Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1G5D8

Protein Details
Accession C1G5D8    Localization Confidence High Confidence Score 18.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
157-179EFSLAKYTLRKRKKYLKRFSVLPHydrophilic
399-426LSWKPNKRGMYYRKRRRWARVRNVVGETHydrophilic
589-610KVEARGHQGRKKRRTEMGTPDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
411-416RKRRRW
595-602HQGRKKRR
Subcellular Location(s) mito 11, nucl 9, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
KEGG pbn:PADG_02393  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MHSRVLPHAYVGLGLPSDTIKIQQIVPNTIISLGKYGSFQANQIIGRPYHLTFEILDHPDTDDNHALRIVPAAELHTESLLADGSLPGEGEDFEGSQEPDGTDPSSMRTNRETVDDNSSQLMTMDEIEVLKKGTTGAGREIINKLLESHSGLDQKTEFSLAKYTLRKRKKYLKRFSVLPLDVPLLTNWMLKQKDAAKIMELRDEIVGLIGCWANVHNGGDAFITTDSAKLRPAGRWLVVDDTGGLIVAAMAERMGILYPPEAGTGNFAAGVDSRAETGKYKGSTSQPCGPSSPDGSVPPVNCPPGQADISSSSSPSSSPRHRRRTLGMSSTNTTLTMIHANAQPNLSLLKYFSFDASDPSPSHPLHTNLKTLSWLQLLEPHSDPVYNNEPPVVSDATLLSWKPNKRGMYYRKRRRWARVRNVVGETRSGGFDGLIVASLMDPTSILKHTVPLLSGSAPVVVYAPHIEPLLRLADFYSTARRTAYMNLKREAWQRNQCLGSTASQNGNPRSAGFYEGCEIDTGDAEKPSAGINEADFPVDPTLLLAPTIQTSRVRLWQVLPGRTHPLMTGRGGAEGYVFHAIRALPALGKVEARGHQGRKKRRTEMGTPDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.1
3 0.09
4 0.1
5 0.1
6 0.11
7 0.13
8 0.14
9 0.17
10 0.2
11 0.24
12 0.27
13 0.28
14 0.27
15 0.25
16 0.25
17 0.23
18 0.2
19 0.18
20 0.14
21 0.14
22 0.14
23 0.16
24 0.18
25 0.18
26 0.19
27 0.21
28 0.24
29 0.24
30 0.27
31 0.29
32 0.24
33 0.26
34 0.29
35 0.25
36 0.24
37 0.24
38 0.22
39 0.18
40 0.22
41 0.26
42 0.26
43 0.26
44 0.23
45 0.24
46 0.26
47 0.26
48 0.27
49 0.26
50 0.24
51 0.24
52 0.24
53 0.22
54 0.2
55 0.21
56 0.16
57 0.11
58 0.11
59 0.12
60 0.13
61 0.13
62 0.14
63 0.11
64 0.11
65 0.1
66 0.1
67 0.08
68 0.07
69 0.06
70 0.05
71 0.05
72 0.06
73 0.06
74 0.05
75 0.05
76 0.06
77 0.06
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.09
82 0.1
83 0.1
84 0.1
85 0.1
86 0.1
87 0.11
88 0.11
89 0.1
90 0.1
91 0.13
92 0.19
93 0.2
94 0.23
95 0.25
96 0.27
97 0.27
98 0.31
99 0.33
100 0.28
101 0.35
102 0.33
103 0.31
104 0.29
105 0.28
106 0.24
107 0.2
108 0.17
109 0.09
110 0.09
111 0.08
112 0.07
113 0.07
114 0.08
115 0.08
116 0.09
117 0.08
118 0.07
119 0.07
120 0.1
121 0.12
122 0.13
123 0.16
124 0.2
125 0.21
126 0.23
127 0.24
128 0.24
129 0.23
130 0.21
131 0.19
132 0.16
133 0.16
134 0.15
135 0.16
136 0.18
137 0.21
138 0.2
139 0.21
140 0.2
141 0.2
142 0.18
143 0.19
144 0.15
145 0.12
146 0.15
147 0.15
148 0.22
149 0.28
150 0.36
151 0.44
152 0.53
153 0.59
154 0.64
155 0.73
156 0.77
157 0.81
158 0.84
159 0.84
160 0.81
161 0.79
162 0.77
163 0.76
164 0.65
165 0.56
166 0.46
167 0.37
168 0.31
169 0.27
170 0.21
171 0.13
172 0.13
173 0.12
174 0.11
175 0.16
176 0.16
177 0.16
178 0.21
179 0.23
180 0.29
181 0.31
182 0.31
183 0.27
184 0.31
185 0.33
186 0.32
187 0.28
188 0.22
189 0.19
190 0.19
191 0.15
192 0.11
193 0.1
194 0.05
195 0.06
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.08
207 0.07
208 0.07
209 0.06
210 0.07
211 0.06
212 0.08
213 0.08
214 0.09
215 0.09
216 0.11
217 0.13
218 0.13
219 0.17
220 0.19
221 0.2
222 0.2
223 0.21
224 0.21
225 0.19
226 0.18
227 0.14
228 0.11
229 0.09
230 0.08
231 0.06
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.02
236 0.02
237 0.02
238 0.02
239 0.02
240 0.02
241 0.02
242 0.02
243 0.03
244 0.03
245 0.04
246 0.04
247 0.05
248 0.06
249 0.05
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.08
264 0.09
265 0.12
266 0.13
267 0.13
268 0.17
269 0.23
270 0.27
271 0.32
272 0.38
273 0.36
274 0.36
275 0.37
276 0.34
277 0.3
278 0.26
279 0.23
280 0.17
281 0.15
282 0.16
283 0.17
284 0.16
285 0.17
286 0.18
287 0.18
288 0.16
289 0.16
290 0.15
291 0.15
292 0.16
293 0.13
294 0.12
295 0.13
296 0.17
297 0.16
298 0.15
299 0.12
300 0.11
301 0.12
302 0.13
303 0.16
304 0.22
305 0.33
306 0.43
307 0.52
308 0.56
309 0.59
310 0.62
311 0.65
312 0.62
313 0.59
314 0.55
315 0.48
316 0.47
317 0.44
318 0.38
319 0.3
320 0.24
321 0.16
322 0.12
323 0.1
324 0.09
325 0.1
326 0.12
327 0.14
328 0.14
329 0.14
330 0.13
331 0.12
332 0.12
333 0.1
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.08
338 0.08
339 0.08
340 0.09
341 0.09
342 0.12
343 0.13
344 0.14
345 0.14
346 0.16
347 0.2
348 0.18
349 0.2
350 0.21
351 0.23
352 0.28
353 0.3
354 0.31
355 0.27
356 0.28
357 0.27
358 0.25
359 0.23
360 0.17
361 0.15
362 0.11
363 0.17
364 0.18
365 0.19
366 0.19
367 0.18
368 0.17
369 0.17
370 0.17
371 0.16
372 0.2
373 0.18
374 0.17
375 0.17
376 0.17
377 0.16
378 0.19
379 0.15
380 0.1
381 0.1
382 0.1
383 0.1
384 0.11
385 0.11
386 0.11
387 0.16
388 0.18
389 0.22
390 0.28
391 0.29
392 0.33
393 0.43
394 0.5
395 0.56
396 0.65
397 0.72
398 0.76
399 0.83
400 0.87
401 0.88
402 0.88
403 0.88
404 0.88
405 0.87
406 0.84
407 0.81
408 0.77
409 0.7
410 0.6
411 0.5
412 0.41
413 0.31
414 0.24
415 0.18
416 0.14
417 0.1
418 0.09
419 0.08
420 0.06
421 0.05
422 0.04
423 0.04
424 0.04
425 0.04
426 0.04
427 0.03
428 0.03
429 0.04
430 0.06
431 0.07
432 0.09
433 0.09
434 0.11
435 0.13
436 0.14
437 0.14
438 0.13
439 0.14
440 0.13
441 0.13
442 0.12
443 0.11
444 0.09
445 0.09
446 0.08
447 0.06
448 0.06
449 0.08
450 0.08
451 0.08
452 0.09
453 0.09
454 0.09
455 0.11
456 0.13
457 0.1
458 0.1
459 0.1
460 0.11
461 0.12
462 0.14
463 0.19
464 0.18
465 0.19
466 0.19
467 0.2
468 0.2
469 0.26
470 0.35
471 0.36
472 0.41
473 0.43
474 0.45
475 0.49
476 0.55
477 0.55
478 0.54
479 0.55
480 0.55
481 0.6
482 0.59
483 0.55
484 0.5
485 0.44
486 0.38
487 0.33
488 0.3
489 0.25
490 0.27
491 0.33
492 0.32
493 0.33
494 0.3
495 0.26
496 0.26
497 0.24
498 0.25
499 0.2
500 0.2
501 0.2
502 0.2
503 0.19
504 0.16
505 0.15
506 0.12
507 0.12
508 0.12
509 0.11
510 0.11
511 0.11
512 0.1
513 0.1
514 0.11
515 0.1
516 0.1
517 0.09
518 0.1
519 0.14
520 0.15
521 0.15
522 0.14
523 0.15
524 0.15
525 0.14
526 0.12
527 0.09
528 0.1
529 0.09
530 0.1
531 0.08
532 0.08
533 0.1
534 0.12
535 0.14
536 0.14
537 0.17
538 0.21
539 0.28
540 0.3
541 0.3
542 0.31
543 0.37
544 0.43
545 0.46
546 0.45
547 0.42
548 0.46
549 0.44
550 0.43
551 0.36
552 0.34
553 0.31
554 0.3
555 0.3
556 0.24
557 0.25
558 0.24
559 0.22
560 0.17
561 0.14
562 0.15
563 0.16
564 0.15
565 0.13
566 0.15
567 0.15
568 0.16
569 0.18
570 0.16
571 0.11
572 0.13
573 0.16
574 0.15
575 0.16
576 0.17
577 0.2
578 0.22
579 0.29
580 0.35
581 0.4
582 0.47
583 0.56
584 0.65
585 0.7
586 0.77
587 0.78
588 0.8
589 0.8
590 0.82