Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GGA0

Protein Details
Accession C1GGA0    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-56LNPEPEKRERYRQQLPTPCPSRFARDYRQSPPPRQKKQKISKDAAVFTRHydrophilic
270-290ANTTRWSKKKLRPKLAPAREAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
277-283KKKLRPK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036887  HTH_APSES_sf  
IPR003163  Tscrpt_reg_HTH_APSES-type  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG pbn:PADG_06337  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51299  HTH_APSES  
Amino Acid Sequences MASIASLLNPEPEKRERYRQQLPTPCPSRFARDYRQSPPPRQKKQKISKDAAVFTRGRVRGELRYPPCEHQSKELAEAHREFQIHPMGHIIEYPRHIPYNSEKKSFLEETGRESFEVFQYTFKVPGDEKTYTVMWDYNIGLVRTTSLFRCNNYSKTAPAKMLNANPGLREICHSITGGALAAQGYWMPFEAAKAVAATFCWKIRYALTPLFGVEFLSICIPPEDSRFGRMVIDPSIVRDATNSARKYRLLEGRNVMSRKNPLDSYRQPTANTTRWSKKKLRPKLAPAREAGVGLGAGVGEDREYIIDTDTSDALCLSPSKPRMNICAPASTPRTPGTFRCKIPSPHEILASLNNLQNNSSKWANKMHQDADLGTEPKSEVSTASSPAELVTRDDSHHDTDNESNDEDGERDIGAEADPKTEHRREFGGSLFDISDKEKQEAYRAKRRSSPLPLTNDARAAYMLMRLHMQDVVSTDYQKRRRASA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.51
3 0.55
4 0.63
5 0.72
6 0.75
7 0.8
8 0.83
9 0.83
10 0.83
11 0.8
12 0.72
13 0.67
14 0.6
15 0.58
16 0.56
17 0.57
18 0.57
19 0.61
20 0.67
21 0.68
22 0.76
23 0.75
24 0.78
25 0.81
26 0.82
27 0.82
28 0.87
29 0.9
30 0.91
31 0.93
32 0.94
33 0.93
34 0.9
35 0.88
36 0.84
37 0.8
38 0.73
39 0.68
40 0.58
41 0.51
42 0.52
43 0.45
44 0.38
45 0.36
46 0.36
47 0.37
48 0.43
49 0.5
50 0.46
51 0.52
52 0.54
53 0.55
54 0.59
55 0.58
56 0.54
57 0.5
58 0.52
59 0.47
60 0.49
61 0.5
62 0.45
63 0.44
64 0.45
65 0.4
66 0.36
67 0.35
68 0.29
69 0.27
70 0.32
71 0.27
72 0.25
73 0.26
74 0.23
75 0.22
76 0.24
77 0.21
78 0.18
79 0.2
80 0.21
81 0.21
82 0.22
83 0.22
84 0.24
85 0.31
86 0.39
87 0.42
88 0.44
89 0.42
90 0.42
91 0.49
92 0.47
93 0.4
94 0.37
95 0.33
96 0.35
97 0.39
98 0.38
99 0.32
100 0.3
101 0.28
102 0.22
103 0.24
104 0.17
105 0.14
106 0.16
107 0.17
108 0.19
109 0.17
110 0.18
111 0.16
112 0.2
113 0.25
114 0.23
115 0.23
116 0.24
117 0.24
118 0.22
119 0.22
120 0.19
121 0.13
122 0.14
123 0.14
124 0.13
125 0.15
126 0.15
127 0.14
128 0.13
129 0.13
130 0.12
131 0.14
132 0.12
133 0.16
134 0.18
135 0.19
136 0.27
137 0.3
138 0.32
139 0.36
140 0.36
141 0.34
142 0.38
143 0.4
144 0.36
145 0.34
146 0.35
147 0.34
148 0.36
149 0.35
150 0.33
151 0.3
152 0.27
153 0.27
154 0.24
155 0.19
156 0.18
157 0.17
158 0.14
159 0.15
160 0.15
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.09
165 0.06
166 0.05
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.05
178 0.05
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.05
183 0.05
184 0.08
185 0.08
186 0.09
187 0.1
188 0.11
189 0.12
190 0.13
191 0.17
192 0.19
193 0.21
194 0.21
195 0.2
196 0.2
197 0.19
198 0.18
199 0.14
200 0.1
201 0.07
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.05
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.08
210 0.12
211 0.12
212 0.14
213 0.15
214 0.15
215 0.15
216 0.16
217 0.15
218 0.12
219 0.13
220 0.11
221 0.11
222 0.13
223 0.12
224 0.11
225 0.09
226 0.1
227 0.13
228 0.2
229 0.2
230 0.2
231 0.22
232 0.23
233 0.26
234 0.3
235 0.33
236 0.29
237 0.32
238 0.34
239 0.35
240 0.4
241 0.38
242 0.33
243 0.28
244 0.3
245 0.27
246 0.26
247 0.24
248 0.22
249 0.29
250 0.35
251 0.38
252 0.39
253 0.39
254 0.37
255 0.39
256 0.42
257 0.4
258 0.39
259 0.38
260 0.42
261 0.46
262 0.52
263 0.58
264 0.6
265 0.64
266 0.7
267 0.74
268 0.74
269 0.79
270 0.84
271 0.83
272 0.79
273 0.7
274 0.62
275 0.52
276 0.43
277 0.32
278 0.21
279 0.13
280 0.08
281 0.07
282 0.04
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.02
287 0.02
288 0.02
289 0.03
290 0.04
291 0.04
292 0.05
293 0.05
294 0.06
295 0.07
296 0.08
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.06
301 0.06
302 0.07
303 0.07
304 0.12
305 0.17
306 0.2
307 0.23
308 0.25
309 0.31
310 0.34
311 0.4
312 0.36
313 0.37
314 0.35
315 0.37
316 0.4
317 0.36
318 0.34
319 0.29
320 0.3
321 0.27
322 0.32
323 0.35
324 0.38
325 0.38
326 0.41
327 0.46
328 0.48
329 0.52
330 0.54
331 0.51
332 0.47
333 0.46
334 0.41
335 0.36
336 0.34
337 0.3
338 0.25
339 0.2
340 0.18
341 0.17
342 0.18
343 0.19
344 0.18
345 0.2
346 0.22
347 0.22
348 0.24
349 0.31
350 0.34
351 0.38
352 0.42
353 0.4
354 0.39
355 0.38
356 0.36
357 0.33
358 0.33
359 0.28
360 0.22
361 0.21
362 0.18
363 0.17
364 0.17
365 0.12
366 0.08
367 0.12
368 0.14
369 0.16
370 0.17
371 0.16
372 0.16
373 0.16
374 0.17
375 0.13
376 0.13
377 0.15
378 0.15
379 0.16
380 0.2
381 0.22
382 0.24
383 0.28
384 0.26
385 0.26
386 0.28
387 0.31
388 0.3
389 0.28
390 0.24
391 0.2
392 0.2
393 0.17
394 0.14
395 0.11
396 0.08
397 0.08
398 0.08
399 0.08
400 0.07
401 0.11
402 0.11
403 0.12
404 0.13
405 0.16
406 0.24
407 0.29
408 0.3
409 0.29
410 0.32
411 0.33
412 0.35
413 0.35
414 0.33
415 0.28
416 0.28
417 0.26
418 0.23
419 0.21
420 0.21
421 0.23
422 0.21
423 0.22
424 0.23
425 0.24
426 0.32
427 0.41
428 0.46
429 0.51
430 0.56
431 0.59
432 0.64
433 0.7
434 0.7
435 0.7
436 0.72
437 0.7
438 0.71
439 0.72
440 0.69
441 0.66
442 0.6
443 0.5
444 0.41
445 0.33
446 0.26
447 0.2
448 0.2
449 0.18
450 0.16
451 0.17
452 0.16
453 0.18
454 0.18
455 0.17
456 0.14
457 0.15
458 0.2
459 0.19
460 0.22
461 0.28
462 0.35
463 0.43
464 0.49