Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3HJR2

Protein Details
Accession A0A1E3HJR2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
81-105STVLNHPKKKSNPLRASRKPLPPLQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
88-100KKKSNPLRASRKP
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 10, mito 8, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019514  Syndetin_C  
IPR039745  Vps54  
IPR012501  Vps54_C  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0000938  C:GARP complex  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042147  P:retrograde transport, endosome to Golgi  
Pfam View protein in Pfam  
PF10474  DUF2451  
PF07928  Vps54  
Amino Acid Sequences MVSNISNRPTPTPTSPPPFSESFLSDLDDIAPSLLETTLSIADYPQWEAIETDPKNINLVSWKLDVSAKDGVEGRGFNAISTVLNHPKKKSNPLRASRKPLPPLQAPPAVPKPPPPSYYDAYLSSITPLHDTFTSIQSSLRAAGELEEDAENAHQELPILNNIPPVFFDTDFDLSSSTTWSELVPSSTLPDPNLQDELSNHLDTLERHLLHEITLRSTSFFSALSNLQDLHSESASCLSHITSLQESLKAVGQGQAKRGLEIIDAQAELANLKLIARAVESIGEVEDIRHTAERLAGEGDWEGSLGCVESLAAWWPRYSVEPLAKEEMLALTTLPALSELPTEVAQLLNIVSTHLVKALTTYLSSLLLRPIEHSASKDELMATLAPMLEGLIKCGTLELVEGIWGDVVVGAIREESRKCLPSSEEEDAKQSDVRGCVVSLAQSLQVMDHSTFFLLCTQLYGSLSGRLRIVKQIGAVMEDAVIKVSKLRPLFLTSSSHFNSYHAPSISLSDILTSAVELSHTRISKIISVRAEQHIVLELEEFLELYKEAMEFIKDTEDLAGRGISPLRNVLSQQARSFVSRYHAEKLTKSAKAVEEEQWTQIDVTAALQNAVELIVQSAICDPPEYRIPPPQTNKQDLEAPNTKQLRIEEKPYFIVKATAETLILLKDYLKVIVNLESVVTEVMSRIIEFLKSFNSRTCQVVLGAGAMRSAGLKNITAKHLALASQSLSVVVALVDYVKEFVRRHADKVGGLLGEFDKLKRDYQEHQNEIHVKLVAIMSDRLAVHCASLRETNWDSDTSKDGPSSYAEMLVKETATLHKVLSKYLASETVETVLSEVVVSITTRLIEEYSRIEVTSEEGKVRMLQDITLISSRLKPLSERKDEVEALEQYRGRVVIHTTSATDMEENQKEETQVDAEEEAHNEDT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.57
3 0.57
4 0.57
5 0.54
6 0.5
7 0.45
8 0.39
9 0.34
10 0.31
11 0.29
12 0.24
13 0.22
14 0.2
15 0.17
16 0.14
17 0.11
18 0.09
19 0.07
20 0.08
21 0.07
22 0.06
23 0.06
24 0.08
25 0.09
26 0.09
27 0.1
28 0.09
29 0.12
30 0.13
31 0.15
32 0.15
33 0.14
34 0.14
35 0.15
36 0.18
37 0.25
38 0.24
39 0.27
40 0.29
41 0.29
42 0.3
43 0.29
44 0.28
45 0.25
46 0.27
47 0.26
48 0.24
49 0.24
50 0.24
51 0.27
52 0.26
53 0.24
54 0.27
55 0.23
56 0.24
57 0.26
58 0.25
59 0.25
60 0.25
61 0.21
62 0.22
63 0.22
64 0.18
65 0.17
66 0.16
67 0.14
68 0.16
69 0.22
70 0.26
71 0.33
72 0.38
73 0.41
74 0.5
75 0.56
76 0.64
77 0.68
78 0.7
79 0.73
80 0.8
81 0.86
82 0.87
83 0.9
84 0.88
85 0.87
86 0.82
87 0.78
88 0.75
89 0.71
90 0.69
91 0.65
92 0.63
93 0.55
94 0.56
95 0.57
96 0.54
97 0.48
98 0.49
99 0.5
100 0.5
101 0.5
102 0.48
103 0.46
104 0.45
105 0.5
106 0.45
107 0.4
108 0.36
109 0.35
110 0.3
111 0.25
112 0.23
113 0.19
114 0.17
115 0.15
116 0.14
117 0.14
118 0.16
119 0.17
120 0.18
121 0.2
122 0.18
123 0.18
124 0.17
125 0.18
126 0.18
127 0.16
128 0.13
129 0.11
130 0.12
131 0.12
132 0.11
133 0.12
134 0.1
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.08
140 0.08
141 0.06
142 0.07
143 0.08
144 0.09
145 0.12
146 0.14
147 0.13
148 0.17
149 0.17
150 0.17
151 0.17
152 0.19
153 0.19
154 0.17
155 0.18
156 0.18
157 0.2
158 0.2
159 0.2
160 0.17
161 0.14
162 0.14
163 0.14
164 0.1
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.09
169 0.1
170 0.11
171 0.11
172 0.11
173 0.13
174 0.16
175 0.17
176 0.16
177 0.19
178 0.19
179 0.21
180 0.23
181 0.2
182 0.18
183 0.18
184 0.23
185 0.23
186 0.21
187 0.18
188 0.17
189 0.19
190 0.18
191 0.25
192 0.25
193 0.21
194 0.22
195 0.24
196 0.23
197 0.23
198 0.27
199 0.21
200 0.17
201 0.19
202 0.18
203 0.18
204 0.18
205 0.18
206 0.14
207 0.13
208 0.1
209 0.12
210 0.13
211 0.13
212 0.14
213 0.13
214 0.13
215 0.14
216 0.15
217 0.14
218 0.13
219 0.12
220 0.11
221 0.14
222 0.14
223 0.12
224 0.12
225 0.09
226 0.11
227 0.11
228 0.13
229 0.11
230 0.14
231 0.14
232 0.15
233 0.15
234 0.15
235 0.16
236 0.14
237 0.13
238 0.15
239 0.2
240 0.21
241 0.23
242 0.29
243 0.27
244 0.27
245 0.28
246 0.23
247 0.18
248 0.18
249 0.16
250 0.11
251 0.11
252 0.1
253 0.1
254 0.09
255 0.09
256 0.07
257 0.06
258 0.04
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.06
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.06
272 0.06
273 0.07
274 0.06
275 0.07
276 0.08
277 0.08
278 0.08
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.11
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.07
288 0.07
289 0.06
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.03
294 0.03
295 0.03
296 0.03
297 0.03
298 0.07
299 0.08
300 0.09
301 0.09
302 0.1
303 0.11
304 0.12
305 0.15
306 0.16
307 0.21
308 0.23
309 0.26
310 0.29
311 0.28
312 0.26
313 0.24
314 0.19
315 0.13
316 0.11
317 0.08
318 0.04
319 0.05
320 0.05
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.05
326 0.05
327 0.06
328 0.06
329 0.07
330 0.07
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.05
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.06
342 0.06
343 0.05
344 0.06
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.08
349 0.07
350 0.08
351 0.09
352 0.08
353 0.09
354 0.1
355 0.1
356 0.11
357 0.12
358 0.13
359 0.13
360 0.14
361 0.15
362 0.16
363 0.17
364 0.15
365 0.13
366 0.12
367 0.12
368 0.11
369 0.08
370 0.06
371 0.06
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.06
376 0.06
377 0.07
378 0.06
379 0.06
380 0.07
381 0.07
382 0.07
383 0.04
384 0.05
385 0.04
386 0.03
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.03
392 0.03
393 0.03
394 0.03
395 0.02
396 0.02
397 0.02
398 0.03
399 0.04
400 0.05
401 0.06
402 0.09
403 0.12
404 0.14
405 0.15
406 0.17
407 0.18
408 0.21
409 0.27
410 0.28
411 0.28
412 0.26
413 0.28
414 0.26
415 0.25
416 0.21
417 0.15
418 0.13
419 0.11
420 0.12
421 0.1
422 0.1
423 0.09
424 0.09
425 0.09
426 0.07
427 0.07
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.05
432 0.05
433 0.06
434 0.06
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.06
446 0.06
447 0.07
448 0.07
449 0.11
450 0.12
451 0.12
452 0.13
453 0.13
454 0.13
455 0.15
456 0.16
457 0.12
458 0.12
459 0.13
460 0.12
461 0.12
462 0.11
463 0.09
464 0.08
465 0.07
466 0.07
467 0.05
468 0.05
469 0.04
470 0.06
471 0.07
472 0.1
473 0.11
474 0.12
475 0.13
476 0.16
477 0.18
478 0.19
479 0.22
480 0.19
481 0.25
482 0.25
483 0.25
484 0.22
485 0.21
486 0.22
487 0.2
488 0.23
489 0.18
490 0.18
491 0.16
492 0.18
493 0.18
494 0.14
495 0.12
496 0.08
497 0.07
498 0.07
499 0.06
500 0.04
501 0.04
502 0.03
503 0.04
504 0.04
505 0.06
506 0.1
507 0.11
508 0.11
509 0.12
510 0.13
511 0.17
512 0.19
513 0.21
514 0.19
515 0.21
516 0.23
517 0.24
518 0.25
519 0.2
520 0.19
521 0.16
522 0.15
523 0.13
524 0.1
525 0.08
526 0.07
527 0.07
528 0.06
529 0.04
530 0.04
531 0.04
532 0.04
533 0.04
534 0.04
535 0.04
536 0.05
537 0.05
538 0.05
539 0.06
540 0.07
541 0.07
542 0.07
543 0.08
544 0.08
545 0.08
546 0.08
547 0.08
548 0.06
549 0.07
550 0.09
551 0.08
552 0.08
553 0.09
554 0.1
555 0.11
556 0.11
557 0.16
558 0.21
559 0.23
560 0.23
561 0.25
562 0.25
563 0.25
564 0.26
565 0.21
566 0.2
567 0.22
568 0.24
569 0.26
570 0.3
571 0.31
572 0.31
573 0.37
574 0.39
575 0.35
576 0.33
577 0.32
578 0.29
579 0.3
580 0.32
581 0.29
582 0.28
583 0.28
584 0.28
585 0.24
586 0.22
587 0.19
588 0.17
589 0.13
590 0.08
591 0.08
592 0.09
593 0.08
594 0.08
595 0.08
596 0.07
597 0.06
598 0.06
599 0.05
600 0.03
601 0.04
602 0.04
603 0.04
604 0.05
605 0.06
606 0.06
607 0.06
608 0.07
609 0.07
610 0.09
611 0.14
612 0.17
613 0.18
614 0.26
615 0.31
616 0.39
617 0.45
618 0.52
619 0.54
620 0.58
621 0.58
622 0.52
623 0.54
624 0.48
625 0.49
626 0.46
627 0.41
628 0.43
629 0.42
630 0.4
631 0.35
632 0.36
633 0.36
634 0.33
635 0.38
636 0.34
637 0.35
638 0.38
639 0.37
640 0.35
641 0.27
642 0.27
643 0.2
644 0.19
645 0.18
646 0.15
647 0.13
648 0.13
649 0.13
650 0.1
651 0.1
652 0.07
653 0.06
654 0.07
655 0.08
656 0.09
657 0.09
658 0.1
659 0.11
660 0.13
661 0.13
662 0.11
663 0.11
664 0.1
665 0.09
666 0.08
667 0.07
668 0.04
669 0.04
670 0.05
671 0.05
672 0.05
673 0.06
674 0.07
675 0.08
676 0.08
677 0.09
678 0.14
679 0.16
680 0.18
681 0.21
682 0.24
683 0.25
684 0.27
685 0.28
686 0.23
687 0.21
688 0.21
689 0.17
690 0.15
691 0.14
692 0.12
693 0.1
694 0.08
695 0.08
696 0.07
697 0.07
698 0.07
699 0.07
700 0.09
701 0.14
702 0.17
703 0.19
704 0.2
705 0.2
706 0.2
707 0.2
708 0.19
709 0.16
710 0.14
711 0.13
712 0.12
713 0.11
714 0.1
715 0.09
716 0.08
717 0.07
718 0.05
719 0.04
720 0.03
721 0.04
722 0.04
723 0.04
724 0.05
725 0.06
726 0.1
727 0.11
728 0.16
729 0.26
730 0.28
731 0.31
732 0.36
733 0.38
734 0.35
735 0.37
736 0.35
737 0.25
738 0.22
739 0.21
740 0.15
741 0.15
742 0.15
743 0.13
744 0.15
745 0.16
746 0.19
747 0.22
748 0.26
749 0.3
750 0.41
751 0.51
752 0.5
753 0.5
754 0.55
755 0.55
756 0.52
757 0.48
758 0.37
759 0.27
760 0.25
761 0.23
762 0.17
763 0.15
764 0.14
765 0.11
766 0.14
767 0.14
768 0.13
769 0.14
770 0.13
771 0.12
772 0.15
773 0.15
774 0.15
775 0.19
776 0.19
777 0.24
778 0.26
779 0.28
780 0.27
781 0.28
782 0.26
783 0.25
784 0.29
785 0.25
786 0.24
787 0.22
788 0.21
789 0.19
790 0.21
791 0.22
792 0.19
793 0.22
794 0.21
795 0.2
796 0.22
797 0.22
798 0.19
799 0.15
800 0.16
801 0.13
802 0.15
803 0.15
804 0.14
805 0.17
806 0.18
807 0.19
808 0.22
809 0.2
810 0.2
811 0.21
812 0.25
813 0.22
814 0.23
815 0.23
816 0.21
817 0.2
818 0.18
819 0.16
820 0.11
821 0.1
822 0.08
823 0.07
824 0.05
825 0.05
826 0.06
827 0.06
828 0.06
829 0.07
830 0.07
831 0.08
832 0.09
833 0.09
834 0.11
835 0.14
836 0.17
837 0.18
838 0.18
839 0.17
840 0.16
841 0.19
842 0.22
843 0.21
844 0.18
845 0.18
846 0.19
847 0.21
848 0.22
849 0.23
850 0.18
851 0.16
852 0.18
853 0.19
854 0.21
855 0.2
856 0.2
857 0.17
858 0.2
859 0.23
860 0.22
861 0.22
862 0.25
863 0.33
864 0.43
865 0.5
866 0.51
867 0.52
868 0.57
869 0.57
870 0.54
871 0.51
872 0.45
873 0.38
874 0.4
875 0.37
876 0.31
877 0.32
878 0.3
879 0.23
880 0.21
881 0.22
882 0.21
883 0.24
884 0.25
885 0.24
886 0.25
887 0.25
888 0.24
889 0.21
890 0.19
891 0.23
892 0.26
893 0.27
894 0.28
895 0.28
896 0.28
897 0.28
898 0.27
899 0.21
900 0.17
901 0.17
902 0.16
903 0.15
904 0.16
905 0.17