Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GJS6

Protein Details
Accession C1GJS6    Localization Confidence High Confidence Score 18.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-51SSTHISHKKARMHPLRQTSFHydrophilic
93-113SGNARGKKRKKGGAGGRKEKEBasic
373-401QSQPQTQAEPKRKQRLPFKPPPNPHRGQLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
96-112ARGKKRKKGGAGGRKEK
384-392RKQRLPFKP
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 11, mito 7, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR045127  TAF11-like  
IPR006809  TAFII28_dom  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
KEGG pbn:PADG_07512  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04719  TAFII28  
CDD cd08048  TAF11  
Amino Acid Sequences MSLSPPPPSPQTPLSLPPSNQNPKKRPLSMPSSTHISHKKARMHPLRQTSFPSSQDSDPRVYSARAASVKSEADGGSVTGSVTGLFAASVDGSGNARGKKRKKGGAGGRKEKETETERDGTASVKGTTVDGGVEVDGGGEEVDEDGDGDEGDMEEVEGEGEDGDGPGTAREAEAERKNLAILIDAFTPAQSTRYDFFKRAKLNKPMVRKIVNQTLSQSVPPNVITTISGYTKVFVGELVEKARTVQEEWAEAADRAAYAEYEAELAREEEKEEEKEEEEAPTRAREQAVTTASTQSTQPTTTTATNAIMDSQTRTNQLSSSAAAADMPSTKTDLTGNDIAVVKTEPSSSNSSTTASDILKSTTTPPSPSTQPQSQPQTQAEPKRKQRLPFKPPPNPHRGQLLPSHLREALRRYKRDGEGGGVGFGGLSMGGMGVKGSFSCGIRGVGGRRLFQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.49
3 0.47
4 0.49
5 0.56
6 0.61
7 0.65
8 0.69
9 0.69
10 0.71
11 0.79
12 0.79
13 0.76
14 0.74
15 0.75
16 0.73
17 0.71
18 0.66
19 0.63
20 0.57
21 0.57
22 0.56
23 0.53
24 0.52
25 0.55
26 0.6
27 0.61
28 0.71
29 0.73
30 0.75
31 0.78
32 0.81
33 0.78
34 0.73
35 0.72
36 0.68
37 0.63
38 0.57
39 0.54
40 0.47
41 0.46
42 0.5
43 0.46
44 0.43
45 0.38
46 0.38
47 0.34
48 0.31
49 0.29
50 0.24
51 0.27
52 0.26
53 0.27
54 0.26
55 0.27
56 0.27
57 0.24
58 0.24
59 0.17
60 0.15
61 0.14
62 0.12
63 0.09
64 0.09
65 0.08
66 0.06
67 0.06
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.04
72 0.04
73 0.04
74 0.04
75 0.04
76 0.04
77 0.04
78 0.05
79 0.06
80 0.08
81 0.12
82 0.16
83 0.21
84 0.3
85 0.37
86 0.47
87 0.55
88 0.61
89 0.64
90 0.71
91 0.76
92 0.78
93 0.82
94 0.82
95 0.78
96 0.73
97 0.67
98 0.57
99 0.53
100 0.47
101 0.41
102 0.37
103 0.36
104 0.33
105 0.32
106 0.32
107 0.26
108 0.23
109 0.2
110 0.14
111 0.12
112 0.12
113 0.11
114 0.11
115 0.1
116 0.08
117 0.06
118 0.06
119 0.05
120 0.05
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.05
158 0.06
159 0.12
160 0.15
161 0.18
162 0.18
163 0.18
164 0.18
165 0.18
166 0.16
167 0.12
168 0.1
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.08
174 0.09
175 0.07
176 0.08
177 0.07
178 0.09
179 0.1
180 0.16
181 0.19
182 0.21
183 0.25
184 0.31
185 0.38
186 0.43
187 0.5
188 0.53
189 0.6
190 0.63
191 0.68
192 0.67
193 0.66
194 0.62
195 0.57
196 0.54
197 0.53
198 0.5
199 0.42
200 0.37
201 0.34
202 0.31
203 0.28
204 0.24
205 0.16
206 0.14
207 0.14
208 0.13
209 0.1
210 0.09
211 0.08
212 0.08
213 0.09
214 0.09
215 0.1
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.09
220 0.08
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.08
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.1
229 0.11
230 0.1
231 0.09
232 0.1
233 0.1
234 0.11
235 0.11
236 0.12
237 0.11
238 0.11
239 0.1
240 0.07
241 0.06
242 0.05
243 0.05
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.07
256 0.08
257 0.1
258 0.11
259 0.12
260 0.13
261 0.13
262 0.15
263 0.15
264 0.15
265 0.15
266 0.15
267 0.14
268 0.14
269 0.14
270 0.14
271 0.14
272 0.13
273 0.13
274 0.18
275 0.19
276 0.19
277 0.19
278 0.2
279 0.19
280 0.19
281 0.18
282 0.14
283 0.13
284 0.12
285 0.12
286 0.11
287 0.15
288 0.15
289 0.16
290 0.15
291 0.15
292 0.15
293 0.15
294 0.14
295 0.11
296 0.11
297 0.12
298 0.13
299 0.14
300 0.15
301 0.16
302 0.16
303 0.16
304 0.17
305 0.16
306 0.14
307 0.14
308 0.12
309 0.11
310 0.1
311 0.09
312 0.08
313 0.08
314 0.09
315 0.08
316 0.09
317 0.09
318 0.1
319 0.11
320 0.11
321 0.15
322 0.17
323 0.16
324 0.18
325 0.19
326 0.18
327 0.18
328 0.18
329 0.12
330 0.11
331 0.12
332 0.11
333 0.13
334 0.19
335 0.19
336 0.22
337 0.22
338 0.23
339 0.22
340 0.22
341 0.22
342 0.17
343 0.17
344 0.15
345 0.16
346 0.15
347 0.15
348 0.17
349 0.2
350 0.22
351 0.23
352 0.24
353 0.28
354 0.32
355 0.38
356 0.42
357 0.42
358 0.46
359 0.52
360 0.58
361 0.58
362 0.59
363 0.56
364 0.57
365 0.57
366 0.62
367 0.64
368 0.65
369 0.71
370 0.75
371 0.78
372 0.78
373 0.81
374 0.82
375 0.82
376 0.83
377 0.84
378 0.84
379 0.89
380 0.89
381 0.88
382 0.81
383 0.74
384 0.72
385 0.64
386 0.58
387 0.55
388 0.56
389 0.54
390 0.52
391 0.52
392 0.46
393 0.45
394 0.44
395 0.45
396 0.46
397 0.48
398 0.5
399 0.53
400 0.59
401 0.62
402 0.65
403 0.59
404 0.54
405 0.51
406 0.47
407 0.41
408 0.31
409 0.27
410 0.2
411 0.17
412 0.11
413 0.04
414 0.03
415 0.02
416 0.03
417 0.03
418 0.03
419 0.03
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.07
424 0.1
425 0.11
426 0.13
427 0.15
428 0.16
429 0.18
430 0.23
431 0.24
432 0.29