Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1E3IPF8

Protein Details
Accession A0A1E3IPF8    Localization Confidence High Confidence Score 19.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
273-295IREESEKRKRGRPRGSGKKDGDVBasic
302-329RAAPGEKRPRGRPKGSLNKKGRKGESDNBasic
338-361KYQRGLVKRGRGRPKGSVNKRKNWBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
278-325EKRKRGRPRGSGKKDGDVSTNEPFRAAPGEKRPRGRPKGSLNKKGRKG
341-361RGLVKRGRGRPKGSVNKRKNW
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.333, cyto 5, cyto_mito 4.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Amino Acid Sequences MPSRATQNKEIRINWDAFPHFTKRLVDLIAAYPHYRTALFGNGGDRWVVERDLCLEVLKDEAWMKDKEEKGWVRRRGNGWEATELFTSGQVHPVRNRIHLLTKRMKEGWYTDKYGIDPNWRSIQEVPSGIRLLFERNHPYYFVLRDLWDGRDPIISPSSNALINSHSDHTQNQLGSTFCPESRYWPTMTEQQMIFGSSKSEGLHKGVQNRSEAINHRSSTYTSTSTEEGESELEEPPSKRQRRPDQTYITNGAEEALVALALANSAESSLLAIREESEKRKRGRPRGSGKKDGDVSTNEPFRAAPGEKRPRGRPKGSLNKKGRKGESDNSAESEEEGKYQRGLVKRGRGRPKGSVNKRKNW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.48
3 0.42
4 0.38
5 0.4
6 0.39
7 0.37
8 0.37
9 0.38
10 0.33
11 0.34
12 0.32
13 0.28
14 0.25
15 0.27
16 0.27
17 0.27
18 0.25
19 0.22
20 0.21
21 0.21
22 0.19
23 0.16
24 0.14
25 0.18
26 0.19
27 0.2
28 0.23
29 0.22
30 0.23
31 0.21
32 0.19
33 0.15
34 0.15
35 0.15
36 0.12
37 0.12
38 0.15
39 0.16
40 0.17
41 0.15
42 0.13
43 0.13
44 0.14
45 0.13
46 0.12
47 0.12
48 0.13
49 0.17
50 0.17
51 0.2
52 0.26
53 0.28
54 0.29
55 0.36
56 0.42
57 0.47
58 0.56
59 0.62
60 0.6
61 0.65
62 0.67
63 0.65
64 0.65
65 0.62
66 0.55
67 0.52
68 0.47
69 0.43
70 0.39
71 0.32
72 0.25
73 0.2
74 0.19
75 0.14
76 0.19
77 0.19
78 0.21
79 0.23
80 0.3
81 0.31
82 0.32
83 0.34
84 0.3
85 0.38
86 0.41
87 0.47
88 0.49
89 0.5
90 0.52
91 0.51
92 0.49
93 0.42
94 0.42
95 0.42
96 0.38
97 0.39
98 0.35
99 0.35
100 0.35
101 0.37
102 0.33
103 0.32
104 0.29
105 0.29
106 0.33
107 0.32
108 0.32
109 0.3
110 0.31
111 0.26
112 0.27
113 0.24
114 0.2
115 0.21
116 0.19
117 0.18
118 0.15
119 0.15
120 0.14
121 0.18
122 0.22
123 0.23
124 0.24
125 0.24
126 0.26
127 0.25
128 0.25
129 0.23
130 0.17
131 0.15
132 0.17
133 0.18
134 0.18
135 0.17
136 0.16
137 0.15
138 0.15
139 0.15
140 0.14
141 0.15
142 0.13
143 0.12
144 0.12
145 0.13
146 0.13
147 0.12
148 0.11
149 0.09
150 0.1
151 0.12
152 0.12
153 0.12
154 0.12
155 0.12
156 0.14
157 0.16
158 0.15
159 0.13
160 0.14
161 0.13
162 0.12
163 0.15
164 0.13
165 0.1
166 0.13
167 0.13
168 0.16
169 0.21
170 0.23
171 0.21
172 0.21
173 0.24
174 0.27
175 0.3
176 0.28
177 0.23
178 0.22
179 0.21
180 0.21
181 0.19
182 0.12
183 0.11
184 0.08
185 0.09
186 0.08
187 0.1
188 0.1
189 0.12
190 0.18
191 0.19
192 0.26
193 0.29
194 0.31
195 0.3
196 0.31
197 0.29
198 0.28
199 0.29
200 0.26
201 0.29
202 0.27
203 0.27
204 0.26
205 0.26
206 0.25
207 0.24
208 0.22
209 0.18
210 0.2
211 0.19
212 0.19
213 0.19
214 0.15
215 0.13
216 0.11
217 0.1
218 0.09
219 0.09
220 0.08
221 0.1
222 0.1
223 0.17
224 0.27
225 0.31
226 0.35
227 0.44
228 0.55
229 0.64
230 0.72
231 0.74
232 0.73
233 0.73
234 0.75
235 0.7
236 0.6
237 0.49
238 0.4
239 0.31
240 0.22
241 0.16
242 0.1
243 0.05
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.03
250 0.02
251 0.02
252 0.03
253 0.03
254 0.03
255 0.04
256 0.04
257 0.05
258 0.05
259 0.06
260 0.07
261 0.12
262 0.16
263 0.23
264 0.31
265 0.38
266 0.42
267 0.51
268 0.6
269 0.66
270 0.73
271 0.76
272 0.78
273 0.83
274 0.87
275 0.89
276 0.82
277 0.8
278 0.74
279 0.65
280 0.58
281 0.51
282 0.46
283 0.43
284 0.43
285 0.35
286 0.31
287 0.29
288 0.26
289 0.27
290 0.25
291 0.25
292 0.32
293 0.43
294 0.49
295 0.57
296 0.65
297 0.71
298 0.77
299 0.77
300 0.75
301 0.76
302 0.81
303 0.84
304 0.85
305 0.85
306 0.86
307 0.89
308 0.89
309 0.84
310 0.81
311 0.78
312 0.75
313 0.74
314 0.71
315 0.64
316 0.57
317 0.53
318 0.44
319 0.37
320 0.32
321 0.23
322 0.19
323 0.2
324 0.18
325 0.17
326 0.2
327 0.24
328 0.28
329 0.35
330 0.39
331 0.47
332 0.55
333 0.65
334 0.72
335 0.76
336 0.76
337 0.79
338 0.82
339 0.82
340 0.84
341 0.86