Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C1GKW5

Protein Details
Accession C1GKW5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
245-271KDYSPKKRVWHDRCYKTHKRHNPDSSLBasic
628-654LRKGFFGRSRNNKSHIRRKTAEKIMQTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, mito 2, cyto 2, golg 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001781  Znf_LIM  
Gene Ontology GO:0030695  F:GTPase regulator activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
KEGG pbn:PADG_07972  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00412  LIM  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00478  LIM_DOMAIN_1  
PS50023  LIM_DOMAIN_2  
CDD cd09392  LIM2_Lrg1p_like  
Amino Acid Sequences MEPCRTGIQEGTRSHSSVTPCNRNSVLSRDSCIPEPCSGTNLSGFCYSQSQRRQNPAVTVNADIGVAPDSCVTAPGVCDRNEGLNTKEGLLARKKSQSSAYSKSKSLEICAKCRTEIANEFVSAFGDIYHPQCFTCHDCQKVLSHEFFPVHEKNGPVPLCETDVFRRLDMLCSKCGGALRDLYISAIGRKYHMNHFTCHSCQKIIGSGDNYYVHRGQAYCKDDYSAKYADPCDSCGMPVMDQYIKDYSPKKRVWHDRCYKTHKRHNPDSSLAELPLLDDHDTEPSTSEEEKILNKFEEMVISLIGDSLGHLESGSREEISDGILALITAVGVLFSSIDIVDDSRRKAGKPPLSDSPEIDLLRAKLTDFMTVSLSRSQQRTRSMSSHLKGIYAASSGLSYFIKRVIKILGENVLNNDPSGTLDEYLNSLDQFPEDLPSTAMVFSKSELNRDDAELCLACNVPIRTECVSWGGYLRRQHLTCKSSCVHCDTCDTPENLYRVLISTPGNSYALCCTSCQDISISGYTNPDSVIPCTYITKLQQYIFLLRVQFKRLGNSPDASYDYIQTATATRTTPPLEKPSKPLDKGIFGRLSSNSDLIAEEQKTNNIRDRTAADTFAIGSKIGSSYQGLRKGFFGRSRNNKSHIRRKTAEKIMQTLH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.41
3 0.37
4 0.38
5 0.45
6 0.48
7 0.47
8 0.53
9 0.52
10 0.51
11 0.51
12 0.49
13 0.47
14 0.4
15 0.42
16 0.41
17 0.44
18 0.44
19 0.45
20 0.4
21 0.36
22 0.38
23 0.35
24 0.33
25 0.31
26 0.28
27 0.29
28 0.26
29 0.25
30 0.23
31 0.22
32 0.21
33 0.26
34 0.27
35 0.31
36 0.4
37 0.47
38 0.52
39 0.61
40 0.66
41 0.63
42 0.69
43 0.65
44 0.61
45 0.54
46 0.48
47 0.4
48 0.34
49 0.3
50 0.22
51 0.18
52 0.12
53 0.1
54 0.09
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.09
59 0.09
60 0.08
61 0.09
62 0.15
63 0.19
64 0.19
65 0.21
66 0.22
67 0.26
68 0.28
69 0.29
70 0.26
71 0.27
72 0.28
73 0.27
74 0.29
75 0.26
76 0.3
77 0.34
78 0.37
79 0.37
80 0.43
81 0.44
82 0.43
83 0.48
84 0.5
85 0.51
86 0.55
87 0.59
88 0.56
89 0.57
90 0.56
91 0.53
92 0.46
93 0.44
94 0.44
95 0.39
96 0.42
97 0.45
98 0.46
99 0.41
100 0.43
101 0.4
102 0.37
103 0.37
104 0.35
105 0.31
106 0.3
107 0.29
108 0.27
109 0.25
110 0.19
111 0.14
112 0.09
113 0.08
114 0.09
115 0.11
116 0.12
117 0.12
118 0.12
119 0.13
120 0.16
121 0.2
122 0.28
123 0.33
124 0.35
125 0.36
126 0.38
127 0.42
128 0.45
129 0.44
130 0.38
131 0.32
132 0.33
133 0.32
134 0.31
135 0.33
136 0.28
137 0.26
138 0.26
139 0.25
140 0.24
141 0.31
142 0.3
143 0.25
144 0.25
145 0.23
146 0.23
147 0.23
148 0.24
149 0.2
150 0.26
151 0.26
152 0.24
153 0.26
154 0.23
155 0.28
156 0.31
157 0.3
158 0.26
159 0.26
160 0.26
161 0.25
162 0.26
163 0.22
164 0.18
165 0.17
166 0.17
167 0.17
168 0.17
169 0.15
170 0.14
171 0.13
172 0.13
173 0.14
174 0.12
175 0.13
176 0.16
177 0.19
178 0.25
179 0.33
180 0.33
181 0.32
182 0.37
183 0.41
184 0.42
185 0.43
186 0.37
187 0.3
188 0.29
189 0.28
190 0.28
191 0.25
192 0.25
193 0.22
194 0.21
195 0.23
196 0.25
197 0.24
198 0.22
199 0.21
200 0.17
201 0.16
202 0.16
203 0.17
204 0.22
205 0.26
206 0.24
207 0.24
208 0.26
209 0.26
210 0.28
211 0.29
212 0.22
213 0.18
214 0.2
215 0.21
216 0.23
217 0.22
218 0.22
219 0.2
220 0.19
221 0.18
222 0.18
223 0.17
224 0.13
225 0.13
226 0.13
227 0.12
228 0.12
229 0.14
230 0.13
231 0.12
232 0.16
233 0.21
234 0.25
235 0.33
236 0.37
237 0.4
238 0.48
239 0.59
240 0.63
241 0.69
242 0.73
243 0.74
244 0.78
245 0.83
246 0.83
247 0.82
248 0.84
249 0.83
250 0.81
251 0.82
252 0.81
253 0.77
254 0.72
255 0.65
256 0.58
257 0.5
258 0.41
259 0.31
260 0.23
261 0.17
262 0.12
263 0.1
264 0.07
265 0.06
266 0.06
267 0.07
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.1
273 0.1
274 0.1
275 0.09
276 0.11
277 0.13
278 0.13
279 0.14
280 0.13
281 0.12
282 0.12
283 0.11
284 0.1
285 0.09
286 0.08
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.05
291 0.05
292 0.04
293 0.03
294 0.04
295 0.04
296 0.03
297 0.03
298 0.04
299 0.04
300 0.06
301 0.07
302 0.06
303 0.05
304 0.06
305 0.06
306 0.07
307 0.06
308 0.05
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.03
313 0.03
314 0.02
315 0.02
316 0.02
317 0.02
318 0.02
319 0.02
320 0.02
321 0.02
322 0.02
323 0.02
324 0.03
325 0.03
326 0.03
327 0.06
328 0.08
329 0.09
330 0.13
331 0.14
332 0.14
333 0.2
334 0.28
335 0.33
336 0.35
337 0.39
338 0.43
339 0.47
340 0.48
341 0.42
342 0.37
343 0.35
344 0.31
345 0.27
346 0.2
347 0.16
348 0.16
349 0.15
350 0.12
351 0.11
352 0.11
353 0.12
354 0.11
355 0.12
356 0.13
357 0.14
358 0.15
359 0.14
360 0.16
361 0.17
362 0.2
363 0.21
364 0.24
365 0.3
366 0.33
367 0.35
368 0.35
369 0.4
370 0.45
371 0.43
372 0.43
373 0.37
374 0.33
375 0.29
376 0.27
377 0.2
378 0.13
379 0.12
380 0.06
381 0.06
382 0.06
383 0.07
384 0.07
385 0.06
386 0.06
387 0.11
388 0.13
389 0.13
390 0.14
391 0.15
392 0.16
393 0.17
394 0.18
395 0.18
396 0.17
397 0.17
398 0.19
399 0.18
400 0.17
401 0.16
402 0.14
403 0.09
404 0.09
405 0.11
406 0.09
407 0.08
408 0.08
409 0.09
410 0.1
411 0.1
412 0.1
413 0.08
414 0.07
415 0.06
416 0.06
417 0.07
418 0.06
419 0.08
420 0.08
421 0.09
422 0.09
423 0.09
424 0.1
425 0.1
426 0.1
427 0.09
428 0.08
429 0.09
430 0.15
431 0.15
432 0.18
433 0.18
434 0.21
435 0.21
436 0.23
437 0.23
438 0.16
439 0.18
440 0.15
441 0.13
442 0.11
443 0.1
444 0.09
445 0.12
446 0.12
447 0.12
448 0.12
449 0.16
450 0.18
451 0.18
452 0.18
453 0.17
454 0.17
455 0.16
456 0.19
457 0.18
458 0.21
459 0.25
460 0.28
461 0.32
462 0.33
463 0.38
464 0.43
465 0.45
466 0.42
467 0.44
468 0.44
469 0.41
470 0.43
471 0.44
472 0.38
473 0.34
474 0.38
475 0.33
476 0.34
477 0.35
478 0.33
479 0.29
480 0.31
481 0.31
482 0.27
483 0.25
484 0.2
485 0.17
486 0.16
487 0.16
488 0.12
489 0.12
490 0.13
491 0.15
492 0.15
493 0.14
494 0.14
495 0.15
496 0.16
497 0.15
498 0.14
499 0.14
500 0.17
501 0.17
502 0.17
503 0.15
504 0.14
505 0.17
506 0.18
507 0.18
508 0.15
509 0.17
510 0.16
511 0.16
512 0.14
513 0.13
514 0.13
515 0.13
516 0.14
517 0.14
518 0.15
519 0.16
520 0.18
521 0.2
522 0.21
523 0.26
524 0.28
525 0.27
526 0.31
527 0.32
528 0.34
529 0.31
530 0.31
531 0.28
532 0.3
533 0.32
534 0.32
535 0.35
536 0.33
537 0.37
538 0.39
539 0.42
540 0.4
541 0.4
542 0.38
543 0.35
544 0.37
545 0.34
546 0.29
547 0.25
548 0.22
549 0.19
550 0.18
551 0.15
552 0.13
553 0.13
554 0.14
555 0.14
556 0.13
557 0.17
558 0.2
559 0.24
560 0.28
561 0.36
562 0.41
563 0.43
564 0.49
565 0.55
566 0.61
567 0.59
568 0.62
569 0.57
570 0.58
571 0.59
572 0.6
573 0.55
574 0.46
575 0.47
576 0.41
577 0.41
578 0.35
579 0.32
580 0.24
581 0.2
582 0.2
583 0.19
584 0.22
585 0.2
586 0.21
587 0.21
588 0.27
589 0.3
590 0.32
591 0.38
592 0.35
593 0.34
594 0.35
595 0.38
596 0.38
597 0.38
598 0.36
599 0.28
600 0.26
601 0.26
602 0.24
603 0.21
604 0.15
605 0.12
606 0.11
607 0.12
608 0.11
609 0.12
610 0.12
611 0.19
612 0.26
613 0.34
614 0.34
615 0.34
616 0.37
617 0.4
618 0.45
619 0.46
620 0.47
621 0.5
622 0.6
623 0.68
624 0.72
625 0.75
626 0.77
627 0.8
628 0.83
629 0.82
630 0.81
631 0.78
632 0.81
633 0.84
634 0.85
635 0.82
636 0.77