Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1C7NDJ6

Protein Details
Accession A0A1C7NDJ6    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-48GSQPTQQQQQQQQQQRPPPTSHydrophilic
305-334VRSLMLTKKERKKMRRQRRAEALKDKRDKIBasic
414-435AVFKIKHCSHPKLRFKIEKNAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
312-335KKERKKMRRQRRAEALKDKRDKIR
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 7.5, cyto_mito 7.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013881  Pre-mRNA_splic_Prp3_dom  
IPR027104  Prp3  
IPR010541  Prp3_C  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06544  DUF1115  
PF08572  PRP3  
Amino Acid Sequences MLIQALIDAKRAEIMAKLAKFKPPQPNGSQPTQQQQQQQQQQRPPPTSSRSSLVQKNRISSKKVTPIPAPPSAGTGGSLNLVELQRHIAEAKTRLAHAPPGTHVRPARTSDTKPPALPLDDSGQFDLKAMMDKIPRRETANTKALARAKQQKSIPAAAEKKPLKLYDEVPADYTDPQKNPYFDPNMDVKIAPKSRRARQLKFVQPGKYVDIANQERAKAQLEKMKQAIAESVKKAGMQTELDVSDKVIKREPPPPVEWWDAPFLANKSYEDVDQVNVDQLDTLVTMYVHHPVPIQPPGEGNTAIVRSLMLTKKERKKMRRQRRAEALKDKRDKIRLGLIEPDAPKVKISNLMKVLGEEQIQDPTKVEARVRKEMELRQKMHEKANEQRKLSPEERRAKIMAKMKEDQKSANEVAVFKIKHCSHPKLRFKIEKNAQQYELTGIVIVHPKCNIVIVEGGPKAIKLYKRLMLRRIDWNDLPAPKNLQADETQMDVDSPILKEGEDNTCYLVWSGPVKNKSFKKFTWRSFESEKMAREELGKWNVENYWDVALSTSDEDLQARQPVI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.23
3 0.26
4 0.33
5 0.34
6 0.41
7 0.45
8 0.52
9 0.57
10 0.57
11 0.62
12 0.64
13 0.72
14 0.7
15 0.73
16 0.72
17 0.66
18 0.67
19 0.65
20 0.63
21 0.61
22 0.64
23 0.67
24 0.7
25 0.75
26 0.75
27 0.77
28 0.81
29 0.81
30 0.76
31 0.72
32 0.7
33 0.67
34 0.65
35 0.6
36 0.55
37 0.53
38 0.55
39 0.59
40 0.61
41 0.62
42 0.6
43 0.63
44 0.69
45 0.68
46 0.66
47 0.64
48 0.64
49 0.65
50 0.67
51 0.64
52 0.6
53 0.62
54 0.63
55 0.62
56 0.56
57 0.46
58 0.43
59 0.39
60 0.34
61 0.26
62 0.2
63 0.15
64 0.13
65 0.12
66 0.09
67 0.12
68 0.12
69 0.11
70 0.11
71 0.13
72 0.12
73 0.13
74 0.14
75 0.12
76 0.17
77 0.2
78 0.25
79 0.24
80 0.25
81 0.27
82 0.28
83 0.32
84 0.29
85 0.29
86 0.28
87 0.34
88 0.34
89 0.38
90 0.39
91 0.37
92 0.4
93 0.42
94 0.45
95 0.44
96 0.47
97 0.51
98 0.57
99 0.56
100 0.51
101 0.5
102 0.46
103 0.41
104 0.38
105 0.3
106 0.27
107 0.26
108 0.27
109 0.26
110 0.23
111 0.21
112 0.2
113 0.18
114 0.13
115 0.13
116 0.13
117 0.15
118 0.2
119 0.24
120 0.31
121 0.35
122 0.37
123 0.38
124 0.43
125 0.46
126 0.49
127 0.52
128 0.48
129 0.44
130 0.48
131 0.49
132 0.47
133 0.48
134 0.5
135 0.46
136 0.51
137 0.51
138 0.52
139 0.51
140 0.52
141 0.47
142 0.45
143 0.47
144 0.43
145 0.5
146 0.45
147 0.44
148 0.43
149 0.41
150 0.36
151 0.34
152 0.33
153 0.31
154 0.34
155 0.31
156 0.29
157 0.28
158 0.26
159 0.24
160 0.27
161 0.23
162 0.19
163 0.23
164 0.25
165 0.26
166 0.27
167 0.32
168 0.33
169 0.29
170 0.32
171 0.32
172 0.3
173 0.3
174 0.27
175 0.22
176 0.25
177 0.3
178 0.28
179 0.33
180 0.39
181 0.45
182 0.55
183 0.62
184 0.6
185 0.64
186 0.72
187 0.72
188 0.74
189 0.73
190 0.66
191 0.61
192 0.58
193 0.51
194 0.44
195 0.34
196 0.27
197 0.3
198 0.28
199 0.3
200 0.3
201 0.27
202 0.25
203 0.26
204 0.27
205 0.2
206 0.21
207 0.22
208 0.23
209 0.27
210 0.27
211 0.27
212 0.25
213 0.23
214 0.24
215 0.22
216 0.24
217 0.2
218 0.21
219 0.2
220 0.2
221 0.2
222 0.17
223 0.15
224 0.11
225 0.11
226 0.12
227 0.12
228 0.12
229 0.12
230 0.11
231 0.16
232 0.17
233 0.17
234 0.18
235 0.21
236 0.23
237 0.3
238 0.34
239 0.32
240 0.34
241 0.36
242 0.37
243 0.39
244 0.36
245 0.31
246 0.28
247 0.24
248 0.22
249 0.2
250 0.16
251 0.13
252 0.14
253 0.12
254 0.12
255 0.12
256 0.12
257 0.11
258 0.11
259 0.1
260 0.1
261 0.1
262 0.09
263 0.08
264 0.08
265 0.06
266 0.05
267 0.05
268 0.04
269 0.04
270 0.03
271 0.03
272 0.04
273 0.05
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.08
278 0.09
279 0.12
280 0.15
281 0.15
282 0.13
283 0.13
284 0.16
285 0.17
286 0.16
287 0.13
288 0.11
289 0.11
290 0.11
291 0.1
292 0.07
293 0.06
294 0.1
295 0.12
296 0.14
297 0.19
298 0.28
299 0.37
300 0.46
301 0.54
302 0.59
303 0.68
304 0.76
305 0.82
306 0.84
307 0.83
308 0.84
309 0.86
310 0.87
311 0.84
312 0.84
313 0.82
314 0.81
315 0.81
316 0.76
317 0.7
318 0.66
319 0.58
320 0.5
321 0.48
322 0.41
323 0.35
324 0.36
325 0.31
326 0.31
327 0.3
328 0.3
329 0.23
330 0.21
331 0.19
332 0.16
333 0.15
334 0.18
335 0.19
336 0.23
337 0.24
338 0.26
339 0.25
340 0.25
341 0.26
342 0.19
343 0.18
344 0.13
345 0.11
346 0.15
347 0.15
348 0.15
349 0.14
350 0.15
351 0.17
352 0.18
353 0.2
354 0.21
355 0.27
356 0.35
357 0.36
358 0.38
359 0.41
360 0.46
361 0.54
362 0.56
363 0.53
364 0.51
365 0.56
366 0.56
367 0.57
368 0.55
369 0.49
370 0.49
371 0.57
372 0.57
373 0.52
374 0.53
375 0.5
376 0.54
377 0.54
378 0.53
379 0.53
380 0.56
381 0.56
382 0.57
383 0.55
384 0.5
385 0.52
386 0.51
387 0.47
388 0.44
389 0.48
390 0.5
391 0.54
392 0.53
393 0.48
394 0.43
395 0.44
396 0.38
397 0.34
398 0.29
399 0.24
400 0.24
401 0.28
402 0.25
403 0.19
404 0.27
405 0.26
406 0.34
407 0.4
408 0.47
409 0.51
410 0.62
411 0.71
412 0.71
413 0.8
414 0.8
415 0.79
416 0.81
417 0.8
418 0.78
419 0.75
420 0.71
421 0.64
422 0.55
423 0.5
424 0.42
425 0.33
426 0.25
427 0.17
428 0.12
429 0.12
430 0.17
431 0.17
432 0.16
433 0.15
434 0.16
435 0.15
436 0.17
437 0.15
438 0.11
439 0.13
440 0.13
441 0.18
442 0.18
443 0.18
444 0.16
445 0.16
446 0.16
447 0.19
448 0.2
449 0.2
450 0.26
451 0.31
452 0.4
453 0.47
454 0.52
455 0.55
456 0.56
457 0.62
458 0.61
459 0.62
460 0.54
461 0.52
462 0.51
463 0.49
464 0.47
465 0.39
466 0.38
467 0.36
468 0.38
469 0.34
470 0.31
471 0.27
472 0.29
473 0.27
474 0.24
475 0.21
476 0.17
477 0.17
478 0.14
479 0.13
480 0.11
481 0.1
482 0.1
483 0.1
484 0.1
485 0.11
486 0.14
487 0.2
488 0.19
489 0.19
490 0.19
491 0.19
492 0.2
493 0.19
494 0.16
495 0.13
496 0.17
497 0.22
498 0.27
499 0.34
500 0.38
501 0.46
502 0.54
503 0.6
504 0.62
505 0.62
506 0.66
507 0.69
508 0.73
509 0.75
510 0.71
511 0.69
512 0.69
513 0.71
514 0.67
515 0.63
516 0.58
517 0.53
518 0.51
519 0.45
520 0.4
521 0.37
522 0.38
523 0.39
524 0.37
525 0.32
526 0.33
527 0.33
528 0.33
529 0.31
530 0.24
531 0.2
532 0.19
533 0.18
534 0.17
535 0.16
536 0.16
537 0.15
538 0.14
539 0.12
540 0.12
541 0.13
542 0.14
543 0.17