 0.29
231 0.27
232 0.24
233 0.19
234 0.18
235 0.16
236 0.11
237 0.05
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.05
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.06
247 0.07
248 0.07
249 0.08
250 0.09
251 0.13
252 0.12
253 0.13
254 0.15
255 0.15
256 0.15
257 0.15
258 0.14
259 0.1
260 0.12
261 0.11
262 0.1
263 0.11
264 0.1
265 0.1
266 0.11
267 0.11
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.06
272 0.07
273 0.06
274 0.06
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.08
279 0.09
280 0.1
281 0.11
282 0.12
283 0.13
284 0.13
285 0.13
286 0.12
287 0.12
288 0.1
289 0.11
290 0.12
291 0.12
292 0.12
293 0.17
294 0.19
295 0.2
296 0.23
297 0.28
298 0.33
299 0.33
300 0.35
301 0.34
302 0.39
303 0.44
304 0.43
305 0.4
306 0.33
307 0.33
308 0.31
309 0.29
310 0.21
311 0.17
312 0.21
313 0.22
314 0.31
315 0.31
316 0.32
317 0.32
318 0.32
319 0.31
320 0.27
321 0.23
322 0.17
323 0.18
324 0.17
325 0.16
326 0.16
327 0.16
328 0.18
329 0.17
330 0.17
331 0.23
332 0.28
333 0.3
334 0.32
335 0.31
336 0.3
337 0.32
338 0.32
339 0.25
340 0.2
341 0.2
342 0.19
343 0.2
344 0.2
345 0.2
346 0.19
347 0.19
348 0.19
349 0.2
350 0.26
351 0.34
352 0.4
353 0.44
354 0.49
355 0.5
356 0.51
357 0.5
358 0.45
359 0.42
360 0.41
361 0.46
362 0.47
363 0.51
364 0.55
365 0.62
366 0.64
367 0.62
368 0.62
369 0.58
370 0.58
371 0.57
372 0.61
373 0.56
374 0.59
375 0.64
376 0.63
377 0.58
378 0.55
379 0.52
380 0.53
381 0.59
382 0.62
383 0.61
384 0.66
385 0.72