FuNGI

C1GJK3

Protein Details

Accession

C1GJK3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
252-277	SDNNHQKQGKTPQKAQKQRRIEEFMT	Hydrophilic
569-589	LEDVKEKSKRTPRKNGIKMSP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto 4, plas 1, pero 1, E.R. 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007855 RNA-dep_RNA_pol_euk-typ
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0003968 F:RNA-dependent RNA polymerase activity GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
KEGG	pbn:PADG_07439 -
Pfam	View protein in Pfam PF05183 RdRP

Amino Acid Sequences

MATPRTPKSSHDFNLLINNLNVTFNLDLPNPAVSTPKHRPGGERTFPERCVGLMKFLYYNNPDNVQRVIDSFQEWARAFLSDWVPKTRQEPGTLPSSRPFIRSNALSMARNITPEQRAKVLDYLWTLLRDEEYIVTRGASRISKDVNTTPSTEQSLTELESGSPAAFAGGSISGSAIVSPDILRKQTSSKMTSPSKRKSDINDSEVFVTAPNSPSHSFHITTLSSDDEFEYSDLDNFDIAPIVDSVDSADSSDNNHQKQGKTPQKAQKQRRIEEFMTISKKVQSTFSPPSFGKTPLGNQNSEHNANTSFSTIASQPTSLTTSFGASTVATSVSPGFGKNLLIEILQGPSTIQALQSEEATALFDNASFGHKHGLDCREDKIRNIIRDLEENGPFSKQYIINSTVPLRYRYEAQRAAHSRRIPVETLLEKVDQDRRKLPEYEDFWNHLHDGLPTSLEKTKSGPWEMAVEMYEDKRSTGDVVTLSGKLSWCKRKGYFDLSLNPLKFERSYRFCRRFGSDRFLEITFPVLTSPPSRLARDTEERGILLEAISRWLANSEHHLLGRVWRSFYLEDVKEKSKRTPRKNGIKMSPELETGSKRSRVFMFAINGTDFGESTMGIPLQDQTSGNRTKMSIDALINWHMPIADNIHQSDCKLFQRLALGLSRTLSTVVLRREEVIFCPDPPGPVMNDGCALMSRSLGLEIKRILDLETLPACYQGRISGAKGIWMVDRDDSRFKGGDRDFGLEITESQLKISYPHGPPHNPRLVADNTQLTFEVVQWSQPLNPSSLNLQVLKVLQHGGVGHSHIKKLIQQEVSIFYKEFLKVIHLSNGVACRKWLQKMKRFGDDGYSYKRQTRRIDNFFPSQYVEQAVLLLDSGFLPLKLPYLTQLFRRILKDYLDSLRKLKVSVSQSTYAYCIADPLGVLSPDEVHFGFSHKWDDGSVVVGTELHDMNVLVARLPAHLPTDIQKRRAVYKNELRHFKDVIVFPTTGDVPLASLLSGGDYDGDQCWVCWDPIIVREFSNSHFDPTTIPSSEQLGLVCHSLPMNQVRSIDQFLAKVFLFNAKPSQLGPCTIEHETFCYHNNDLGCKGAVMLAWLLSYLVDSKKAGLELPGKAWRRLRAEYMPVKLEQPAYKTFDHEKRNSSNIIDYLLFDVIKAESDRILEDFDRFCEEHSGLPIDPHLVDAWNKAEQRAANEKQGGKLELYDALQGIKRKLRNVKEEWDAWKKLTDNTSYAMKIAEAAQRLQKVQPPSFEHDLSYTWRNSQYEWERFRASCAYKDSRADFVWYAAGPILCEMKARALGGYRMVENQIYSTLKVNRNSAKRAVGRILRRKSGEESDCEYDDEDFDADESLFVDLDENINDSRLDEE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.53
2	0.5
3	0.45
4	0.35
5	0.34
6	0.27
7	0.25
8	0.23
9	0.17
10	0.16
11	0.14
12	0.17
13	0.16
14	0.16
15	0.17
16	0.19
17	0.16
18	0.15
19	0.18
20	0.18
21	0.26
22	0.34
23	0.42
24	0.46
25	0.48
26	0.53
27	0.58
28	0.67
29	0.67
30	0.67
31	0.65
32	0.64
33	0.64
34	0.61
35	0.52
36	0.42
37	0.39
38	0.32
39	0.31
40	0.26
41	0.28
42	0.28
43	0.28
44	0.35
45	0.33
46	0.38
47	0.35
48	0.38
49	0.38
50	0.37
51	0.38
52	0.33
53	0.29
54	0.26
55	0.24
56	0.21
57	0.21
58	0.21
59	0.2
60	0.25
61	0.24
62	0.23
63	0.22
64	0.21
65	0.2
66	0.24
67	0.29
68	0.28
69	0.31
70	0.36
71	0.37
72	0.39
73	0.41
74	0.44
75	0.42
76	0.42
77	0.42
78	0.39
79	0.47
80	0.47
81	0.47
82	0.42
83	0.44
84	0.4
85	0.39
86	0.38
87	0.33
88	0.37
89	0.36
90	0.36
91	0.38
92	0.41
93	0.39
94	0.38
95	0.39
96	0.33
97	0.33
98	0.31
99	0.29
100	0.32
101	0.35
102	0.36
103	0.36
104	0.37
105	0.37
106	0.39
107	0.34
108	0.31
109	0.28
110	0.28
111	0.26
112	0.25
113	0.23
114	0.2
115	0.2
116	0.16
117	0.15
118	0.15
119	0.16
120	0.16
121	0.16
122	0.16
123	0.16
124	0.16
125	0.19
126	0.19
127	0.18
128	0.22
129	0.26
130	0.28
131	0.32
132	0.36
133	0.38
134	0.37
135	0.39
136	0.36
137	0.36
138	0.37
139	0.33
140	0.29
141	0.25
142	0.25
143	0.22
144	0.2
145	0.17
146	0.13
147	0.13
148	0.13
149	0.11
150	0.09
151	0.07
152	0.06
153	0.05
154	0.05
155	0.06
156	0.05
157	0.05
158	0.05
159	0.06
160	0.06
161	0.06
162	0.06
163	0.05
164	0.05
165	0.06
166	0.06
167	0.11
168	0.13
169	0.15
170	0.16
171	0.18
172	0.23
173	0.29
174	0.36
175	0.37
176	0.39
177	0.47
178	0.55
179	0.63
180	0.68
181	0.7
182	0.71
183	0.71
184	0.71
185	0.7
186	0.72
187	0.71
188	0.67
189	0.62
190	0.55
191	0.52
192	0.47
193	0.39
194	0.28
195	0.21
196	0.17
197	0.15
198	0.13
199	0.16
200	0.17
201	0.2
202	0.24
203	0.27
204	0.27
205	0.26
206	0.3
207	0.26
208	0.26
209	0.25
210	0.23
211	0.19
212	0.18
213	0.17
214	0.13
215	0.13
216	0.12
217	0.12
218	0.1
219	0.11
220	0.1
221	0.1
222	0.09
223	0.08
224	0.09
225	0.08
226	0.07
227	0.07
228	0.06
229	0.07
230	0.07
231	0.07
232	0.07
233	0.08
234	0.08
235	0.07
236	0.08
237	0.07
238	0.11
239	0.2
240	0.25
241	0.25
242	0.31
243	0.34
244	0.35
245	0.43
246	0.51
247	0.52
248	0.54
249	0.62
250	0.67
251	0.74
252	0.83
253	0.85
254	0.84
255	0.84
256	0.84
257	0.83
258	0.81
259	0.72
260	0.68
261	0.62
262	0.6
263	0.54
264	0.49
265	0.41
266	0.37
267	0.37
268	0.31
269	0.3
270	0.25
271	0.28
272	0.36
273	0.37
274	0.38
275	0.37
276	0.4
277	0.4
278	0.39
279	0.34
280	0.28
281	0.31
282	0.36
283	0.39
284	0.36
285	0.35
286	0.4
287	0.43
288	0.43
289	0.37
290	0.29
291	0.27
292	0.27
293	0.26
294	0.2
295	0.14
296	0.12
297	0.13
298	0.12
299	0.13
300	0.13
301	0.13
302	0.12
303	0.13
304	0.15
305	0.14
306	0.14
307	0.12
308	0.12
309	0.12
310	0.12
311	0.11
312	0.08
313	0.09
314	0.08
315	0.08
316	0.06
317	0.07
318	0.07
319	0.08
320	0.08
321	0.08
322	0.09
323	0.09
324	0.1
325	0.09
326	0.1
327	0.1
328	0.09
329	0.09
330	0.09
331	0.09
332	0.09
333	0.08
334	0.07
335	0.07
336	0.08
337	0.07
338	0.07
339	0.07
340	0.09
341	0.09
342	0.1
343	0.1
344	0.09
345	0.09
346	0.09
347	0.08
348	0.06
349	0.06
350	0.05
351	0.05
352	0.06
353	0.08
354	0.07
355	0.08
356	0.12
357	0.13
358	0.15
359	0.2
360	0.24
361	0.27
362	0.28
363	0.31
364	0.36
365	0.36
366	0.36
367	0.4
368	0.42
369	0.4
370	0.41
371	0.43
372	0.36
373	0.38
374	0.4
375	0.35
376	0.3
377	0.29
378	0.27
379	0.23
380	0.21
381	0.18
382	0.19
383	0.16
384	0.16
385	0.19
386	0.23
387	0.24
388	0.26
389	0.28
390	0.27
391	0.28
392	0.29
393	0.26
394	0.23
395	0.27
396	0.3
397	0.36
398	0.38
399	0.38
400	0.45
401	0.49
402	0.53
403	0.55
404	0.52
405	0.47
406	0.45
407	0.46
408	0.38
409	0.33
410	0.33
411	0.28
412	0.27
413	0.26
414	0.22
415	0.19
416	0.21
417	0.27
418	0.25
419	0.27
420	0.31
421	0.34
422	0.37
423	0.4
424	0.4
425	0.4
426	0.41
427	0.43
428	0.41
429	0.41
430	0.37
431	0.36
432	0.33
433	0.25
434	0.21
435	0.16
436	0.14
437	0.11
438	0.12
439	0.1
440	0.13
441	0.16
442	0.16
443	0.16
444	0.16
445	0.2
446	0.23
447	0.25
448	0.23
449	0.21
450	0.22
451	0.22
452	0.2
453	0.16
454	0.13
455	0.12
456	0.12
457	0.13
458	0.1
459	0.1
460	0.09
461	0.09
462	0.09
463	0.09
464	0.1
465	0.09
466	0.11
467	0.12
468	0.12
469	0.12
470	0.12
471	0.12
472	0.13
473	0.19
474	0.26
475	0.28
476	0.34
477	0.37
478	0.43
479	0.48
480	0.52
481	0.52
482	0.48
483	0.51
484	0.49
485	0.52
486	0.45
487	0.41
488	0.34
489	0.29
490	0.25
491	0.23
492	0.25
493	0.26
494	0.35
495	0.44
496	0.5
497	0.51
498	0.54
499	0.57
500	0.58
501	0.56
502	0.56
503	0.47
504	0.43
505	0.43
506	0.4
507	0.34
508	0.25
509	0.23
510	0.14
511	0.13
512	0.1
513	0.08
514	0.09
515	0.09
516	0.11
517	0.15
518	0.18
519	0.19
520	0.2
521	0.23
522	0.28
523	0.33
524	0.34
525	0.3
526	0.28
527	0.27
528	0.26
529	0.23
530	0.17
531	0.11
532	0.09
533	0.07
534	0.07
535	0.07
536	0.06
537	0.06
538	0.07
539	0.08
540	0.07
541	0.12
542	0.14
543	0.15
544	0.16
545	0.17
546	0.16
547	0.2
548	0.25
549	0.22
550	0.19
551	0.18
552	0.21
553	0.19
554	0.21
555	0.23
556	0.19
557	0.21
558	0.24
559	0.29
560	0.3
561	0.32
562	0.37
563	0.41
564	0.49
565	0.55
566	0.62
567	0.67
568	0.74
569	0.81
570	0.82
571	0.8
572	0.76
573	0.69
574	0.6
575	0.51
576	0.4
577	0.33
578	0.26
579	0.2
580	0.18
581	0.2
582	0.23
583	0.22
584	0.23
585	0.23
586	0.24
587	0.24
588	0.25
589	0.24
590	0.2
591	0.21
592	0.19
593	0.18
594	0.16
595	0.14
596	0.1
597	0.07
598	0.06
599	0.05
600	0.05
601	0.05
602	0.05
603	0.05
604	0.05
605	0.05
606	0.06
607	0.07
608	0.06
609	0.07
610	0.13
611	0.15
612	0.15
613	0.15
614	0.15
615	0.16
616	0.16
617	0.17
618	0.14
619	0.13
620	0.14
621	0.15
622	0.17
623	0.16
624	0.14
625	0.12
626	0.09
627	0.09
628	0.08
629	0.1
630	0.12
631	0.13
632	0.13
633	0.15
634	0.15
635	0.15
636	0.16
637	0.15
638	0.13
639	0.13
640	0.13
641	0.13
642	0.15
643	0.15
644	0.16
645	0.15
646	0.14
647	0.12
648	0.13
649	0.12
650	0.1
651	0.09
652	0.08
653	0.07
654	0.1
655	0.12
656	0.13
657	0.12
658	0.13
659	0.14
660	0.14
661	0.15
662	0.16
663	0.15
664	0.13
665	0.16
666	0.15
667	0.14
668	0.14
669	0.14
670	0.09
671	0.11
672	0.11
673	0.09
674	0.1
675	0.09
676	0.09
677	0.08
678	0.08
679	0.06
680	0.05
681	0.05
682	0.05
683	0.06
684	0.07
685	0.07
686	0.08
687	0.09
688	0.1
689	0.1
690	0.1
691	0.1
692	0.09
693	0.09
694	0.1
695	0.1
696	0.1
697	0.1
698	0.11
699	0.1
700	0.1
701	0.1
702	0.07
703	0.09
704	0.09
705	0.1
706	0.13
707	0.12
708	0.14
709	0.14
710	0.14
711	0.12
712	0.12
713	0.12
714	0.1
715	0.11
716	0.12
717	0.15
718	0.15
719	0.16
720	0.16
721	0.15
722	0.21
723	0.21
724	0.24
725	0.23
726	0.25
727	0.23
728	0.22
729	0.23
730	0.15
731	0.14
732	0.11
733	0.11
734	0.08
735	0.08
736	0.09
737	0.08
738	0.1
739	0.11
740	0.16
741	0.16
742	0.21
743	0.25
744	0.29
745	0.33
746	0.4
747	0.43
748	0.37
749	0.35
750	0.35
751	0.34
752	0.33
753	0.32
754	0.27
755	0.22
756	0.22
757	0.21
758	0.16
759	0.14
760	0.11
761	0.12
762	0.08
763	0.08
764	0.09
765	0.09
766	0.1
767	0.12
768	0.13
769	0.11
770	0.11
771	0.12
772	0.13
773	0.15
774	0.16
775	0.14
776	0.13
777	0.13
778	0.14
779	0.13
780	0.12
781	0.1
782	0.08
783	0.08
784	0.08
785	0.08
786	0.08
787	0.09
788	0.14
789	0.14
790	0.14
791	0.14
792	0.15
793	0.17
794	0.2
795	0.25
796	0.21
797	0.21
798	0.22
799	0.26
800	0.28
801	0.25
802	0.22
803	0.16
804	0.17
805	0.16
806	0.15
807	0.1
808	0.12
809	0.13
810	0.14
811	0.18
812	0.16
813	0.15
814	0.17
815	0.23
816	0.2
817	0.18
818	0.17
819	0.17
820	0.2
821	0.26
822	0.32
823	0.36
824	0.43
825	0.54
826	0.58
827	0.61
828	0.59
829	0.54
830	0.52
831	0.47
832	0.43
833	0.4
834	0.39
835	0.34
836	0.38
837	0.42
838	0.43
839	0.45
840	0.52
841	0.54
842	0.58
843	0.64
844	0.64
845	0.65
846	0.59
847	0.53
848	0.45
849	0.36
850	0.28
851	0.21
852	0.17
853	0.11
854	0.1
855	0.09
856	0.06
857	0.06
858	0.05
859	0.04
860	0.03
861	0.04
862	0.04
863	0.04
864	0.05
865	0.05
866	0.06
867	0.06
868	0.06
869	0.08
870	0.13
871	0.15
872	0.17
873	0.25
874	0.26
875	0.3
876	0.32
877	0.32
878	0.3
879	0.3
880	0.3
881	0.26
882	0.3
883	0.31
884	0.3
885	0.29
886	0.31
887	0.29
888	0.27
889	0.25
890	0.25
891	0.25
892	0.3
893	0.32
894	0.31
895	0.31
896	0.32
897	0.32
898	0.25
899	0.21
900	0.15
901	0.11
902	0.08
903	0.08
904	0.07
905	0.07
906	0.08
907	0.07
908	0.07
909	0.07
910	0.08
911	0.08
912	0.1
913	0.08
914	0.08
915	0.08
916	0.11
917	0.12
918	0.12
919	0.15
920	0.13
921	0.14
922	0.13
923	0.14
924	0.11
925	0.12
926	0.11
927	0.08
928	0.08
929	0.08
930	0.08
931	0.09
932	0.09
933	0.06
934	0.07
935	0.06
936	0.07
937	0.08
938	0.08
939	0.06
940	0.07
941	0.07
942	0.08
943	0.08
944	0.09
945	0.09
946	0.09
947	0.1
948	0.15
949	0.25
950	0.28
951	0.31
952	0.33
953	0.34
954	0.42
955	0.49
956	0.5
957	0.49
958	0.55
959	0.62
960	0.67
961	0.73
962	0.69
963	0.65
964	0.6
965	0.52
966	0.48
967	0.4
968	0.36
969	0.31
970	0.26
971	0.22
972	0.23
973	0.22
974	0.15
975	0.13
976	0.1
977	0.07
978	0.07
979	0.07
980	0.05
981	0.05
982	0.04
983	0.05
984	0.05
985	0.04
986	0.04
987	0.04
988	0.05
989	0.05
990	0.07
991	0.06
992	0.06
993	0.08
994	0.09
995	0.09
996	0.09
997	0.1
998	0.1
999	0.15
1000	0.18
1001	0.16
1002	0.15
1003	0.18
1004	0.18
1005	0.2
1006	0.25
1007	0.21
1008	0.21
1009	0.21
1010	0.21
1011	0.2
1012	0.23
1013	0.26
1014	0.2
1015	0.21
1016	0.19
1017	0.21
1018	0.22
1019	0.21
1020	0.17
1021	0.13
1022	0.13
1023	0.13
1024	0.12
1025	0.1
1026	0.09
1027	0.09
1028	0.12
1029	0.16
1030	0.18
1031	0.19
1032	0.21
1033	0.22
1034	0.25
1035	0.27
1036	0.25
1037	0.21
1038	0.19
1039	0.18
1040	0.2
1041	0.17
1042	0.15
1043	0.13
1044	0.17
1045	0.16
1046	0.17
1047	0.2
1048	0.18
1049	0.19
1050	0.19
1051	0.24
1052	0.19
1053	0.21
1054	0.22
1055	0.2
1056	0.24
1057	0.25
1058	0.26
1059	0.21
1060	0.22
1061	0.22
1062	0.21
1063	0.22
1064	0.21
1065	0.2
1066	0.22
1067	0.23
1068	0.22
1069	0.21
1070	0.22
1071	0.2
1072	0.15
1073	0.15
1074	0.13
1075	0.11
1076	0.1
1077	0.09
1078	0.07
1079	0.06
1080	0.06
1081	0.06
1082	0.05
1083	0.06
1084	0.07
1085	0.07
1086	0.09
1087	0.1
1088	0.11
1089	0.12
1090	0.13
1091	0.13
1092	0.16
1093	0.2
1094	0.2
1095	0.25
1096	0.32
1097	0.34
1098	0.38
1099	0.42
1100	0.44
1101	0.45
1102	0.47
1103	0.48
1104	0.47
1105	0.53
1106	0.55
1107	0.55
1108	0.51
1109	0.46
1110	0.44
1111	0.4
1112	0.38
1113	0.31
1114	0.28
1115	0.29
1116	0.3
1117	0.3
1118	0.34
1119	0.4
1120	0.43
1121	0.49
1122	0.5
1123	0.52
1124	0.53
1125	0.57
1126	0.55
1127	0.49
1128	0.45
1129	0.38
1130	0.36
1131	0.29
1132	0.24
1133	0.22
1134	0.2
1135	0.18
1136	0.13
1137	0.13
1138	0.1
1139	0.11
1140	0.11
1141	0.1
1142	0.1
1143	0.11
1144	0.12
1145	0.12
1146	0.15
1147	0.13
1148	0.16
1149	0.16
1150	0.17
1151	0.21
1152	0.2
1153	0.2
1154	0.22
1155	0.22
1156	0.21
1157	0.22
1158	0.24
1159	0.2
1160	0.2
1161	0.19
1162	0.17
1163	0.16
1164	0.15
1165	0.13
1166	0.11
1167	0.12
1168	0.14
1169	0.17
1170	0.21
1171	0.21
1172	0.21
1173	0.24
1174	0.24
1175	0.3
1176	0.37
1177	0.38
1178	0.39
1179	0.45
1180	0.46
1181	0.47
1182	0.49
1183	0.44
1184	0.35
1185	0.32
1186	0.26
1187	0.23
1188	0.22
1189	0.19
1190	0.15
1191	0.15
1192	0.18
1193	0.2
1194	0.23
1195	0.27
1196	0.29
1197	0.36
1198	0.46
1199	0.52
1200	0.58
1201	0.62
1202	0.65
1203	0.65
1204	0.68
1205	0.68
1206	0.67
1207	0.61
1208	0.53
1209	0.51
1210	0.45
1211	0.44
1212	0.44
1213	0.4
1214	0.33
1215	0.34
1216	0.38
1217	0.34
1218	0.32
1219	0.27
1220	0.21
1221	0.18
1222	0.2
1223	0.21
1224	0.18
1225	0.2
1226	0.25
1227	0.28
1228	0.3
1229	0.32
1230	0.34
1231	0.37
1232	0.39
1233	0.44
1234	0.45
1235	0.5
1236	0.53
1237	0.51
1238	0.47
1239	0.41
1240	0.39
1241	0.36
1242	0.36
1243	0.3
1244	0.28
1245	0.32
1246	0.32
1247	0.31
1248	0.39
1249	0.43
1250	0.48
1251	0.51
1252	0.53
1253	0.53
1254	0.52
1255	0.55
1256	0.53
1257	0.47
1258	0.43
1259	0.46
1260	0.48
1261	0.48
1262	0.54
1263	0.53
1264	0.5
1265	0.47
1266	0.46
1267	0.38
1268	0.33
1269	0.31
1270	0.25
1271	0.23
1272	0.2
1273	0.18
1274	0.14
1275	0.15
1276	0.15
1277	0.12
1278	0.13
1279	0.13
1280	0.15
1281	0.17
1282	0.17
1283	0.18
1284	0.19
1285	0.21
1286	0.25
1287	0.27
1288	0.24
1289	0.24
1290	0.25
1291	0.24
1292	0.21
1293	0.21
1294	0.21
1295	0.2
1296	0.19
1297	0.24
1298	0.3
1299	0.36
1300	0.4
1301	0.46
1302	0.5
1303	0.56
1304	0.61
1305	0.6
1306	0.61
1307	0.6
1308	0.62
1309	0.63
1310	0.63
1311	0.66
1312	0.71
1313	0.73
1314	0.71
1315	0.7
1316	0.68
1317	0.65
1318	0.67
1319	0.62
1320	0.57
1321	0.56
1322	0.53
1323	0.51
1324	0.48
1325	0.42
1326	0.33
1327	0.28
1328	0.24
1329	0.17
1330	0.12
1331	0.11
1332	0.11
1333	0.1
1334	0.09
1335	0.09
1336	0.08
1337	0.07
1338	0.07
1339	0.08
1340	0.07
1341	0.08
1342	0.09
1343	0.1
1344	0.1
1345	0.11
1346	0.12

C1GJK3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer