Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1E3ICX1

Protein Details
Accession A0A1E3ICX1    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-36DKTPNLSGSKREKRHREDDEEDDAcidic
50-117GEHDHDDKDRERRHRHRHRDETEEERRERHRRRDERREDETEEEREDRKRRRKEREMRERERARERETBasic
143-172SNYRDRSRESHRSHRSHRSHRDDRDRPSMLBasic
195-232YEEQMERERRRRRSPPPLPPPPPPPPPRHRRRDSPIYDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
57-116KDRERRHRHRHRDETEEERRERHRRRDERREDETEEEREDRKRRRKEREMRERERARERE
201-231RERRRRRSPPPLPPPPPPPPPRHRRRDSPIY
233-238APPRRP
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR029123  RBM39_linker  
IPR006509  RBM39_SF  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF15519  RBM39linker  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12285  RRM3_RBM39_like  
Amino Acid Sequences MSATPPMASTNGDDKTPNLSGSKREKRHREDDEEDDHDRSGRSHRYRRDGEHDHDDKDRERRHRHRHRDETEEERRERHRRRDERREDETEEEREDRKRRRKEREMRERERARERETDRDRGRDMGDDDYRRGSREHSVGKHSNYRDRSRESHRSHRSHRSHRDDRDRPSMLDESERLRVDRDVIEERRHRDLHYEEQMERERRRRRSPPPLPPPPPPPPPRHRRRDSPIYDAPPRRPPPPRDEADVEARSIFVSQLSAQMTSQILGMFFEDKLGRHAVRSAKVIMDRGRRSKGIGYVELDSVDLVNQALGLSGTVVMGIPINIMLNEADRNATGTELITATALSGFDLVLPPDVKANAHRDAPIPHHRLFISNLAYSLGSNDLRQVFEPFGELEFVDLHVDHNGLRKGTAYVQYRECQAAQMALDAMNGFDLASRPIKVQTIQDRNSYNQSLEALEDGGNLGAKLDANQRQQLMYKLARTEPPVNLSLSAPKSKAQARSPSMNPTVYVQVNNMFNPEEETERNWDLDLAEDVKEEVESKYGQVKRIKIEKMSAGEVYIEFADTGAASKAIKGLNGRFFGGRQLQAGYISETLFKAHL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.29
3 0.29
4 0.28
5 0.24
6 0.25
7 0.33
8 0.43
9 0.53
10 0.56
11 0.64
12 0.72
13 0.77
14 0.85
15 0.86
16 0.84
17 0.8
18 0.79
19 0.76
20 0.72
21 0.66
22 0.57
23 0.48
24 0.4
25 0.34
26 0.28
27 0.28
28 0.32
29 0.39
30 0.47
31 0.55
32 0.63
33 0.7
34 0.76
35 0.79
36 0.77
37 0.74
38 0.76
39 0.71
40 0.64
41 0.62
42 0.58
43 0.54
44 0.55
45 0.56
46 0.55
47 0.62
48 0.69
49 0.75
50 0.83
51 0.89
52 0.9
53 0.93
54 0.9
55 0.89
56 0.84
57 0.83
58 0.82
59 0.8
60 0.71
61 0.66
62 0.67
63 0.69
64 0.72
65 0.72
66 0.73
67 0.75
68 0.83
69 0.89
70 0.91
71 0.9
72 0.89
73 0.85
74 0.79
75 0.75
76 0.69
77 0.61
78 0.54
79 0.48
80 0.42
81 0.43
82 0.46
83 0.5
84 0.55
85 0.62
86 0.69
87 0.77
88 0.85
89 0.88
90 0.91
91 0.92
92 0.93
93 0.91
94 0.92
95 0.89
96 0.86
97 0.86
98 0.8
99 0.74
100 0.72
101 0.68
102 0.68
103 0.66
104 0.69
105 0.63
106 0.63
107 0.59
108 0.53
109 0.49
110 0.43
111 0.39
112 0.36
113 0.38
114 0.35
115 0.35
116 0.37
117 0.36
118 0.33
119 0.31
120 0.26
121 0.26
122 0.31
123 0.37
124 0.36
125 0.44
126 0.49
127 0.53
128 0.58
129 0.57
130 0.58
131 0.57
132 0.6
133 0.58
134 0.59
135 0.6
136 0.62
137 0.68
138 0.67
139 0.7
140 0.73
141 0.75
142 0.77
143 0.81
144 0.82
145 0.82
146 0.85
147 0.84
148 0.84
149 0.85
150 0.88
151 0.85
152 0.82
153 0.8
154 0.73
155 0.63
156 0.58
157 0.51
158 0.41
159 0.37
160 0.32
161 0.26
162 0.28
163 0.28
164 0.23
165 0.22
166 0.21
167 0.2
168 0.2
169 0.21
170 0.24
171 0.26
172 0.34
173 0.37
174 0.41
175 0.45
176 0.44
177 0.4
178 0.38
179 0.39
180 0.4
181 0.43
182 0.43
183 0.37
184 0.42
185 0.48
186 0.48
187 0.48
188 0.48
189 0.49
190 0.53
191 0.62
192 0.66
193 0.69
194 0.74
195 0.8
196 0.82
197 0.84
198 0.87
199 0.83
200 0.8
201 0.78
202 0.73
203 0.72
204 0.67
205 0.65
206 0.64
207 0.7
208 0.74
209 0.76
210 0.76
211 0.76
212 0.79
213 0.81
214 0.77
215 0.74
216 0.72
217 0.68
218 0.69
219 0.64
220 0.6
221 0.58
222 0.56
223 0.53
224 0.54
225 0.53
226 0.52
227 0.56
228 0.55
229 0.51
230 0.52
231 0.49
232 0.49
233 0.45
234 0.37
235 0.29
236 0.26
237 0.2
238 0.17
239 0.13
240 0.05
241 0.05
242 0.05
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.07
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.07
258 0.07
259 0.07
260 0.09
261 0.11
262 0.11
263 0.1
264 0.15
265 0.17
266 0.19
267 0.21
268 0.2
269 0.2
270 0.21
271 0.24
272 0.25
273 0.29
274 0.31
275 0.33
276 0.35
277 0.33
278 0.34
279 0.33
280 0.33
281 0.28
282 0.26
283 0.23
284 0.22
285 0.22
286 0.2
287 0.18
288 0.12
289 0.09
290 0.07
291 0.05
292 0.03
293 0.03
294 0.03
295 0.03
296 0.03
297 0.03
298 0.03
299 0.02
300 0.03
301 0.03
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.03
312 0.03
313 0.04
314 0.04
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.05
322 0.05
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.05
327 0.04
328 0.04
329 0.05
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.03
334 0.03
335 0.04
336 0.04
337 0.05
338 0.06
339 0.06
340 0.07
341 0.07
342 0.08
343 0.11
344 0.15
345 0.16
346 0.17
347 0.19
348 0.19
349 0.22
350 0.28
351 0.34
352 0.34
353 0.33
354 0.34
355 0.33
356 0.33
357 0.33
358 0.32
359 0.26
360 0.21
361 0.2
362 0.18
363 0.18
364 0.16
365 0.14
366 0.12
367 0.09
368 0.09
369 0.12
370 0.12
371 0.13
372 0.13
373 0.14
374 0.12
375 0.12
376 0.13
377 0.1
378 0.09
379 0.09
380 0.08
381 0.07
382 0.07
383 0.07
384 0.07
385 0.06
386 0.06
387 0.06
388 0.07
389 0.07
390 0.11
391 0.13
392 0.12
393 0.12
394 0.13
395 0.14
396 0.17
397 0.24
398 0.24
399 0.27
400 0.31
401 0.32
402 0.33
403 0.33
404 0.3
405 0.24
406 0.19
407 0.17
408 0.13
409 0.12
410 0.11
411 0.09
412 0.09
413 0.08
414 0.07
415 0.05
416 0.05
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.07
421 0.09
422 0.09
423 0.1
424 0.12
425 0.14
426 0.16
427 0.22
428 0.3
429 0.38
430 0.4
431 0.45
432 0.46
433 0.47
434 0.51
435 0.45
436 0.36
437 0.28
438 0.26
439 0.21
440 0.19
441 0.16
442 0.12
443 0.1
444 0.09
445 0.08
446 0.07
447 0.07
448 0.06
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.07
453 0.13
454 0.2
455 0.23
456 0.27
457 0.28
458 0.29
459 0.31
460 0.33
461 0.33
462 0.3
463 0.3
464 0.3
465 0.32
466 0.34
467 0.38
468 0.39
469 0.36
470 0.36
471 0.34
472 0.32
473 0.3
474 0.28
475 0.29
476 0.28
477 0.29
478 0.26
479 0.26
480 0.3
481 0.34
482 0.41
483 0.41
484 0.47
485 0.49
486 0.55
487 0.57
488 0.6
489 0.59
490 0.52
491 0.46
492 0.39
493 0.39
494 0.33
495 0.3
496 0.24
497 0.25
498 0.26
499 0.25
500 0.24
501 0.19
502 0.18
503 0.2
504 0.21
505 0.19
506 0.19
507 0.22
508 0.26
509 0.26
510 0.27
511 0.23
512 0.22
513 0.18
514 0.19
515 0.19
516 0.15
517 0.13
518 0.13
519 0.13
520 0.13
521 0.13
522 0.12
523 0.09
524 0.1
525 0.1
526 0.12
527 0.21
528 0.24
529 0.31
530 0.36
531 0.41
532 0.47
533 0.55
534 0.59
535 0.54
536 0.57
537 0.57
538 0.55
539 0.53
540 0.45
541 0.37
542 0.33
543 0.29
544 0.24
545 0.18
546 0.13
547 0.1
548 0.09
549 0.08
550 0.07
551 0.08
552 0.07
553 0.07
554 0.07
555 0.08
556 0.12
557 0.12
558 0.15
559 0.19
560 0.26
561 0.33
562 0.35
563 0.37
564 0.34
565 0.34
566 0.39
567 0.4
568 0.35
569 0.29
570 0.29
571 0.28
572 0.28
573 0.29
574 0.25
575 0.2
576 0.18
577 0.18
578 0.17