Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GFT2

Protein Details
Accession C1GFT2    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
192-217YYQYAPRKPSEKKRRSTTRCNSRIVKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
111-128RSPKARKMIRGKPEKIPR
200-205PSEKKR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 4.5, cyto_mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG pbn:PADG_06118  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd01389  HMG-box_ROX1-like  
Amino Acid Sequences MATAMTTAADPMSGSLDLVLELIWQHAMNHLKSTKNEILLPADIDVVIGLDNVEKIKDRLSMLLSTPVVSFKDNVNGVYRIMPTPALDGVVDAAVAQIMPMIVTNNDRSARSPKARKMIRGKPEKIPRPSNAFILYRRHHHPLVKASNPDFHNNDISILLGKRWKAESSETKAYFKALADEIKAQHAKDHPYYQYAPRKPSEKKRRSTTRCNSRIVKSSKFGSRGAATPISQSDGANANFLSSASDENNILNVERNFNLLVPLIPSPQLTNMSMTHTTNYVGGFGDTGFMNMPVRRPVAGNTAQQSLHSNTSAPTQWVNLDFDLDQFLDTFSQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.08
3 0.08
4 0.08
5 0.08
6 0.07
7 0.05
8 0.05
9 0.06
10 0.06
11 0.06
12 0.07
13 0.12
14 0.18
15 0.18
16 0.25
17 0.28
18 0.32
19 0.34
20 0.43
21 0.42
22 0.4
23 0.41
24 0.36
25 0.37
26 0.33
27 0.33
28 0.24
29 0.2
30 0.16
31 0.14
32 0.11
33 0.07
34 0.06
35 0.05
36 0.04
37 0.04
38 0.05
39 0.05
40 0.06
41 0.08
42 0.08
43 0.11
44 0.14
45 0.15
46 0.17
47 0.2
48 0.22
49 0.22
50 0.28
51 0.25
52 0.23
53 0.22
54 0.21
55 0.19
56 0.17
57 0.17
58 0.12
59 0.19
60 0.19
61 0.19
62 0.22
63 0.21
64 0.21
65 0.23
66 0.23
67 0.17
68 0.17
69 0.17
70 0.13
71 0.14
72 0.13
73 0.11
74 0.09
75 0.08
76 0.08
77 0.07
78 0.07
79 0.05
80 0.04
81 0.03
82 0.03
83 0.03
84 0.02
85 0.02
86 0.02
87 0.03
88 0.04
89 0.05
90 0.07
91 0.08
92 0.12
93 0.14
94 0.14
95 0.17
96 0.22
97 0.29
98 0.36
99 0.43
100 0.45
101 0.54
102 0.57
103 0.63
104 0.68
105 0.69
106 0.7
107 0.72
108 0.7
109 0.7
110 0.76
111 0.76
112 0.74
113 0.71
114 0.65
115 0.63
116 0.61
117 0.54
118 0.48
119 0.43
120 0.38
121 0.4
122 0.38
123 0.34
124 0.37
125 0.38
126 0.37
127 0.37
128 0.39
129 0.41
130 0.46
131 0.45
132 0.45
133 0.42
134 0.45
135 0.44
136 0.42
137 0.35
138 0.29
139 0.27
140 0.23
141 0.22
142 0.15
143 0.14
144 0.11
145 0.1
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.1
150 0.11
151 0.12
152 0.12
153 0.18
154 0.24
155 0.3
156 0.38
157 0.38
158 0.38
159 0.37
160 0.36
161 0.32
162 0.24
163 0.19
164 0.12
165 0.12
166 0.12
167 0.14
168 0.14
169 0.18
170 0.19
171 0.16
172 0.18
173 0.19
174 0.22
175 0.23
176 0.27
177 0.23
178 0.26
179 0.29
180 0.34
181 0.41
182 0.41
183 0.42
184 0.41
185 0.47
186 0.5
187 0.59
188 0.62
189 0.62
190 0.66
191 0.73
192 0.81
193 0.82
194 0.86
195 0.86
196 0.85
197 0.83
198 0.82
199 0.77
200 0.7
201 0.71
202 0.66
203 0.6
204 0.52
205 0.51
206 0.49
207 0.47
208 0.43
209 0.37
210 0.34
211 0.31
212 0.31
213 0.28
214 0.23
215 0.21
216 0.21
217 0.2
218 0.18
219 0.16
220 0.14
221 0.16
222 0.16
223 0.16
224 0.15
225 0.13
226 0.12
227 0.12
228 0.11
229 0.07
230 0.09
231 0.08
232 0.1
233 0.1
234 0.1
235 0.11
236 0.11
237 0.1
238 0.13
239 0.13
240 0.15
241 0.15
242 0.17
243 0.16
244 0.16
245 0.16
246 0.12
247 0.12
248 0.11
249 0.12
250 0.11
251 0.12
252 0.12
253 0.12
254 0.14
255 0.17
256 0.15
257 0.17
258 0.17
259 0.21
260 0.23
261 0.23
262 0.22
263 0.2
264 0.19
265 0.18
266 0.17
267 0.13
268 0.11
269 0.1
270 0.09
271 0.08
272 0.09
273 0.07
274 0.08
275 0.07
276 0.08
277 0.11
278 0.11
279 0.14
280 0.16
281 0.18
282 0.18
283 0.19
284 0.21
285 0.27
286 0.32
287 0.35
288 0.35
289 0.37
290 0.36
291 0.36
292 0.38
293 0.33
294 0.31
295 0.25
296 0.23
297 0.2
298 0.25
299 0.26
300 0.23
301 0.21
302 0.19
303 0.22
304 0.24
305 0.27
306 0.22
307 0.23
308 0.21
309 0.2
310 0.21
311 0.18
312 0.15
313 0.12