Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1E3IT08

Protein Details
Accession A0A1E3IT08    Localization Confidence High Confidence Score 24.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-26ANLTKKQQKALAFRNKQKAKKADGHydrophilic
72-97TDEISKKTKDQEKKKRKTAWDEDEGEAcidic
240-261MEQHKGKKTRGGRRVKAKASGDBasic
281-304INDRARLQTRQPFQKKRWEPTGANHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
57-60KRKR
77-88KKTKDQEKKKRK
201-223GRKKKIQVRNERIGGQRERKAEK
244-257KGKKTRGGRRVKAK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 4, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MSANLTKKQQKALAFRNKQKAKKADGETPADLPEEDIIQDDVDQPKEKSVGIDLSKKRKRDEQEKEKTGSDTDEISKKTKDQEKKKRKTAWDEDEGEHGKTEKNKKDAKQRFILFVGNLTFKTSKEEVQKHFESAAGQKPAVRLLTTKATPTQPSKSRGIAFVELPSSSAIQACLKLHHSQLGGRTINVELTAGGGGSSEGRKKKIQVRNERIGGQRERKAEKEKELNGEAQEVAVEQEMEQHKGKKTRGGRRVKAKASGDETLATGGPSRSLPNTKPSRINDRARLQTRQPFQKKRWEPTGANSISVGDK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.78
3 0.82
4 0.85
5 0.84
6 0.84
7 0.82
8 0.79
9 0.79
10 0.75
11 0.74
12 0.72
13 0.71
14 0.64
15 0.57
16 0.5
17 0.41
18 0.34
19 0.26
20 0.19
21 0.13
22 0.11
23 0.1
24 0.1
25 0.09
26 0.09
27 0.12
28 0.14
29 0.16
30 0.19
31 0.18
32 0.2
33 0.21
34 0.21
35 0.19
36 0.19
37 0.23
38 0.25
39 0.34
40 0.39
41 0.48
42 0.54
43 0.57
44 0.58
45 0.59
46 0.64
47 0.65
48 0.7
49 0.7
50 0.75
51 0.78
52 0.78
53 0.72
54 0.64
55 0.54
56 0.45
57 0.35
58 0.27
59 0.24
60 0.25
61 0.25
62 0.27
63 0.27
64 0.27
65 0.34
66 0.39
67 0.45
68 0.51
69 0.61
70 0.69
71 0.78
72 0.86
73 0.87
74 0.86
75 0.87
76 0.86
77 0.83
78 0.81
79 0.75
80 0.66
81 0.64
82 0.57
83 0.47
84 0.37
85 0.29
86 0.22
87 0.25
88 0.32
89 0.32
90 0.38
91 0.45
92 0.5
93 0.61
94 0.68
95 0.68
96 0.68
97 0.64
98 0.6
99 0.55
100 0.51
101 0.4
102 0.33
103 0.28
104 0.2
105 0.18
106 0.17
107 0.16
108 0.13
109 0.19
110 0.17
111 0.2
112 0.27
113 0.34
114 0.35
115 0.41
116 0.42
117 0.38
118 0.37
119 0.33
120 0.27
121 0.23
122 0.25
123 0.2
124 0.19
125 0.19
126 0.19
127 0.2
128 0.18
129 0.15
130 0.1
131 0.11
132 0.16
133 0.16
134 0.16
135 0.17
136 0.19
137 0.21
138 0.24
139 0.28
140 0.29
141 0.33
142 0.35
143 0.35
144 0.34
145 0.34
146 0.33
147 0.28
148 0.23
149 0.19
150 0.17
151 0.14
152 0.13
153 0.12
154 0.09
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.06
159 0.08
160 0.08
161 0.1
162 0.12
163 0.13
164 0.14
165 0.16
166 0.16
167 0.16
168 0.19
169 0.24
170 0.22
171 0.21
172 0.21
173 0.18
174 0.18
175 0.16
176 0.12
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.05
185 0.06
186 0.1
187 0.13
188 0.16
189 0.18
190 0.23
191 0.33
192 0.4
193 0.49
194 0.56
195 0.63
196 0.69
197 0.71
198 0.7
199 0.65
200 0.65
201 0.62
202 0.58
203 0.54
204 0.52
205 0.52
206 0.52
207 0.56
208 0.54
209 0.55
210 0.56
211 0.55
212 0.55
213 0.54
214 0.51
215 0.43
216 0.4
217 0.31
218 0.22
219 0.18
220 0.12
221 0.1
222 0.07
223 0.06
224 0.04
225 0.11
226 0.13
227 0.16
228 0.19
229 0.22
230 0.28
231 0.34
232 0.37
233 0.39
234 0.47
235 0.54
236 0.62
237 0.69
238 0.72
239 0.77
240 0.85
241 0.81
242 0.8
243 0.74
244 0.71
245 0.66
246 0.59
247 0.5
248 0.41
249 0.36
250 0.28
251 0.24
252 0.17
253 0.13
254 0.11
255 0.1
256 0.11
257 0.12
258 0.16
259 0.21
260 0.24
261 0.32
262 0.41
263 0.45
264 0.53
265 0.57
266 0.62
267 0.66
268 0.73
269 0.73
270 0.73
271 0.77
272 0.75
273 0.75
274 0.73
275 0.73
276 0.73
277 0.75
278 0.76
279 0.76
280 0.76
281 0.81
282 0.82
283 0.82
284 0.82
285 0.8
286 0.73
287 0.71
288 0.76
289 0.66
290 0.58
291 0.49