Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GF11

Protein Details
Accession C1GF11    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-58GMEFKPANKDKRKILHIKRKKVKDAQSRAERFARKKEEAKNPKLKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-64FKPANKDKRKILHIKRKKVKDAQSRAERFARKKEEAKNPKLKAERLRRN
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 6, mito 3, cyto_pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR044281  IMP4/RPF1  
Gene Ontology GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG pbn:PADG_05847  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MPSKKSKLLPSGGMEFKPANKDKRKILHIKRKKVKDAQSRAERFARKKEEAKNPKLKAERLRRNIPLTLERKRVWDDVDSDVEDGLGMSFDVERVKRHKMEEEAWREKIDEINATSGNEGKGGEGEEADEHGDNDEVDSMIASESDEDEDSEGNDRIQESNRTRKSKLPSATERATSPTQSTRSTNLDLAPDALAAKFPTLFTKELPPAPKILITTSINSTLHDQAQLLTDLFPNSVYIRRSAHKYAHKYSVREISKFASNRNFTALVVVEEDQKRVSGMTIVHLPVGPTFHFSVSNWVEGKKLPGHGNSTGHWPELILNNFRTPLGMLAAHLFRTLFPAQPELVGRQVVTLHNQRDYIFVRRHRYVFREKRETEKSVVGADGKEMKGVEGIRTGLQELGPRFTLKLRRVDKGIQRASGQEWEWKGGMEKQRTKFQL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.42
3 0.4
4 0.43
5 0.44
6 0.46
7 0.51
8 0.57
9 0.63
10 0.71
11 0.77
12 0.78
13 0.82
14 0.84
15 0.85
16 0.9
17 0.91
18 0.92
19 0.92
20 0.9
21 0.9
22 0.89
23 0.89
24 0.89
25 0.89
26 0.85
27 0.81
28 0.79
29 0.77
30 0.72
31 0.72
32 0.7
33 0.66
34 0.69
35 0.73
36 0.76
37 0.78
38 0.83
39 0.83
40 0.78
41 0.8
42 0.78
43 0.76
44 0.75
45 0.75
46 0.76
47 0.74
48 0.78
49 0.76
50 0.74
51 0.71
52 0.67
53 0.65
54 0.62
55 0.61
56 0.6
57 0.55
58 0.54
59 0.54
60 0.51
61 0.44
62 0.41
63 0.36
64 0.33
65 0.36
66 0.32
67 0.28
68 0.25
69 0.22
70 0.17
71 0.14
72 0.09
73 0.05
74 0.04
75 0.04
76 0.04
77 0.05
78 0.08
79 0.09
80 0.13
81 0.17
82 0.24
83 0.28
84 0.31
85 0.37
86 0.39
87 0.45
88 0.51
89 0.57
90 0.57
91 0.55
92 0.52
93 0.47
94 0.42
95 0.38
96 0.3
97 0.24
98 0.18
99 0.2
100 0.2
101 0.19
102 0.19
103 0.18
104 0.16
105 0.13
106 0.12
107 0.08
108 0.08
109 0.09
110 0.09
111 0.07
112 0.08
113 0.07
114 0.07
115 0.08
116 0.08
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.05
133 0.06
134 0.05
135 0.06
136 0.06
137 0.07
138 0.09
139 0.09
140 0.08
141 0.08
142 0.09
143 0.1
144 0.12
145 0.2
146 0.23
147 0.33
148 0.41
149 0.45
150 0.47
151 0.51
152 0.56
153 0.57
154 0.58
155 0.56
156 0.56
157 0.58
158 0.59
159 0.54
160 0.48
161 0.44
162 0.39
163 0.31
164 0.26
165 0.24
166 0.24
167 0.24
168 0.26
169 0.25
170 0.27
171 0.28
172 0.27
173 0.24
174 0.22
175 0.2
176 0.19
177 0.15
178 0.11
179 0.09
180 0.08
181 0.07
182 0.06
183 0.06
184 0.05
185 0.05
186 0.07
187 0.09
188 0.1
189 0.11
190 0.16
191 0.18
192 0.21
193 0.24
194 0.22
195 0.21
196 0.21
197 0.21
198 0.17
199 0.15
200 0.16
201 0.15
202 0.16
203 0.15
204 0.18
205 0.17
206 0.17
207 0.18
208 0.15
209 0.14
210 0.13
211 0.12
212 0.1
213 0.11
214 0.11
215 0.09
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.07
221 0.06
222 0.07
223 0.1
224 0.1
225 0.11
226 0.14
227 0.16
228 0.21
229 0.24
230 0.3
231 0.35
232 0.42
233 0.44
234 0.52
235 0.54
236 0.5
237 0.51
238 0.53
239 0.48
240 0.42
241 0.39
242 0.31
243 0.34
244 0.34
245 0.34
246 0.32
247 0.31
248 0.31
249 0.33
250 0.31
251 0.24
252 0.25
253 0.21
254 0.14
255 0.13
256 0.13
257 0.15
258 0.15
259 0.15
260 0.13
261 0.13
262 0.12
263 0.11
264 0.11
265 0.08
266 0.08
267 0.1
268 0.13
269 0.13
270 0.13
271 0.14
272 0.13
273 0.11
274 0.13
275 0.1
276 0.1
277 0.11
278 0.11
279 0.12
280 0.12
281 0.19
282 0.19
283 0.23
284 0.21
285 0.2
286 0.2
287 0.2
288 0.24
289 0.19
290 0.22
291 0.22
292 0.24
293 0.28
294 0.31
295 0.33
296 0.3
297 0.35
298 0.32
299 0.28
300 0.25
301 0.21
302 0.19
303 0.22
304 0.25
305 0.21
306 0.21
307 0.22
308 0.23
309 0.23
310 0.21
311 0.15
312 0.13
313 0.12
314 0.1
315 0.09
316 0.12
317 0.13
318 0.13
319 0.13
320 0.12
321 0.09
322 0.14
323 0.15
324 0.14
325 0.15
326 0.17
327 0.17
328 0.19
329 0.21
330 0.18
331 0.19
332 0.17
333 0.16
334 0.14
335 0.16
336 0.15
337 0.2
338 0.25
339 0.26
340 0.27
341 0.29
342 0.28
343 0.31
344 0.33
345 0.35
346 0.36
347 0.41
348 0.46
349 0.5
350 0.54
351 0.55
352 0.59
353 0.62
354 0.65
355 0.68
356 0.71
357 0.68
358 0.73
359 0.75
360 0.72
361 0.65
362 0.6
363 0.51
364 0.43
365 0.42
366 0.34
367 0.27
368 0.26
369 0.27
370 0.22
371 0.22
372 0.2
373 0.18
374 0.2
375 0.2
376 0.19
377 0.16
378 0.17
379 0.17
380 0.18
381 0.18
382 0.16
383 0.16
384 0.2
385 0.19
386 0.21
387 0.21
388 0.22
389 0.22
390 0.27
391 0.35
392 0.35
393 0.44
394 0.45
395 0.49
396 0.54
397 0.62
398 0.65
399 0.67
400 0.68
401 0.62
402 0.58
403 0.55
404 0.53
405 0.5
406 0.43
407 0.39
408 0.35
409 0.35
410 0.33
411 0.31
412 0.3
413 0.32
414 0.39
415 0.42
416 0.49
417 0.52