FuNGI

A0A1C7NEK3

Protein Details

Accession

A0A1C7NEK3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
86-110	DGVAPRAKMNQQRSRRFRTARDAEE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1305-1327	GRGGNRGFRGGRGRGGRGGRGNG

Subcellular Location(s)

nucl 12, cyto_nucl 11.5, cyto 9, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR016494 5_3_exoribonuclease_1 IPR014722 Rib_L2_dom2 IPR041385 SH3_12 IPR040992 XRN1_D1 IPR047007 XRN1_D1_sf IPR041106 XRN1_D2_D3 IPR040486 Xrn1_D3 IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR047008 XRN1_SH3_sf
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF18129 SH3_12 PF18332 XRN1_D1 PF18334 XRN1_D2_D3 PF18194 Xrn1_D3 PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGIPKFFRWISERYPMCSQLITDNSIPEFDNLYLDMNGIIHNCSHNNNDNAHFRITEEQIWIGVFNYIDHLFSKIKPKKFFFLAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRTARDAEELRQKALQKGEELPTEDPFDSNCITPGTEFMKRLTAELRYFISKKVSEDANWRGVEIVLSGPEVPGEGEHKIMEYIRLARAQPDYDPNVRHCLYGLDADLIMLGLLSHDPHFALLREEVNFGRQNQKKKQSLDSQNFYLMHLSLMREYLEMEFKSIGDNLSFKYDFERILDDFILLALFVGNDFLPNLPNLHINEGALGLMFKIYKEVLPTCDSYIQDGGKVNMTGLQKILDGISSVVEKEAYELEAIDSLYLAGKRENGQSERQLLMNIEKKKAMKDGKLVITDKQERIFRQVSNYLLSGKTGKGTTLHFNMPFKARDKKFMIQLAEDLNMTCHLDYDEKDKSTYVELSFGSDIEDVIDEESEASDESEADEEAIAARDRVLKKYETAEIIPENMTREDVEREEKERFEAGLKQWKADYYKEKMNIDIDDKKQMDDLVGSYIVGIQWVLRYYYDGVASWGWFYPYHYAPKISDLKDVARFENHSFALGTPFKPFEQLMGVLPSLSKKLLPAAYQDLMTDPASPIIDFYPRQFDLDMNGKKQDWEAIVKIPFIDEKRLLEAMKSREHRLTTEEKSRTAFGDSYKFVFDESLAKKNPDDLPVYPSPLPGVFPDIHHCLAREEIYNLPTLTLHNYNLELRKGILPGAKVGKDALAGFPSLQTIPHSFEIKHHGVHVFQQDSRNESVVISIKNRYQHADIEEIAKLFLYRSIYVQYPYLKEAVVIGVSNAEKKYYVTFNNGKKQILEHIWDDKERESWESRMGRAEYMPSKRFGLLVGDIEVGFHVCVLNGMHQTEDGALVKEFVNPSLEDLVPIQMVVIKVSNPDPRYIEKPAPPIHKSFPIKSTVFFLGNRFLGAQATVIGHSHGHVDIEMTVPVDEKYQNEPEFGHEIAREQEEVVRYVAANVVARELDLSPLALSKLTSAVSVVQKNNQRINVGLNLKFESRGEKVLGYTRKHPVGYWEYSNTAVTLIQEYCQKFPEFVALLKNQKGSAMLSVDDFRWTSDGQAAVRQMKDWIHEKKIDSLTRASFDTEELDDAYCRKVEESAIKYHEKYESLDFKKVVIRGAPRKVLLKPGDAEVRLNYQSFSLGDRVVYVCDSGFVPLGNKGTVVGVQEKIVDIVFDTTFMSGTSLGGRCSEFRGISLPYSNLINTSNPSHKNMSRDNHSSSSGRSANHSSGNNRSYHQDHHNNREQESYRGGRGGNRGFRGGRGRGGRGGRGNGRNDHDHRSFH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.51
2	0.5
3	0.47
4	0.43
5	0.38
6	0.35
7	0.36
8	0.35
9	0.3
10	0.3
11	0.29
12	0.29
13	0.28
14	0.22
15	0.21
16	0.17
17	0.17
18	0.15
19	0.16
20	0.15
21	0.14
22	0.14
23	0.11
24	0.12
25	0.11
26	0.11
27	0.1
28	0.13
29	0.15
30	0.18
31	0.23
32	0.3
33	0.33
34	0.37
35	0.42
36	0.46
37	0.47
38	0.46
39	0.4
40	0.34
41	0.36
42	0.35
43	0.32
44	0.28
45	0.25
46	0.23
47	0.23
48	0.21
49	0.16
50	0.15
51	0.11
52	0.09
53	0.13
54	0.12
55	0.13
56	0.13
57	0.16
58	0.17
59	0.2
60	0.31
61	0.36
62	0.43
63	0.51
64	0.56
65	0.6
66	0.62
67	0.66
68	0.6
69	0.58
70	0.54
71	0.46
72	0.44
73	0.37
74	0.34
75	0.27
76	0.22
77	0.16
78	0.17
79	0.22
80	0.28
81	0.38
82	0.46
83	0.56
84	0.67
85	0.75
86	0.81
87	0.85
88	0.83
89	0.81
90	0.81
91	0.81
92	0.75
93	0.75
94	0.7
95	0.65
96	0.69
97	0.63
98	0.54
99	0.49
100	0.46
101	0.42
102	0.43
103	0.41
104	0.34
105	0.38
106	0.41
107	0.41
108	0.42
109	0.39
110	0.35
111	0.36
112	0.33
113	0.27
114	0.22
115	0.22
116	0.19
117	0.18
118	0.17
119	0.14
120	0.14
121	0.14
122	0.18
123	0.2
124	0.23
125	0.24
126	0.24
127	0.29
128	0.29
129	0.3
130	0.3
131	0.31
132	0.28
133	0.3
134	0.32
135	0.32
136	0.33
137	0.34
138	0.37
139	0.33
140	0.33
141	0.35
142	0.35
143	0.32
144	0.39
145	0.43
146	0.43
147	0.41
148	0.39
149	0.34
150	0.31
151	0.28
152	0.21
153	0.16
154	0.09
155	0.09
156	0.09
157	0.08
158	0.08
159	0.08
160	0.07
161	0.07
162	0.09
163	0.09
164	0.1
165	0.1
166	0.11
167	0.12
168	0.12
169	0.13
170	0.14
171	0.16
172	0.18
173	0.22
174	0.22
175	0.24
176	0.27
177	0.27
178	0.27
179	0.3
180	0.33
181	0.35
182	0.38
183	0.37
184	0.41
185	0.4
186	0.37
187	0.31
188	0.27
189	0.23
190	0.23
191	0.21
192	0.15
193	0.14
194	0.14
195	0.13
196	0.11
197	0.08
198	0.05
199	0.04
200	0.03
201	0.03
202	0.05
203	0.05
204	0.06
205	0.06
206	0.07
207	0.09
208	0.09
209	0.12
210	0.13
211	0.15
212	0.16
213	0.18
214	0.18
215	0.21
216	0.24
217	0.23
218	0.31
219	0.34
220	0.42
221	0.5
222	0.6
223	0.63
224	0.64
225	0.71
226	0.71
227	0.77
228	0.77
229	0.74
230	0.67
231	0.65
232	0.61
233	0.52
234	0.43
235	0.32
236	0.24
237	0.19
238	0.17
239	0.12
240	0.12
241	0.12
242	0.11
243	0.11
244	0.12
245	0.15
246	0.14
247	0.15
248	0.15
249	0.14
250	0.16
251	0.15
252	0.14
253	0.1
254	0.12
255	0.11
256	0.17
257	0.17
258	0.16
259	0.19
260	0.2
261	0.19
262	0.2
263	0.22
264	0.17
265	0.19
266	0.19
267	0.15
268	0.14
269	0.13
270	0.11
271	0.07
272	0.06
273	0.04
274	0.03
275	0.03
276	0.04
277	0.04
278	0.04
279	0.05
280	0.05
281	0.06
282	0.07
283	0.08
284	0.08
285	0.13
286	0.14
287	0.17
288	0.17
289	0.16
290	0.16
291	0.15
292	0.13
293	0.09
294	0.08
295	0.05
296	0.05
297	0.05
298	0.05
299	0.06
300	0.07
301	0.07
302	0.11
303	0.13
304	0.15
305	0.18
306	0.2
307	0.21
308	0.25
309	0.24
310	0.24
311	0.25
312	0.22
313	0.22
314	0.21
315	0.2
316	0.18
317	0.18
318	0.15
319	0.17
320	0.17
321	0.16
322	0.15
323	0.14
324	0.12
325	0.13
326	0.13
327	0.08
328	0.07
329	0.07
330	0.07
331	0.07
332	0.07
333	0.07
334	0.07
335	0.06
336	0.07
337	0.08
338	0.07
339	0.07
340	0.07
341	0.07
342	0.08
343	0.08
344	0.07
345	0.06
346	0.05
347	0.07
348	0.07
349	0.08
350	0.07
351	0.09
352	0.12
353	0.16
354	0.22
355	0.23
356	0.27
357	0.31
358	0.34
359	0.33
360	0.32
361	0.28
362	0.24
363	0.28
364	0.31
365	0.3
366	0.28
367	0.3
368	0.31
369	0.32
370	0.39
371	0.39
372	0.36
373	0.39
374	0.45
375	0.46
376	0.51
377	0.5
378	0.45
379	0.47
380	0.48
381	0.44
382	0.41
383	0.39
384	0.34
385	0.4
386	0.4
387	0.33
388	0.33
389	0.35
390	0.32
391	0.3
392	0.3
393	0.25
394	0.22
395	0.22
396	0.18
397	0.14
398	0.15
399	0.13
400	0.12
401	0.12
402	0.15
403	0.19
404	0.21
405	0.25
406	0.26
407	0.27
408	0.29
409	0.31
410	0.31
411	0.3
412	0.36
413	0.33
414	0.38
415	0.43
416	0.45
417	0.48
418	0.5
419	0.48
420	0.39
421	0.4
422	0.34
423	0.29
424	0.24
425	0.18
426	0.13
427	0.11
428	0.11
429	0.08
430	0.07
431	0.07
432	0.08
433	0.09
434	0.14
435	0.18
436	0.18
437	0.19
438	0.19
439	0.19
440	0.2
441	0.22
442	0.17
443	0.15
444	0.14
445	0.16
446	0.16
447	0.15
448	0.14
449	0.11
450	0.1
451	0.08
452	0.08
453	0.05
454	0.06
455	0.06
456	0.04
457	0.04
458	0.04
459	0.04
460	0.04
461	0.04
462	0.04
463	0.04
464	0.04
465	0.05
466	0.05
467	0.05
468	0.04
469	0.04
470	0.04
471	0.06
472	0.05
473	0.05
474	0.06
475	0.11
476	0.13
477	0.15
478	0.18
479	0.18
480	0.2
481	0.23
482	0.25
483	0.22
484	0.21
485	0.21
486	0.19
487	0.2
488	0.18
489	0.16
490	0.15
491	0.12
492	0.12
493	0.1
494	0.11
495	0.12
496	0.13
497	0.17
498	0.17
499	0.19
500	0.21
501	0.21
502	0.21
503	0.2
504	0.19
505	0.16
506	0.19
507	0.2
508	0.28
509	0.28
510	0.27
511	0.27
512	0.29
513	0.29
514	0.3
515	0.32
516	0.27
517	0.33
518	0.38
519	0.38
520	0.37
521	0.36
522	0.33
523	0.31
524	0.33
525	0.28
526	0.3
527	0.3
528	0.28
529	0.27
530	0.25
531	0.2
532	0.15
533	0.14
534	0.08
535	0.08
536	0.07
537	0.07
538	0.07
539	0.06
540	0.06
541	0.05
542	0.03
543	0.04
544	0.05
545	0.05
546	0.05
547	0.06
548	0.08
549	0.09
550	0.09
551	0.09
552	0.1
553	0.1
554	0.1
555	0.09
556	0.08
557	0.08
558	0.07
559	0.08
560	0.11
561	0.13
562	0.17
563	0.17
564	0.19
565	0.18
566	0.25
567	0.3
568	0.27
569	0.28
570	0.26
571	0.28
572	0.32
573	0.33
574	0.27
575	0.23
576	0.24
577	0.22
578	0.25
579	0.22
580	0.16
581	0.15
582	0.14
583	0.18
584	0.17
585	0.17
586	0.14
587	0.15
588	0.14
589	0.15
590	0.15
591	0.11
592	0.11
593	0.11
594	0.11
595	0.11
596	0.11
597	0.09
598	0.1
599	0.09
600	0.08
601	0.07
602	0.06
603	0.05
604	0.09
605	0.1
606	0.11
607	0.13
608	0.17
609	0.17
610	0.17
611	0.17
612	0.15
613	0.15
614	0.14
615	0.12
616	0.08
617	0.08
618	0.08
619	0.08
620	0.07
621	0.06
622	0.08
623	0.08
624	0.09
625	0.14
626	0.14
627	0.15
628	0.15
629	0.14
630	0.15
631	0.24
632	0.26
633	0.22
634	0.23
635	0.22
636	0.22
637	0.22
638	0.21
639	0.13
640	0.14
641	0.13
642	0.16
643	0.16
644	0.16
645	0.16
646	0.14
647	0.14
648	0.13
649	0.14
650	0.11
651	0.11
652	0.14
653	0.15
654	0.15
655	0.14
656	0.18
657	0.18
658	0.24
659	0.25
660	0.25
661	0.27
662	0.28
663	0.28
664	0.27
665	0.3
666	0.28
667	0.35
668	0.34
669	0.33
670	0.33
671	0.33
672	0.3
673	0.25
674	0.22
675	0.15
676	0.18
677	0.18
678	0.17
679	0.17
680	0.16
681	0.14
682	0.13
683	0.11
684	0.14
685	0.16
686	0.2
687	0.21
688	0.21
689	0.21
690	0.25
691	0.27
692	0.22
693	0.22
694	0.18
695	0.23
696	0.24
697	0.27
698	0.23
699	0.21
700	0.19
701	0.16
702	0.16
703	0.1
704	0.12
705	0.09
706	0.1
707	0.14
708	0.16
709	0.17
710	0.17
711	0.17
712	0.14
713	0.15
714	0.15
715	0.12
716	0.11
717	0.12
718	0.12
719	0.13
720	0.12
721	0.11
722	0.1
723	0.1
724	0.11
725	0.11
726	0.11
727	0.11
728	0.12
729	0.14
730	0.16
731	0.16
732	0.13
733	0.13
734	0.14
735	0.13
736	0.14
737	0.13
738	0.11
739	0.14
740	0.17
741	0.17
742	0.15
743	0.15
744	0.14
745	0.13
746	0.13
747	0.1
748	0.07
749	0.07
750	0.07
751	0.07
752	0.07
753	0.07
754	0.06
755	0.07
756	0.08
757	0.11
758	0.13
759	0.15
760	0.14
761	0.17
762	0.24
763	0.24
764	0.23
765	0.21
766	0.2
767	0.18
768	0.22
769	0.25
770	0.2
771	0.2
772	0.24
773	0.23
774	0.26
775	0.26
776	0.23
777	0.19
778	0.16
779	0.17
780	0.16
781	0.16
782	0.15
783	0.16
784	0.18
785	0.21
786	0.22
787	0.22
788	0.21
789	0.22
790	0.23
791	0.23
792	0.22
793	0.2
794	0.2
795	0.18
796	0.16
797	0.12
798	0.1
799	0.07
800	0.09
801	0.09
802	0.08
803	0.09
804	0.12
805	0.13
806	0.14
807	0.16
808	0.17
809	0.16
810	0.17
811	0.16
812	0.14
813	0.13
814	0.13
815	0.11
816	0.08
817	0.07
818	0.05
819	0.07
820	0.07
821	0.09
822	0.09
823	0.09
824	0.09
825	0.09
826	0.12
827	0.14
828	0.16
829	0.21
830	0.29
831	0.36
832	0.44
833	0.47
834	0.44
835	0.41
836	0.4
837	0.39
838	0.34
839	0.3
840	0.24
841	0.27
842	0.28
843	0.29
844	0.29
845	0.24
846	0.23
847	0.21
848	0.22
849	0.19
850	0.18
851	0.25
852	0.26
853	0.26
854	0.29
855	0.29
856	0.26
857	0.24
858	0.28
859	0.26
860	0.31
861	0.32
862	0.28
863	0.29
864	0.28
865	0.28
866	0.23
867	0.2
868	0.15
869	0.14
870	0.14
871	0.13
872	0.12
873	0.12
874	0.11
875	0.08
876	0.06
877	0.05
878	0.04
879	0.03
880	0.04
881	0.05
882	0.07
883	0.08
884	0.09
885	0.09
886	0.09
887	0.09
888	0.09
889	0.1
890	0.08
891	0.08
892	0.07
893	0.08
894	0.09
895	0.11
896	0.11
897	0.1
898	0.11
899	0.1
900	0.12
901	0.14
902	0.13
903	0.12
904	0.12
905	0.12
906	0.1
907	0.1
908	0.08
909	0.07
910	0.07
911	0.07
912	0.07
913	0.07
914	0.08
915	0.12
916	0.18
917	0.17
918	0.19
919	0.22
920	0.25
921	0.29
922	0.33
923	0.36
924	0.34
925	0.4
926	0.45
927	0.49
928	0.48
929	0.47
930	0.46
931	0.5
932	0.5
933	0.46
934	0.43
935	0.43
936	0.41
937	0.38
938	0.38
939	0.32
940	0.3
941	0.27
942	0.26
943	0.23
944	0.23
945	0.22
946	0.18
947	0.15
948	0.13
949	0.12
950	0.1
951	0.07
952	0.07
953	0.07
954	0.07
955	0.07
956	0.07
957	0.07
958	0.08
959	0.07
960	0.07
961	0.07
962	0.07
963	0.07
964	0.08
965	0.08
966	0.07
967	0.07
968	0.07
969	0.08
970	0.09
971	0.09
972	0.1
973	0.15
974	0.21
975	0.22
976	0.22
977	0.23
978	0.25
979	0.27
980	0.25
981	0.22
982	0.15
983	0.16
984	0.17
985	0.18
986	0.15
987	0.12
988	0.15
989	0.14
990	0.16
991	0.15
992	0.13
993	0.11
994	0.12
995	0.12
996	0.11
997	0.11
998	0.1
999	0.1
1000	0.1
1001	0.1
1002	0.1
1003	0.09
1004	0.09
1005	0.07
1006	0.08
1007	0.07
1008	0.07
1009	0.08
1010	0.07
1011	0.07
1012	0.06
1013	0.08
1014	0.08
1015	0.08
1016	0.08
1017	0.12
1018	0.17
1019	0.22
1020	0.23
1021	0.28
1022	0.34
1023	0.4
1024	0.44
1025	0.42
1026	0.38
1027	0.34
1028	0.36
1029	0.38
1030	0.38
1031	0.34
1032	0.32
1033	0.31
1034	0.31
1035	0.3
1036	0.27
1037	0.24
1038	0.2
1039	0.21
1040	0.2
1041	0.19
1042	0.2
1043	0.28
1044	0.34
1045	0.33
1046	0.36
1047	0.4
1048	0.43
1049	0.42
1050	0.41
1051	0.41
1052	0.41
1053	0.43
1054	0.41
1055	0.38
1056	0.35
1057	0.36
1058	0.36
1059	0.28
1060	0.21
1061	0.16
1062	0.12
1063	0.12
1064	0.11
1065	0.11
1066	0.17
1067	0.19
1068	0.2
1069	0.23
1070	0.22
1071	0.2
1072	0.2
1073	0.25
1074	0.21
1075	0.21
1076	0.26
1077	0.28
1078	0.33
1079	0.35
1080	0.36
1081	0.29
1082	0.28
1083	0.28
1084	0.23
1085	0.2
1086	0.17
1087	0.15
1088	0.15
1089	0.17
1090	0.16
1091	0.17
1092	0.16
1093	0.13
1094	0.13
1095	0.13
1096	0.12
1097	0.14
1098	0.16
1099	0.15
1100	0.19
1101	0.23
1102	0.25
1103	0.26
1104	0.25
1105	0.24
1106	0.23
1107	0.27
1108	0.31
1109	0.34
1110	0.36
1111	0.4
1112	0.42
1113	0.48
1114	0.54
1115	0.53
1116	0.48
1117	0.47
1118	0.44
1119	0.42
1120	0.41
1121	0.34
1122	0.26
1123	0.23
1124	0.23
1125	0.18
1126	0.16
1127	0.14
1128	0.14
1129	0.13
1130	0.13
1131	0.14
1132	0.12
1133	0.12
1134	0.11
1135	0.12
1136	0.15
1137	0.23
1138	0.26
1139	0.32
1140	0.37
1141	0.41
1142	0.41
1143	0.43
1144	0.42
1145	0.35
1146	0.34
1147	0.35
1148	0.4
1149	0.41
1150	0.46
1151	0.43
1152	0.41
1153	0.45
1154	0.43
1155	0.38
1156	0.33
1157	0.38
1158	0.41
1159	0.49
1160	0.52
1161	0.49
1162	0.53
1163	0.51
1164	0.55
1165	0.49
1166	0.46
1167	0.4
1168	0.4
1169	0.43
1170	0.4
1171	0.4
1172	0.33
1173	0.35
1174	0.31
1175	0.3
1176	0.24
1177	0.18
1178	0.19
1179	0.18
1180	0.18
1181	0.15
1182	0.14
1183	0.13
1184	0.15
1185	0.15
1186	0.14
1187	0.14
1188	0.12
1189	0.1
1190	0.1
1191	0.11
1192	0.1
1193	0.1
1194	0.09
1195	0.1
1196	0.13
1197	0.15
1198	0.14
1199	0.13
1200	0.13
1201	0.13
1202	0.14
1203	0.15
1204	0.16
1205	0.15
1206	0.16
1207	0.16
1208	0.16
1209	0.16
1210	0.14
1211	0.11
1212	0.08
1213	0.1
1214	0.09
1215	0.09
1216	0.1
1217	0.09
1218	0.09
1219	0.09
1220	0.1
1221	0.07
1222	0.08
1223	0.12
1224	0.13
1225	0.13
1226	0.15
1227	0.16
1228	0.16
1229	0.2
1230	0.24
1231	0.19
1232	0.19
1233	0.23
1234	0.24
1235	0.25
1236	0.28
1237	0.25
1238	0.22
1239	0.23
1240	0.22
1241	0.2
1242	0.2
1243	0.19
1244	0.18
1245	0.24
1246	0.3
1247	0.32
1248	0.37
1249	0.42
1250	0.44
1251	0.49
1252	0.55
1253	0.57
1254	0.57
1255	0.6
1256	0.62
1257	0.59
1258	0.6
1259	0.54
1260	0.48
1261	0.49
1262	0.44
1263	0.38
1264	0.37
1265	0.39
1266	0.38
1267	0.43
1268	0.45
1269	0.41
1270	0.47
1271	0.5
1272	0.47
1273	0.44
1274	0.46
1275	0.43
1276	0.45
1277	0.5
1278	0.51
1279	0.55
1280	0.63
1281	0.71
1282	0.69
1283	0.66
1284	0.69
1285	0.61
1286	0.55
1287	0.54
1288	0.49
1289	0.42
1290	0.41
1291	0.41
1292	0.38
1293	0.44
1294	0.49
1295	0.49
1296	0.47
1297	0.5
1298	0.48
1299	0.53
1300	0.55
1301	0.5
1302	0.49
1303	0.47
1304	0.48
1305	0.5
1306	0.54
1307	0.55
1308	0.53
1309	0.58
1310	0.59
1311	0.6
1312	0.62
1313	0.61
1314	0.63
1315	0.65
1316	0.62
1317	0.63

A0A1C7NEK3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer