Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3IRR6

Protein Details
Accession A0A1E3IRR6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
49-69GIQKMKFKPKVPIRRPKSEVEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
54-65KFKPKVPIRRPK
87-105ASSRGRGSSERGRGRAGGR
192-210KEKGEKVDRNSKLKDRKGK
Subcellular Location(s) cyto 11, cyto_nucl 10.666, cyto_mito 10.666, nucl 8, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007811  RPC4  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
Pfam View protein in Pfam  
PF05132  RNA_pol_Rpc4  
Amino Acid Sequences MSKRPGVPNLIIAAESSRPSAGDDGSAPASAQSTPGSTPVPNEWGPPLGIQKMKFKPKVPIRRPKSEVEVKTEQAAPAALPATRGGASSRGRGSSERGRGRAGGRGAPLISASVAAGVFGGPRPVASSSRKFTAVAPTNTAEYPSDTEVYSDHSEEDGLPSGGHPVDIDLVSTLSELAPTSLYRDRKLTQGKEKGEKVDRNSKLKDRKGKFSAPILAIKDEPVSPGRKESHLRGDNGKISEDKHQDLDERGRRVRDFMQTGGNEKPEAEEVNTAQAVDLSESEDEEEEEDIEHDFIVTGGSDDPKSKLFMFQFPHLFPRFHPRGPVDLSIDEDIKPDIRSAAALSKARKLAQNQSSEGRVGTMVVMKSGKVKMVFGNDIVMNVAPGVPTTFTQQFVHLDAKKKDAIVVGDVHKNYVVTPDIDRLLQDLYTHGGQTPGDKEAEIRKRSVLIKDW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.19
3 0.16
4 0.14
5 0.13
6 0.15
7 0.16
8 0.14
9 0.14
10 0.14
11 0.17
12 0.18
13 0.17
14 0.16
15 0.14
16 0.14
17 0.12
18 0.12
19 0.1
20 0.1
21 0.11
22 0.14
23 0.15
24 0.15
25 0.18
26 0.2
27 0.25
28 0.23
29 0.25
30 0.24
31 0.24
32 0.25
33 0.24
34 0.24
35 0.24
36 0.28
37 0.29
38 0.37
39 0.43
40 0.53
41 0.56
42 0.56
43 0.61
44 0.68
45 0.76
46 0.77
47 0.79
48 0.77
49 0.82
50 0.83
51 0.78
52 0.77
53 0.76
54 0.7
55 0.67
56 0.65
57 0.55
58 0.54
59 0.5
60 0.4
61 0.31
62 0.27
63 0.18
64 0.14
65 0.14
66 0.11
67 0.09
68 0.1
69 0.11
70 0.11
71 0.11
72 0.11
73 0.16
74 0.19
75 0.23
76 0.25
77 0.25
78 0.26
79 0.27
80 0.32
81 0.35
82 0.43
83 0.44
84 0.44
85 0.44
86 0.46
87 0.46
88 0.46
89 0.4
90 0.34
91 0.29
92 0.29
93 0.27
94 0.23
95 0.22
96 0.16
97 0.13
98 0.09
99 0.07
100 0.06
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.04
105 0.05
106 0.05
107 0.06
108 0.04
109 0.05
110 0.07
111 0.09
112 0.13
113 0.19
114 0.25
115 0.28
116 0.31
117 0.33
118 0.32
119 0.31
120 0.38
121 0.4
122 0.35
123 0.36
124 0.34
125 0.34
126 0.33
127 0.33
128 0.23
129 0.16
130 0.16
131 0.14
132 0.14
133 0.12
134 0.13
135 0.12
136 0.16
137 0.16
138 0.14
139 0.13
140 0.12
141 0.12
142 0.12
143 0.13
144 0.1
145 0.08
146 0.08
147 0.07
148 0.09
149 0.09
150 0.08
151 0.07
152 0.05
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.05
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.05
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.05
166 0.05
167 0.09
168 0.14
169 0.16
170 0.17
171 0.21
172 0.21
173 0.28
174 0.37
175 0.4
176 0.44
177 0.51
178 0.55
179 0.58
180 0.59
181 0.58
182 0.58
183 0.55
184 0.51
185 0.53
186 0.53
187 0.52
188 0.54
189 0.56
190 0.58
191 0.61
192 0.65
193 0.59
194 0.63
195 0.62
196 0.63
197 0.58
198 0.54
199 0.52
200 0.44
201 0.44
202 0.36
203 0.32
204 0.26
205 0.23
206 0.19
207 0.14
208 0.13
209 0.11
210 0.13
211 0.12
212 0.16
213 0.17
214 0.2
215 0.22
216 0.24
217 0.32
218 0.34
219 0.36
220 0.35
221 0.37
222 0.38
223 0.36
224 0.34
225 0.24
226 0.22
227 0.27
228 0.26
229 0.23
230 0.21
231 0.21
232 0.21
233 0.23
234 0.3
235 0.28
236 0.3
237 0.31
238 0.32
239 0.32
240 0.33
241 0.35
242 0.32
243 0.29
244 0.26
245 0.31
246 0.29
247 0.31
248 0.3
249 0.27
250 0.21
251 0.18
252 0.17
253 0.12
254 0.12
255 0.1
256 0.1
257 0.09
258 0.12
259 0.12
260 0.11
261 0.1
262 0.09
263 0.08
264 0.07
265 0.07
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.05
275 0.05
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.05
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.04
285 0.04
286 0.05
287 0.06
288 0.07
289 0.08
290 0.09
291 0.1
292 0.13
293 0.12
294 0.17
295 0.18
296 0.24
297 0.27
298 0.31
299 0.34
300 0.33
301 0.39
302 0.36
303 0.35
304 0.3
305 0.36
306 0.36
307 0.33
308 0.37
309 0.33
310 0.37
311 0.4
312 0.42
313 0.35
314 0.31
315 0.32
316 0.28
317 0.27
318 0.21
319 0.18
320 0.15
321 0.13
322 0.13
323 0.1
324 0.09
325 0.08
326 0.09
327 0.1
328 0.14
329 0.18
330 0.22
331 0.24
332 0.29
333 0.31
334 0.33
335 0.36
336 0.36
337 0.4
338 0.44
339 0.47
340 0.45
341 0.46
342 0.46
343 0.42
344 0.37
345 0.28
346 0.21
347 0.15
348 0.13
349 0.13
350 0.11
351 0.13
352 0.13
353 0.13
354 0.17
355 0.18
356 0.2
357 0.17
358 0.19
359 0.2
360 0.26
361 0.27
362 0.24
363 0.26
364 0.23
365 0.22
366 0.21
367 0.17
368 0.11
369 0.09
370 0.09
371 0.05
372 0.05
373 0.06
374 0.06
375 0.07
376 0.13
377 0.15
378 0.18
379 0.19
380 0.21
381 0.22
382 0.24
383 0.32
384 0.31
385 0.37
386 0.37
387 0.41
388 0.4
389 0.39
390 0.38
391 0.33
392 0.31
393 0.26
394 0.29
395 0.29
396 0.33
397 0.33
398 0.32
399 0.29
400 0.26
401 0.23
402 0.22
403 0.19
404 0.15
405 0.17
406 0.21
407 0.22
408 0.22
409 0.22
410 0.19
411 0.19
412 0.17
413 0.15
414 0.12
415 0.14
416 0.15
417 0.16
418 0.14
419 0.15
420 0.15
421 0.19
422 0.2
423 0.19
424 0.18
425 0.18
426 0.21
427 0.29
428 0.38
429 0.38
430 0.37
431 0.37
432 0.42
433 0.47