FuNGI

A0A1C7N9B6

Protein Details

Accession

A0A1C7N9B6

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
193-217	IEYASGRRRPKRKMKYNSVEREQKL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
199-208	RRRPKRKMKY
272-276	KGKGR

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 11, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR021950 Spt20 IPR046468 Spt20-like_SEP
Gene Ontology	GO:0000124 C:SAGA complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity
Pfam	View protein in Pfam PF12090 Spt20

Amino Acid Sequences

MASTKVMAELHSKQAANVSPSLSKKSASRWHASQSNHKSQPLKDENELLRRHANSPPSLCLHLYPTYFKFEHEDGFFSYKSQFKDFLICVKERRLPGDLVDVFNEASCRYYDGCLLVDIHDHRAQGAQNTTKRIVMKPTAESIWTDIALLSEEWGVSYTEDFALQIEAQILIATEEPLCLDPSIQVSRISNAIEYASGRRRPKRKMKYNSVEREQKLAKKAESIKLMTLMDARAKRTFPFEPSFGKISFIHDWRSKRTKLGAEALPAIDTKKGKGRKGVMEPPVLSDGRKCTRTVRFERTEGDRKVYTIVNIYVNNGEYDGVFRWGTVYDTSINGGSIDFKLGTENLVEAYILHLKSTYGQFNAVICDNTNVNAVPPSPSTIRLPNGITQPAPQRPTQPTQPAQNQTQSVQIQAHQVPQQAPQQVQQLTQQGQQARPAQPLTNLQIQQLHAQQNRAMQAKAAMLPPHQRALLAQAQAQAQAQAQAQAQTSNQPPQNQQPSSQQTPQQTPQQTPQQTPQQTPQQTPQQVPQQLSTGLTQAQIQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.38
3	0.35
4	0.34
5	0.3
6	0.31
7	0.34
8	0.4
9	0.35
10	0.33
11	0.33
12	0.4
13	0.46
14	0.47
15	0.52
16	0.5
17	0.58
18	0.62
19	0.65
20	0.66
21	0.67
22	0.71
23	0.69
24	0.7
25	0.66
26	0.62
27	0.67
28	0.65
29	0.61
30	0.54
31	0.57
32	0.58
33	0.61
34	0.6
35	0.53
36	0.51
37	0.48
38	0.48
39	0.44
40	0.44
41	0.43
42	0.44
43	0.45
44	0.42
45	0.42
46	0.4
47	0.36
48	0.34
49	0.32
50	0.31
51	0.31
52	0.29
53	0.34
54	0.33
55	0.32
56	0.33
57	0.3
58	0.33
59	0.29
60	0.3
61	0.26
62	0.3
63	0.29
64	0.24
65	0.27
66	0.26
67	0.27
68	0.28
69	0.27
70	0.24
71	0.31
72	0.31
73	0.35
74	0.36
75	0.36
76	0.36
77	0.4
78	0.45
79	0.4
80	0.42
81	0.38
82	0.34
83	0.33
84	0.39
85	0.35
86	0.31
87	0.3
88	0.27
89	0.23
90	0.22
91	0.21
92	0.11
93	0.1
94	0.09
95	0.1
96	0.1
97	0.11
98	0.13
99	0.14
100	0.14
101	0.14
102	0.15
103	0.13
104	0.16
105	0.16
106	0.2
107	0.2
108	0.19
109	0.19
110	0.2
111	0.21
112	0.21
113	0.26
114	0.28
115	0.3
116	0.35
117	0.36
118	0.37
119	0.38
120	0.36
121	0.37
122	0.35
123	0.36
124	0.34
125	0.36
126	0.34
127	0.32
128	0.3
129	0.26
130	0.22
131	0.17
132	0.15
133	0.11
134	0.1
135	0.1
136	0.09
137	0.08
138	0.06
139	0.06
140	0.06
141	0.06
142	0.07
143	0.06
144	0.06
145	0.07
146	0.06
147	0.07
148	0.07
149	0.06
150	0.07
151	0.07
152	0.07
153	0.06
154	0.06
155	0.06
156	0.06
157	0.05
158	0.04
159	0.05
160	0.05
161	0.04
162	0.04
163	0.05
164	0.06
165	0.07
166	0.06
167	0.06
168	0.07
169	0.1
170	0.12
171	0.13
172	0.14
173	0.13
174	0.15
175	0.16
176	0.16
177	0.12
178	0.11
179	0.1
180	0.09
181	0.1
182	0.13
183	0.18
184	0.24
185	0.3
186	0.37
187	0.44
188	0.53
189	0.63
190	0.7
191	0.75
192	0.79
193	0.84
194	0.87
195	0.91
196	0.9
197	0.87
198	0.85
199	0.75
200	0.71
201	0.63
202	0.57
203	0.52
204	0.47
205	0.4
206	0.38
207	0.42
208	0.41
209	0.41
210	0.38
211	0.33
212	0.32
213	0.31
214	0.24
215	0.2
216	0.16
217	0.16
218	0.17
219	0.18
220	0.17
221	0.18
222	0.18
223	0.22
224	0.23
225	0.23
226	0.25
227	0.25
228	0.26
229	0.29
230	0.31
231	0.26
232	0.27
233	0.22
234	0.24
235	0.24
236	0.22
237	0.24
238	0.26
239	0.28
240	0.33
241	0.39
242	0.36
243	0.35
244	0.39
245	0.38
246	0.37
247	0.41
248	0.36
249	0.31
250	0.31
251	0.28
252	0.23
253	0.2
254	0.16
255	0.12
256	0.1
257	0.1
258	0.15
259	0.2
260	0.22
261	0.28
262	0.32
263	0.37
264	0.44
265	0.5
266	0.48
267	0.47
268	0.45
269	0.41
270	0.39
271	0.32
272	0.25
273	0.19
274	0.2
275	0.2
276	0.21
277	0.2
278	0.23
279	0.31
280	0.39
281	0.45
282	0.48
283	0.49
284	0.5
285	0.53
286	0.54
287	0.56
288	0.48
289	0.45
290	0.37
291	0.33
292	0.33
293	0.29
294	0.23
295	0.16
296	0.17
297	0.16
298	0.16
299	0.16
300	0.15
301	0.15
302	0.14
303	0.11
304	0.1
305	0.06
306	0.08
307	0.07
308	0.08
309	0.08
310	0.08
311	0.08
312	0.08
313	0.09
314	0.08
315	0.09
316	0.08
317	0.09
318	0.1
319	0.09
320	0.09
321	0.08
322	0.08
323	0.07
324	0.07
325	0.07
326	0.06
327	0.06
328	0.07
329	0.07
330	0.07
331	0.06
332	0.06
333	0.06
334	0.06
335	0.06
336	0.05
337	0.07
338	0.1
339	0.1
340	0.09
341	0.09
342	0.09
343	0.12
344	0.15
345	0.16
346	0.12
347	0.13
348	0.15
349	0.15
350	0.17
351	0.15
352	0.13
353	0.11
354	0.12
355	0.11
356	0.11
357	0.11
358	0.09
359	0.09
360	0.09
361	0.09
362	0.1
363	0.1
364	0.13
365	0.13
366	0.15
367	0.18
368	0.21
369	0.23
370	0.24
371	0.25
372	0.26
373	0.29
374	0.29
375	0.26
376	0.25
377	0.31
378	0.33
379	0.34
380	0.31
381	0.34
382	0.37
383	0.42
384	0.46
385	0.48
386	0.46
387	0.52
388	0.6
389	0.59
390	0.58
391	0.57
392	0.52
393	0.44
394	0.46
395	0.38
396	0.32
397	0.28
398	0.25
399	0.25
400	0.25
401	0.28
402	0.24
403	0.27
404	0.26
405	0.29
406	0.32
407	0.3
408	0.3
409	0.29
410	0.33
411	0.31
412	0.31
413	0.32
414	0.32
415	0.31
416	0.33
417	0.35
418	0.32
419	0.32
420	0.37
421	0.39
422	0.36
423	0.38
424	0.37
425	0.33
426	0.33
427	0.37
428	0.35
429	0.37
430	0.35
431	0.32
432	0.34
433	0.34
434	0.35
435	0.35
436	0.39
437	0.33
438	0.35
439	0.35
440	0.36
441	0.4
442	0.39
443	0.33
444	0.25
445	0.26
446	0.26
447	0.27
448	0.26
449	0.22
450	0.23
451	0.29
452	0.31
453	0.32
454	0.29
455	0.27
456	0.24
457	0.28
458	0.31
459	0.26
460	0.25
461	0.25
462	0.25
463	0.27
464	0.26
465	0.21
466	0.15
467	0.17
468	0.15
469	0.15
470	0.16
471	0.17
472	0.17
473	0.18
474	0.18
475	0.21
476	0.24
477	0.29
478	0.32
479	0.34
480	0.38
481	0.46
482	0.56
483	0.52
484	0.52
485	0.54
486	0.59
487	0.61
488	0.63
489	0.59
490	0.56
491	0.62
492	0.64
493	0.63
494	0.59
495	0.57
496	0.59
497	0.63
498	0.61
499	0.58
500	0.6
501	0.61
502	0.62
503	0.62
504	0.62
505	0.62
506	0.62
507	0.62
508	0.62
509	0.62
510	0.62
511	0.61
512	0.61
513	0.6
514	0.61
515	0.59
516	0.53
517	0.47
518	0.42
519	0.41
520	0.34
521	0.27
522	0.22

A0A1C7N9B6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer