Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3ITA4

Protein Details
Accession A0A1E3ITA4    Localization Confidence High Confidence Score 21.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
43-65AEENYAKRRQDMKREKEEKEVREBasic
93-118NLDAKAWIKKQKKGEKRRAKEFAEMNHydrophilic
275-300KEGEAGFKKPKRKKTKRSSRHVDAEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
50-75RRQDMKREKEEKEVREKIEKARNKSA
98-112AWIKKQKKGEKRRAK
281-293FKKPKRKKTKRSS
338-348ARRAAVKKKSK
616-630KTSGRMKTEKRLKKI
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 14.5, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005011  SNU66/SART1  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03343  SART-1  
Amino Acid Sequences MSSHQESLSLEETNKVRVSLGLAPIGAAPAEGEEVPEDKDAIAEENYAKRRQDMKREKEEKEVREKIEKARNKSALNAKLRGTTLADPGKDDNLDAKAWIKKQKKGEKRRAKEFAEMNARELEERNNLIYGEEDLAGIRVGHDVEDFEEGEDVILTLKDSKVLDEGEDELQNVNMTEDAAIKAAKDRKRKAQQAYTGYDDEEFDEGRIGQRAEVLGKYDESFVTGKVKLEGFRLGGPVEKKSKLSVEEAEAGAPVQMVKLNLDYTKEFEVSDYVKEGEAGFKKPKRKKTKRSSRHVDAEEDTNAMGVDDQPTFAPRVVVAGPENLVDDDDLQAALSRARRAAVKKKSKVKQEDFIAQIAQRRQEEELKSKEEDSAEDGRITFDETSEFVRNVSLDSLAVLVKRERIFSPPNSSNPAPAPAGPSDSNSEVVVKIERREEGEVDEDEDMGEEDEGLAEMAAREGMSLEEYRIRIDSQMQEIQELKAQVKEEEDASEPTVGQGMAGVLALLRHQGALKSQTTEDEERERIQKQKDLWLADYRRRMAQRELERIQARGGNKDQAQREWENRMREQQEARDALDIYKNYKPDVSIKYHDEFGREMTPKEAWKSLSHKFHGKTSGRMKTEKRLKKIAEERKQLTMNSSDTPLGMSEAFSRRQQKTGEAHMVLTVGNKQSVQANGSKKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.24
3 0.21
4 0.2
5 0.24
6 0.24
7 0.26
8 0.24
9 0.22
10 0.22
11 0.22
12 0.21
13 0.16
14 0.1
15 0.07
16 0.05
17 0.07
18 0.07
19 0.07
20 0.08
21 0.09
22 0.11
23 0.12
24 0.12
25 0.1
26 0.11
27 0.11
28 0.12
29 0.12
30 0.12
31 0.15
32 0.23
33 0.28
34 0.32
35 0.32
36 0.35
37 0.44
38 0.5
39 0.58
40 0.61
41 0.66
42 0.73
43 0.81
44 0.79
45 0.8
46 0.81
47 0.78
48 0.77
49 0.75
50 0.69
51 0.69
52 0.69
53 0.68
54 0.69
55 0.69
56 0.67
57 0.69
58 0.71
59 0.64
60 0.68
61 0.69
62 0.68
63 0.67
64 0.63
65 0.55
66 0.53
67 0.52
68 0.46
69 0.4
70 0.33
71 0.34
72 0.35
73 0.33
74 0.31
75 0.32
76 0.33
77 0.29
78 0.26
79 0.22
80 0.19
81 0.19
82 0.17
83 0.2
84 0.23
85 0.28
86 0.37
87 0.41
88 0.45
89 0.56
90 0.65
91 0.71
92 0.77
93 0.83
94 0.85
95 0.88
96 0.92
97 0.9
98 0.84
99 0.81
100 0.75
101 0.73
102 0.72
103 0.63
104 0.54
105 0.48
106 0.44
107 0.37
108 0.33
109 0.27
110 0.21
111 0.22
112 0.21
113 0.19
114 0.19
115 0.18
116 0.17
117 0.15
118 0.12
119 0.11
120 0.1
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.08
125 0.07
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.06
131 0.07
132 0.1
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.06
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.06
145 0.09
146 0.09
147 0.1
148 0.12
149 0.12
150 0.13
151 0.13
152 0.15
153 0.14
154 0.15
155 0.14
156 0.12
157 0.12
158 0.12
159 0.1
160 0.08
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.13
170 0.2
171 0.26
172 0.34
173 0.4
174 0.5
175 0.6
176 0.69
177 0.72
178 0.74
179 0.77
180 0.75
181 0.74
182 0.68
183 0.59
184 0.5
185 0.42
186 0.32
187 0.25
188 0.18
189 0.14
190 0.09
191 0.09
192 0.08
193 0.09
194 0.11
195 0.1
196 0.09
197 0.1
198 0.11
199 0.11
200 0.12
201 0.13
202 0.12
203 0.12
204 0.13
205 0.13
206 0.12
207 0.12
208 0.12
209 0.11
210 0.14
211 0.14
212 0.14
213 0.15
214 0.17
215 0.16
216 0.17
217 0.18
218 0.16
219 0.16
220 0.16
221 0.14
222 0.17
223 0.17
224 0.2
225 0.22
226 0.22
227 0.22
228 0.23
229 0.26
230 0.24
231 0.26
232 0.24
233 0.23
234 0.24
235 0.23
236 0.22
237 0.19
238 0.16
239 0.13
240 0.1
241 0.07
242 0.04
243 0.05
244 0.05
245 0.05
246 0.06
247 0.08
248 0.08
249 0.11
250 0.11
251 0.12
252 0.14
253 0.14
254 0.13
255 0.12
256 0.14
257 0.13
258 0.13
259 0.12
260 0.1
261 0.1
262 0.1
263 0.1
264 0.13
265 0.14
266 0.17
267 0.23
268 0.27
269 0.37
270 0.44
271 0.54
272 0.6
273 0.69
274 0.77
275 0.81
276 0.88
277 0.89
278 0.93
279 0.92
280 0.89
281 0.87
282 0.79
283 0.71
284 0.61
285 0.54
286 0.43
287 0.34
288 0.25
289 0.16
290 0.13
291 0.09
292 0.07
293 0.04
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.06
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.05
303 0.07
304 0.07
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.08
310 0.08
311 0.06
312 0.06
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.06
322 0.07
323 0.07
324 0.08
325 0.09
326 0.12
327 0.17
328 0.26
329 0.35
330 0.44
331 0.51
332 0.6
333 0.66
334 0.72
335 0.77
336 0.72
337 0.69
338 0.63
339 0.61
340 0.53
341 0.48
342 0.4
343 0.31
344 0.3
345 0.24
346 0.23
347 0.17
348 0.17
349 0.18
350 0.23
351 0.25
352 0.28
353 0.3
354 0.31
355 0.31
356 0.3
357 0.3
358 0.25
359 0.22
360 0.2
361 0.19
362 0.17
363 0.16
364 0.16
365 0.14
366 0.14
367 0.15
368 0.1
369 0.07
370 0.07
371 0.07
372 0.1
373 0.12
374 0.11
375 0.1
376 0.1
377 0.1
378 0.1
379 0.1
380 0.07
381 0.05
382 0.05
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.07
387 0.07
388 0.11
389 0.12
390 0.14
391 0.14
392 0.18
393 0.23
394 0.25
395 0.34
396 0.34
397 0.36
398 0.4
399 0.39
400 0.37
401 0.34
402 0.33
403 0.25
404 0.21
405 0.21
406 0.15
407 0.19
408 0.17
409 0.17
410 0.17
411 0.17
412 0.18
413 0.15
414 0.15
415 0.12
416 0.12
417 0.14
418 0.12
419 0.13
420 0.14
421 0.15
422 0.17
423 0.18
424 0.18
425 0.17
426 0.19
427 0.17
428 0.17
429 0.16
430 0.13
431 0.11
432 0.11
433 0.09
434 0.06
435 0.05
436 0.03
437 0.03
438 0.03
439 0.03
440 0.03
441 0.03
442 0.03
443 0.03
444 0.03
445 0.03
446 0.03
447 0.03
448 0.03
449 0.04
450 0.05
451 0.06
452 0.07
453 0.1
454 0.1
455 0.11
456 0.12
457 0.12
458 0.12
459 0.15
460 0.18
461 0.19
462 0.23
463 0.22
464 0.23
465 0.24
466 0.24
467 0.22
468 0.21
469 0.16
470 0.15
471 0.16
472 0.15
473 0.15
474 0.15
475 0.13
476 0.14
477 0.16
478 0.14
479 0.15
480 0.15
481 0.13
482 0.12
483 0.12
484 0.1
485 0.07
486 0.06
487 0.05
488 0.04
489 0.04
490 0.04
491 0.03
492 0.03
493 0.04
494 0.04
495 0.04
496 0.04
497 0.05
498 0.06
499 0.09
500 0.14
501 0.16
502 0.18
503 0.18
504 0.21
505 0.25
506 0.27
507 0.27
508 0.28
509 0.28
510 0.29
511 0.32
512 0.33
513 0.35
514 0.36
515 0.38
516 0.36
517 0.43
518 0.45
519 0.45
520 0.45
521 0.48
522 0.49
523 0.52
524 0.56
525 0.49
526 0.5
527 0.5
528 0.5
529 0.48
530 0.52
531 0.54
532 0.56
533 0.56
534 0.58
535 0.56
536 0.53
537 0.49
538 0.44
539 0.36
540 0.34
541 0.35
542 0.33
543 0.35
544 0.41
545 0.42
546 0.41
547 0.46
548 0.45
549 0.47
550 0.49
551 0.51
552 0.51
553 0.52
554 0.57
555 0.53
556 0.53
557 0.53
558 0.5
559 0.52
560 0.48
561 0.45
562 0.39
563 0.37
564 0.33
565 0.34
566 0.29
567 0.25
568 0.27
569 0.27
570 0.25
571 0.25
572 0.26
573 0.28
574 0.33
575 0.36
576 0.38
577 0.42
578 0.44
579 0.48
580 0.47
581 0.41
582 0.36
583 0.32
584 0.35
585 0.31
586 0.3
587 0.27
588 0.3
589 0.31
590 0.34
591 0.34
592 0.28
593 0.33
594 0.39
595 0.44
596 0.5
597 0.51
598 0.56
599 0.55
600 0.59
601 0.63
602 0.6
603 0.61
604 0.62
605 0.66
606 0.62
607 0.67
608 0.65
609 0.66
610 0.73
611 0.73
612 0.7
613 0.71
614 0.69
615 0.73
616 0.78
617 0.79
618 0.78
619 0.79
620 0.75
621 0.74
622 0.74
623 0.64
624 0.58
625 0.52
626 0.45
627 0.37
628 0.36
629 0.29
630 0.25
631 0.25
632 0.21
633 0.17
634 0.14
635 0.13
636 0.16
637 0.2
638 0.23
639 0.29
640 0.37
641 0.38
642 0.43
643 0.44
644 0.46
645 0.49
646 0.55
647 0.58
648 0.51
649 0.49
650 0.44
651 0.42
652 0.34
653 0.29
654 0.24
655 0.17
656 0.17
657 0.17
658 0.17
659 0.21
660 0.24
661 0.25
662 0.28