Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0A0HT53

Protein Details
Accession A0A0A0HT53    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
142-170RQIYKLRSPYSTRKRRKLRQKLGHVFLTPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
154-163RKRRKLRQKL
Subcellular Location(s) extr 15, mito 4, nucl 3.5, cyto_nucl 3.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018392  LysM_dom  
IPR036779  LysM_dom_sf  
KEGG pbn:PADG_11578  -  
CDD cd00118  LysM  
Amino Acid Sequences MNLQAALCILAVLCVNGLPTGTLSFSQNPNSTCLETHTAARLGDICASIKPGQNYCNEIAVQGQSAVPETVLRQATEFMAICARQWLVGPNDTCESIATVAGISVGELVTLNVARNPRKLRKHQPECVGLSGILFLSIHGGRQIYKLRSPYSTRKRRKLRQKLGHVFLTPRKSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.05
3 0.06
4 0.06
5 0.05
6 0.06
7 0.07
8 0.08
9 0.09
10 0.12
11 0.15
12 0.18
13 0.23
14 0.26
15 0.26
16 0.28
17 0.3
18 0.29
19 0.25
20 0.27
21 0.27
22 0.24
23 0.25
24 0.25
25 0.23
26 0.22
27 0.22
28 0.19
29 0.15
30 0.15
31 0.14
32 0.11
33 0.1
34 0.13
35 0.15
36 0.16
37 0.18
38 0.19
39 0.22
40 0.24
41 0.27
42 0.25
43 0.26
44 0.23
45 0.2
46 0.19
47 0.16
48 0.14
49 0.1
50 0.09
51 0.06
52 0.07
53 0.07
54 0.06
55 0.06
56 0.06
57 0.1
58 0.11
59 0.11
60 0.1
61 0.11
62 0.11
63 0.13
64 0.12
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.08
69 0.08
70 0.08
71 0.06
72 0.06
73 0.09
74 0.09
75 0.13
76 0.14
77 0.14
78 0.15
79 0.15
80 0.15
81 0.12
82 0.11
83 0.08
84 0.07
85 0.06
86 0.05
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.03
91 0.03
92 0.03
93 0.03
94 0.03
95 0.03
96 0.03
97 0.04
98 0.04
99 0.06
100 0.1
101 0.12
102 0.18
103 0.26
104 0.34
105 0.43
106 0.52
107 0.61
108 0.69
109 0.77
110 0.79
111 0.8
112 0.78
113 0.73
114 0.65
115 0.55
116 0.44
117 0.34
118 0.27
119 0.19
120 0.12
121 0.08
122 0.05
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.09
127 0.09
128 0.1
129 0.15
130 0.22
131 0.23
132 0.28
133 0.32
134 0.34
135 0.4
136 0.46
137 0.53
138 0.57
139 0.64
140 0.69
141 0.75
142 0.83
143 0.88
144 0.92
145 0.93
146 0.93
147 0.93
148 0.94
149 0.94
150 0.9
151 0.86
152 0.78
153 0.73
154 0.69