Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GDK2

Protein Details
Accession C1GDK2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
163-193GPHSGKKPYVQSKGRKFERARGRRRSRGFKVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
164-193PHSGKKPYVQSKGRKFERARGRRRSRGFKV
Subcellular Location(s) nucl 10, mito 9, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036227  L18e/L15P_sf  
IPR021132  Ribosomal_L18/L18-A/B/e_CS  
IPR000039  Ribosomal_L18e  
IPR021131  Ribosomal_L18e/L15P  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
KEGG pbn:PADG_05338  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17135  Ribosomal_L18  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01106  RIBOSOMAL_L18E  
Amino Acid Sequences MGKPPCIDLDRHHVRGSHRKAPKSDNVYLLLLVKLYRFLSRRTDSSFNKVVLRRLFMSRINRPPVSLSRIVSAIGTKETAEANKGKTIVIVGTVTDDNRLLNVPKISVAALRFTSTARARIEKAGGETLTLDQLALRAPTGANTLLLRGPKNAREAVKHFGFGPHSGKKPYVQSKGRKFERARGRRRSRGFKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.57
3 0.6
4 0.6
5 0.59
6 0.63
7 0.66
8 0.7
9 0.73
10 0.7
11 0.67
12 0.62
13 0.57
14 0.51
15 0.46
16 0.39
17 0.3
18 0.22
19 0.17
20 0.13
21 0.11
22 0.11
23 0.16
24 0.16
25 0.19
26 0.27
27 0.31
28 0.35
29 0.39
30 0.46
31 0.45
32 0.5
33 0.52
34 0.45
35 0.48
36 0.46
37 0.46
38 0.4
39 0.41
40 0.36
41 0.34
42 0.36
43 0.35
44 0.41
45 0.43
46 0.48
47 0.51
48 0.48
49 0.46
50 0.46
51 0.45
52 0.43
53 0.38
54 0.31
55 0.26
56 0.26
57 0.25
58 0.21
59 0.17
60 0.12
61 0.09
62 0.09
63 0.07
64 0.08
65 0.08
66 0.08
67 0.1
68 0.11
69 0.12
70 0.13
71 0.14
72 0.13
73 0.12
74 0.12
75 0.1
76 0.09
77 0.07
78 0.05
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.06
85 0.06
86 0.07
87 0.06
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.09
93 0.09
94 0.1
95 0.1
96 0.1
97 0.1
98 0.11
99 0.11
100 0.1
101 0.15
102 0.15
103 0.19
104 0.19
105 0.21
106 0.21
107 0.23
108 0.25
109 0.21
110 0.21
111 0.19
112 0.17
113 0.15
114 0.15
115 0.13
116 0.12
117 0.1
118 0.08
119 0.05
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.08
128 0.08
129 0.09
130 0.09
131 0.1
132 0.12
133 0.15
134 0.15
135 0.17
136 0.2
137 0.23
138 0.27
139 0.31
140 0.31
141 0.36
142 0.39
143 0.42
144 0.4
145 0.38
146 0.34
147 0.33
148 0.33
149 0.3
150 0.33
151 0.32
152 0.34
153 0.36
154 0.37
155 0.38
156 0.45
157 0.51
158 0.54
159 0.57
160 0.63
161 0.71
162 0.79
163 0.82
164 0.82
165 0.77
166 0.76
167 0.79
168 0.79
169 0.79
170 0.79
171 0.83
172 0.84
173 0.9