Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C7N3E3

Protein Details
Accession A0A1C7N3E3    Localization Confidence Low Confidence Score 7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
691-719PSSTQPKQLFDTRRKRNQRTRDRMQGLVRHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) plas 9, nucl 5.5, pero 4, E.R. 4, cyto_nucl 3.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028802  SMG8  
IPR019354  SMG8/SMG9  
Gene Ontology GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF10220  Smg8_Smg9  
Amino Acid Sequences MDEINTLLEKTDLESLRDAGLQVISIFGVSDAKRMFNKALTLANRIVGASVFYAQQQKIAPGLQLYVDVSTKTVYLFMDANLDTTTCASESFAATSTSHQSNTMRGLLFMLTVSHIVIPVLPPSLLPADFLSTLVCLQQVKMNMYTHLAQYLSACWKHWDIPVPNLLFEKKENERNHSANTGWWGPAKGVPFLIFVATDIPFDAIVPASIKKMQDALQMRIKALFRALHLIPLKLDTPSSLPSVEVRSLFFLPSTSQPIIHIIPHFQPSQPDDSPFPLSLDAYLEECNRPQDPSEQLYHEYSDKLLRNFVAIWLKTATTRHPLHHNSGYGRKNEKSIPLPTGIQFASAAVCLLSFLFQRPLTENEADFRKIITTQFPSTKGMIQQIEVILRKKIKDIVEIEQVFSKSHSMEIMQKCNEAYLQDSPPYYTAKYHEWKRNNVMRMYRSLARGPCMEEFAARLERECDLIWKQGRQSCEHISLTGRPCRLKIGHETEEKQPSSRDERVMVYDMGKHNSGFSLFHACDCGKSQRIRDDPFDLDEANVKFYQKFNCCLTPGRAALDLAASSYGCQQTLVLNTDEIPHHDAALLYLGSSSLYKNNVGLDKMEGFMSNTHFLIPWSMTTLNEVKLIKQQQQQQQEKDETVNKDPSTLGDTTEWPVLGKALPSPAPPKPVVASAISLEAFPALGSNPTPSSTQPKQLFDTRRKRNQRTRDRMQGLVRGYIGAEYECPHGHRFLSCGEGRVCKLGHAGHPKEHGNHFVHQDLSLHILCPCSNNNTEVTAQLLRIYVVTPDDAVSISIEPKINLYQHTTVDLDIKDALLFGPNSMYCLRLPFIYRDTQGKPIQFPLDAQSRLKSGYLQKDYIKFHFKSSSKWA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.23
3 0.24
4 0.24
5 0.23
6 0.16
7 0.15
8 0.13
9 0.11
10 0.1
11 0.08
12 0.07
13 0.07
14 0.06
15 0.1
16 0.1
17 0.15
18 0.16
19 0.2
20 0.22
21 0.25
22 0.28
23 0.27
24 0.3
25 0.29
26 0.36
27 0.35
28 0.39
29 0.37
30 0.36
31 0.33
32 0.29
33 0.26
34 0.18
35 0.16
36 0.12
37 0.11
38 0.1
39 0.12
40 0.18
41 0.18
42 0.21
43 0.21
44 0.21
45 0.23
46 0.24
47 0.23
48 0.18
49 0.19
50 0.16
51 0.16
52 0.15
53 0.14
54 0.14
55 0.13
56 0.12
57 0.12
58 0.11
59 0.1
60 0.11
61 0.09
62 0.11
63 0.11
64 0.11
65 0.16
66 0.15
67 0.16
68 0.15
69 0.15
70 0.13
71 0.12
72 0.13
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.09
77 0.1
78 0.12
79 0.12
80 0.13
81 0.13
82 0.16
83 0.2
84 0.21
85 0.21
86 0.22
87 0.22
88 0.24
89 0.28
90 0.3
91 0.25
92 0.22
93 0.23
94 0.2
95 0.2
96 0.16
97 0.13
98 0.09
99 0.09
100 0.09
101 0.08
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.08
107 0.09
108 0.08
109 0.08
110 0.1
111 0.13
112 0.12
113 0.13
114 0.13
115 0.14
116 0.15
117 0.15
118 0.13
119 0.11
120 0.11
121 0.1
122 0.11
123 0.08
124 0.09
125 0.12
126 0.15
127 0.18
128 0.22
129 0.23
130 0.22
131 0.25
132 0.26
133 0.23
134 0.22
135 0.19
136 0.15
137 0.15
138 0.18
139 0.21
140 0.2
141 0.2
142 0.21
143 0.23
144 0.26
145 0.28
146 0.33
147 0.31
148 0.35
149 0.42
150 0.4
151 0.39
152 0.39
153 0.36
154 0.29
155 0.27
156 0.29
157 0.27
158 0.35
159 0.38
160 0.43
161 0.49
162 0.51
163 0.53
164 0.49
165 0.44
166 0.37
167 0.38
168 0.33
169 0.26
170 0.25
171 0.22
172 0.19
173 0.21
174 0.21
175 0.17
176 0.16
177 0.15
178 0.15
179 0.14
180 0.14
181 0.11
182 0.09
183 0.11
184 0.1
185 0.09
186 0.08
187 0.08
188 0.07
189 0.07
190 0.08
191 0.05
192 0.06
193 0.07
194 0.08
195 0.09
196 0.12
197 0.12
198 0.13
199 0.15
200 0.17
201 0.23
202 0.27
203 0.3
204 0.35
205 0.36
206 0.36
207 0.38
208 0.36
209 0.29
210 0.28
211 0.24
212 0.18
213 0.22
214 0.22
215 0.25
216 0.26
217 0.25
218 0.22
219 0.22
220 0.22
221 0.17
222 0.17
223 0.11
224 0.12
225 0.13
226 0.14
227 0.13
228 0.12
229 0.14
230 0.17
231 0.18
232 0.16
233 0.15
234 0.17
235 0.17
236 0.17
237 0.15
238 0.13
239 0.12
240 0.14
241 0.19
242 0.16
243 0.16
244 0.17
245 0.2
246 0.2
247 0.2
248 0.19
249 0.16
250 0.18
251 0.21
252 0.21
253 0.18
254 0.2
255 0.21
256 0.27
257 0.25
258 0.25
259 0.24
260 0.26
261 0.28
262 0.26
263 0.24
264 0.18
265 0.17
266 0.14
267 0.14
268 0.11
269 0.1
270 0.11
271 0.11
272 0.11
273 0.12
274 0.14
275 0.13
276 0.13
277 0.14
278 0.16
279 0.19
280 0.22
281 0.25
282 0.24
283 0.26
284 0.26
285 0.27
286 0.23
287 0.19
288 0.17
289 0.2
290 0.21
291 0.19
292 0.2
293 0.18
294 0.18
295 0.18
296 0.21
297 0.22
298 0.19
299 0.2
300 0.19
301 0.2
302 0.2
303 0.21
304 0.19
305 0.2
306 0.22
307 0.23
308 0.31
309 0.34
310 0.39
311 0.42
312 0.43
313 0.39
314 0.46
315 0.47
316 0.44
317 0.45
318 0.4
319 0.39
320 0.38
321 0.39
322 0.36
323 0.35
324 0.32
325 0.3
326 0.3
327 0.27
328 0.28
329 0.22
330 0.18
331 0.14
332 0.12
333 0.1
334 0.08
335 0.08
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.05
343 0.09
344 0.09
345 0.1
346 0.13
347 0.15
348 0.19
349 0.2
350 0.19
351 0.19
352 0.21
353 0.21
354 0.19
355 0.16
356 0.13
357 0.13
358 0.13
359 0.15
360 0.16
361 0.19
362 0.21
363 0.23
364 0.25
365 0.25
366 0.26
367 0.23
368 0.24
369 0.21
370 0.18
371 0.18
372 0.16
373 0.18
374 0.18
375 0.17
376 0.16
377 0.17
378 0.17
379 0.17
380 0.21
381 0.19
382 0.23
383 0.25
384 0.26
385 0.33
386 0.33
387 0.32
388 0.29
389 0.29
390 0.23
391 0.2
392 0.17
393 0.08
394 0.08
395 0.08
396 0.07
397 0.15
398 0.18
399 0.23
400 0.23
401 0.23
402 0.23
403 0.23
404 0.22
405 0.14
406 0.13
407 0.11
408 0.12
409 0.13
410 0.13
411 0.14
412 0.15
413 0.16
414 0.14
415 0.12
416 0.13
417 0.17
418 0.24
419 0.31
420 0.38
421 0.42
422 0.46
423 0.53
424 0.57
425 0.55
426 0.53
427 0.5
428 0.44
429 0.43
430 0.42
431 0.37
432 0.32
433 0.32
434 0.28
435 0.25
436 0.24
437 0.23
438 0.2
439 0.18
440 0.16
441 0.12
442 0.12
443 0.13
444 0.15
445 0.12
446 0.12
447 0.11
448 0.12
449 0.13
450 0.12
451 0.12
452 0.11
453 0.17
454 0.18
455 0.19
456 0.22
457 0.23
458 0.25
459 0.26
460 0.29
461 0.27
462 0.3
463 0.28
464 0.26
465 0.25
466 0.29
467 0.3
468 0.3
469 0.28
470 0.24
471 0.24
472 0.28
473 0.27
474 0.25
475 0.28
476 0.32
477 0.36
478 0.4
479 0.42
480 0.43
481 0.49
482 0.46
483 0.39
484 0.32
485 0.29
486 0.32
487 0.32
488 0.29
489 0.24
490 0.25
491 0.27
492 0.28
493 0.25
494 0.19
495 0.2
496 0.2
497 0.2
498 0.19
499 0.16
500 0.14
501 0.14
502 0.14
503 0.1
504 0.09
505 0.14
506 0.13
507 0.14
508 0.16
509 0.15
510 0.15
511 0.18
512 0.21
513 0.2
514 0.23
515 0.26
516 0.33
517 0.39
518 0.41
519 0.42
520 0.42
521 0.38
522 0.37
523 0.35
524 0.27
525 0.21
526 0.22
527 0.19
528 0.17
529 0.16
530 0.14
531 0.14
532 0.17
533 0.23
534 0.22
535 0.26
536 0.26
537 0.29
538 0.3
539 0.33
540 0.34
541 0.32
542 0.3
543 0.28
544 0.25
545 0.22
546 0.2
547 0.17
548 0.13
549 0.08
550 0.08
551 0.06
552 0.05
553 0.08
554 0.08
555 0.07
556 0.08
557 0.08
558 0.09
559 0.12
560 0.14
561 0.12
562 0.12
563 0.12
564 0.14
565 0.14
566 0.14
567 0.15
568 0.12
569 0.12
570 0.12
571 0.12
572 0.1
573 0.11
574 0.09
575 0.06
576 0.06
577 0.06
578 0.06
579 0.06
580 0.07
581 0.07
582 0.09
583 0.09
584 0.1
585 0.13
586 0.15
587 0.15
588 0.16
589 0.16
590 0.15
591 0.15
592 0.15
593 0.12
594 0.11
595 0.12
596 0.14
597 0.13
598 0.12
599 0.12
600 0.12
601 0.12
602 0.13
603 0.12
604 0.09
605 0.11
606 0.12
607 0.11
608 0.15
609 0.17
610 0.16
611 0.19
612 0.19
613 0.17
614 0.24
615 0.27
616 0.31
617 0.34
618 0.41
619 0.45
620 0.55
621 0.62
622 0.59
623 0.62
624 0.58
625 0.54
626 0.51
627 0.49
628 0.43
629 0.41
630 0.42
631 0.35
632 0.34
633 0.32
634 0.29
635 0.27
636 0.23
637 0.19
638 0.15
639 0.17
640 0.17
641 0.18
642 0.17
643 0.13
644 0.13
645 0.12
646 0.11
647 0.1
648 0.09
649 0.11
650 0.12
651 0.15
652 0.2
653 0.21
654 0.26
655 0.26
656 0.27
657 0.25
658 0.26
659 0.26
660 0.22
661 0.21
662 0.17
663 0.18
664 0.16
665 0.15
666 0.12
667 0.1
668 0.08
669 0.06
670 0.06
671 0.04
672 0.05
673 0.06
674 0.08
675 0.09
676 0.11
677 0.12
678 0.14
679 0.22
680 0.25
681 0.34
682 0.37
683 0.4
684 0.43
685 0.51
686 0.58
687 0.6
688 0.67
689 0.68
690 0.73
691 0.8
692 0.86
693 0.88
694 0.9
695 0.91
696 0.91
697 0.9
698 0.9
699 0.84
700 0.81
701 0.75
702 0.71
703 0.61
704 0.54
705 0.44
706 0.33
707 0.29
708 0.22
709 0.18
710 0.12
711 0.1
712 0.09
713 0.12
714 0.12
715 0.14
716 0.15
717 0.16
718 0.17
719 0.17
720 0.18
721 0.17
722 0.23
723 0.22
724 0.25
725 0.26
726 0.29
727 0.29
728 0.31
729 0.29
730 0.23
731 0.26
732 0.25
733 0.3
734 0.36
735 0.39
736 0.4
737 0.45
738 0.48
739 0.5
740 0.49
741 0.49
742 0.42
743 0.43
744 0.42
745 0.39
746 0.36
747 0.32
748 0.3
749 0.23
750 0.25
751 0.2
752 0.17
753 0.15
754 0.16
755 0.15
756 0.17
757 0.19
758 0.2
759 0.21
760 0.23
761 0.23
762 0.25
763 0.26
764 0.23
765 0.25
766 0.2
767 0.19
768 0.18
769 0.17
770 0.14
771 0.13
772 0.13
773 0.1
774 0.1
775 0.1
776 0.1
777 0.1
778 0.1
779 0.1
780 0.1
781 0.1
782 0.1
783 0.1
784 0.13
785 0.14
786 0.13
787 0.15
788 0.19
789 0.2
790 0.21
791 0.26
792 0.27
793 0.27
794 0.3
795 0.29
796 0.26
797 0.28
798 0.26
799 0.21
800 0.18
801 0.17
802 0.14
803 0.13
804 0.12
805 0.11
806 0.11
807 0.1
808 0.14
809 0.14
810 0.17
811 0.17
812 0.18
813 0.15
814 0.18
815 0.19
816 0.18
817 0.21
818 0.23
819 0.27
820 0.32
821 0.35
822 0.38
823 0.41
824 0.46
825 0.49
826 0.48
827 0.47
828 0.46
829 0.47
830 0.41
831 0.39
832 0.37
833 0.39
834 0.38
835 0.37
836 0.35
837 0.33
838 0.34
839 0.33
840 0.33
841 0.33
842 0.4
843 0.45
844 0.47
845 0.51
846 0.57
847 0.62
848 0.63
849 0.63
850 0.53
851 0.53
852 0.58
853 0.53