Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C7NJU0

Protein Details
Accession A0A1C7NJU0    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
406-432EGVRERDRLRHDRQKQRQREMRMSKMGBasic
572-593LDTFLNKAKKGKRSRDDEEDSDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
581-583KGK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 11, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MASLSSLLPKPRQTLASNANTAPQLEKQINQLITKSTQSRIPPYGQRQSFRPRVAEDFGNGGAFPEIHIAQYPLGMGRKDNKAADRKGGALTLQVDADGNVKYDAIARQGHSDDRIIHSSYKDLVPINERKDMDVDKLVMDRPSEEEVQSVAEKTRLALEKIVNGKIKAAQPKNIGSTNGSGSNKDPTYIRYTPMQSQTGDGFNSGAKQRIIRMVDAPRDPMEPPNHLHKKVPRGPPSPPAPVMHSPPRKLTAKEQAEWVIPPCVSNWKNTKGYTIPLDKRLAADGRGLQELTINDNFAKFSEALYAADRHAREEVRQRNLMQQKLAQKQKEVEEDKLRQLAQKAREERAGFKPSSSAAEPPSNANRPSASSLMPDYDSSGSESGSESEEESSPVRGRRSDDSDEEGVRERDRLRHDRQKQRQREMRMSKMGTEARAKHLAREQGRDISEKIALGLAKPSLSKESMYDARLFNQTEGIGSGFGNDDSYNTYDKALFNQSSTSIYRYRGENTDSEVLGSTNTEDLERAIRQDKFSTRKGFQGTEGGESSSGPVEFEKETLAAAKSTSKDVFGLDTFLNKAKKGKRSRDDEEDSDDDRRKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.5
3 0.54
4 0.54
5 0.5
6 0.49
7 0.44
8 0.42
9 0.36
10 0.3
11 0.28
12 0.26
13 0.27
14 0.29
15 0.36
16 0.39
17 0.37
18 0.36
19 0.34
20 0.35
21 0.39
22 0.37
23 0.32
24 0.34
25 0.37
26 0.43
27 0.43
28 0.47
29 0.51
30 0.56
31 0.64
32 0.65
33 0.64
34 0.64
35 0.69
36 0.71
37 0.66
38 0.62
39 0.56
40 0.55
41 0.56
42 0.51
43 0.43
44 0.38
45 0.33
46 0.29
47 0.24
48 0.19
49 0.15
50 0.12
51 0.11
52 0.1
53 0.1
54 0.1
55 0.11
56 0.11
57 0.11
58 0.11
59 0.11
60 0.11
61 0.14
62 0.14
63 0.17
64 0.22
65 0.28
66 0.33
67 0.37
68 0.41
69 0.47
70 0.51
71 0.55
72 0.51
73 0.47
74 0.44
75 0.4
76 0.33
77 0.27
78 0.25
79 0.19
80 0.16
81 0.14
82 0.12
83 0.11
84 0.13
85 0.1
86 0.09
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.11
91 0.12
92 0.14
93 0.17
94 0.17
95 0.21
96 0.23
97 0.25
98 0.24
99 0.25
100 0.23
101 0.25
102 0.28
103 0.26
104 0.26
105 0.25
106 0.25
107 0.25
108 0.23
109 0.21
110 0.19
111 0.2
112 0.25
113 0.31
114 0.33
115 0.37
116 0.37
117 0.35
118 0.38
119 0.37
120 0.33
121 0.29
122 0.26
123 0.21
124 0.22
125 0.23
126 0.2
127 0.19
128 0.16
129 0.16
130 0.18
131 0.18
132 0.17
133 0.16
134 0.15
135 0.17
136 0.16
137 0.14
138 0.11
139 0.11
140 0.11
141 0.11
142 0.17
143 0.17
144 0.18
145 0.21
146 0.21
147 0.27
148 0.31
149 0.36
150 0.32
151 0.3
152 0.3
153 0.3
154 0.34
155 0.37
156 0.37
157 0.38
158 0.39
159 0.43
160 0.46
161 0.43
162 0.39
163 0.32
164 0.31
165 0.27
166 0.3
167 0.27
168 0.23
169 0.22
170 0.27
171 0.25
172 0.24
173 0.22
174 0.18
175 0.26
176 0.26
177 0.27
178 0.26
179 0.29
180 0.34
181 0.39
182 0.38
183 0.3
184 0.31
185 0.31
186 0.27
187 0.24
188 0.19
189 0.14
190 0.11
191 0.14
192 0.13
193 0.14
194 0.13
195 0.13
196 0.15
197 0.2
198 0.22
199 0.2
200 0.25
201 0.27
202 0.32
203 0.32
204 0.32
205 0.27
206 0.27
207 0.27
208 0.27
209 0.24
210 0.22
211 0.24
212 0.32
213 0.37
214 0.37
215 0.42
216 0.42
217 0.49
218 0.55
219 0.62
220 0.6
221 0.57
222 0.6
223 0.62
224 0.62
225 0.57
226 0.5
227 0.42
228 0.39
229 0.38
230 0.39
231 0.41
232 0.41
233 0.38
234 0.38
235 0.42
236 0.4
237 0.4
238 0.41
239 0.42
240 0.42
241 0.41
242 0.41
243 0.37
244 0.35
245 0.33
246 0.28
247 0.19
248 0.14
249 0.13
250 0.11
251 0.18
252 0.17
253 0.22
254 0.26
255 0.31
256 0.35
257 0.35
258 0.38
259 0.31
260 0.33
261 0.33
262 0.36
263 0.32
264 0.33
265 0.34
266 0.31
267 0.3
268 0.3
269 0.25
270 0.18
271 0.17
272 0.14
273 0.14
274 0.15
275 0.14
276 0.12
277 0.13
278 0.12
279 0.13
280 0.12
281 0.1
282 0.1
283 0.1
284 0.1
285 0.08
286 0.1
287 0.07
288 0.06
289 0.08
290 0.09
291 0.09
292 0.1
293 0.11
294 0.1
295 0.13
296 0.13
297 0.12
298 0.13
299 0.13
300 0.14
301 0.23
302 0.29
303 0.31
304 0.34
305 0.34
306 0.4
307 0.45
308 0.45
309 0.37
310 0.35
311 0.38
312 0.44
313 0.49
314 0.42
315 0.38
316 0.4
317 0.42
318 0.46
319 0.41
320 0.38
321 0.39
322 0.41
323 0.41
324 0.4
325 0.36
326 0.3
327 0.31
328 0.32
329 0.31
330 0.36
331 0.37
332 0.37
333 0.42
334 0.41
335 0.42
336 0.43
337 0.42
338 0.34
339 0.3
340 0.29
341 0.25
342 0.27
343 0.23
344 0.18
345 0.16
346 0.19
347 0.19
348 0.21
349 0.26
350 0.27
351 0.26
352 0.25
353 0.23
354 0.22
355 0.25
356 0.23
357 0.18
358 0.16
359 0.16
360 0.17
361 0.17
362 0.14
363 0.13
364 0.12
365 0.12
366 0.12
367 0.11
368 0.1
369 0.09
370 0.1
371 0.09
372 0.09
373 0.09
374 0.08
375 0.09
376 0.09
377 0.1
378 0.1
379 0.12
380 0.13
381 0.16
382 0.17
383 0.18
384 0.21
385 0.25
386 0.32
387 0.34
388 0.34
389 0.37
390 0.38
391 0.36
392 0.34
393 0.32
394 0.26
395 0.22
396 0.22
397 0.18
398 0.21
399 0.28
400 0.35
401 0.41
402 0.5
403 0.6
404 0.69
405 0.78
406 0.83
407 0.85
408 0.88
409 0.87
410 0.84
411 0.85
412 0.83
413 0.8
414 0.78
415 0.69
416 0.6
417 0.59
418 0.53
419 0.46
420 0.43
421 0.37
422 0.35
423 0.42
424 0.4
425 0.37
426 0.4
427 0.45
428 0.42
429 0.45
430 0.43
431 0.41
432 0.43
433 0.42
434 0.37
435 0.31
436 0.29
437 0.23
438 0.2
439 0.15
440 0.14
441 0.12
442 0.13
443 0.11
444 0.11
445 0.11
446 0.12
447 0.13
448 0.14
449 0.15
450 0.14
451 0.2
452 0.23
453 0.25
454 0.27
455 0.25
456 0.27
457 0.31
458 0.31
459 0.24
460 0.22
461 0.2
462 0.17
463 0.17
464 0.14
465 0.1
466 0.09
467 0.09
468 0.08
469 0.08
470 0.08
471 0.07
472 0.07
473 0.1
474 0.12
475 0.13
476 0.13
477 0.14
478 0.16
479 0.16
480 0.2
481 0.24
482 0.23
483 0.21
484 0.23
485 0.23
486 0.24
487 0.25
488 0.25
489 0.21
490 0.24
491 0.26
492 0.27
493 0.3
494 0.31
495 0.32
496 0.31
497 0.34
498 0.35
499 0.32
500 0.3
501 0.26
502 0.22
503 0.19
504 0.17
505 0.12
506 0.09
507 0.09
508 0.08
509 0.08
510 0.09
511 0.13
512 0.14
513 0.17
514 0.22
515 0.24
516 0.27
517 0.33
518 0.4
519 0.43
520 0.5
521 0.54
522 0.5
523 0.55
524 0.58
525 0.53
526 0.48
527 0.49
528 0.43
529 0.4
530 0.38
531 0.32
532 0.27
533 0.24
534 0.23
535 0.17
536 0.15
537 0.11
538 0.1
539 0.12
540 0.12
541 0.13
542 0.13
543 0.11
544 0.11
545 0.14
546 0.15
547 0.12
548 0.13
549 0.18
550 0.18
551 0.23
552 0.23
553 0.22
554 0.21
555 0.22
556 0.25
557 0.2
558 0.22
559 0.17
560 0.19
561 0.21
562 0.26
563 0.27
564 0.25
565 0.33
566 0.38
567 0.47
568 0.55
569 0.64
570 0.68
571 0.75
572 0.81
573 0.83
574 0.83
575 0.78
576 0.75
577 0.69
578 0.63
579 0.6