Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GDR1

Protein Details
Accession C1GDR1    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
51-70VPESKGIKAKQTFKRRKMGSHydrophilic
305-327GEESSGRKQIKGKKKKKKKKGKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
309-327SGRKQIKGKKKKKKKKGKK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013520  Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3  
IPR037431  REX4_DEDDh_dom  
IPR047021  REXO1/3/4-like  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0008408  F:3'-5' exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG pbn:PADG_05397  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00929  RNase_T  
CDD cd06144  REX4_like  
Amino Acid Sequences MDLNNLSSNWRKLQATLKKDSPSTIQERQTSAPVGKDGVKRKRTSLLPSLVPESKGIKAKQTFKRRKMGSIISTAAAAEETDTLSIAAISQRNGSTTSTVQEKSQPAGEARVNEGLSPTATVGKYVAIDCEMVGVGPNPDRDSALGRVSIVNYNGEQVYDSFVRPKETVTDWRTHVSGVSPKHMAEARELEEVQKDVAKILDGCILIGHAIRNDLKALLLSHPNRDIRDTSKHPPYRKLAGGGSPRLKILALELLGLDIQGAAHSSVEDARATMLLFRRDKEAFEREHAKKWPPIRAPIDKENYGEESSGRKQIKGKKKKKKKKGKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.52
3 0.56
4 0.58
5 0.58
6 0.59
7 0.58
8 0.53
9 0.51
10 0.51
11 0.5
12 0.51
13 0.5
14 0.53
15 0.52
16 0.5
17 0.46
18 0.4
19 0.34
20 0.29
21 0.27
22 0.3
23 0.35
24 0.41
25 0.47
26 0.54
27 0.53
28 0.56
29 0.62
30 0.61
31 0.61
32 0.61
33 0.57
34 0.54
35 0.55
36 0.56
37 0.51
38 0.46
39 0.4
40 0.34
41 0.32
42 0.34
43 0.31
44 0.34
45 0.39
46 0.48
47 0.56
48 0.64
49 0.7
50 0.71
51 0.8
52 0.75
53 0.74
54 0.72
55 0.71
56 0.65
57 0.6
58 0.54
59 0.44
60 0.41
61 0.34
62 0.26
63 0.18
64 0.13
65 0.07
66 0.05
67 0.05
68 0.05
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.07
75 0.08
76 0.09
77 0.11
78 0.11
79 0.12
80 0.14
81 0.14
82 0.14
83 0.14
84 0.16
85 0.18
86 0.19
87 0.19
88 0.23
89 0.24
90 0.23
91 0.24
92 0.24
93 0.2
94 0.24
95 0.25
96 0.2
97 0.21
98 0.23
99 0.2
100 0.18
101 0.18
102 0.14
103 0.12
104 0.11
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.1
112 0.09
113 0.09
114 0.07
115 0.07
116 0.06
117 0.07
118 0.06
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.07
124 0.07
125 0.08
126 0.08
127 0.09
128 0.09
129 0.12
130 0.13
131 0.13
132 0.12
133 0.12
134 0.12
135 0.13
136 0.14
137 0.11
138 0.1
139 0.09
140 0.1
141 0.09
142 0.09
143 0.08
144 0.06
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.11
149 0.11
150 0.14
151 0.14
152 0.14
153 0.14
154 0.16
155 0.24
156 0.24
157 0.27
158 0.26
159 0.28
160 0.28
161 0.25
162 0.22
163 0.17
164 0.19
165 0.16
166 0.18
167 0.17
168 0.17
169 0.19
170 0.21
171 0.19
172 0.17
173 0.18
174 0.18
175 0.19
176 0.19
177 0.17
178 0.16
179 0.16
180 0.14
181 0.12
182 0.09
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.07
187 0.08
188 0.11
189 0.1
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.08
194 0.09
195 0.08
196 0.05
197 0.07
198 0.08
199 0.08
200 0.09
201 0.09
202 0.08
203 0.09
204 0.1
205 0.1
206 0.18
207 0.18
208 0.21
209 0.26
210 0.28
211 0.28
212 0.3
213 0.3
214 0.27
215 0.34
216 0.37
217 0.39
218 0.48
219 0.53
220 0.55
221 0.59
222 0.61
223 0.59
224 0.56
225 0.53
226 0.45
227 0.46
228 0.49
229 0.49
230 0.47
231 0.41
232 0.38
233 0.34
234 0.32
235 0.24
236 0.19
237 0.16
238 0.12
239 0.11
240 0.11
241 0.11
242 0.11
243 0.11
244 0.08
245 0.04
246 0.03
247 0.03
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.05
253 0.06
254 0.07
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.08
259 0.08
260 0.11
261 0.15
262 0.22
263 0.24
264 0.24
265 0.29
266 0.3
267 0.32
268 0.35
269 0.38
270 0.34
271 0.39
272 0.48
273 0.46
274 0.53
275 0.56
276 0.55
277 0.55
278 0.58
279 0.61
280 0.57
281 0.63
282 0.64
283 0.69
284 0.7
285 0.73
286 0.74
287 0.67
288 0.62
289 0.57
290 0.52
291 0.43
292 0.36
293 0.28
294 0.27
295 0.28
296 0.35
297 0.33
298 0.32
299 0.38
300 0.48
301 0.58
302 0.63
303 0.7
304 0.73
305 0.83
306 0.91
307 0.95