Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3ITR9

Protein Details
Accession A0A1E3ITR9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
255-275GINVHKQRTWRQYMNRRGGFNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-27RDSGRARSRSPKGR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MSSRGHHEEHGRARDSGRARSRSPKGRTDSYDKGKPFFSVRRSWRGRDRDYEETSNRERKHREARSEGNGRNRPNGQDYDHDPNTANSYEGRHRDADKRWEREDTGRDHRQRYTRDHEESRSRAYKDVRENRGDRSGYWGGGNDENHHNRGQYEGDYYKRKEEGRDRNYQSRDRRVIEEGRRRREEERALGITYTEDGRINDPRAKEREQEERERQQLEDAPDPNDPEAQMAALMGFGGFSTTKKKGVEHNAEGGINVHKQRTWRQYMNRRGGFNRPLDKVKD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.49
3 0.5
4 0.5
5 0.49
6 0.5
7 0.58
8 0.67
9 0.7
10 0.71
11 0.71
12 0.69
13 0.72
14 0.74
15 0.73
16 0.73
17 0.72
18 0.73
19 0.66
20 0.61
21 0.54
22 0.49
23 0.47
24 0.45
25 0.42
26 0.44
27 0.49
28 0.57
29 0.62
30 0.66
31 0.69
32 0.71
33 0.71
34 0.71
35 0.71
36 0.69
37 0.7
38 0.71
39 0.64
40 0.61
41 0.62
42 0.61
43 0.56
44 0.55
45 0.53
46 0.54
47 0.61
48 0.63
49 0.65
50 0.65
51 0.7
52 0.72
53 0.77
54 0.73
55 0.72
56 0.7
57 0.63
58 0.61
59 0.56
60 0.5
61 0.46
62 0.44
63 0.37
64 0.35
65 0.39
66 0.42
67 0.4
68 0.38
69 0.33
70 0.3
71 0.31
72 0.26
73 0.21
74 0.13
75 0.16
76 0.21
77 0.23
78 0.25
79 0.24
80 0.27
81 0.33
82 0.38
83 0.45
84 0.48
85 0.51
86 0.51
87 0.52
88 0.51
89 0.51
90 0.5
91 0.46
92 0.46
93 0.49
94 0.51
95 0.51
96 0.54
97 0.54
98 0.54
99 0.54
100 0.54
101 0.53
102 0.55
103 0.56
104 0.56
105 0.57
106 0.55
107 0.54
108 0.51
109 0.44
110 0.41
111 0.41
112 0.42
113 0.44
114 0.51
115 0.5
116 0.51
117 0.52
118 0.51
119 0.54
120 0.48
121 0.38
122 0.36
123 0.32
124 0.26
125 0.24
126 0.22
127 0.17
128 0.19
129 0.19
130 0.14
131 0.18
132 0.19
133 0.21
134 0.2
135 0.19
136 0.16
137 0.18
138 0.16
139 0.11
140 0.14
141 0.14
142 0.19
143 0.23
144 0.24
145 0.26
146 0.28
147 0.28
148 0.31
149 0.38
150 0.45
151 0.46
152 0.55
153 0.58
154 0.63
155 0.67
156 0.69
157 0.66
158 0.64
159 0.64
160 0.56
161 0.54
162 0.5
163 0.54
164 0.55
165 0.59
166 0.58
167 0.61
168 0.62
169 0.62
170 0.59
171 0.58
172 0.55
173 0.5
174 0.48
175 0.42
176 0.39
177 0.36
178 0.34
179 0.27
180 0.21
181 0.16
182 0.1
183 0.09
184 0.09
185 0.12
186 0.16
187 0.19
188 0.22
189 0.23
190 0.29
191 0.33
192 0.36
193 0.38
194 0.39
195 0.46
196 0.49
197 0.56
198 0.58
199 0.61
200 0.62
201 0.59
202 0.54
203 0.48
204 0.46
205 0.41
206 0.39
207 0.33
208 0.31
209 0.31
210 0.32
211 0.28
212 0.24
213 0.2
214 0.14
215 0.13
216 0.1
217 0.09
218 0.07
219 0.06
220 0.05
221 0.05
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.04
226 0.04
227 0.06
228 0.12
229 0.14
230 0.19
231 0.2
232 0.23
233 0.31
234 0.41
235 0.5
236 0.49
237 0.53
238 0.52
239 0.51
240 0.48
241 0.41
242 0.34
243 0.29
244 0.26
245 0.22
246 0.2
247 0.25
248 0.34
249 0.42
250 0.48
251 0.52
252 0.61
253 0.7
254 0.79
255 0.86
256 0.83
257 0.79
258 0.74
259 0.74
260 0.71
261 0.69
262 0.67
263 0.61