Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GCD5

Protein Details
Accession C1GCD5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-37QSVRIGKGTPRRKTKKVHKSSGTDDKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-29GKGTPRRKTKKVHK
Subcellular Location(s) nucl 20, mito_nucl 13.333, cyto_nucl 11.333, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039370  BTF3  
IPR038187  NAC_A/B_dom_sf  
IPR002715  Nas_poly-pep-assoc_cplx_dom  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
KEGG pbn:PADG_04657  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01849  NAC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51151  NAC_AB  
CDD cd22055  NAC_BTF3  
Amino Acid Sequences MDQAKLARLQQSVRIGKGTPRRKTKKVHKSSGTDDKKLQTSLKKLNVQPIQAIEEVNMFKEDGNVIHFAAPKVHASVPSNTFAIYGNGEDKELTELVPGILNQLGPDSLASLRKLAESYQSMQKRESGGDGKNVEEEDDDDIPDLVDGENFESKVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.36
3 0.41
4 0.49
5 0.52
6 0.51
7 0.58
8 0.65
9 0.7
10 0.8
11 0.83
12 0.85
13 0.85
14 0.87
15 0.84
16 0.83
17 0.84
18 0.84
19 0.8
20 0.73
21 0.66
22 0.59
23 0.54
24 0.49
25 0.45
26 0.4
27 0.41
28 0.45
29 0.5
30 0.53
31 0.52
32 0.58
33 0.58
34 0.52
35 0.47
36 0.4
37 0.34
38 0.28
39 0.26
40 0.17
41 0.16
42 0.14
43 0.13
44 0.11
45 0.09
46 0.08
47 0.08
48 0.08
49 0.06
50 0.08
51 0.08
52 0.08
53 0.09
54 0.1
55 0.1
56 0.11
57 0.11
58 0.1
59 0.11
60 0.11
61 0.12
62 0.13
63 0.16
64 0.17
65 0.18
66 0.17
67 0.15
68 0.15
69 0.14
70 0.12
71 0.1
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.07
81 0.06
82 0.06
83 0.06
84 0.07
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.07
96 0.09
97 0.1
98 0.1
99 0.11
100 0.11
101 0.12
102 0.11
103 0.15
104 0.16
105 0.2
106 0.28
107 0.33
108 0.34
109 0.34
110 0.37
111 0.33
112 0.31
113 0.33
114 0.29
115 0.26
116 0.32
117 0.32
118 0.3
119 0.3
120 0.29
121 0.24
122 0.2
123 0.18
124 0.16
125 0.15
126 0.14
127 0.13
128 0.13
129 0.12
130 0.11
131 0.11
132 0.06
133 0.06
134 0.07
135 0.09
136 0.12