Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1G5J2

Protein Details
Accession C1G5J2    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
350-373AELAAKREKMERKKKLAALTKARRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
179-190KRKAMEAKQKGA
276-285ANGRGKTKAP
355-373KREKMERKKKLAALTKARR
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 10.5, mito 7, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
KEGG pbn:PADG_02447  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MGANLALLQFLSSVLSSIETGDPIPTAPPAGRNPAPGPASSVSKANSTPSSTTQTNQRPTNGQKRRAEDDVRPTGKPNKVSRSSSPQRPTSQKPTPTSSVAARALSVSKPETPKLPTRTPSTSTSKIAALPSPSPAKPPPKGSYAEMMLRAKALQEKAPTHLGMIKHHSVSKEKQLQQKRKAMEAKQKGAEGQKGAEGQKGAEAVKNKKNESTATKSSNTNGQQTQRSSAARAALLKSRGESEYKGTSRPPPTASAPEYKGTSGLPSRRASNTGRANGRGKTKAPHKPVRDEYLGTDEEDEGGIYDDDYDEGGYYSDESTDMEAGLMDVEEEEQRALRVAKLEDEKELQAELAAKREKMERKKKLAALTKARR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.08
3 0.08
4 0.1
5 0.1
6 0.1
7 0.11
8 0.11
9 0.11
10 0.1
11 0.11
12 0.09
13 0.1
14 0.11
15 0.16
16 0.19
17 0.27
18 0.28
19 0.32
20 0.34
21 0.39
22 0.4
23 0.34
24 0.36
25 0.31
26 0.34
27 0.3
28 0.32
29 0.26
30 0.27
31 0.28
32 0.27
33 0.27
34 0.26
35 0.28
36 0.29
37 0.34
38 0.33
39 0.34
40 0.4
41 0.45
42 0.49
43 0.5
44 0.5
45 0.51
46 0.58
47 0.67
48 0.67
49 0.68
50 0.67
51 0.69
52 0.72
53 0.71
54 0.68
55 0.64
56 0.64
57 0.65
58 0.61
59 0.55
60 0.54
61 0.55
62 0.54
63 0.56
64 0.54
65 0.53
66 0.57
67 0.62
68 0.64
69 0.66
70 0.69
71 0.7
72 0.7
73 0.67
74 0.67
75 0.69
76 0.71
77 0.7
78 0.7
79 0.68
80 0.66
81 0.66
82 0.62
83 0.58
84 0.53
85 0.45
86 0.43
87 0.37
88 0.32
89 0.26
90 0.23
91 0.21
92 0.19
93 0.19
94 0.15
95 0.17
96 0.2
97 0.21
98 0.24
99 0.26
100 0.34
101 0.39
102 0.43
103 0.43
104 0.47
105 0.5
106 0.51
107 0.53
108 0.52
109 0.49
110 0.45
111 0.42
112 0.37
113 0.34
114 0.31
115 0.27
116 0.22
117 0.18
118 0.2
119 0.22
120 0.21
121 0.23
122 0.27
123 0.32
124 0.33
125 0.39
126 0.39
127 0.39
128 0.42
129 0.4
130 0.39
131 0.35
132 0.33
133 0.31
134 0.29
135 0.24
136 0.22
137 0.2
138 0.16
139 0.17
140 0.15
141 0.14
142 0.17
143 0.19
144 0.21
145 0.24
146 0.23
147 0.2
148 0.22
149 0.2
150 0.19
151 0.22
152 0.22
153 0.2
154 0.22
155 0.23
156 0.24
157 0.26
158 0.32
159 0.36
160 0.39
161 0.47
162 0.55
163 0.63
164 0.67
165 0.71
166 0.64
167 0.62
168 0.63
169 0.61
170 0.61
171 0.6
172 0.56
173 0.52
174 0.5
175 0.45
176 0.41
177 0.36
178 0.27
179 0.2
180 0.16
181 0.17
182 0.17
183 0.16
184 0.14
185 0.12
186 0.12
187 0.12
188 0.11
189 0.1
190 0.15
191 0.19
192 0.25
193 0.29
194 0.29
195 0.3
196 0.32
197 0.33
198 0.35
199 0.38
200 0.38
201 0.38
202 0.4
203 0.39
204 0.38
205 0.42
206 0.37
207 0.34
208 0.32
209 0.31
210 0.34
211 0.34
212 0.36
213 0.33
214 0.31
215 0.28
216 0.26
217 0.24
218 0.2
219 0.21
220 0.2
221 0.2
222 0.22
223 0.2
224 0.19
225 0.19
226 0.19
227 0.19
228 0.18
229 0.18
230 0.24
231 0.25
232 0.26
233 0.26
234 0.32
235 0.34
236 0.36
237 0.34
238 0.3
239 0.32
240 0.37
241 0.38
242 0.37
243 0.36
244 0.35
245 0.34
246 0.3
247 0.27
248 0.21
249 0.21
250 0.21
251 0.23
252 0.26
253 0.27
254 0.3
255 0.31
256 0.35
257 0.35
258 0.38
259 0.43
260 0.44
261 0.46
262 0.48
263 0.5
264 0.5
265 0.54
266 0.49
267 0.43
268 0.43
269 0.49
270 0.53
271 0.59
272 0.64
273 0.63
274 0.69
275 0.73
276 0.72
277 0.67
278 0.59
279 0.52
280 0.49
281 0.44
282 0.34
283 0.29
284 0.22
285 0.18
286 0.16
287 0.13
288 0.07
289 0.08
290 0.07
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.05
298 0.05
299 0.06
300 0.05
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.07
305 0.07
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.06
314 0.04
315 0.04
316 0.05
317 0.05
318 0.06
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.1
323 0.11
324 0.12
325 0.16
326 0.17
327 0.24
328 0.3
329 0.31
330 0.33
331 0.35
332 0.34
333 0.31
334 0.3
335 0.22
336 0.17
337 0.21
338 0.18
339 0.23
340 0.25
341 0.25
342 0.27
343 0.35
344 0.43
345 0.49
346 0.59
347 0.62
348 0.68
349 0.77
350 0.81
351 0.83
352 0.83
353 0.83