Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GBM8

Protein Details
Accession C1GBM8    Localization Confidence High Confidence Score 16.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
47-66KTADDKKKEAQRIQREKDKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
25-34KNKKGGSAKK
53-54KK
259-267KKERLDKKA
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11, cyto 4.5, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032378  ZC3H15/TMA46_C  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG pbn:PADG_05029  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF16543  DFRP_C  
PF00642  zf-CCCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MPPKKGSDQPKKSKATVEDKTFGMKNKKGGSAKKQIAQLQAQARSNKTADDKKKEAQRIQREKDKAAAEQAKREAAELFKPVQVQKVPFGVDPKTVLCVFFKKGSCEKGKKCKFSHDSAVERKAQKKDLYSDSRYAEEDKKLDLMDNWDEEKLRNVVLSKHGNPKTTTDKVCKYFIEAVENQKYGWFWVCPNGGDKCMYKHSLPPGFVLKTKEQRAAEKALMDKSPLKTLTLEDFLESERHKLTGKLTPVTPETFAKWKKERLDKKAAEEEARKAKDASGRAMFENGDWNASEDESGDGSDHDDDDNQNEWNMESLRKETERLRDQSEEERIAKLRGASSQVHANGAGLDEPSNPVDGAG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.75
3 0.73
4 0.7
5 0.64
6 0.58
7 0.6
8 0.55
9 0.54
10 0.53
11 0.48
12 0.47
13 0.5
14 0.57
15 0.59
16 0.65
17 0.67
18 0.69
19 0.72
20 0.69
21 0.7
22 0.66
23 0.66
24 0.6
25 0.58
26 0.55
27 0.55
28 0.55
29 0.53
30 0.5
31 0.48
32 0.45
33 0.42
34 0.42
35 0.45
36 0.49
37 0.53
38 0.57
39 0.59
40 0.68
41 0.72
42 0.73
43 0.73
44 0.75
45 0.77
46 0.79
47 0.82
48 0.77
49 0.71
50 0.7
51 0.63
52 0.53
53 0.52
54 0.52
55 0.45
56 0.47
57 0.48
58 0.44
59 0.41
60 0.39
61 0.31
62 0.25
63 0.26
64 0.22
65 0.22
66 0.2
67 0.23
68 0.23
69 0.26
70 0.27
71 0.26
72 0.26
73 0.27
74 0.27
75 0.26
76 0.29
77 0.25
78 0.23
79 0.23
80 0.2
81 0.2
82 0.19
83 0.18
84 0.17
85 0.19
86 0.2
87 0.24
88 0.25
89 0.28
90 0.32
91 0.39
92 0.46
93 0.52
94 0.58
95 0.63
96 0.7
97 0.73
98 0.71
99 0.75
100 0.71
101 0.68
102 0.69
103 0.65
104 0.64
105 0.62
106 0.65
107 0.6
108 0.59
109 0.59
110 0.54
111 0.51
112 0.46
113 0.44
114 0.45
115 0.47
116 0.51
117 0.48
118 0.49
119 0.45
120 0.44
121 0.4
122 0.38
123 0.32
124 0.28
125 0.25
126 0.21
127 0.2
128 0.19
129 0.18
130 0.15
131 0.16
132 0.15
133 0.16
134 0.16
135 0.15
136 0.16
137 0.15
138 0.17
139 0.13
140 0.11
141 0.1
142 0.1
143 0.11
144 0.17
145 0.23
146 0.24
147 0.33
148 0.36
149 0.37
150 0.37
151 0.4
152 0.41
153 0.41
154 0.42
155 0.38
156 0.41
157 0.42
158 0.43
159 0.39
160 0.35
161 0.33
162 0.3
163 0.3
164 0.26
165 0.29
166 0.3
167 0.3
168 0.26
169 0.22
170 0.21
171 0.16
172 0.16
173 0.11
174 0.07
175 0.12
176 0.13
177 0.13
178 0.16
179 0.16
180 0.16
181 0.18
182 0.18
183 0.16
184 0.19
185 0.21
186 0.18
187 0.21
188 0.28
189 0.3
190 0.3
191 0.29
192 0.3
193 0.29
194 0.32
195 0.32
196 0.3
197 0.33
198 0.35
199 0.39
200 0.36
201 0.38
202 0.39
203 0.4
204 0.36
205 0.31
206 0.3
207 0.27
208 0.26
209 0.24
210 0.24
211 0.21
212 0.24
213 0.22
214 0.21
215 0.19
216 0.2
217 0.22
218 0.2
219 0.19
220 0.15
221 0.15
222 0.15
223 0.17
224 0.16
225 0.14
226 0.12
227 0.12
228 0.13
229 0.14
230 0.16
231 0.2
232 0.24
233 0.25
234 0.25
235 0.27
236 0.29
237 0.29
238 0.28
239 0.23
240 0.22
241 0.28
242 0.3
243 0.35
244 0.38
245 0.43
246 0.49
247 0.58
248 0.65
249 0.65
250 0.73
251 0.69
252 0.71
253 0.73
254 0.68
255 0.64
256 0.58
257 0.56
258 0.54
259 0.51
260 0.45
261 0.37
262 0.37
263 0.37
264 0.36
265 0.36
266 0.32
267 0.32
268 0.32
269 0.33
270 0.3
271 0.24
272 0.28
273 0.21
274 0.17
275 0.15
276 0.16
277 0.15
278 0.15
279 0.14
280 0.09
281 0.1
282 0.09
283 0.09
284 0.07
285 0.07
286 0.08
287 0.09
288 0.09
289 0.08
290 0.09
291 0.1
292 0.13
293 0.14
294 0.13
295 0.13
296 0.13
297 0.13
298 0.15
299 0.16
300 0.15
301 0.16
302 0.18
303 0.24
304 0.25
305 0.28
306 0.3
307 0.39
308 0.46
309 0.48
310 0.51
311 0.49
312 0.51
313 0.56
314 0.58
315 0.54
316 0.46
317 0.46
318 0.42
319 0.39
320 0.38
321 0.32
322 0.27
323 0.24
324 0.28
325 0.26
326 0.28
327 0.34
328 0.33
329 0.32
330 0.3
331 0.27
332 0.22
333 0.21
334 0.18
335 0.11
336 0.11
337 0.1
338 0.12
339 0.13
340 0.13