Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3IHF1

Protein Details
Accession A0A1E3IHF1    Localization Confidence Low Confidence Score 7.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
115-134WTETPKGKGKKPVNKDRFISHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 19, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010920  LSM_dom_sf  
IPR047575  Sm  
IPR027248  Sm_D2  
IPR001163  Sm_dom_euk/arc  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0030532  C:small nuclear ribonucleoprotein complex  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01423  LSM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS52002  SM  
CDD cd01720  Sm_D2  
Amino Acid Sequences MKQYTKTSFNQYSQILAYLYIFYLPTYIKSAAMRTVVFSKTSQYAHVPKSELDEAQIRELEEYEISQGPLSVLQQSVRNSSQVLISLRNNKKLLARVKAFDRHCNMVLENVKEMWTETPKGKGKKPVNKDRFISKMFLRGDSVILVLRNAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.28
3 0.21
4 0.19
5 0.13
6 0.12
7 0.1
8 0.09
9 0.07
10 0.08
11 0.08
12 0.09
13 0.13
14 0.13
15 0.15
16 0.16
17 0.18
18 0.19
19 0.21
20 0.2
21 0.18
22 0.21
23 0.2
24 0.21
25 0.19
26 0.19
27 0.2
28 0.21
29 0.21
30 0.22
31 0.26
32 0.27
33 0.3
34 0.29
35 0.25
36 0.3
37 0.29
38 0.24
39 0.2
40 0.22
41 0.2
42 0.2
43 0.21
44 0.16
45 0.15
46 0.15
47 0.13
48 0.09
49 0.08
50 0.08
51 0.08
52 0.08
53 0.07
54 0.07
55 0.06
56 0.06
57 0.07
58 0.05
59 0.05
60 0.06
61 0.1
62 0.11
63 0.14
64 0.14
65 0.14
66 0.14
67 0.14
68 0.14
69 0.13
70 0.14
71 0.13
72 0.16
73 0.26
74 0.28
75 0.34
76 0.34
77 0.32
78 0.34
79 0.38
80 0.41
81 0.39
82 0.39
83 0.37
84 0.42
85 0.48
86 0.48
87 0.48
88 0.46
89 0.42
90 0.41
91 0.39
92 0.34
93 0.33
94 0.35
95 0.3
96 0.26
97 0.22
98 0.21
99 0.19
100 0.2
101 0.16
102 0.16
103 0.17
104 0.17
105 0.26
106 0.33
107 0.38
108 0.43
109 0.5
110 0.56
111 0.64
112 0.73
113 0.75
114 0.77
115 0.8
116 0.79
117 0.77
118 0.74
119 0.67
120 0.61
121 0.52
122 0.51
123 0.45
124 0.43
125 0.38
126 0.32
127 0.3
128 0.25
129 0.24
130 0.18
131 0.16