Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A0HTG6

Protein Details
Accession A0A0A0HTG6    Localization Confidence High Confidence Score 25
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-49VQSVVSHKQRGQKHPRKGKQRQNHPSAGSNNHydrophilic
80-103FPTGGMKPGRPPKRQKTTVSYHAHHydrophilic
225-248PHVGNNRQSRKKWRRSDNVPAIALHydrophilic
477-506HYSKPGKNSTSDKRRNQRIQRDRRQQMDSSHydrophilic
527-566RSGYFNPQDRRKQKQQQFKGSAKTKAKKVPNNRGRPPYNAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
28-39RGQKHPRKGKQR
538-560KQKQQQFKGSAKTKAKKVPNNRG
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG pbn:PADG_11935  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MDSHPMPGDAVQPFHPQPVQSVVSHKQRGQKHPRKGKQRQNHPSAGSNNGPPKHTQPQSCYNCGSLEHWAQQCPEPRREFPTGGMKPGRPPKRQKTTVSYHAHYQGDPFYDKSHPGPQRSYTHPPVAHPTYQPRPMAASTYGSPTPMSAHPYSAGPWPHEPLPPQYNSPQSYGLPTSTSAYNPQFSSASTAMPPHRGYFHPQYASQYAEPEYHRKSFDRHQQMPPHVGNNRQSRKKWRRSDNVPAIALPVEPWMEELQSLDIPESNSGQNEIVWRPAVQVARPLPSTFDERDDIGMLPPFTTLPPGMNNTALYKHCHLGMSVSKIHPGQGSRGKFQTECELVSIDELISRRKLIFETHRIEPPPPVEEADGGLEQDDEIYEENHSQENYGSVVSSNEAGDDRAMSGGYSSEYSHTPLCSPKAGYRDDMSSTGSYQADDRGSFRESASPDAPEDPVSPDLRTNYEYHEFQDRQDSKQHYSKPGKNSTSDKRRNQRIQRDRRQQMDSSTRKSGQLDGRRNAPFDCRGGRSGYFNPQDRRKQKQQQFKGSAKTKAKKVPNNRGRPPYNAISEGHLHENHDNRCGLDGNTGRSHNEDSSQPKRSHGYADIQQSDHHHPHDQVDFEHNSRKRSRQDESLSAPEEPMRQEDDITPRIRRRQPHVAEAYRYDLHQPNILAIY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.32
3 0.27
4 0.28
5 0.32
6 0.32
7 0.28
8 0.34
9 0.37
10 0.45
11 0.51
12 0.52
13 0.53
14 0.59
15 0.68
16 0.73
17 0.75
18 0.76
19 0.82
20 0.87
21 0.91
22 0.93
23 0.93
24 0.92
25 0.93
26 0.93
27 0.91
28 0.9
29 0.83
30 0.8
31 0.73
32 0.69
33 0.62
34 0.58
35 0.57
36 0.51
37 0.49
38 0.44
39 0.47
40 0.5
41 0.53
42 0.52
43 0.51
44 0.59
45 0.64
46 0.66
47 0.62
48 0.53
49 0.48
50 0.43
51 0.38
52 0.34
53 0.32
54 0.34
55 0.34
56 0.34
57 0.35
58 0.39
59 0.45
60 0.45
61 0.49
62 0.48
63 0.5
64 0.54
65 0.58
66 0.54
67 0.51
68 0.55
69 0.5
70 0.51
71 0.53
72 0.48
73 0.5
74 0.59
75 0.62
76 0.6
77 0.68
78 0.71
79 0.77
80 0.83
81 0.82
82 0.81
83 0.81
84 0.82
85 0.8
86 0.72
87 0.67
88 0.65
89 0.59
90 0.5
91 0.43
92 0.37
93 0.32
94 0.31
95 0.26
96 0.22
97 0.23
98 0.25
99 0.27
100 0.33
101 0.35
102 0.38
103 0.42
104 0.46
105 0.5
106 0.55
107 0.6
108 0.57
109 0.59
110 0.55
111 0.53
112 0.55
113 0.54
114 0.5
115 0.46
116 0.48
117 0.47
118 0.52
119 0.5
120 0.42
121 0.4
122 0.38
123 0.37
124 0.3
125 0.26
126 0.21
127 0.25
128 0.25
129 0.22
130 0.21
131 0.17
132 0.19
133 0.17
134 0.22
135 0.18
136 0.19
137 0.19
138 0.2
139 0.21
140 0.23
141 0.24
142 0.21
143 0.23
144 0.25
145 0.26
146 0.28
147 0.29
148 0.3
149 0.34
150 0.33
151 0.34
152 0.36
153 0.4
154 0.4
155 0.41
156 0.36
157 0.31
158 0.32
159 0.3
160 0.26
161 0.2
162 0.19
163 0.19
164 0.17
165 0.17
166 0.19
167 0.19
168 0.21
169 0.2
170 0.21
171 0.19
172 0.19
173 0.23
174 0.19
175 0.18
176 0.16
177 0.19
178 0.19
179 0.23
180 0.24
181 0.19
182 0.22
183 0.22
184 0.28
185 0.32
186 0.38
187 0.36
188 0.36
189 0.4
190 0.39
191 0.4
192 0.34
193 0.28
194 0.22
195 0.23
196 0.24
197 0.25
198 0.27
199 0.27
200 0.29
201 0.28
202 0.32
203 0.37
204 0.45
205 0.49
206 0.52
207 0.56
208 0.62
209 0.65
210 0.67
211 0.6
212 0.56
213 0.48
214 0.48
215 0.48
216 0.5
217 0.55
218 0.55
219 0.59
220 0.64
221 0.72
222 0.77
223 0.79
224 0.79
225 0.8
226 0.81
227 0.88
228 0.86
229 0.82
230 0.72
231 0.62
232 0.53
233 0.43
234 0.34
235 0.23
236 0.14
237 0.07
238 0.06
239 0.07
240 0.07
241 0.06
242 0.06
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.07
247 0.06
248 0.07
249 0.08
250 0.08
251 0.1
252 0.09
253 0.08
254 0.1
255 0.1
256 0.09
257 0.11
258 0.11
259 0.11
260 0.11
261 0.11
262 0.11
263 0.14
264 0.14
265 0.12
266 0.18
267 0.18
268 0.2
269 0.21
270 0.2
271 0.18
272 0.19
273 0.23
274 0.18
275 0.19
276 0.18
277 0.17
278 0.18
279 0.17
280 0.16
281 0.12
282 0.13
283 0.1
284 0.09
285 0.08
286 0.08
287 0.07
288 0.08
289 0.07
290 0.06
291 0.08
292 0.11
293 0.11
294 0.12
295 0.12
296 0.13
297 0.16
298 0.16
299 0.17
300 0.16
301 0.16
302 0.16
303 0.16
304 0.15
305 0.15
306 0.17
307 0.18
308 0.19
309 0.19
310 0.19
311 0.19
312 0.2
313 0.18
314 0.16
315 0.17
316 0.22
317 0.24
318 0.25
319 0.26
320 0.27
321 0.25
322 0.26
323 0.26
324 0.2
325 0.18
326 0.16
327 0.15
328 0.13
329 0.13
330 0.12
331 0.06
332 0.07
333 0.07
334 0.08
335 0.07
336 0.08
337 0.08
338 0.09
339 0.1
340 0.13
341 0.19
342 0.26
343 0.3
344 0.32
345 0.36
346 0.36
347 0.36
348 0.33
349 0.28
350 0.22
351 0.18
352 0.16
353 0.13
354 0.12
355 0.12
356 0.11
357 0.1
358 0.08
359 0.07
360 0.06
361 0.06
362 0.05
363 0.04
364 0.03
365 0.03
366 0.04
367 0.04
368 0.05
369 0.06
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.08
375 0.08
376 0.07
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.07
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.06
387 0.06
388 0.06
389 0.05
390 0.05
391 0.04
392 0.04
393 0.04
394 0.05
395 0.06
396 0.06
397 0.07
398 0.08
399 0.1
400 0.1
401 0.1
402 0.11
403 0.14
404 0.15
405 0.16
406 0.17
407 0.19
408 0.24
409 0.25
410 0.26
411 0.25
412 0.25
413 0.25
414 0.24
415 0.23
416 0.18
417 0.17
418 0.18
419 0.16
420 0.14
421 0.12
422 0.13
423 0.12
424 0.12
425 0.13
426 0.13
427 0.14
428 0.15
429 0.15
430 0.17
431 0.17
432 0.21
433 0.21
434 0.2
435 0.19
436 0.2
437 0.2
438 0.16
439 0.16
440 0.14
441 0.16
442 0.16
443 0.16
444 0.16
445 0.17
446 0.18
447 0.19
448 0.18
449 0.2
450 0.23
451 0.23
452 0.24
453 0.31
454 0.29
455 0.28
456 0.37
457 0.34
458 0.32
459 0.39
460 0.4
461 0.38
462 0.44
463 0.49
464 0.48
465 0.56
466 0.6
467 0.62
468 0.68
469 0.65
470 0.64
471 0.67
472 0.68
473 0.69
474 0.73
475 0.73
476 0.73
477 0.8
478 0.85
479 0.87
480 0.88
481 0.88
482 0.89
483 0.9
484 0.92
485 0.88
486 0.85
487 0.8
488 0.72
489 0.69
490 0.69
491 0.65
492 0.59
493 0.58
494 0.53
495 0.5
496 0.49
497 0.47
498 0.46
499 0.48
500 0.52
501 0.49
502 0.55
503 0.54
504 0.54
505 0.49
506 0.44
507 0.38
508 0.34
509 0.35
510 0.31
511 0.31
512 0.34
513 0.34
514 0.34
515 0.34
516 0.39
517 0.41
518 0.45
519 0.5
520 0.56
521 0.65
522 0.66
523 0.71
524 0.73
525 0.77
526 0.79
527 0.83
528 0.84
529 0.85
530 0.87
531 0.84
532 0.84
533 0.8
534 0.8
535 0.79
536 0.76
537 0.73
538 0.73
539 0.76
540 0.75
541 0.79
542 0.81
543 0.82
544 0.85
545 0.86
546 0.87
547 0.81
548 0.77
549 0.74
550 0.69
551 0.63
552 0.55
553 0.47
554 0.41
555 0.4
556 0.37
557 0.35
558 0.29
559 0.27
560 0.29
561 0.36
562 0.33
563 0.35
564 0.33
565 0.28
566 0.29
567 0.28
568 0.24
569 0.25
570 0.27
571 0.28
572 0.32
573 0.33
574 0.32
575 0.33
576 0.36
577 0.29
578 0.28
579 0.29
580 0.32
581 0.39
582 0.46
583 0.44
584 0.45
585 0.47
586 0.46
587 0.46
588 0.43
589 0.42
590 0.41
591 0.49
592 0.49
593 0.46
594 0.46
595 0.46
596 0.49
597 0.45
598 0.41
599 0.36
600 0.34
601 0.38
602 0.41
603 0.38
604 0.32
605 0.35
606 0.36
607 0.35
608 0.43
609 0.41
610 0.43
611 0.47
612 0.53
613 0.55
614 0.59
615 0.62
616 0.63
617 0.68
618 0.7
619 0.71
620 0.71
621 0.65
622 0.57
623 0.52
624 0.44
625 0.39
626 0.32
627 0.27
628 0.23
629 0.21
630 0.23
631 0.27
632 0.32
633 0.35
634 0.38
635 0.43
636 0.46
637 0.55
638 0.6
639 0.63
640 0.64
641 0.69
642 0.71
643 0.74
644 0.77
645 0.75
646 0.74
647 0.7
648 0.67
649 0.57
650 0.51
651 0.47
652 0.43
653 0.38
654 0.36
655 0.33