Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1E3IFV2

Protein Details
Accession A0A1E3IFV2    Localization Confidence High Confidence Score 22.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
76-95VSLIARKRPKREEEQSDTIFHydrophilic
155-177ELTNSPPRAKKRTKSSCRESILRHydrophilic
794-819EEIRREDDDKRKRLKKLYGTNRHGIEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
162-166RAKKR
380-409SKGKAREKSPGNSTPKATESRGKLGARGRH
804-807RKRL
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences METYQIEANDVFYASPLGRLQRQGTRGRPNLTHQSPVTSIPALECSSVQNKGSIYGMFIPKKRRLPKMTAGNAASVSLIARKRPKREEEQSDTIFVASSSGSRSGGRTKDVLQSQEKLQGYDPFDGVAKTSQNLKELDQAERKLPRVKGKRMTFELTNSPPRAKKRTKSSCRESILRGKVAFTKREAIASPKNYDESPSKMTAITRPSATLCEKSTKSRYHNFTRDASSAHLQVSSSSSQSRPRKPITRSISANTTTDTNSSSESNEDNSSDSEDELTLGHTPERHQSLGYKSSSVASSSPPIARRSLSLDHHMSQGQSPQHAEASVLAEMSDEEPLVTPRASGISLWADEIKRKSPENVRVKNRETRAQASSVGKYVGSKGKAREKSPGNSTPKATESRGKLGARGRHRVESNDEKHMDPSFLQRYQDATVTKDNRKRSVSKGEHNSERSITLAPKPTHPREVQPPKSPSTETRKVLVKTKDSGHSFFEMLEHISSSDLDEFDDEFLDGPSFVANPHEEEDLEFMGDNEFSDEDRKWLTSMMDASNLCPYCNQPLPREPSHSHKRLKARLHKLSTPAPTPSNPNARSLPWQQAIDFCTLHRAETTIIPLGIRAGYPQKIDFRNLYKRLEQKWIKQELNRIIKNPMVSRVFSAIKNEISKIGKLRWGGLVHQSKEERMAAVKPGYYGEVGRLVLIDHFQNLRQWGYLVPSVPPARRGSAALDNVALPIDPLSPNDFIVNVLVPEVAVFLIMDDRGYTKLSPDGYDEACRIREESARYGDWKFSEGDNKLKKTLEEIRREDDDKRKRLKKLYGTNRHGIEQDDYKEDTRSKRIKGQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.13
3 0.14
4 0.18
5 0.22
6 0.27
7 0.32
8 0.37
9 0.45
10 0.5
11 0.57
12 0.62
13 0.66
14 0.67
15 0.66
16 0.67
17 0.7
18 0.65
19 0.64
20 0.54
21 0.53
22 0.48
23 0.46
24 0.42
25 0.32
26 0.29
27 0.22
28 0.25
29 0.21
30 0.2
31 0.17
32 0.18
33 0.22
34 0.25
35 0.24
36 0.23
37 0.22
38 0.23
39 0.25
40 0.2
41 0.2
42 0.23
43 0.3
44 0.34
45 0.38
46 0.44
47 0.5
48 0.6
49 0.65
50 0.68
51 0.68
52 0.7
53 0.76
54 0.79
55 0.78
56 0.77
57 0.7
58 0.62
59 0.55
60 0.46
61 0.36
62 0.25
63 0.18
64 0.16
65 0.16
66 0.2
67 0.3
68 0.37
69 0.45
70 0.54
71 0.62
72 0.67
73 0.76
74 0.8
75 0.79
76 0.81
77 0.74
78 0.67
79 0.59
80 0.49
81 0.38
82 0.28
83 0.19
84 0.11
85 0.09
86 0.09
87 0.1
88 0.11
89 0.12
90 0.15
91 0.21
92 0.24
93 0.27
94 0.27
95 0.29
96 0.36
97 0.4
98 0.43
99 0.41
100 0.41
101 0.41
102 0.46
103 0.43
104 0.37
105 0.35
106 0.35
107 0.34
108 0.33
109 0.3
110 0.23
111 0.23
112 0.22
113 0.2
114 0.17
115 0.15
116 0.13
117 0.2
118 0.22
119 0.25
120 0.26
121 0.26
122 0.31
123 0.32
124 0.39
125 0.38
126 0.38
127 0.41
128 0.44
129 0.46
130 0.46
131 0.49
132 0.52
133 0.55
134 0.62
135 0.66
136 0.7
137 0.75
138 0.73
139 0.73
140 0.66
141 0.61
142 0.59
143 0.56
144 0.56
145 0.49
146 0.49
147 0.49
148 0.53
149 0.58
150 0.59
151 0.61
152 0.64
153 0.73
154 0.79
155 0.83
156 0.85
157 0.85
158 0.83
159 0.79
160 0.74
161 0.73
162 0.69
163 0.64
164 0.56
165 0.48
166 0.49
167 0.5
168 0.46
169 0.39
170 0.38
171 0.33
172 0.36
173 0.35
174 0.34
175 0.37
176 0.39
177 0.39
178 0.35
179 0.36
180 0.33
181 0.36
182 0.32
183 0.29
184 0.29
185 0.28
186 0.27
187 0.26
188 0.27
189 0.29
190 0.29
191 0.27
192 0.23
193 0.22
194 0.22
195 0.25
196 0.27
197 0.25
198 0.24
199 0.28
200 0.29
201 0.35
202 0.42
203 0.45
204 0.49
205 0.54
206 0.59
207 0.62
208 0.68
209 0.66
210 0.63
211 0.61
212 0.55
213 0.48
214 0.44
215 0.36
216 0.3
217 0.26
218 0.22
219 0.17
220 0.16
221 0.17
222 0.15
223 0.13
224 0.14
225 0.15
226 0.24
227 0.33
228 0.4
229 0.44
230 0.51
231 0.58
232 0.6
233 0.68
234 0.67
235 0.67
236 0.63
237 0.59
238 0.58
239 0.51
240 0.48
241 0.38
242 0.33
243 0.25
244 0.21
245 0.19
246 0.13
247 0.13
248 0.13
249 0.13
250 0.13
251 0.13
252 0.14
253 0.14
254 0.14
255 0.13
256 0.13
257 0.14
258 0.13
259 0.12
260 0.11
261 0.1
262 0.09
263 0.08
264 0.08
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.08
269 0.09
270 0.14
271 0.17
272 0.17
273 0.16
274 0.2
275 0.24
276 0.3
277 0.29
278 0.25
279 0.23
280 0.24
281 0.24
282 0.21
283 0.17
284 0.12
285 0.13
286 0.15
287 0.18
288 0.19
289 0.2
290 0.21
291 0.2
292 0.2
293 0.23
294 0.26
295 0.26
296 0.29
297 0.31
298 0.3
299 0.31
300 0.31
301 0.26
302 0.21
303 0.23
304 0.19
305 0.17
306 0.16
307 0.15
308 0.15
309 0.14
310 0.14
311 0.1
312 0.1
313 0.09
314 0.08
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.06
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.05
324 0.07
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.07
329 0.07
330 0.06
331 0.08
332 0.08
333 0.09
334 0.09
335 0.11
336 0.1
337 0.13
338 0.16
339 0.18
340 0.19
341 0.19
342 0.24
343 0.3
344 0.4
345 0.47
346 0.54
347 0.59
348 0.64
349 0.67
350 0.7
351 0.65
352 0.62
353 0.55
354 0.51
355 0.45
356 0.39
357 0.39
358 0.35
359 0.32
360 0.26
361 0.22
362 0.18
363 0.16
364 0.17
365 0.17
366 0.17
367 0.19
368 0.22
369 0.31
370 0.36
371 0.37
372 0.42
373 0.42
374 0.44
375 0.49
376 0.53
377 0.5
378 0.48
379 0.48
380 0.43
381 0.41
382 0.39
383 0.34
384 0.3
385 0.27
386 0.29
387 0.33
388 0.31
389 0.32
390 0.34
391 0.39
392 0.39
393 0.43
394 0.41
395 0.39
396 0.4
397 0.39
398 0.4
399 0.43
400 0.41
401 0.4
402 0.39
403 0.35
404 0.36
405 0.34
406 0.28
407 0.19
408 0.21
409 0.19
410 0.19
411 0.19
412 0.18
413 0.2
414 0.2
415 0.23
416 0.18
417 0.16
418 0.21
419 0.26
420 0.32
421 0.36
422 0.38
423 0.4
424 0.43
425 0.44
426 0.43
427 0.49
428 0.49
429 0.52
430 0.58
431 0.58
432 0.6
433 0.59
434 0.55
435 0.44
436 0.38
437 0.31
438 0.23
439 0.19
440 0.17
441 0.22
442 0.21
443 0.27
444 0.34
445 0.36
446 0.4
447 0.4
448 0.41
449 0.44
450 0.54
451 0.54
452 0.55
453 0.56
454 0.53
455 0.54
456 0.52
457 0.47
458 0.46
459 0.47
460 0.41
461 0.41
462 0.44
463 0.43
464 0.49
465 0.48
466 0.43
467 0.38
468 0.4
469 0.43
470 0.4
471 0.4
472 0.35
473 0.31
474 0.27
475 0.24
476 0.2
477 0.14
478 0.12
479 0.1
480 0.08
481 0.06
482 0.06
483 0.06
484 0.07
485 0.07
486 0.06
487 0.06
488 0.06
489 0.07
490 0.06
491 0.07
492 0.06
493 0.05
494 0.06
495 0.06
496 0.05
497 0.05
498 0.05
499 0.04
500 0.04
501 0.06
502 0.06
503 0.07
504 0.09
505 0.09
506 0.09
507 0.1
508 0.11
509 0.1
510 0.09
511 0.08
512 0.06
513 0.06
514 0.06
515 0.06
516 0.05
517 0.05
518 0.05
519 0.08
520 0.08
521 0.09
522 0.1
523 0.1
524 0.1
525 0.11
526 0.11
527 0.11
528 0.14
529 0.13
530 0.17
531 0.16
532 0.17
533 0.21
534 0.21
535 0.19
536 0.17
537 0.17
538 0.18
539 0.24
540 0.26
541 0.25
542 0.32
543 0.39
544 0.41
545 0.47
546 0.44
547 0.48
548 0.55
549 0.59
550 0.57
551 0.58
552 0.64
553 0.65
554 0.73
555 0.74
556 0.74
557 0.76
558 0.76
559 0.73
560 0.69
561 0.68
562 0.62
563 0.55
564 0.48
565 0.4
566 0.36
567 0.38
568 0.39
569 0.42
570 0.38
571 0.4
572 0.38
573 0.38
574 0.42
575 0.4
576 0.41
577 0.36
578 0.35
579 0.32
580 0.33
581 0.33
582 0.3
583 0.26
584 0.18
585 0.2
586 0.2
587 0.19
588 0.16
589 0.15
590 0.14
591 0.15
592 0.18
593 0.14
594 0.14
595 0.13
596 0.13
597 0.13
598 0.12
599 0.1
600 0.09
601 0.11
602 0.14
603 0.15
604 0.18
605 0.24
606 0.26
607 0.29
608 0.32
609 0.36
610 0.44
611 0.47
612 0.49
613 0.49
614 0.54
615 0.55
616 0.61
617 0.59
618 0.58
619 0.63
620 0.67
621 0.65
622 0.61
623 0.65
624 0.65
625 0.69
626 0.63
627 0.55
628 0.49
629 0.47
630 0.48
631 0.41
632 0.39
633 0.32
634 0.3
635 0.29
636 0.32
637 0.32
638 0.29
639 0.31
640 0.27
641 0.28
642 0.29
643 0.28
644 0.29
645 0.28
646 0.3
647 0.3
648 0.29
649 0.3
650 0.29
651 0.3
652 0.3
653 0.3
654 0.29
655 0.35
656 0.4
657 0.37
658 0.43
659 0.42
660 0.37
661 0.38
662 0.37
663 0.28
664 0.22
665 0.23
666 0.21
667 0.22
668 0.22
669 0.2
670 0.2
671 0.2
672 0.18
673 0.16
674 0.13
675 0.15
676 0.14
677 0.13
678 0.13
679 0.12
680 0.11
681 0.12
682 0.11
683 0.1
684 0.11
685 0.12
686 0.15
687 0.17
688 0.17
689 0.17
690 0.17
691 0.15
692 0.18
693 0.2
694 0.18
695 0.17
696 0.23
697 0.27
698 0.28
699 0.31
700 0.29
701 0.29
702 0.3
703 0.31
704 0.29
705 0.33
706 0.34
707 0.31
708 0.29
709 0.26
710 0.25
711 0.23
712 0.17
713 0.09
714 0.07
715 0.08
716 0.08
717 0.09
718 0.13
719 0.14
720 0.14
721 0.15
722 0.14
723 0.13
724 0.14
725 0.13
726 0.09
727 0.09
728 0.08
729 0.07
730 0.07
731 0.07
732 0.05
733 0.04
734 0.04
735 0.04
736 0.05
737 0.06
738 0.06
739 0.06
740 0.07
741 0.09
742 0.11
743 0.11
744 0.11
745 0.16
746 0.18
747 0.19
748 0.21
749 0.24
750 0.25
751 0.28
752 0.28
753 0.27
754 0.27
755 0.27
756 0.24
757 0.23
758 0.25
759 0.27
760 0.32
761 0.34
762 0.36
763 0.38
764 0.39
765 0.41
766 0.36
767 0.33
768 0.29
769 0.26
770 0.32
771 0.32
772 0.4
773 0.45
774 0.48
775 0.5
776 0.5
777 0.47
778 0.45
779 0.52
780 0.52
781 0.53
782 0.55
783 0.57
784 0.61
785 0.64
786 0.63
787 0.64
788 0.64
789 0.64
790 0.69
791 0.71
792 0.73
793 0.8
794 0.83
795 0.83
796 0.84
797 0.86
798 0.86
799 0.86
800 0.85
801 0.79
802 0.72
803 0.63
804 0.54
805 0.49
806 0.45
807 0.41
808 0.37
809 0.37
810 0.35
811 0.38
812 0.4
813 0.41
814 0.44
815 0.48