FuNGI

A0A1E3IXS7

Protein Details

Accession

A0A1E3IXS7

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
2-28	ADASLFLRKNKDKQRRRNVTITPRTAT	Hydrophilic
165-187	GSAPGGKKRKTKRGTKEVFHQDI	Basic
627-654	SPSAGSSSHNRPKKQKKGSTPLSQPEDI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
169-178	GGKKRKTKRG
430-439	KKLKKIMRKR
502-516	ASPASKRFPSPKKGK
611-644	KKARPASGASSTKRKSSPSAGSSSHNRPKKQKKG

Subcellular Location(s)

nucl 21, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MADASLFLRKNKDKQRRRNVTITPRTATNDSPSLPSQHPPRIPLDSSASAATSRASPSTSTAIKTEPSSSNVTEIKILSTGANNGLRYNLMRLNSIKDVDPVRITQPILMNRKKPGPKEPPTFALDDNGKIIGRYVYDTEGKPVLNDEAKPTIEKNEQADMSLIGSAPGGKKRKTKRGTKEVFHQDIEIMRLRREEAFPWVLESGHPQEKPAQPEQWVGRMVEQGQLSTVLLCNDGTSEGFELVPLGRTYKFEPARPFKPLDSDAANKLFELQAKQKIHDRWALRPADIGEGSSTSSPVPQVKVEHGLEERASKMEQRIKLSKGMRIDKRPKAEKYEDDFKREGHRVDLGLEGGVEEELDFDEAEEFQDDDDNNTFYHDAREEEEARELEERMKKEFRLANANVGDRPQIAAEGDEDDLFGYNSLNDEGKKLKKIMRKRMKENGEDYDVDEDEESDSDSDSETEIKDKENEKENEDKKDPTSANASQPSPRPISRPPTARTASPASKRFPSPKKGKASTAPPGSGTSLLVQRATSRGASPRPTTPGSSAGRAASPLGRVHSLDGGLSRGTTPVDRGSSPPSVPTSAQGGSPTSATREASPAPSTGSSQTGKKARPASGASSTKRKSSPSAGSSSHNRPKKQKKGSTPLSQPEDIPPFPDMITKQDVLNWFRSNKKPSVPMSEAIGAFRKRIVGAGTNRDANQKLFLGWIRLLADQEAGSLKLKSEYRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.78
2	0.87
3	0.89
4	0.9
5	0.9
6	0.9
7	0.9
8	0.9
9	0.86
10	0.78
11	0.7
12	0.68
13	0.61
14	0.53
15	0.48
16	0.43
17	0.37
18	0.38
19	0.36
20	0.36
21	0.35
22	0.39
23	0.41
24	0.45
25	0.46
26	0.46
27	0.49
28	0.5
29	0.5
30	0.48
31	0.47
32	0.41
33	0.39
34	0.36
35	0.31
36	0.25
37	0.23
38	0.2
39	0.15
40	0.14
41	0.13
42	0.14
43	0.14
44	0.17
45	0.23
46	0.24
47	0.24
48	0.24
49	0.25
50	0.26
51	0.28
52	0.3
53	0.27
54	0.28
55	0.31
56	0.3
57	0.33
58	0.33
59	0.32
60	0.29
61	0.26
62	0.24
63	0.2
64	0.2
65	0.15
66	0.15
67	0.16
68	0.19
69	0.22
70	0.21
71	0.21
72	0.21
73	0.21
74	0.21
75	0.23
76	0.22
77	0.19
78	0.23
79	0.24
80	0.29
81	0.31
82	0.32
83	0.28
84	0.29
85	0.29
86	0.28
87	0.29
88	0.25
89	0.24
90	0.26
91	0.25
92	0.24
93	0.29
94	0.34
95	0.41
96	0.46
97	0.48
98	0.49
99	0.58
100	0.61
101	0.6
102	0.62
103	0.64
104	0.67
105	0.71
106	0.71
107	0.67
108	0.64
109	0.61
110	0.51
111	0.47
112	0.39
113	0.32
114	0.28
115	0.24
116	0.21
117	0.18
118	0.18
119	0.13
120	0.12
121	0.13
122	0.13
123	0.15
124	0.19
125	0.2
126	0.22
127	0.23
128	0.22
129	0.2
130	0.2
131	0.21
132	0.2
133	0.2
134	0.21
135	0.23
136	0.24
137	0.25
138	0.24
139	0.26
140	0.26
141	0.29
142	0.28
143	0.3
144	0.29
145	0.29
146	0.28
147	0.23
148	0.2
149	0.17
150	0.13
151	0.07
152	0.07
153	0.08
154	0.1
155	0.17
156	0.21
157	0.25
158	0.34
159	0.43
160	0.54
161	0.61
162	0.7
163	0.73
164	0.8
165	0.84
166	0.81
167	0.82
168	0.82
169	0.78
170	0.68
171	0.58
172	0.48
173	0.4
174	0.37
175	0.33
176	0.24
177	0.2
178	0.2
179	0.21
180	0.22
181	0.22
182	0.21
183	0.21
184	0.23
185	0.22
186	0.23
187	0.22
188	0.2
189	0.18
190	0.21
191	0.2
192	0.23
193	0.23
194	0.21
195	0.28
196	0.32
197	0.38
198	0.38
199	0.36
200	0.32
201	0.38
202	0.39
203	0.37
204	0.34
205	0.29
206	0.26
207	0.25
208	0.24
209	0.22
210	0.2
211	0.15
212	0.13
213	0.14
214	0.12
215	0.1
216	0.1
217	0.06
218	0.07
219	0.07
220	0.06
221	0.06
222	0.07
223	0.06
224	0.06
225	0.07
226	0.07
227	0.07
228	0.06
229	0.07
230	0.06
231	0.08
232	0.07
233	0.08
234	0.09
235	0.11
236	0.13
237	0.21
238	0.24
239	0.27
240	0.36
241	0.41
242	0.44
243	0.47
244	0.48
245	0.39
246	0.42
247	0.39
248	0.33
249	0.3
250	0.29
251	0.28
252	0.28
253	0.28
254	0.22
255	0.21
256	0.19
257	0.16
258	0.17
259	0.18
260	0.24
261	0.26
262	0.28
263	0.33
264	0.35
265	0.37
266	0.4
267	0.38
268	0.35
269	0.42
270	0.42
271	0.35
272	0.34
273	0.31
274	0.28
275	0.26
276	0.2
277	0.13
278	0.11
279	0.12
280	0.1
281	0.09
282	0.06
283	0.06
284	0.08
285	0.09
286	0.1
287	0.1
288	0.12
289	0.13
290	0.19
291	0.19
292	0.2
293	0.19
294	0.19
295	0.18
296	0.17
297	0.16
298	0.11
299	0.12
300	0.1
301	0.15
302	0.2
303	0.23
304	0.27
305	0.32
306	0.32
307	0.39
308	0.4
309	0.38
310	0.4
311	0.45
312	0.45
313	0.5
314	0.57
315	0.56
316	0.62
317	0.66
318	0.62
319	0.61
320	0.61
321	0.58
322	0.56
323	0.6
324	0.55
325	0.53
326	0.5
327	0.44
328	0.44
329	0.39
330	0.33
331	0.24
332	0.24
333	0.19
334	0.19
335	0.18
336	0.13
337	0.1
338	0.09
339	0.07
340	0.06
341	0.05
342	0.03
343	0.03
344	0.03
345	0.03
346	0.03
347	0.03
348	0.03
349	0.03
350	0.03
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.05
356	0.05
357	0.07
358	0.07
359	0.08
360	0.07
361	0.08
362	0.09
363	0.07
364	0.09
365	0.08
366	0.08
367	0.09
368	0.13
369	0.14
370	0.14
371	0.16
372	0.15
373	0.15
374	0.15
375	0.14
376	0.15
377	0.18
378	0.18
379	0.2
380	0.22
381	0.22
382	0.27
383	0.29
384	0.27
385	0.31
386	0.31
387	0.34
388	0.34
389	0.35
390	0.29
391	0.27
392	0.25
393	0.17
394	0.16
395	0.09
396	0.07
397	0.06
398	0.06
399	0.06
400	0.07
401	0.07
402	0.06
403	0.06
404	0.06
405	0.06
406	0.06
407	0.05
408	0.04
409	0.04
410	0.04
411	0.05
412	0.06
413	0.06
414	0.08
415	0.13
416	0.16
417	0.18
418	0.21
419	0.26
420	0.33
421	0.43
422	0.52
423	0.58
424	0.64
425	0.7
426	0.76
427	0.78
428	0.76
429	0.71
430	0.65
431	0.58
432	0.5
433	0.42
434	0.35
435	0.27
436	0.22
437	0.17
438	0.12
439	0.09
440	0.08
441	0.08
442	0.05
443	0.05
444	0.05
445	0.05
446	0.05
447	0.05
448	0.06
449	0.06
450	0.08
451	0.08
452	0.1
453	0.14
454	0.17
455	0.21
456	0.29
457	0.31
458	0.33
459	0.42
460	0.45
461	0.48
462	0.47
463	0.45
464	0.37
465	0.43
466	0.39
467	0.32
468	0.35
469	0.3
470	0.34
471	0.36
472	0.36
473	0.33
474	0.36
475	0.38
476	0.35
477	0.33
478	0.31
479	0.33
480	0.39
481	0.42
482	0.46
483	0.44
484	0.49
485	0.5
486	0.46
487	0.45
488	0.45
489	0.45
490	0.46
491	0.48
492	0.43
493	0.45
494	0.49
495	0.53
496	0.54
497	0.57
498	0.59
499	0.62
500	0.69
501	0.69
502	0.7
503	0.67
504	0.67
505	0.66
506	0.62
507	0.54
508	0.46
509	0.43
510	0.39
511	0.32
512	0.25
513	0.19
514	0.16
515	0.16
516	0.15
517	0.13
518	0.13
519	0.14
520	0.15
521	0.14
522	0.13
523	0.18
524	0.22
525	0.28
526	0.3
527	0.32
528	0.36
529	0.37
530	0.37
531	0.34
532	0.38
533	0.35
534	0.34
535	0.32
536	0.28
537	0.26
538	0.24
539	0.23
540	0.16
541	0.16
542	0.15
543	0.16
544	0.16
545	0.16
546	0.17
547	0.17
548	0.16
549	0.14
550	0.13
551	0.12
552	0.11
553	0.11
554	0.09
555	0.08
556	0.09
557	0.09
558	0.1
559	0.13
560	0.16
561	0.16
562	0.19
563	0.23
564	0.26
565	0.25
566	0.27
567	0.25
568	0.25
569	0.25
570	0.25
571	0.24
572	0.21
573	0.21
574	0.2
575	0.19
576	0.17
577	0.17
578	0.16
579	0.14
580	0.16
581	0.16
582	0.15
583	0.17
584	0.18
585	0.21
586	0.22
587	0.2
588	0.2
589	0.21
590	0.21
591	0.2
592	0.23
593	0.22
594	0.23
595	0.3
596	0.34
597	0.35
598	0.4
599	0.44
600	0.43
601	0.47
602	0.49
603	0.47
604	0.5
605	0.56
606	0.53
607	0.57
608	0.56
609	0.55
610	0.54
611	0.51
612	0.47
613	0.47
614	0.52
615	0.48
616	0.52
617	0.49
618	0.52
619	0.56
620	0.61
621	0.61
622	0.59
623	0.6
624	0.64
625	0.73
626	0.78
627	0.82
628	0.82
629	0.84
630	0.87
631	0.91
632	0.9
633	0.88
634	0.87
635	0.82
636	0.74
637	0.64
638	0.6
639	0.57
640	0.47
641	0.4
642	0.31
643	0.26
644	0.24
645	0.27
646	0.21
647	0.2
648	0.25
649	0.24
650	0.23
651	0.26
652	0.32
653	0.32
654	0.37
655	0.37
656	0.37
657	0.44
658	0.52
659	0.54
660	0.54
661	0.58
662	0.59
663	0.6
664	0.65
665	0.61
666	0.55
667	0.54
668	0.53
669	0.46
670	0.41
671	0.42
672	0.33
673	0.3
674	0.29
675	0.25
676	0.2
677	0.22
678	0.23
679	0.24
680	0.31
681	0.39
682	0.43
683	0.46
684	0.47
685	0.5
686	0.48
687	0.41
688	0.38
689	0.3
690	0.26
691	0.26
692	0.27
693	0.27
694	0.25
695	0.27
696	0.24
697	0.25
698	0.25
699	0.21
700	0.2
701	0.16
702	0.17
703	0.15
704	0.14
705	0.15
706	0.14
707	0.14
708	0.19

A0A1E3IXS7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer