Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3IB00

Protein Details
Accession A0A1E3IB00    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
252-316TSQGDIDKKRKGKKRPGEEDTDEKPKSKKKKKHANGEGEGGDDKRKSTSKKFIGEKKKKLDKKSABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
259-316KKRKGKKRPGEEDTDEKPKSKKKKKHANGEGEGGDDKRKSTSKKFIGEKKKKLDKKSA
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 8, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MASASGYNHHRFARAVLKKSRKWEPSLTVQLFANHWRFENSPVNFQYDGPMKPFLLAIRSQVIPASLIPFLYDIQPPISFVDGCLVVELQDYRRSPENRSRVVMRPAAETLAQTIDVMLERKGQNWDEGVALELESRIIAATSPPLYLGTSIMATRNATLALTLTTPAQPNLSAEGALRRPQQLESELTSSVEKFRKLILAGSRSGAGAAPFQPDWLVLRAKEQYESLLKRKERVGMLSQGAQGPDGERPGTSQGDIDKKRKGKKRPGEEDTDEKPKSKKKKKHANGEGEGGDDKRKSTSKKFIGEKKKKLDKKSA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.46
3 0.52
4 0.61
5 0.65
6 0.72
7 0.77
8 0.73
9 0.71
10 0.71
11 0.67
12 0.67
13 0.72
14 0.67
15 0.59
16 0.54
17 0.49
18 0.42
19 0.42
20 0.37
21 0.27
22 0.26
23 0.27
24 0.27
25 0.32
26 0.39
27 0.35
28 0.39
29 0.39
30 0.43
31 0.4
32 0.39
33 0.38
34 0.34
35 0.33
36 0.27
37 0.28
38 0.23
39 0.23
40 0.24
41 0.19
42 0.18
43 0.17
44 0.17
45 0.18
46 0.19
47 0.18
48 0.17
49 0.17
50 0.14
51 0.14
52 0.13
53 0.1
54 0.09
55 0.09
56 0.1
57 0.1
58 0.11
59 0.11
60 0.1
61 0.12
62 0.12
63 0.13
64 0.13
65 0.14
66 0.12
67 0.11
68 0.13
69 0.11
70 0.11
71 0.1
72 0.09
73 0.07
74 0.08
75 0.09
76 0.09
77 0.14
78 0.14
79 0.17
80 0.25
81 0.27
82 0.31
83 0.4
84 0.47
85 0.45
86 0.49
87 0.51
88 0.49
89 0.53
90 0.51
91 0.43
92 0.37
93 0.33
94 0.3
95 0.26
96 0.2
97 0.15
98 0.12
99 0.11
100 0.08
101 0.07
102 0.06
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.11
107 0.11
108 0.13
109 0.16
110 0.16
111 0.17
112 0.17
113 0.17
114 0.12
115 0.12
116 0.11
117 0.08
118 0.07
119 0.06
120 0.05
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.05
129 0.05
130 0.06
131 0.06
132 0.06
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.06
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.06
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.09
159 0.09
160 0.08
161 0.08
162 0.11
163 0.12
164 0.15
165 0.16
166 0.15
167 0.16
168 0.16
169 0.18
170 0.17
171 0.18
172 0.18
173 0.19
174 0.18
175 0.18
176 0.17
177 0.15
178 0.18
179 0.18
180 0.15
181 0.14
182 0.15
183 0.16
184 0.17
185 0.21
186 0.22
187 0.23
188 0.23
189 0.23
190 0.23
191 0.2
192 0.2
193 0.16
194 0.1
195 0.08
196 0.08
197 0.1
198 0.09
199 0.1
200 0.09
201 0.09
202 0.11
203 0.12
204 0.13
205 0.11
206 0.15
207 0.18
208 0.19
209 0.2
210 0.18
211 0.19
212 0.24
213 0.29
214 0.32
215 0.37
216 0.37
217 0.4
218 0.42
219 0.44
220 0.4
221 0.4
222 0.39
223 0.36
224 0.38
225 0.38
226 0.36
227 0.32
228 0.29
229 0.25
230 0.2
231 0.15
232 0.13
233 0.12
234 0.11
235 0.09
236 0.11
237 0.14
238 0.15
239 0.14
240 0.15
241 0.19
242 0.28
243 0.34
244 0.37
245 0.42
246 0.48
247 0.57
248 0.65
249 0.7
250 0.71
251 0.76
252 0.83
253 0.85
254 0.85
255 0.84
256 0.82
257 0.79
258 0.74
259 0.73
260 0.63
261 0.55
262 0.55
263 0.54
264 0.59
265 0.62
266 0.66
267 0.67
268 0.78
269 0.85
270 0.9
271 0.92
272 0.92
273 0.87
274 0.84
275 0.74
276 0.65
277 0.57
278 0.46
279 0.39
280 0.29
281 0.24
282 0.22
283 0.28
284 0.32
285 0.39
286 0.49
287 0.54
288 0.63
289 0.71
290 0.76
291 0.82
292 0.86
293 0.87
294 0.87
295 0.89
296 0.88